Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2DDL5

Protein Details
Accession A0A1Y2DDL5    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-148APAAEEKKERKKRVHDPNAPKRPLTBasic
272-295EEAVKTPKPKATRKRKSTAAVEVEHydrophilic
302-328VKTATPVASPEKKRKRQSKGAAEPVPEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-139KKERKKRVHD
278-287PKPKATRKRK
311-340PEKKRKRQSKGAAEPVPEEPKKSGRKKKSA
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 10, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MARPKKNAAAAPAAPAQVPVAAAPAPIPAMPQPAPLPILQALPDNNAATLVINRAEYVRVRDSVYARLSTIQDLLRSFAADYVRQSNLLLGEPTSLDNVPSLHALASLDHAAFGFAPLAAEAVAPAAEEKKERKKRVHDPNAPKRPLTPYFLYMQTARPIIANDLGEEAPKGAVQEEGQRRWASMTPQEKMAWNNAYQFNLRLYNARVHSYKAGNALAREMSDQDALTYADGNAIPHPTVSGVEDAALPNDHDAIAEQLQLAAPVSAPASPEEAVKTPKPKATRKRKSTAAVEVEEGEASAVKTATPVASPEKKRKRQSKGAAEPVPEEPKKSGRKKKSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.29
3 0.24
4 0.16
5 0.15
6 0.1
7 0.09
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.09
13 0.08
14 0.1
15 0.09
16 0.15
17 0.15
18 0.18
19 0.18
20 0.2
21 0.22
22 0.2
23 0.22
24 0.18
25 0.19
26 0.16
27 0.19
28 0.17
29 0.19
30 0.21
31 0.18
32 0.17
33 0.15
34 0.15
35 0.12
36 0.12
37 0.11
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.11
42 0.13
43 0.14
44 0.19
45 0.2
46 0.21
47 0.23
48 0.27
49 0.28
50 0.32
51 0.33
52 0.29
53 0.26
54 0.28
55 0.27
56 0.24
57 0.25
58 0.2
59 0.19
60 0.18
61 0.19
62 0.16
63 0.16
64 0.15
65 0.14
66 0.15
67 0.14
68 0.16
69 0.19
70 0.19
71 0.19
72 0.19
73 0.17
74 0.16
75 0.16
76 0.14
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.11
82 0.09
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.04
114 0.05
115 0.07
116 0.12
117 0.23
118 0.33
119 0.39
120 0.46
121 0.55
122 0.65
123 0.74
124 0.8
125 0.8
126 0.82
127 0.87
128 0.9
129 0.82
130 0.72
131 0.63
132 0.58
133 0.51
134 0.45
135 0.36
136 0.28
137 0.29
138 0.3
139 0.29
140 0.24
141 0.22
142 0.19
143 0.17
144 0.14
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.1
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.13
163 0.17
164 0.18
165 0.21
166 0.21
167 0.21
168 0.22
169 0.24
170 0.18
171 0.22
172 0.26
173 0.24
174 0.26
175 0.27
176 0.27
177 0.27
178 0.28
179 0.23
180 0.19
181 0.22
182 0.22
183 0.22
184 0.21
185 0.21
186 0.19
187 0.19
188 0.18
189 0.16
190 0.16
191 0.21
192 0.22
193 0.24
194 0.23
195 0.23
196 0.27
197 0.26
198 0.26
199 0.23
200 0.23
201 0.21
202 0.21
203 0.2
204 0.16
205 0.15
206 0.14
207 0.12
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.08
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.09
257 0.1
258 0.11
259 0.13
260 0.15
261 0.19
262 0.23
263 0.28
264 0.3
265 0.35
266 0.42
267 0.5
268 0.58
269 0.65
270 0.72
271 0.76
272 0.8
273 0.83
274 0.84
275 0.81
276 0.8
277 0.75
278 0.67
279 0.59
280 0.51
281 0.43
282 0.35
283 0.27
284 0.17
285 0.11
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.11
295 0.18
296 0.28
297 0.35
298 0.46
299 0.56
300 0.65
301 0.75
302 0.83
303 0.85
304 0.86
305 0.9
306 0.9
307 0.9
308 0.91
309 0.86
310 0.79
311 0.72
312 0.67
313 0.66
314 0.55
315 0.47
316 0.41
317 0.44
318 0.52
319 0.59
320 0.64