Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2E4F8

Protein Details
Accession A0A1Y2E4F8    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-127DVPLTKRKPKLPPKASETDMHydrophilic
153-177AAAREAKQAKQRKPAPKKSIKDESDHydrophilic
763-784VEEERKKISKKFEKDNQKRVADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-173KRKSIENAAAREAKQAKQRKPAPKKSIK
214-243IRKKKTALATKAKPTKATPAKKVPAKSAKK
382-397RKARPGAEKKAEKAEK
428-442RGRGEHPKTGKVKKR
769-774KISKKF
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13.5, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011010  DNA_brk_join_enz  
IPR013034  DNA_topo_DNA_db_N_dom1  
IPR013030  DNA_topo_DNA_db_N_dom2  
IPR001631  TopoI  
IPR025834  TopoI_C_dom  
IPR014711  TopoI_cat_a-hlx-sub_euk  
IPR014727  TopoI_cat_a/b-sub_euk  
IPR013500  TopoI_cat_euk  
IPR008336  TopoI_DNA-bd_euk  
IPR036202  TopoI_DNA-bd_euk_N_sf  
IPR013499  TopoI_euk  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003917  F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity  
GO:0006265  P:DNA topological change  
Pfam View protein in Pfam  
PF14370  Topo_C_assoc  
PF01028  Topoisom_I  
PF02919  Topoisom_I_N  
CDD cd00659  Topo_IB_C  
cd03488  Topoisomer_IB_N_htopoI_like  
Amino Acid Sequences MSSDYSSDDMPLARPNGHLSATTISKAEDKAMDRGNSRAKSLVAPVSIRHGPIKDEHAMDIDSPPVNGNKRKSRSSFNHTVSYKDESDSEDGPMTKRQKADSDDSDDDVPLTKRKPKLPPKASETDMLDIDDSDDDEPLNVKLAQKRKSIENAAAREAKQAKQRKPAPKKSIKDESDDDLPLSRAKPAKRQSNGTAGKSNGVKKDIDSDSDAPIRKKKTALATKAKPTKATPAKKVPAKSAKKEQSEDPGDGEEGEEEYRWWDAPKKEDDSIKWNMLEHNGVLFPPEYEPLPKNVRLLYDGTPVNLHIEAEEVAGFFGAMLNSTHNVENPVFQKNFFGDFCEIITRTGGAKDKQGNKVAIKEFSKLDFKQIFEYYQAKSDARKARPGAEKKAEKAEKDKAEAAYMFCKWDGRKEKVGNFRVEPPGLFRGRGEHPKTGKVKKRVLPEQITINIGKDAEVPPAPAGHKWKAVQHDNKATWLAMWQENINGAYKYVMLAANSSVKGQSDFKKFEKARNLKNHIARIRKDYQTELHSSLMQDRQRATAMYLIDKLALRAGNEKDAENEAETVGCCSLKFEHVTLKAPDTVIFDFLGKDSIRYYDEVRVEKQVFKNFQHFKKPPKGEGDDLFDRLTTTQLNKHLSSYMPGLTAKVFRTYNASYTMGKLLKDIKVAPNMTVAEKVNLYNQANREVAVLCNHKRTVGAGHEAQMEKLGDRIKGLKFQQWRTKLMLIDVDPKQKKKKGADFFKLDEDLDDAWIQEHLNFLVEEERKKISKKFEKDNQKRVADGEKPMPDKELKERLKAADDLGKQYKKEYKSQKVEAEGKGPTVEKIEANIKKIDDRIKNFELQAADREGNKEVALGTSKINYIDPRLTVVFSKKFDVPIEKLFSKTLREKFNWAIKSVEDEENWEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.24
3 0.26
4 0.26
5 0.25
6 0.22
7 0.25
8 0.26
9 0.26
10 0.23
11 0.21
12 0.23
13 0.23
14 0.23
15 0.24
16 0.24
17 0.3
18 0.36
19 0.39
20 0.38
21 0.44
22 0.5
23 0.46
24 0.45
25 0.42
26 0.36
27 0.35
28 0.38
29 0.37
30 0.31
31 0.31
32 0.3
33 0.34
34 0.34
35 0.33
36 0.32
37 0.28
38 0.27
39 0.29
40 0.34
41 0.33
42 0.32
43 0.31
44 0.3
45 0.29
46 0.28
47 0.24
48 0.22
49 0.17
50 0.16
51 0.16
52 0.19
53 0.25
54 0.31
55 0.39
56 0.46
57 0.52
58 0.61
59 0.64
60 0.69
61 0.72
62 0.74
63 0.76
64 0.71
65 0.74
66 0.66
67 0.64
68 0.58
69 0.55
70 0.47
71 0.37
72 0.33
73 0.27
74 0.3
75 0.28
76 0.26
77 0.23
78 0.23
79 0.24
80 0.3
81 0.31
82 0.31
83 0.33
84 0.35
85 0.38
86 0.43
87 0.49
88 0.48
89 0.53
90 0.51
91 0.5
92 0.48
93 0.41
94 0.35
95 0.3
96 0.25
97 0.21
98 0.23
99 0.28
100 0.33
101 0.41
102 0.52
103 0.59
104 0.69
105 0.74
106 0.79
107 0.79
108 0.81
109 0.75
110 0.71
111 0.64
112 0.56
113 0.46
114 0.38
115 0.3
116 0.22
117 0.21
118 0.15
119 0.12
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.07
126 0.1
127 0.1
128 0.14
129 0.21
130 0.29
131 0.35
132 0.4
133 0.43
134 0.47
135 0.54
136 0.55
137 0.57
138 0.58
139 0.55
140 0.56
141 0.57
142 0.51
143 0.5
144 0.49
145 0.45
146 0.45
147 0.5
148 0.51
149 0.57
150 0.66
151 0.69
152 0.77
153 0.83
154 0.85
155 0.87
156 0.87
157 0.86
158 0.87
159 0.79
160 0.74
161 0.67
162 0.61
163 0.55
164 0.48
165 0.4
166 0.3
167 0.28
168 0.24
169 0.2
170 0.21
171 0.21
172 0.23
173 0.32
174 0.4
175 0.49
176 0.52
177 0.59
178 0.59
179 0.65
180 0.68
181 0.64
182 0.6
183 0.51
184 0.5
185 0.48
186 0.48
187 0.41
188 0.37
189 0.32
190 0.28
191 0.35
192 0.32
193 0.3
194 0.3
195 0.28
196 0.3
197 0.34
198 0.37
199 0.32
200 0.37
201 0.37
202 0.35
203 0.35
204 0.36
205 0.42
206 0.48
207 0.55
208 0.59
209 0.63
210 0.7
211 0.77
212 0.73
213 0.66
214 0.58
215 0.59
216 0.59
217 0.59
218 0.58
219 0.6
220 0.66
221 0.69
222 0.7
223 0.69
224 0.69
225 0.69
226 0.69
227 0.69
228 0.7
229 0.7
230 0.7
231 0.64
232 0.63
233 0.59
234 0.52
235 0.43
236 0.35
237 0.29
238 0.26
239 0.23
240 0.13
241 0.1
242 0.09
243 0.07
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.14
250 0.17
251 0.23
252 0.29
253 0.33
254 0.36
255 0.4
256 0.41
257 0.41
258 0.43
259 0.4
260 0.35
261 0.31
262 0.29
263 0.26
264 0.25
265 0.19
266 0.15
267 0.12
268 0.11
269 0.12
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.11
276 0.13
277 0.17
278 0.22
279 0.23
280 0.24
281 0.24
282 0.25
283 0.24
284 0.26
285 0.23
286 0.24
287 0.23
288 0.21
289 0.2
290 0.19
291 0.19
292 0.15
293 0.13
294 0.07
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.03
304 0.04
305 0.03
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.06
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.11
314 0.11
315 0.14
316 0.16
317 0.21
318 0.2
319 0.2
320 0.21
321 0.19
322 0.22
323 0.18
324 0.2
325 0.15
326 0.15
327 0.16
328 0.17
329 0.16
330 0.13
331 0.13
332 0.1
333 0.1
334 0.12
335 0.15
336 0.14
337 0.18
338 0.25
339 0.32
340 0.37
341 0.41
342 0.42
343 0.4
344 0.46
345 0.43
346 0.41
347 0.36
348 0.33
349 0.3
350 0.29
351 0.33
352 0.26
353 0.31
354 0.28
355 0.28
356 0.3
357 0.29
358 0.27
359 0.25
360 0.28
361 0.21
362 0.22
363 0.23
364 0.19
365 0.19
366 0.27
367 0.32
368 0.32
369 0.38
370 0.36
371 0.41
372 0.5
373 0.55
374 0.54
375 0.55
376 0.56
377 0.52
378 0.6
379 0.55
380 0.48
381 0.47
382 0.48
383 0.41
384 0.41
385 0.42
386 0.32
387 0.31
388 0.3
389 0.26
390 0.2
391 0.18
392 0.15
393 0.12
394 0.14
395 0.13
396 0.21
397 0.27
398 0.29
399 0.36
400 0.4
401 0.47
402 0.55
403 0.6
404 0.55
405 0.5
406 0.49
407 0.45
408 0.4
409 0.33
410 0.27
411 0.27
412 0.24
413 0.22
414 0.17
415 0.19
416 0.22
417 0.31
418 0.31
419 0.32
420 0.33
421 0.4
422 0.47
423 0.52
424 0.55
425 0.55
426 0.6
427 0.58
428 0.65
429 0.64
430 0.65
431 0.61
432 0.55
433 0.51
434 0.45
435 0.41
436 0.33
437 0.27
438 0.19
439 0.15
440 0.13
441 0.1
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.08
447 0.1
448 0.1
449 0.11
450 0.15
451 0.15
452 0.18
453 0.19
454 0.23
455 0.28
456 0.35
457 0.4
458 0.41
459 0.47
460 0.44
461 0.44
462 0.41
463 0.35
464 0.27
465 0.22
466 0.18
467 0.12
468 0.12
469 0.11
470 0.1
471 0.11
472 0.12
473 0.11
474 0.08
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.06
482 0.07
483 0.07
484 0.1
485 0.1
486 0.1
487 0.09
488 0.09
489 0.1
490 0.13
491 0.19
492 0.22
493 0.27
494 0.28
495 0.38
496 0.38
497 0.43
498 0.51
499 0.51
500 0.55
501 0.61
502 0.67
503 0.64
504 0.68
505 0.7
506 0.66
507 0.66
508 0.59
509 0.56
510 0.55
511 0.51
512 0.48
513 0.42
514 0.4
515 0.36
516 0.38
517 0.32
518 0.27
519 0.25
520 0.23
521 0.24
522 0.26
523 0.23
524 0.21
525 0.2
526 0.2
527 0.2
528 0.2
529 0.18
530 0.15
531 0.15
532 0.14
533 0.14
534 0.13
535 0.14
536 0.13
537 0.12
538 0.11
539 0.11
540 0.1
541 0.14
542 0.15
543 0.17
544 0.18
545 0.18
546 0.18
547 0.19
548 0.19
549 0.15
550 0.14
551 0.1
552 0.1
553 0.09
554 0.09
555 0.07
556 0.07
557 0.06
558 0.06
559 0.07
560 0.09
561 0.11
562 0.11
563 0.17
564 0.19
565 0.24
566 0.24
567 0.25
568 0.24
569 0.23
570 0.23
571 0.2
572 0.18
573 0.15
574 0.14
575 0.12
576 0.11
577 0.11
578 0.13
579 0.1
580 0.1
581 0.09
582 0.1
583 0.11
584 0.13
585 0.15
586 0.18
587 0.23
588 0.25
589 0.26
590 0.3
591 0.31
592 0.35
593 0.37
594 0.39
595 0.38
596 0.39
597 0.47
598 0.49
599 0.52
600 0.58
601 0.58
602 0.59
603 0.65
604 0.67
605 0.63
606 0.64
607 0.63
608 0.57
609 0.56
610 0.55
611 0.47
612 0.43
613 0.38
614 0.3
615 0.25
616 0.21
617 0.18
618 0.12
619 0.12
620 0.15
621 0.2
622 0.25
623 0.25
624 0.26
625 0.27
626 0.25
627 0.25
628 0.23
629 0.18
630 0.16
631 0.15
632 0.15
633 0.15
634 0.17
635 0.16
636 0.18
637 0.17
638 0.16
639 0.22
640 0.23
641 0.24
642 0.25
643 0.27
644 0.23
645 0.24
646 0.3
647 0.25
648 0.24
649 0.23
650 0.24
651 0.23
652 0.25
653 0.26
654 0.25
655 0.3
656 0.3
657 0.29
658 0.28
659 0.28
660 0.26
661 0.27
662 0.23
663 0.18
664 0.18
665 0.18
666 0.17
667 0.21
668 0.22
669 0.23
670 0.24
671 0.28
672 0.27
673 0.27
674 0.25
675 0.2
676 0.2
677 0.21
678 0.26
679 0.24
680 0.29
681 0.29
682 0.28
683 0.27
684 0.28
685 0.27
686 0.25
687 0.28
688 0.24
689 0.26
690 0.31
691 0.31
692 0.29
693 0.26
694 0.22
695 0.17
696 0.18
697 0.18
698 0.14
699 0.15
700 0.2
701 0.2
702 0.27
703 0.29
704 0.33
705 0.38
706 0.47
707 0.55
708 0.55
709 0.57
710 0.55
711 0.57
712 0.51
713 0.45
714 0.42
715 0.34
716 0.37
717 0.38
718 0.42
719 0.43
720 0.48
721 0.54
722 0.54
723 0.6
724 0.62
725 0.68
726 0.69
727 0.74
728 0.78
729 0.77
730 0.74
731 0.72
732 0.64
733 0.54
734 0.43
735 0.35
736 0.26
737 0.2
738 0.17
739 0.11
740 0.1
741 0.11
742 0.1
743 0.08
744 0.09
745 0.07
746 0.09
747 0.08
748 0.08
749 0.15
750 0.18
751 0.19
752 0.21
753 0.25
754 0.27
755 0.31
756 0.36
757 0.4
758 0.47
759 0.54
760 0.62
761 0.67
762 0.76
763 0.83
764 0.88
765 0.86
766 0.79
767 0.71
768 0.64
769 0.62
770 0.56
771 0.51
772 0.49
773 0.47
774 0.47
775 0.46
776 0.47
777 0.41
778 0.4
779 0.43
780 0.46
781 0.43
782 0.46
783 0.5
784 0.5
785 0.52
786 0.49
787 0.44
788 0.41
789 0.4
790 0.41
791 0.45
792 0.46
793 0.41
794 0.46
795 0.5
796 0.46
797 0.53
798 0.56
799 0.58
800 0.64
801 0.72
802 0.72
803 0.74
804 0.77
805 0.71
806 0.65
807 0.55
808 0.47
809 0.42
810 0.36
811 0.28
812 0.24
813 0.23
814 0.18
815 0.21
816 0.29
817 0.3
818 0.33
819 0.35
820 0.34
821 0.35
822 0.4
823 0.45
824 0.44
825 0.47
826 0.53
827 0.53
828 0.57
829 0.54
830 0.53
831 0.47
832 0.4
833 0.37
834 0.34
835 0.32
836 0.29
837 0.31
838 0.29
839 0.27
840 0.24
841 0.21
842 0.15
843 0.16
844 0.18
845 0.17
846 0.16
847 0.18
848 0.19
849 0.19
850 0.22
851 0.21
852 0.22
853 0.25
854 0.24
855 0.27
856 0.27
857 0.27
858 0.29
859 0.35
860 0.36
861 0.34
862 0.38
863 0.36
864 0.38
865 0.41
866 0.44
867 0.41
868 0.43
869 0.48
870 0.46
871 0.45
872 0.46
873 0.44
874 0.44
875 0.48
876 0.48
877 0.49
878 0.5
879 0.56
880 0.61
881 0.67
882 0.63
883 0.56
884 0.51
885 0.43
886 0.47
887 0.45
888 0.41
889 0.32