Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2DKZ3

Protein Details
Accession A0A1Y2DKZ3    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
64-90VSRQSPHGWRVRKRGMKPRFNSRRILKHydrophilic
277-298SDDQGKMRRKPGPRKRDPIVNABasic
306-331TVLITQPKRGRGRPRKESPRDSTENRHydrophilic
357-385PADGHRPINKPKQPRGRSNNRRQSHDETPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-83RVRKRGMKPRF
282-292KMRRKPGPRKR
312-381PKRGRGRPRKESPRDSTENRGKETKLFNPLARQRGRPRKVMIEEAPADGHRPINKPKQPRGRSNNRRQSH
386-388PPR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 13, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MVLQTRCPRRPPPQLLLDVHYAVVPNEILSLSRTLPLSPSILHLATVLPQNMTRDIINHKRCIVSRQSPHGWRVRKRGMKPRFNSRRILKWDNLTQFESQIKALIQQQNDTIETLREHIGTLEKQNDYLKGRLNGMEETLGSSDDYATELGRGGAFIIAIFKSLATSNYPAHRRGVLGCLRDEKTRACAARAIFLGRVGKGHKFRVWLLHGQRFLKTPSISVYEYLGLPDDTTNTPDLREVIRSLPPFVQRCLRKRTREMKSNIKEDDFNVVDEDTSDDQGKMRRKPGPRKRDPIVNADPESDPKTVLITQPKRGRGRPRKESPRDSTENRGKETKLFNPLARQRGRPRKVMIEEAPADGHRPINKPKQPRGRSNNRRQSHDETPPPRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.75
3 0.7
4 0.65
5 0.55
6 0.46
7 0.37
8 0.29
9 0.2
10 0.18
11 0.13
12 0.09
13 0.09
14 0.08
15 0.08
16 0.1
17 0.12
18 0.11
19 0.14
20 0.15
21 0.14
22 0.16
23 0.17
24 0.18
25 0.16
26 0.18
27 0.19
28 0.19
29 0.19
30 0.18
31 0.16
32 0.17
33 0.2
34 0.18
35 0.15
36 0.16
37 0.18
38 0.2
39 0.21
40 0.18
41 0.17
42 0.25
43 0.34
44 0.39
45 0.41
46 0.42
47 0.45
48 0.46
49 0.49
50 0.5
51 0.5
52 0.51
53 0.56
54 0.62
55 0.63
56 0.68
57 0.7
58 0.7
59 0.68
60 0.7
61 0.72
62 0.72
63 0.76
64 0.8
65 0.82
66 0.83
67 0.82
68 0.84
69 0.84
70 0.8
71 0.8
72 0.76
73 0.75
74 0.73
75 0.74
76 0.67
77 0.63
78 0.67
79 0.63
80 0.61
81 0.54
82 0.46
83 0.41
84 0.38
85 0.32
86 0.24
87 0.2
88 0.15
89 0.16
90 0.22
91 0.24
92 0.23
93 0.23
94 0.25
95 0.26
96 0.26
97 0.24
98 0.18
99 0.14
100 0.14
101 0.15
102 0.14
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.14
107 0.14
108 0.18
109 0.21
110 0.2
111 0.21
112 0.22
113 0.26
114 0.25
115 0.26
116 0.28
117 0.25
118 0.27
119 0.27
120 0.28
121 0.24
122 0.21
123 0.19
124 0.14
125 0.13
126 0.12
127 0.1
128 0.08
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.04
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.07
152 0.08
153 0.1
154 0.12
155 0.18
156 0.21
157 0.22
158 0.23
159 0.23
160 0.22
161 0.21
162 0.25
163 0.23
164 0.23
165 0.23
166 0.26
167 0.27
168 0.27
169 0.27
170 0.21
171 0.21
172 0.23
173 0.23
174 0.19
175 0.21
176 0.2
177 0.22
178 0.22
179 0.19
180 0.15
181 0.16
182 0.16
183 0.13
184 0.14
185 0.12
186 0.16
187 0.18
188 0.21
189 0.21
190 0.22
191 0.23
192 0.28
193 0.3
194 0.32
195 0.35
196 0.37
197 0.39
198 0.38
199 0.38
200 0.33
201 0.32
202 0.29
203 0.23
204 0.18
205 0.17
206 0.2
207 0.19
208 0.18
209 0.18
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.12
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.07
219 0.09
220 0.1
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.12
225 0.1
226 0.11
227 0.12
228 0.13
229 0.18
230 0.18
231 0.2
232 0.22
233 0.27
234 0.28
235 0.28
236 0.34
237 0.36
238 0.42
239 0.5
240 0.55
241 0.56
242 0.64
243 0.72
244 0.73
245 0.76
246 0.77
247 0.78
248 0.77
249 0.77
250 0.7
251 0.61
252 0.53
253 0.44
254 0.45
255 0.34
256 0.27
257 0.21
258 0.18
259 0.15
260 0.14
261 0.17
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.18
268 0.25
269 0.27
270 0.32
271 0.38
272 0.47
273 0.59
274 0.68
275 0.73
276 0.77
277 0.8
278 0.79
279 0.82
280 0.76
281 0.74
282 0.72
283 0.67
284 0.58
285 0.53
286 0.48
287 0.41
288 0.41
289 0.32
290 0.24
291 0.17
292 0.18
293 0.17
294 0.21
295 0.28
296 0.3
297 0.39
298 0.46
299 0.54
300 0.58
301 0.64
302 0.7
303 0.71
304 0.77
305 0.78
306 0.82
307 0.85
308 0.89
309 0.91
310 0.88
311 0.86
312 0.83
313 0.78
314 0.77
315 0.75
316 0.71
317 0.66
318 0.62
319 0.54
320 0.53
321 0.55
322 0.51
323 0.51
324 0.49
325 0.48
326 0.53
327 0.6
328 0.63
329 0.61
330 0.62
331 0.64
332 0.7
333 0.73
334 0.71
335 0.69
336 0.7
337 0.7
338 0.71
339 0.64
340 0.62
341 0.58
342 0.52
343 0.48
344 0.39
345 0.35
346 0.27
347 0.28
348 0.24
349 0.28
350 0.35
351 0.44
352 0.51
353 0.59
354 0.69
355 0.75
356 0.79
357 0.85
358 0.87
359 0.87
360 0.91
361 0.92
362 0.93
363 0.89
364 0.87
365 0.84
366 0.81
367 0.79
368 0.78
369 0.77