FuNGI

A0A1Y2DLG2

Protein Details

Accession

A0A1Y2DLG2

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
72-91	GKVSTKPSRPSQPARCYLRV	Hydrophilic
591-615	STPTPTPSDRPRRGGRGRGRRGGNA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
200-270	ERKAAKAKEAASAKSAKQSRQESQGVKIKTSEEPKKRGKDSKSEKVDKTAEKEKEKEKEKPKEPVKLLTKK
385-392	SRRSRGKK
600-612	RPRRGGRGRGRRG

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 10.5, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3 cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MSSSNASRKANALIAINANNETTRKMKPPVTGKKVTIRRLPPALTSDEFWTILGDEWREGNGKVDWVSYEPGKVSTKPSRPSQPARCYLRVMKIEDIPSLSDAIQRATWEDAKRSFTDPALVGPPVIENSIYQKVPTGKRRTDPRQGTIDQDPDFMAYLDSLTHPPSSSKDPEADQSGVDEPTKENAKVTSTPLVEYIKERKAAKAKEAASAKSAKQSRQESQGVKIKTSEEPKKRGKDSKSEKVDKTAEKEKEKEKEKPKEPVKLLTKKAAAQEAAEAAKAIAGQIATGKAAEEAVSSAVPKSRRAGIAAAAKILQRDLGLSPGSAHRRARQDAAKAEKAEVVPSKAEASAPSEKATKETKETKDAETPKTAPTGPKAQPAESSRRSRGKKATAAPATDSTKSRENDPPAKPTTGPIILLKKEASKTAETKSNGAASTATVPVASSTSTSTPMPTPPTGPKAAAKVQPASAKAGGQTQAKKSAAQPSQGATRAFVKHANPSQGVTEPLLKQAMEIFGTVTFVEIDKRKGFAYMDFGDYQGLCKAIAASPVSVGQGTVQVLERKEKKPTTPATSVPAISAAAVNDTHTSASTPTPTPSDRPRRGGRGRGRRGGNAAASEANEGGSTPASGAG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.32
3	0.31
4	0.28
5	0.25
6	0.24
7	0.22
8	0.21
9	0.21
10	0.23
11	0.27
12	0.33
13	0.38
14	0.45
15	0.55
16	0.63
17	0.68
18	0.71
19	0.7
20	0.74
21	0.77
22	0.77
23	0.75
24	0.71
25	0.7
26	0.69
27	0.66
28	0.6
29	0.55
30	0.53
31	0.46
32	0.42
33	0.37
34	0.33
35	0.31
36	0.26
37	0.23
38	0.17
39	0.18
40	0.18
41	0.16
42	0.14
43	0.14
44	0.16
45	0.17
46	0.16
47	0.17
48	0.16
49	0.17
50	0.17
51	0.17
52	0.17
53	0.17
54	0.21
55	0.18
56	0.19
57	0.18
58	0.21
59	0.23
60	0.24
61	0.3
62	0.36
63	0.43
64	0.47
65	0.54
66	0.6
67	0.65
68	0.74
69	0.76
70	0.76
71	0.78
72	0.8
73	0.76
74	0.72
75	0.7
76	0.68
77	0.64
78	0.58
79	0.52
80	0.49
81	0.48
82	0.43
83	0.38
84	0.31
85	0.26
86	0.23
87	0.19
88	0.16
89	0.15
90	0.15
91	0.14
92	0.14
93	0.14
94	0.17
95	0.22
96	0.22
97	0.27
98	0.29
99	0.32
100	0.34
101	0.36
102	0.34
103	0.29
104	0.31
105	0.26
106	0.25
107	0.24
108	0.22
109	0.18
110	0.16
111	0.16
112	0.13
113	0.13
114	0.1
115	0.07
116	0.13
117	0.18
118	0.17
119	0.17
120	0.2
121	0.27
122	0.35
123	0.44
124	0.48
125	0.49
126	0.57
127	0.67
128	0.71
129	0.74
130	0.74
131	0.7
132	0.69
133	0.65
134	0.63
135	0.58
136	0.55
137	0.45
138	0.38
139	0.32
140	0.25
141	0.24
142	0.18
143	0.13
144	0.07
145	0.07
146	0.06
147	0.08
148	0.08
149	0.09
150	0.1
151	0.1
152	0.11
153	0.14
154	0.19
155	0.22
156	0.23
157	0.24
158	0.25
159	0.28
160	0.31
161	0.29
162	0.23
163	0.21
164	0.21
165	0.19
166	0.18
167	0.15
168	0.11
169	0.15
170	0.18
171	0.16
172	0.15
173	0.15
174	0.19
175	0.2
176	0.23
177	0.25
178	0.22
179	0.23
180	0.25
181	0.25
182	0.22
183	0.24
184	0.27
185	0.25
186	0.29
187	0.29
188	0.32
189	0.39
190	0.41
191	0.42
192	0.44
193	0.42
194	0.44
195	0.47
196	0.42
197	0.37
198	0.38
199	0.33
200	0.33
201	0.35
202	0.31
203	0.35
204	0.4
205	0.4
206	0.44
207	0.5
208	0.44
209	0.48
210	0.53
211	0.46
212	0.41
213	0.38
214	0.33
215	0.31
216	0.38
217	0.4
218	0.4
219	0.48
220	0.55
221	0.61
222	0.66
223	0.69
224	0.66
225	0.67
226	0.69
227	0.71
228	0.72
229	0.73
230	0.67
231	0.66
232	0.67
233	0.59
234	0.55
235	0.54
236	0.51
237	0.47
238	0.51
239	0.5
240	0.53
241	0.55
242	0.59
243	0.6
244	0.63
245	0.65
246	0.7
247	0.7
248	0.71
249	0.68
250	0.68
251	0.67
252	0.65
253	0.62
254	0.58
255	0.54
256	0.48
257	0.48
258	0.42
259	0.32
260	0.24
261	0.22
262	0.18
263	0.16
264	0.13
265	0.11
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.06
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.05
275	0.04
276	0.05
277	0.05
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.05
286	0.05
287	0.08
288	0.09
289	0.1
290	0.11
291	0.14
292	0.15
293	0.16
294	0.17
295	0.19
296	0.24
297	0.23
298	0.21
299	0.19
300	0.19
301	0.17
302	0.16
303	0.12
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.08
311	0.12
312	0.15
313	0.17
314	0.18
315	0.21
316	0.26
317	0.28
318	0.32
319	0.32
320	0.35
321	0.38
322	0.44
323	0.43
324	0.38
325	0.37
326	0.34
327	0.3
328	0.28
329	0.23
330	0.17
331	0.13
332	0.13
333	0.13
334	0.11
335	0.11
336	0.09
337	0.13
338	0.16
339	0.16
340	0.17
341	0.18
342	0.18
343	0.21
344	0.24
345	0.21
346	0.23
347	0.3
348	0.32
349	0.37
350	0.4
351	0.4
352	0.44
353	0.47
354	0.44
355	0.4
356	0.39
357	0.33
358	0.33
359	0.31
360	0.24
361	0.23
362	0.28
363	0.26
364	0.32
365	0.32
366	0.3
367	0.35
368	0.37
369	0.43
370	0.41
371	0.46
372	0.45
373	0.52
374	0.54
375	0.56
376	0.6
377	0.59
378	0.6
379	0.59
380	0.63
381	0.58
382	0.56
383	0.52
384	0.49
385	0.44
386	0.39
387	0.34
388	0.27
389	0.3
390	0.29
391	0.32
392	0.33
393	0.37
394	0.44
395	0.46
396	0.49
397	0.46
398	0.48
399	0.43
400	0.38
401	0.36
402	0.28
403	0.26
404	0.24
405	0.26
406	0.25
407	0.26
408	0.26
409	0.24
410	0.24
411	0.25
412	0.24
413	0.22
414	0.25
415	0.27
416	0.34
417	0.32
418	0.32
419	0.32
420	0.32
421	0.28
422	0.25
423	0.21
424	0.14
425	0.16
426	0.14
427	0.12
428	0.08
429	0.08
430	0.08
431	0.08
432	0.08
433	0.06
434	0.07
435	0.08
436	0.11
437	0.11
438	0.12
439	0.13
440	0.16
441	0.19
442	0.19
443	0.21
444	0.24
445	0.29
446	0.29
447	0.3
448	0.3
449	0.31
450	0.36
451	0.37
452	0.35
453	0.33
454	0.35
455	0.37
456	0.35
457	0.34
458	0.29
459	0.25
460	0.23
461	0.24
462	0.24
463	0.26
464	0.29
465	0.28
466	0.35
467	0.35
468	0.36
469	0.35
470	0.41
471	0.39
472	0.38
473	0.36
474	0.32
475	0.37
476	0.39
477	0.37
478	0.29
479	0.31
480	0.29
481	0.29
482	0.31
483	0.27
484	0.31
485	0.36
486	0.4
487	0.35
488	0.34
489	0.35
490	0.33
491	0.33
492	0.26
493	0.26
494	0.21
495	0.22
496	0.22
497	0.19
498	0.18
499	0.18
500	0.18
501	0.13
502	0.13
503	0.11
504	0.1
505	0.11
506	0.1
507	0.09
508	0.07
509	0.07
510	0.11
511	0.13
512	0.18
513	0.18
514	0.2
515	0.2
516	0.22
517	0.23
518	0.21
519	0.26
520	0.23
521	0.26
522	0.25
523	0.25
524	0.24
525	0.23
526	0.22
527	0.16
528	0.14
529	0.09
530	0.09
531	0.1
532	0.1
533	0.15
534	0.15
535	0.14
536	0.14
537	0.16
538	0.16
539	0.14
540	0.13
541	0.09
542	0.11
543	0.11
544	0.11
545	0.13
546	0.17
547	0.18
548	0.27
549	0.34
550	0.34
551	0.43
552	0.47
553	0.49
554	0.55
555	0.62
556	0.61
557	0.61
558	0.61
559	0.58
560	0.57
561	0.52
562	0.42
563	0.35
564	0.26
565	0.21
566	0.18
567	0.13
568	0.1
569	0.1
570	0.11
571	0.11
572	0.11
573	0.11
574	0.11
575	0.12
576	0.11
577	0.14
578	0.17
579	0.17
580	0.19
581	0.24
582	0.26
583	0.31
584	0.41
585	0.49
586	0.53
587	0.6
588	0.66
589	0.71
590	0.78
591	0.82
592	0.82
593	0.82
594	0.84
595	0.85
596	0.82
597	0.77
598	0.73
599	0.7
600	0.63
601	0.54
602	0.47
603	0.4
604	0.35
605	0.31
606	0.25
607	0.19
608	0.14
609	0.12
610	0.11
611	0.09
612	0.09

A0A1Y2DLG2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer