Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2EKS7

Protein Details
Accession A0A1Y2EKS7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-86VCEQCHAKRVRCDRVKPCCGAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 6, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002815  Spo11/TopoVI_A  
IPR013049  Spo11/TopoVI_A_N  
IPR036078  Spo11/TopoVI_A_sf  
IPR034136  TOPRIM_Topo6A/Spo11  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003918  F:DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006259  P:DNA metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF04406  TP6A_N  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
cd00223  TOPRIM_TopoIIB_SPO  
Amino Acid Sequences MEHIGSSWATTPSSHRVLSTISSPTSSTRAPTEEGGHSVQRTSVLPSQDSARNSDSGTASYTSDPVCEQCHAKRVRCDRVKPCCGACSRRGRDCSFGRRQGQSTQETSVQSTPVSLNNSAGITTQISSSNGPFTQATPAERHPVLQDGIYVFEEGDSQPAAIIAKIEGILEDIVDALSLNRVLMIPLRSRQSGNEVMIRFPSDRIAGAKKFTALLQILHCIHEALVSGRIVTKRNIYYHNPDLFCSQAYVDQLVDDIAFTFGVGRDALNVRAASKGLVAGGNFDIIGQDHHGVPIPHTSSLDGVDFHSSRWILVIEKEATFRSLVASRYFELSAAGPGILITAKGYPDLATRQFLHLVQSSYPHIPIHALVDFDPDGLAIMRTYKHGSRSLDHEENVTLPGLYWLGVKSSDVLDPQRHLAASPLQQLSQQSGNMPPSCQLSASSNVHPPNQLNMETLCTLTSNDRKKAVNLLRSLNNQHDQDTEEMMLTRELQLMLMLNKKAEIQALDDSMTAWLNEHLCA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.26
3 0.26
4 0.28
5 0.3
6 0.3
7 0.27
8 0.24
9 0.24
10 0.25
11 0.26
12 0.27
13 0.25
14 0.24
15 0.23
16 0.25
17 0.26
18 0.28
19 0.31
20 0.29
21 0.32
22 0.33
23 0.32
24 0.3
25 0.28
26 0.26
27 0.23
28 0.21
29 0.23
30 0.24
31 0.24
32 0.25
33 0.26
34 0.3
35 0.33
36 0.33
37 0.33
38 0.3
39 0.28
40 0.28
41 0.31
42 0.27
43 0.23
44 0.24
45 0.21
46 0.2
47 0.19
48 0.21
49 0.16
50 0.16
51 0.16
52 0.14
53 0.16
54 0.17
55 0.2
56 0.22
57 0.31
58 0.38
59 0.43
60 0.51
61 0.58
62 0.66
63 0.71
64 0.77
65 0.78
66 0.82
67 0.84
68 0.79
69 0.73
70 0.69
71 0.67
72 0.64
73 0.62
74 0.62
75 0.62
76 0.65
77 0.68
78 0.64
79 0.66
80 0.67
81 0.69
82 0.67
83 0.69
84 0.67
85 0.66
86 0.65
87 0.64
88 0.62
89 0.57
90 0.5
91 0.45
92 0.43
93 0.38
94 0.38
95 0.33
96 0.27
97 0.21
98 0.2
99 0.18
100 0.17
101 0.2
102 0.17
103 0.17
104 0.17
105 0.18
106 0.16
107 0.15
108 0.13
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.12
115 0.13
116 0.15
117 0.14
118 0.16
119 0.15
120 0.15
121 0.19
122 0.2
123 0.21
124 0.22
125 0.24
126 0.27
127 0.27
128 0.27
129 0.22
130 0.23
131 0.22
132 0.18
133 0.17
134 0.13
135 0.15
136 0.14
137 0.13
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.03
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.07
171 0.1
172 0.12
173 0.15
174 0.19
175 0.2
176 0.2
177 0.21
178 0.24
179 0.26
180 0.26
181 0.28
182 0.26
183 0.25
184 0.26
185 0.26
186 0.21
187 0.17
188 0.16
189 0.11
190 0.11
191 0.13
192 0.18
193 0.17
194 0.18
195 0.18
196 0.18
197 0.18
198 0.17
199 0.17
200 0.13
201 0.14
202 0.13
203 0.17
204 0.17
205 0.17
206 0.17
207 0.13
208 0.12
209 0.11
210 0.1
211 0.07
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.13
219 0.17
220 0.18
221 0.22
222 0.26
223 0.29
224 0.34
225 0.4
226 0.45
227 0.41
228 0.38
229 0.36
230 0.32
231 0.28
232 0.22
233 0.14
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.12
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.09
290 0.08
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.13
295 0.12
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.08
300 0.09
301 0.14
302 0.13
303 0.14
304 0.15
305 0.14
306 0.15
307 0.14
308 0.13
309 0.11
310 0.12
311 0.13
312 0.14
313 0.16
314 0.16
315 0.18
316 0.18
317 0.16
318 0.14
319 0.12
320 0.11
321 0.09
322 0.08
323 0.06
324 0.05
325 0.06
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.08
335 0.12
336 0.13
337 0.16
338 0.17
339 0.19
340 0.2
341 0.2
342 0.22
343 0.21
344 0.2
345 0.18
346 0.19
347 0.2
348 0.2
349 0.2
350 0.17
351 0.14
352 0.13
353 0.14
354 0.14
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.14
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.08
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.04
367 0.06
368 0.07
369 0.09
370 0.12
371 0.14
372 0.18
373 0.24
374 0.27
375 0.29
376 0.35
377 0.42
378 0.42
379 0.4
380 0.38
381 0.33
382 0.3
383 0.28
384 0.22
385 0.13
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.07
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.1
397 0.11
398 0.13
399 0.16
400 0.18
401 0.2
402 0.22
403 0.22
404 0.21
405 0.19
406 0.2
407 0.22
408 0.24
409 0.29
410 0.28
411 0.26
412 0.28
413 0.29
414 0.3
415 0.27
416 0.23
417 0.18
418 0.21
419 0.27
420 0.26
421 0.26
422 0.24
423 0.25
424 0.24
425 0.23
426 0.2
427 0.19
428 0.25
429 0.28
430 0.3
431 0.33
432 0.35
433 0.36
434 0.37
435 0.35
436 0.34
437 0.34
438 0.32
439 0.27
440 0.26
441 0.28
442 0.25
443 0.24
444 0.18
445 0.15
446 0.15
447 0.2
448 0.27
449 0.31
450 0.35
451 0.4
452 0.41
453 0.43
454 0.52
455 0.54
456 0.53
457 0.51
458 0.53
459 0.55
460 0.59
461 0.62
462 0.59
463 0.57
464 0.5
465 0.46
466 0.41
467 0.37
468 0.33
469 0.31
470 0.25
471 0.19
472 0.18
473 0.17
474 0.16
475 0.15
476 0.14
477 0.13
478 0.12
479 0.11
480 0.12
481 0.14
482 0.16
483 0.21
484 0.21
485 0.19
486 0.2
487 0.21
488 0.21
489 0.21
490 0.19
491 0.17
492 0.21
493 0.22
494 0.22
495 0.21
496 0.2
497 0.19
498 0.18
499 0.14
500 0.1
501 0.12