Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2DGR4

Protein Details
Accession A0A1Y2DGR4    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-55PFLGSRSSSSKPKKKPSSRLSFGLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-45KPKKK
273-275RKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MSAFGSKRQPRKITVQDEEEEDGGAPLRVRPFLGSRSSSSKPKKKPSSRLSFGLGEGASIEDSTAALGGELPIFTPKKTSLAAAVVGNSAYKKGLKGVAKNNILPVRSSETDEDRPRYSKEYLSELQNSTPSTPARGSSLQIADDDGDIEMVLDPSELEGATVVEVTSNALSVEPATTPHILTESEIAEKKARRERQRERLAAQSDDFIPLDASDDDSRQVGDSYLTLLSRSSKSKPKEKRLTTDDDLVEDDSFFVEDGGLSLGKKAERDAARKKRADMANMIAAAEGNSDGETSDDSEAERRAAYEKAQTRAGMDGLAEEREAQQRRLNKNGGVQVPPKITPLPDLSVLVEEFKARMGRKEVEAQRMKDKIAQLKREREGIMKREPEVQTLLNEAGERYQSLMGQDSVAAAKSLLDRARGGDTAIGAARGLDSLGTTPIGQDRMEM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.72
3 0.65
4 0.64
5 0.6
6 0.5
7 0.4
8 0.3
9 0.23
10 0.16
11 0.15
12 0.11
13 0.12
14 0.14
15 0.14
16 0.15
17 0.18
18 0.21
19 0.26
20 0.32
21 0.33
22 0.34
23 0.41
24 0.45
25 0.52
26 0.58
27 0.63
28 0.66
29 0.73
30 0.8
31 0.83
32 0.89
33 0.9
34 0.91
35 0.88
36 0.83
37 0.77
38 0.69
39 0.59
40 0.52
41 0.41
42 0.3
43 0.23
44 0.19
45 0.13
46 0.1
47 0.1
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.04
53 0.04
54 0.04
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.11
60 0.12
61 0.12
62 0.15
63 0.15
64 0.18
65 0.19
66 0.2
67 0.19
68 0.2
69 0.23
70 0.2
71 0.2
72 0.17
73 0.16
74 0.16
75 0.13
76 0.11
77 0.1
78 0.1
79 0.09
80 0.12
81 0.19
82 0.24
83 0.31
84 0.39
85 0.48
86 0.51
87 0.52
88 0.55
89 0.52
90 0.48
91 0.41
92 0.35
93 0.33
94 0.29
95 0.31
96 0.27
97 0.3
98 0.37
99 0.41
100 0.42
101 0.38
102 0.4
103 0.39
104 0.41
105 0.37
106 0.33
107 0.31
108 0.34
109 0.34
110 0.37
111 0.4
112 0.37
113 0.36
114 0.34
115 0.32
116 0.25
117 0.25
118 0.2
119 0.18
120 0.18
121 0.17
122 0.19
123 0.19
124 0.19
125 0.21
126 0.22
127 0.2
128 0.19
129 0.19
130 0.14
131 0.13
132 0.12
133 0.07
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.03
141 0.03
142 0.04
143 0.04
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.04
149 0.04
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.04
162 0.06
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.09
172 0.11
173 0.12
174 0.13
175 0.16
176 0.18
177 0.23
178 0.3
179 0.37
180 0.43
181 0.53
182 0.62
183 0.69
184 0.77
185 0.76
186 0.7
187 0.7
188 0.64
189 0.55
190 0.45
191 0.36
192 0.27
193 0.23
194 0.2
195 0.12
196 0.1
197 0.08
198 0.09
199 0.07
200 0.08
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.08
217 0.1
218 0.13
219 0.16
220 0.23
221 0.28
222 0.37
223 0.46
224 0.55
225 0.63
226 0.66
227 0.7
228 0.69
229 0.72
230 0.65
231 0.62
232 0.52
233 0.42
234 0.38
235 0.3
236 0.24
237 0.16
238 0.13
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.04
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.14
255 0.19
256 0.26
257 0.37
258 0.46
259 0.55
260 0.57
261 0.58
262 0.59
263 0.58
264 0.54
265 0.47
266 0.4
267 0.35
268 0.33
269 0.31
270 0.22
271 0.19
272 0.15
273 0.12
274 0.07
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.09
286 0.09
287 0.1
288 0.09
289 0.08
290 0.1
291 0.11
292 0.12
293 0.19
294 0.23
295 0.26
296 0.28
297 0.28
298 0.27
299 0.27
300 0.26
301 0.18
302 0.12
303 0.11
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.08
308 0.1
309 0.16
310 0.19
311 0.19
312 0.22
313 0.3
314 0.36
315 0.43
316 0.45
317 0.41
318 0.45
319 0.5
320 0.5
321 0.47
322 0.44
323 0.41
324 0.41
325 0.38
326 0.34
327 0.28
328 0.24
329 0.23
330 0.24
331 0.22
332 0.2
333 0.2
334 0.19
335 0.2
336 0.2
337 0.17
338 0.14
339 0.11
340 0.1
341 0.11
342 0.15
343 0.14
344 0.19
345 0.23
346 0.26
347 0.29
348 0.39
349 0.43
350 0.49
351 0.55
352 0.54
353 0.57
354 0.56
355 0.54
356 0.48
357 0.49
358 0.48
359 0.49
360 0.56
361 0.57
362 0.64
363 0.65
364 0.67
365 0.62
366 0.6
367 0.6
368 0.56
369 0.57
370 0.52
371 0.5
372 0.53
373 0.52
374 0.48
375 0.43
376 0.38
377 0.3
378 0.29
379 0.28
380 0.2
381 0.2
382 0.17
383 0.15
384 0.14
385 0.13
386 0.12
387 0.13
388 0.13
389 0.14
390 0.17
391 0.15
392 0.14
393 0.14
394 0.13
395 0.13
396 0.12
397 0.11
398 0.08
399 0.09
400 0.11
401 0.16
402 0.17
403 0.18
404 0.19
405 0.21
406 0.25
407 0.24
408 0.23
409 0.19
410 0.18
411 0.18
412 0.18
413 0.16
414 0.12
415 0.11
416 0.11
417 0.09
418 0.08
419 0.05
420 0.06
421 0.06
422 0.08
423 0.09
424 0.09
425 0.1
426 0.14
427 0.16