FuNGI

A0A1Y2E5W7

Protein Details

Accession

A0A1Y2E5W7

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
24-44	QGKVRAPGPRRPKKDVADDAP	Basic
404-426	KQQTSFCRLHKRKSAQRDRSAQG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
28-36	RAPGPRRPK
175-212	KKGRASYGKASQKPPQRLAKSKVPREESLSPKKAFKRP
298-306	KKTRARKQK

Subcellular Location(s)

mito_nucl 13.166, nucl 13, mito 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MSYSKRHIGFSRHAHAPSLLKTVQGKVRAPGPRRPKKDVADDAPPMSSSDEDESFFGPTVKNEPSGSGNHGTPTTRYDSPHAKYQKPMTQKESVDSDSDDEIYSLKQNIKPTIFSSRDKSKQGDTSVNYSKPPTTRRSTAQASSASSKRSAQEMCKDSADHMTNDIGFVKSQSSKKGRASYGKASQKPPQRLAKSKVPREESLSPKKAFKRPQISLSPSPQKPTAPKRTQGPFVAEYSPMRNPAPSRYRPPMLPSDDWPAPEKGVRTKVKPNSDDSTESDQSSKSSIRGVTTNRIAEKKTRARKQKSLVSKEESPPRPVFRRFIKGADLDDDVKEALSTHALKLLDNASDREGTGEALASGDESGSDISIEDTQLFGPRCPMCHAPVDPDMLKKHSNHGRMNIKQQTSFCRLHKRKSAQRDRSAQGYPDIDWVNLEVRLIEHETFIKDILQGARSSYYASLLNDKVDTGQNRTLLKTDDSLTPGYYGPRGLRVMTEFIMRTFSDTVRKRAVEDRLVSARGYTGYVQAVLVPELAIRLIMEDMKVGEEDARVILRDTVELGDFLHEEARDVVVKASDDEED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.53
3	0.5
4	0.44
5	0.42
6	0.35
7	0.33
8	0.34
9	0.38
10	0.4
11	0.42
12	0.41
13	0.37
14	0.45
15	0.5
16	0.52
17	0.55
18	0.6
19	0.64
20	0.7
21	0.75
22	0.76
23	0.75
24	0.81
25	0.81
26	0.76
27	0.74
28	0.71
29	0.64
30	0.56
31	0.48
32	0.39
33	0.3
34	0.24
35	0.18
36	0.17
37	0.17
38	0.17
39	0.18
40	0.18
41	0.18
42	0.18
43	0.16
44	0.13
45	0.13
46	0.17
47	0.18
48	0.2
49	0.19
50	0.21
51	0.23
52	0.25
53	0.29
54	0.28
55	0.27
56	0.26
57	0.28
58	0.26
59	0.24
60	0.26
61	0.26
62	0.25
63	0.27
64	0.31
65	0.37
66	0.4
67	0.48
68	0.51
69	0.49
70	0.54
71	0.6
72	0.61
73	0.62
74	0.65
75	0.62
76	0.63
77	0.61
78	0.58
79	0.55
80	0.49
81	0.42
82	0.36
83	0.32
84	0.25
85	0.24
86	0.2
87	0.14
88	0.13
89	0.12
90	0.13
91	0.13
92	0.17
93	0.2
94	0.24
95	0.3
96	0.32
97	0.33
98	0.34
99	0.41
100	0.41
101	0.42
102	0.44
103	0.48
104	0.52
105	0.54
106	0.54
107	0.51
108	0.52
109	0.53
110	0.54
111	0.47
112	0.49
113	0.52
114	0.5
115	0.45
116	0.41
117	0.4
118	0.37
119	0.4
120	0.39
121	0.39
122	0.42
123	0.46
124	0.51
125	0.53
126	0.51
127	0.51
128	0.47
129	0.44
130	0.44
131	0.42
132	0.36
133	0.32
134	0.32
135	0.27
136	0.29
137	0.29
138	0.29
139	0.36
140	0.37
141	0.38
142	0.38
143	0.37
144	0.33
145	0.36
146	0.33
147	0.24
148	0.22
149	0.2
150	0.19
151	0.19
152	0.19
153	0.12
154	0.1
155	0.1
156	0.11
157	0.16
158	0.18
159	0.25
160	0.29
161	0.35
162	0.42
163	0.48
164	0.51
165	0.54
166	0.58
167	0.58
168	0.63
169	0.66
170	0.65
171	0.62
172	0.63
173	0.64
174	0.65
175	0.64
176	0.64
177	0.62
178	0.65
179	0.67
180	0.71
181	0.72
182	0.72
183	0.72
184	0.68
185	0.62
186	0.61
187	0.62
188	0.61
189	0.61
190	0.6
191	0.54
192	0.55
193	0.6
194	0.61
195	0.61
196	0.61
197	0.61
198	0.58
199	0.64
200	0.65
201	0.66
202	0.64
203	0.64
204	0.64
205	0.55
206	0.54
207	0.48
208	0.43
209	0.44
210	0.48
211	0.51
212	0.47
213	0.51
214	0.55
215	0.58
216	0.6
217	0.55
218	0.51
219	0.42
220	0.38
221	0.36
222	0.29
223	0.26
224	0.24
225	0.22
226	0.19
227	0.17
228	0.16
229	0.16
230	0.23
231	0.3
232	0.32
233	0.37
234	0.41
235	0.43
236	0.42
237	0.45
238	0.45
239	0.42
240	0.39
241	0.35
242	0.36
243	0.34
244	0.34
245	0.33
246	0.26
247	0.21
248	0.2
249	0.19
250	0.18
251	0.26
252	0.27
253	0.29
254	0.37
255	0.44
256	0.5
257	0.51
258	0.51
259	0.46
260	0.46
261	0.45
262	0.41
263	0.41
264	0.34
265	0.33
266	0.28
267	0.25
268	0.22
269	0.21
270	0.17
271	0.1
272	0.11
273	0.11
274	0.12
275	0.15
276	0.18
277	0.21
278	0.23
279	0.25
280	0.25
281	0.26
282	0.26
283	0.26
284	0.33
285	0.37
286	0.43
287	0.49
288	0.57
289	0.63
290	0.7
291	0.73
292	0.73
293	0.74
294	0.72
295	0.7
296	0.65
297	0.63
298	0.6
299	0.61
300	0.56
301	0.5
302	0.45
303	0.44
304	0.44
305	0.42
306	0.43
307	0.39
308	0.44
309	0.41
310	0.4
311	0.4
312	0.36
313	0.34
314	0.31
315	0.27
316	0.21
317	0.18
318	0.17
319	0.13
320	0.11
321	0.09
322	0.07
323	0.05
324	0.07
325	0.08
326	0.07
327	0.11
328	0.12
329	0.12
330	0.13
331	0.14
332	0.13
333	0.14
334	0.15
335	0.12
336	0.12
337	0.12
338	0.12
339	0.11
340	0.09
341	0.08
342	0.07
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.04
347	0.04
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.03
355	0.04
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.1
362	0.11
363	0.1
364	0.15
365	0.15
366	0.17
367	0.2
368	0.22
369	0.2
370	0.25
371	0.26
372	0.25
373	0.27
374	0.3
375	0.27
376	0.29
377	0.28
378	0.26
379	0.29
380	0.25
381	0.31
382	0.34
383	0.41
384	0.41
385	0.48
386	0.55
387	0.56
388	0.65
389	0.64
390	0.59
391	0.54
392	0.53
393	0.51
394	0.48
395	0.49
396	0.45
397	0.49
398	0.51
399	0.56
400	0.63
401	0.67
402	0.69
403	0.74
404	0.81
405	0.8
406	0.84
407	0.84
408	0.77
409	0.73
410	0.67
411	0.57
412	0.5
413	0.41
414	0.33
415	0.29
416	0.27
417	0.21
418	0.18
419	0.18
420	0.15
421	0.13
422	0.13
423	0.08
424	0.07
425	0.1
426	0.12
427	0.11
428	0.11
429	0.12
430	0.14
431	0.14
432	0.14
433	0.12
434	0.1
435	0.13
436	0.14
437	0.15
438	0.14
439	0.15
440	0.16
441	0.15
442	0.17
443	0.14
444	0.13
445	0.14
446	0.15
447	0.19
448	0.18
449	0.19
450	0.18
451	0.18
452	0.18
453	0.21
454	0.22
455	0.23
456	0.26
457	0.29
458	0.31
459	0.32
460	0.32
461	0.29
462	0.29
463	0.25
464	0.24
465	0.23
466	0.24
467	0.24
468	0.22
469	0.21
470	0.2
471	0.19
472	0.18
473	0.17
474	0.15
475	0.19
476	0.2
477	0.19
478	0.2
479	0.21
480	0.24
481	0.22
482	0.25
483	0.2
484	0.2
485	0.22
486	0.19
487	0.2
488	0.19
489	0.2
490	0.26
491	0.3
492	0.35
493	0.39
494	0.4
495	0.4
496	0.45
497	0.51
498	0.49
499	0.48
500	0.5
501	0.47
502	0.48
503	0.44
504	0.37
505	0.31
506	0.24
507	0.23
508	0.17
509	0.14
510	0.14
511	0.15
512	0.14
513	0.14
514	0.14
515	0.13
516	0.12
517	0.09
518	0.08
519	0.08
520	0.08
521	0.06
522	0.05
523	0.06
524	0.07
525	0.07
526	0.07
527	0.08
528	0.09
529	0.1
530	0.1
531	0.09
532	0.1
533	0.09
534	0.1
535	0.11
536	0.12
537	0.11
538	0.12
539	0.14
540	0.13
541	0.13
542	0.14
543	0.14
544	0.13
545	0.13
546	0.12
547	0.12
548	0.12
549	0.12
550	0.14
551	0.12
552	0.13
553	0.13
554	0.15
555	0.15
556	0.15
557	0.16
558	0.15
559	0.16
560	0.16

A0A1Y2E5W7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer