Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2DIA8

Protein Details
Accession A0A1Y2DIA8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
530-555NTKDSTPTSKKAKKHEPPSKVTPVPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-76KKLEAKKA
539-557KKAKKHEPPSKVTPVPPPR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9.333, mito 8.5, cyto_mito 6.833, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MAPKSSIGSLAAMKKNINEKKSTPAIKSSSIRARELPASSKSSEFVEDSSSSSGSDGSDSDDGIEAARKKLEAKKATALKPKVNGIKAVPATATEVQTAKKPPKADSESDSESDTTSSGSDSESEKKPAPKTDAKKSSTNTSDSGSTSSESGSESGSGSDSESDSDNEEESGAKAQSVAKTQTPAKPTTTKPAAQAAKSTEDSDSSSEDSDDENEVDPKAIASINGASGAKQAGQVAQPAWLENSEFMIRKASSDNPGKEVADFFSKANLEGKQVWYFTAPASLPITVLRDMEIDMAKAAAGGTIIKHQGDSYGLDLEPYATNNQVQILMANKKGDKWSTPVSHGVDSTVHIRREAKFGGESTVSATATDDYVRRPKPIREQPEGLRARFTPIGVPNPKPVPFTRPAVKASAIASLRTKPAAESSSESDSDEEMTTTAALPFQPKPVANDNLKRKQPVDESGSDDDDTSSSDSDEAETLPPPAKETKPAGQPAKRAKMLDSKLSADMAKTTFATPQIPSSQASKITNRSNTKDSTPTSKKAKKHEPPSKVTPVPPPRIGIPGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.45
3 0.5
4 0.49
5 0.47
6 0.45
7 0.52
8 0.6
9 0.62
10 0.56
11 0.57
12 0.57
13 0.58
14 0.59
15 0.59
16 0.58
17 0.56
18 0.56
19 0.5
20 0.5
21 0.48
22 0.48
23 0.45
24 0.41
25 0.42
26 0.41
27 0.39
28 0.35
29 0.32
30 0.3
31 0.26
32 0.21
33 0.21
34 0.2
35 0.21
36 0.22
37 0.2
38 0.17
39 0.16
40 0.16
41 0.11
42 0.11
43 0.09
44 0.11
45 0.12
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.11
51 0.16
52 0.14
53 0.15
54 0.17
55 0.17
56 0.21
57 0.29
58 0.38
59 0.39
60 0.43
61 0.5
62 0.58
63 0.66
64 0.71
65 0.69
66 0.66
67 0.64
68 0.67
69 0.65
70 0.59
71 0.54
72 0.46
73 0.49
74 0.44
75 0.4
76 0.32
77 0.25
78 0.28
79 0.27
80 0.25
81 0.18
82 0.19
83 0.18
84 0.23
85 0.29
86 0.3
87 0.31
88 0.32
89 0.34
90 0.43
91 0.48
92 0.48
93 0.46
94 0.48
95 0.48
96 0.47
97 0.45
98 0.35
99 0.29
100 0.25
101 0.2
102 0.13
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.11
109 0.17
110 0.19
111 0.23
112 0.27
113 0.33
114 0.36
115 0.41
116 0.46
117 0.5
118 0.54
119 0.61
120 0.67
121 0.65
122 0.68
123 0.65
124 0.66
125 0.61
126 0.56
127 0.47
128 0.4
129 0.38
130 0.32
131 0.3
132 0.22
133 0.19
134 0.16
135 0.14
136 0.12
137 0.11
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.08
158 0.1
159 0.09
160 0.08
161 0.09
162 0.11
163 0.13
164 0.16
165 0.18
166 0.17
167 0.21
168 0.25
169 0.29
170 0.3
171 0.31
172 0.32
173 0.35
174 0.36
175 0.41
176 0.43
177 0.4
178 0.39
179 0.45
180 0.44
181 0.39
182 0.4
183 0.34
184 0.33
185 0.32
186 0.31
187 0.22
188 0.2
189 0.2
190 0.18
191 0.16
192 0.13
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.12
236 0.12
237 0.13
238 0.15
239 0.15
240 0.2
241 0.26
242 0.27
243 0.26
244 0.28
245 0.27
246 0.25
247 0.24
248 0.18
249 0.14
250 0.14
251 0.12
252 0.13
253 0.13
254 0.13
255 0.15
256 0.14
257 0.14
258 0.14
259 0.17
260 0.16
261 0.16
262 0.15
263 0.14
264 0.13
265 0.11
266 0.12
267 0.1
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.11
274 0.09
275 0.09
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.04
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.05
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.06
296 0.07
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.08
306 0.09
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.1
316 0.12
317 0.13
318 0.15
319 0.15
320 0.16
321 0.19
322 0.2
323 0.17
324 0.19
325 0.25
326 0.26
327 0.29
328 0.32
329 0.32
330 0.32
331 0.3
332 0.26
333 0.2
334 0.18
335 0.2
336 0.2
337 0.18
338 0.18
339 0.21
340 0.21
341 0.25
342 0.25
343 0.22
344 0.18
345 0.19
346 0.2
347 0.18
348 0.17
349 0.14
350 0.15
351 0.13
352 0.11
353 0.11
354 0.09
355 0.09
356 0.1
357 0.09
358 0.1
359 0.18
360 0.19
361 0.23
362 0.26
363 0.31
364 0.41
365 0.5
366 0.55
367 0.54
368 0.59
369 0.59
370 0.66
371 0.65
372 0.55
373 0.48
374 0.4
375 0.38
376 0.33
377 0.29
378 0.24
379 0.23
380 0.32
381 0.33
382 0.35
383 0.36
384 0.39
385 0.4
386 0.38
387 0.35
388 0.33
389 0.33
390 0.37
391 0.38
392 0.39
393 0.39
394 0.39
395 0.39
396 0.34
397 0.3
398 0.31
399 0.25
400 0.23
401 0.23
402 0.22
403 0.22
404 0.21
405 0.2
406 0.14
407 0.18
408 0.18
409 0.18
410 0.2
411 0.22
412 0.25
413 0.26
414 0.26
415 0.22
416 0.2
417 0.2
418 0.16
419 0.13
420 0.09
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.07
426 0.07
427 0.1
428 0.11
429 0.14
430 0.18
431 0.19
432 0.23
433 0.3
434 0.36
435 0.4
436 0.48
437 0.55
438 0.61
439 0.64
440 0.63
441 0.57
442 0.57
443 0.55
444 0.54
445 0.5
446 0.45
447 0.46
448 0.46
449 0.47
450 0.4
451 0.35
452 0.28
453 0.21
454 0.19
455 0.14
456 0.11
457 0.09
458 0.09
459 0.09
460 0.09
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.11
466 0.14
467 0.14
468 0.16
469 0.21
470 0.21
471 0.26
472 0.32
473 0.37
474 0.42
475 0.51
476 0.58
477 0.58
478 0.65
479 0.69
480 0.72
481 0.69
482 0.62
483 0.58
484 0.59
485 0.58
486 0.58
487 0.52
488 0.46
489 0.43
490 0.44
491 0.39
492 0.3
493 0.29
494 0.21
495 0.19
496 0.17
497 0.16
498 0.17
499 0.19
500 0.21
501 0.18
502 0.22
503 0.24
504 0.25
505 0.26
506 0.27
507 0.29
508 0.32
509 0.36
510 0.37
511 0.41
512 0.48
513 0.55
514 0.59
515 0.61
516 0.61
517 0.61
518 0.6
519 0.6
520 0.56
521 0.57
522 0.57
523 0.59
524 0.64
525 0.67
526 0.69
527 0.72
528 0.79
529 0.78
530 0.82
531 0.85
532 0.84
533 0.85
534 0.87
535 0.86
536 0.81
537 0.75
538 0.74
539 0.74
540 0.73
541 0.68
542 0.62
543 0.54