Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2E4W6

Protein Details
Accession A0A1Y2E4W6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
132-157SSDIVETKKSRKSKKARGDKDLEQDPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-148KKSRKSKKAR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.833, mito 6.5, cyto_mito 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MSTPFSYAQAAKGQFTAKPAAPQSVSSQAASTTSSQSQVGTVGTTTNTPSVAASTTSNDNDANENAVEPSESSSKSNAGSTMQPAKEEESSAEIAPEEASQPIVQETKQVADTWVPSTERRGMGPNSSSTRSSDIVETKKSRKSKKARGDKDLEQDPSVEKDKDSEAPKVELSEAPIPAVNPWTQRAALQQKSTPAQSSTPSRAATAGGNASPATTALFSSVEAKSRPALNNDAESTISHGRPAPNGVKSQRRGNEPVRDGSDQAGRRSAPRGSRIGDKGERRVGEPLPVVSDVHLWPTVESAITGSKAQDKTDKPQEKEETKEESGPKEKTKWVPVPYVPTVNFQTPLPTRGGRGGRPAGSRGGRDTGVRGNHASGSSVDRSQAAAMKSAGGSHDGAVNGQAASAASHMVNRASVDNSGAREMNKSSAGMTAEAVKSSADPSPSINGKDGLSKQSQGESNGSALNQQQSSGAPTGSDLRIESSSWVADQSKESLFPSAKESKHHSNNRNEGGSRSRGGNRGRGNHQGANGHHPAYSASGQSFGMPPRQNSYPANFAVLFGNQYPGPNTGHGHRGSNRHNSTSSNYFRQPQTSGARISPAQTSSNQYDMSLHPASNFPSYGAPYGFTDGSSILDLVKGQLEFYFSVDNLCKDTFLRRHMDSQGFVFIEVIAGFRRMQNMTTNIDVIRVACEDNPEVEIVIGADDNRTRLRRRHGWEAWVYPPGQRHESVNYDNGPSNCYYYSRHAYGLYQAATHGAYPLDSPPMFSPNGVDAQFAPYMNGATYVQAMGNGINGMNGVHSQAPVGESQLSAEVPEFSPSGAMGASDLGSAAPGRDSAKVGQHTTGVNGEAAPLTNGTHEEIAQPYQPPYTNGVGDAVEAEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.29
3 0.32
4 0.26
5 0.31
6 0.33
7 0.36
8 0.35
9 0.36
10 0.37
11 0.39
12 0.39
13 0.33
14 0.31
15 0.25
16 0.25
17 0.25
18 0.22
19 0.19
20 0.19
21 0.2
22 0.2
23 0.19
24 0.19
25 0.18
26 0.16
27 0.12
28 0.11
29 0.11
30 0.11
31 0.12
32 0.13
33 0.13
34 0.13
35 0.12
36 0.12
37 0.12
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.15
42 0.2
43 0.21
44 0.22
45 0.21
46 0.21
47 0.22
48 0.21
49 0.21
50 0.16
51 0.16
52 0.15
53 0.14
54 0.13
55 0.11
56 0.14
57 0.15
58 0.16
59 0.17
60 0.19
61 0.21
62 0.22
63 0.23
64 0.2
65 0.19
66 0.21
67 0.25
68 0.33
69 0.31
70 0.31
71 0.31
72 0.33
73 0.32
74 0.3
75 0.25
76 0.2
77 0.22
78 0.2
79 0.19
80 0.16
81 0.15
82 0.14
83 0.13
84 0.1
85 0.08
86 0.09
87 0.08
88 0.09
89 0.11
90 0.12
91 0.11
92 0.15
93 0.17
94 0.18
95 0.2
96 0.2
97 0.19
98 0.2
99 0.22
100 0.2
101 0.23
102 0.22
103 0.21
104 0.25
105 0.3
106 0.29
107 0.29
108 0.32
109 0.3
110 0.35
111 0.38
112 0.39
113 0.38
114 0.4
115 0.4
116 0.36
117 0.37
118 0.32
119 0.31
120 0.29
121 0.31
122 0.33
123 0.4
124 0.44
125 0.46
126 0.53
127 0.6
128 0.64
129 0.67
130 0.73
131 0.76
132 0.8
133 0.85
134 0.87
135 0.88
136 0.87
137 0.84
138 0.81
139 0.78
140 0.7
141 0.59
142 0.51
143 0.43
144 0.4
145 0.36
146 0.28
147 0.21
148 0.21
149 0.23
150 0.28
151 0.3
152 0.3
153 0.29
154 0.31
155 0.31
156 0.3
157 0.29
158 0.24
159 0.25
160 0.24
161 0.21
162 0.19
163 0.19
164 0.18
165 0.17
166 0.19
167 0.16
168 0.14
169 0.16
170 0.18
171 0.18
172 0.18
173 0.26
174 0.33
175 0.36
176 0.38
177 0.38
178 0.41
179 0.44
180 0.45
181 0.39
182 0.32
183 0.28
184 0.29
185 0.33
186 0.33
187 0.35
188 0.33
189 0.31
190 0.3
191 0.29
192 0.25
193 0.22
194 0.18
195 0.14
196 0.14
197 0.13
198 0.12
199 0.11
200 0.1
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.11
208 0.12
209 0.14
210 0.14
211 0.15
212 0.17
213 0.22
214 0.24
215 0.24
216 0.28
217 0.28
218 0.31
219 0.31
220 0.3
221 0.25
222 0.23
223 0.24
224 0.23
225 0.2
226 0.17
227 0.19
228 0.19
229 0.2
230 0.25
231 0.25
232 0.25
233 0.31
234 0.36
235 0.42
236 0.45
237 0.52
238 0.52
239 0.53
240 0.56
241 0.58
242 0.61
243 0.56
244 0.57
245 0.53
246 0.49
247 0.44
248 0.4
249 0.39
250 0.32
251 0.3
252 0.28
253 0.24
254 0.24
255 0.27
256 0.29
257 0.27
258 0.29
259 0.32
260 0.31
261 0.38
262 0.39
263 0.43
264 0.46
265 0.45
266 0.46
267 0.47
268 0.45
269 0.39
270 0.41
271 0.34
272 0.31
273 0.28
274 0.23
275 0.19
276 0.19
277 0.17
278 0.14
279 0.15
280 0.11
281 0.12
282 0.13
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.14
295 0.15
296 0.16
297 0.23
298 0.24
299 0.31
300 0.41
301 0.48
302 0.44
303 0.52
304 0.59
305 0.56
306 0.58
307 0.55
308 0.52
309 0.45
310 0.48
311 0.42
312 0.39
313 0.41
314 0.4
315 0.38
316 0.35
317 0.39
318 0.38
319 0.44
320 0.46
321 0.43
322 0.46
323 0.45
324 0.48
325 0.45
326 0.45
327 0.38
328 0.34
329 0.33
330 0.28
331 0.27
332 0.2
333 0.23
334 0.19
335 0.2
336 0.2
337 0.18
338 0.18
339 0.23
340 0.26
341 0.22
342 0.27
343 0.29
344 0.29
345 0.3
346 0.31
347 0.3
348 0.29
349 0.28
350 0.24
351 0.23
352 0.2
353 0.19
354 0.2
355 0.19
356 0.19
357 0.2
358 0.18
359 0.16
360 0.17
361 0.17
362 0.15
363 0.11
364 0.13
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.12
369 0.12
370 0.12
371 0.14
372 0.11
373 0.12
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.1
379 0.08
380 0.08
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.08
404 0.09
405 0.1
406 0.11
407 0.11
408 0.1
409 0.11
410 0.11
411 0.12
412 0.11
413 0.1
414 0.1
415 0.11
416 0.11
417 0.1
418 0.09
419 0.11
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.08
424 0.07
425 0.08
426 0.09
427 0.07
428 0.07
429 0.08
430 0.11
431 0.13
432 0.14
433 0.14
434 0.14
435 0.13
436 0.17
437 0.17
438 0.18
439 0.17
440 0.18
441 0.17
442 0.19
443 0.2
444 0.18
445 0.18
446 0.15
447 0.15
448 0.14
449 0.14
450 0.12
451 0.11
452 0.12
453 0.1
454 0.1
455 0.09
456 0.09
457 0.11
458 0.11
459 0.1
460 0.07
461 0.08
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.08
466 0.09
467 0.1
468 0.1
469 0.1
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.09
474 0.08
475 0.08
476 0.09
477 0.1
478 0.1
479 0.11
480 0.11
481 0.13
482 0.13
483 0.13
484 0.18
485 0.23
486 0.23
487 0.26
488 0.31
489 0.37
490 0.46
491 0.54
492 0.57
493 0.59
494 0.66
495 0.67
496 0.64
497 0.56
498 0.49
499 0.45
500 0.4
501 0.32
502 0.27
503 0.26
504 0.29
505 0.31
506 0.35
507 0.36
508 0.39
509 0.42
510 0.46
511 0.47
512 0.43
513 0.44
514 0.41
515 0.37
516 0.38
517 0.35
518 0.28
519 0.24
520 0.22
521 0.2
522 0.18
523 0.17
524 0.12
525 0.1
526 0.11
527 0.11
528 0.11
529 0.12
530 0.11
531 0.17
532 0.18
533 0.18
534 0.21
535 0.23
536 0.26
537 0.26
538 0.28
539 0.26
540 0.25
541 0.27
542 0.23
543 0.22
544 0.2
545 0.18
546 0.16
547 0.11
548 0.12
549 0.09
550 0.1
551 0.1
552 0.11
553 0.12
554 0.12
555 0.14
556 0.14
557 0.2
558 0.21
559 0.24
560 0.26
561 0.32
562 0.37
563 0.46
564 0.46
565 0.43
566 0.44
567 0.42
568 0.42
569 0.44
570 0.43
571 0.38
572 0.38
573 0.39
574 0.39
575 0.39
576 0.36
577 0.34
578 0.34
579 0.32
580 0.32
581 0.28
582 0.3
583 0.27
584 0.27
585 0.23
586 0.2
587 0.18
588 0.18
589 0.22
590 0.22
591 0.24
592 0.23
593 0.2
594 0.21
595 0.19
596 0.24
597 0.2
598 0.18
599 0.16
600 0.17
601 0.19
602 0.18
603 0.18
604 0.13
605 0.13
606 0.15
607 0.16
608 0.14
609 0.14
610 0.13
611 0.15
612 0.14
613 0.12
614 0.12
615 0.1
616 0.11
617 0.1
618 0.09
619 0.06
620 0.07
621 0.07
622 0.07
623 0.08
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.09
628 0.09
629 0.11
630 0.12
631 0.1
632 0.13
633 0.14
634 0.14
635 0.15
636 0.14
637 0.14
638 0.13
639 0.21
640 0.23
641 0.27
642 0.32
643 0.32
644 0.36
645 0.42
646 0.45
647 0.39
648 0.35
649 0.35
650 0.29
651 0.27
652 0.22
653 0.16
654 0.13
655 0.11
656 0.1
657 0.06
658 0.07
659 0.07
660 0.08
661 0.12
662 0.12
663 0.13
664 0.18
665 0.22
666 0.24
667 0.25
668 0.25
669 0.22
670 0.22
671 0.21
672 0.16
673 0.14
674 0.11
675 0.11
676 0.1
677 0.12
678 0.12
679 0.13
680 0.13
681 0.12
682 0.11
683 0.1
684 0.09
685 0.07
686 0.06
687 0.05
688 0.05
689 0.06
690 0.07
691 0.09
692 0.14
693 0.17
694 0.22
695 0.28
696 0.38
697 0.45
698 0.52
699 0.61
700 0.61
701 0.66
702 0.68
703 0.67
704 0.61
705 0.55
706 0.49
707 0.4
708 0.41
709 0.37
710 0.33
711 0.3
712 0.29
713 0.31
714 0.37
715 0.38
716 0.37
717 0.35
718 0.34
719 0.37
720 0.34
721 0.32
722 0.26
723 0.25
724 0.21
725 0.22
726 0.22
727 0.25
728 0.32
729 0.31
730 0.32
731 0.31
732 0.31
733 0.34
734 0.35
735 0.29
736 0.22
737 0.2
738 0.2
739 0.19
740 0.17
741 0.13
742 0.08
743 0.08
744 0.09
745 0.1
746 0.14
747 0.14
748 0.16
749 0.17
750 0.2
751 0.2
752 0.19
753 0.2
754 0.17
755 0.22
756 0.2
757 0.19
758 0.16
759 0.2
760 0.22
761 0.19
762 0.17
763 0.13
764 0.14
765 0.13
766 0.14
767 0.1
768 0.09
769 0.1
770 0.1
771 0.1
772 0.09
773 0.1
774 0.08
775 0.08
776 0.08
777 0.07
778 0.06
779 0.06
780 0.06
781 0.06
782 0.06
783 0.07
784 0.08
785 0.08
786 0.08
787 0.09
788 0.1
789 0.1
790 0.11
791 0.1
792 0.09
793 0.1
794 0.12
795 0.11
796 0.11
797 0.11
798 0.11
799 0.11
800 0.13
801 0.12
802 0.11
803 0.11
804 0.1
805 0.1
806 0.08
807 0.07
808 0.06
809 0.06
810 0.07
811 0.06
812 0.06
813 0.05
814 0.06
815 0.06
816 0.06
817 0.06
818 0.07
819 0.09
820 0.11
821 0.14
822 0.17
823 0.25
824 0.3
825 0.32
826 0.32
827 0.33
828 0.32
829 0.32
830 0.31
831 0.24
832 0.19
833 0.17
834 0.16
835 0.14
836 0.13
837 0.12
838 0.1
839 0.09
840 0.1
841 0.11
842 0.13
843 0.13
844 0.13
845 0.15
846 0.17
847 0.19
848 0.2
849 0.22
850 0.21
851 0.24
852 0.25
853 0.25
854 0.28
855 0.29
856 0.28
857 0.26
858 0.27
859 0.23
860 0.21