Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2FXC1

Protein Details
Accession A0A1Y2FXC1    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-77QQEQLVPNMPQKRKRGRPRKDEQRSNPIQTTNHydrophilic
108-136TDGTPAPVKRPRGRPPKNRSNSNQTTNFTHydrophilic
166-191DGSPAPVKRPRGRPPKNARPPEQSSQHydrophilic
279-316TGKTKYGRGRPRKDEMRPTKKVKKAKPKIEARKPNASLBasic
879-909DEEEPKAKGKQKAKSKSKQSQVRREHARSVYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-65KRKRGRPRK
116-124KRPRGRPPK
173-184KRPRGRPPKNAR
283-313KYGRGRPRKDEMRPTKKVKKAKPKIEARKPN
884-897KAKGKQKAKSKSKQ
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.333, cyto 10, nucl 9.5, cyto_mito 6.833, extr 3, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MSGGPETFACLAAPVTTATINQTGQNGNVASVGTSSTAAVDTQGSQQEQLVPNMPQKRKRGRPRKDEQRSNPIQTTNPTLTPSPAEGSALTANTVPQAVVATASTSATDGTPAPVKRPRGRPPKNRSNSNQTTNFTLAPIPAEGSALTANVAPQAVGVTASVNVSDGSPAPVKRPRGRPPKNARPPEQSSQQPADADPSSGASSSPAVTPRKTSRKAKASAKSVQSLANNNDEHSDQADQPVEETAQASTAQENVEDASDVDYTPDAAVATTSMSTTETGKTKYGRGRPRKDEMRPTKKVKKAKPKIEARKPNASLHERRIQSLLQDPRFRIRYKDGSIKESMFSYLGTHQDEAALLELRDRQAFHGLGPDRSVIKATGQVPTITPCPLIDILSPTQVCTNVRKEALRQYMPEAKTHVLYHVSNQAAVTKPKKMTLKFGTSQSLYSKDPLSSTLTLNTGLDNKTCAWMPSNTGEQYLAVGGAFHHQSPRSLYKYKSEEGCIQLWRTWRDGDSYESELAIILAHDFGICWDLKWMPLATQPDKYLGLLAGCFGNGQVAGFLIEKQAQSGLSYVKFTTPAFAINMKDHHITCFDWQSSHSIVVGCDDGMVAQFDLSRKAHPAIGSLLPTHVAHPQSCYLSHIVSCKPLLPHIVATNGFDGEVCFTDLSGGSGAGGATVKLPRLRSISYCFAWSNLTGALVSSDESGVSVRYASARQVSTVSLTDSLPGLITSAACVQPLLNDECQKLPGVAEHACHPIIALGDASGQVWLYNVHTKCQLRKGALYKRLVCAASYVTQVKPEVQEAWRSGKTIEDVQNMFQPGTMVFLEGLPSVEYREAAVNKRAQGSDDEVDEQQETGKAAAGKKGKAPRTAEDDSEQDFDEEEPKAKGKQKAKSKSKQSQVRREHARSVYHDEVMVRALAWNPNLTIADQGGSPSNAWAGVLATAYKTFVRIEDVGVN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.1
4 0.1
5 0.13
6 0.16
7 0.16
8 0.17
9 0.2
10 0.2
11 0.2
12 0.24
13 0.21
14 0.18
15 0.18
16 0.16
17 0.13
18 0.12
19 0.12
20 0.09
21 0.09
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.14
30 0.18
31 0.18
32 0.18
33 0.2
34 0.26
35 0.27
36 0.29
37 0.28
38 0.27
39 0.34
40 0.43
41 0.49
42 0.5
43 0.57
44 0.65
45 0.72
46 0.81
47 0.85
48 0.86
49 0.89
50 0.93
51 0.94
52 0.94
53 0.95
54 0.93
55 0.93
56 0.91
57 0.87
58 0.81
59 0.73
60 0.66
61 0.58
62 0.57
63 0.5
64 0.43
65 0.38
66 0.34
67 0.33
68 0.32
69 0.3
70 0.25
71 0.21
72 0.2
73 0.17
74 0.19
75 0.2
76 0.17
77 0.15
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.09
83 0.07
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.08
94 0.07
95 0.09
96 0.08
97 0.1
98 0.17
99 0.17
100 0.23
101 0.29
102 0.37
103 0.45
104 0.54
105 0.62
106 0.67
107 0.77
108 0.82
109 0.87
110 0.9
111 0.91
112 0.91
113 0.88
114 0.88
115 0.86
116 0.84
117 0.81
118 0.72
119 0.68
120 0.6
121 0.53
122 0.43
123 0.34
124 0.26
125 0.2
126 0.18
127 0.13
128 0.11
129 0.11
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.1
155 0.14
156 0.14
157 0.19
158 0.25
159 0.34
160 0.41
161 0.5
162 0.58
163 0.65
164 0.74
165 0.8
166 0.85
167 0.88
168 0.9
169 0.9
170 0.87
171 0.85
172 0.83
173 0.79
174 0.75
175 0.7
176 0.66
177 0.6
178 0.55
179 0.47
180 0.4
181 0.37
182 0.3
183 0.25
184 0.19
185 0.16
186 0.14
187 0.14
188 0.13
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.12
193 0.16
194 0.18
195 0.19
196 0.25
197 0.34
198 0.43
199 0.5
200 0.57
201 0.62
202 0.68
203 0.76
204 0.79
205 0.78
206 0.76
207 0.76
208 0.72
209 0.66
210 0.58
211 0.54
212 0.48
213 0.44
214 0.4
215 0.39
216 0.34
217 0.3
218 0.3
219 0.26
220 0.24
221 0.2
222 0.2
223 0.13
224 0.15
225 0.17
226 0.15
227 0.15
228 0.15
229 0.13
230 0.11
231 0.11
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.08
264 0.11
265 0.13
266 0.15
267 0.19
268 0.2
269 0.25
270 0.32
271 0.4
272 0.47
273 0.55
274 0.63
275 0.67
276 0.75
277 0.79
278 0.79
279 0.81
280 0.82
281 0.81
282 0.8
283 0.82
284 0.82
285 0.81
286 0.82
287 0.81
288 0.81
289 0.81
290 0.83
291 0.84
292 0.85
293 0.88
294 0.9
295 0.91
296 0.86
297 0.86
298 0.79
299 0.74
300 0.71
301 0.67
302 0.62
303 0.58
304 0.59
305 0.5
306 0.48
307 0.45
308 0.37
309 0.32
310 0.34
311 0.36
312 0.34
313 0.38
314 0.37
315 0.42
316 0.45
317 0.44
318 0.4
319 0.39
320 0.4
321 0.42
322 0.5
323 0.46
324 0.47
325 0.49
326 0.46
327 0.39
328 0.32
329 0.27
330 0.18
331 0.15
332 0.13
333 0.12
334 0.14
335 0.14
336 0.14
337 0.13
338 0.13
339 0.13
340 0.11
341 0.1
342 0.08
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.1
347 0.11
348 0.11
349 0.1
350 0.14
351 0.14
352 0.13
353 0.19
354 0.2
355 0.2
356 0.2
357 0.2
358 0.17
359 0.17
360 0.18
361 0.1
362 0.1
363 0.14
364 0.15
365 0.16
366 0.16
367 0.16
368 0.16
369 0.17
370 0.18
371 0.13
372 0.12
373 0.09
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.09
378 0.12
379 0.12
380 0.16
381 0.16
382 0.14
383 0.14
384 0.15
385 0.16
386 0.16
387 0.19
388 0.19
389 0.21
390 0.22
391 0.24
392 0.3
393 0.36
394 0.34
395 0.31
396 0.32
397 0.38
398 0.38
399 0.37
400 0.31
401 0.25
402 0.25
403 0.24
404 0.21
405 0.16
406 0.16
407 0.16
408 0.2
409 0.19
410 0.17
411 0.17
412 0.18
413 0.17
414 0.2
415 0.21
416 0.2
417 0.2
418 0.25
419 0.31
420 0.29
421 0.36
422 0.38
423 0.43
424 0.41
425 0.43
426 0.42
427 0.37
428 0.37
429 0.31
430 0.28
431 0.21
432 0.2
433 0.18
434 0.15
435 0.14
436 0.14
437 0.17
438 0.15
439 0.15
440 0.15
441 0.14
442 0.14
443 0.14
444 0.13
445 0.11
446 0.1
447 0.1
448 0.09
449 0.09
450 0.1
451 0.1
452 0.1
453 0.09
454 0.1
455 0.12
456 0.13
457 0.16
458 0.15
459 0.16
460 0.15
461 0.13
462 0.13
463 0.1
464 0.08
465 0.04
466 0.04
467 0.03
468 0.05
469 0.06
470 0.05
471 0.07
472 0.07
473 0.08
474 0.12
475 0.17
476 0.2
477 0.23
478 0.25
479 0.31
480 0.35
481 0.37
482 0.35
483 0.34
484 0.33
485 0.32
486 0.33
487 0.28
488 0.24
489 0.24
490 0.25
491 0.24
492 0.22
493 0.2
494 0.17
495 0.18
496 0.18
497 0.19
498 0.18
499 0.19
500 0.18
501 0.17
502 0.16
503 0.14
504 0.12
505 0.09
506 0.06
507 0.03
508 0.03
509 0.03
510 0.03
511 0.03
512 0.03
513 0.05
514 0.05
515 0.04
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.08
520 0.08
521 0.07
522 0.12
523 0.17
524 0.18
525 0.2
526 0.21
527 0.21
528 0.22
529 0.21
530 0.17
531 0.12
532 0.1
533 0.08
534 0.07
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.04
539 0.04
540 0.03
541 0.03
542 0.03
543 0.03
544 0.04
545 0.04
546 0.05
547 0.05
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.08
552 0.07
553 0.07
554 0.08
555 0.1
556 0.09
557 0.1
558 0.1
559 0.1
560 0.12
561 0.11
562 0.11
563 0.1
564 0.1
565 0.11
566 0.13
567 0.14
568 0.14
569 0.16
570 0.17
571 0.18
572 0.17
573 0.17
574 0.16
575 0.16
576 0.17
577 0.2
578 0.18
579 0.16
580 0.17
581 0.19
582 0.18
583 0.18
584 0.16
585 0.12
586 0.12
587 0.12
588 0.12
589 0.08
590 0.07
591 0.06
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.04
596 0.04
597 0.05
598 0.06
599 0.09
600 0.1
601 0.11
602 0.12
603 0.14
604 0.16
605 0.15
606 0.16
607 0.16
608 0.18
609 0.18
610 0.16
611 0.15
612 0.14
613 0.14
614 0.13
615 0.14
616 0.14
617 0.13
618 0.15
619 0.17
620 0.17
621 0.17
622 0.18
623 0.16
624 0.15
625 0.16
626 0.18
627 0.16
628 0.17
629 0.17
630 0.18
631 0.17
632 0.18
633 0.19
634 0.17
635 0.18
636 0.17
637 0.2
638 0.18
639 0.18
640 0.18
641 0.15
642 0.14
643 0.11
644 0.1
645 0.08
646 0.08
647 0.08
648 0.07
649 0.06
650 0.07
651 0.07
652 0.08
653 0.07
654 0.06
655 0.05
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.05
660 0.04
661 0.05
662 0.06
663 0.08
664 0.11
665 0.12
666 0.15
667 0.18
668 0.2
669 0.23
670 0.28
671 0.32
672 0.31
673 0.33
674 0.3
675 0.28
676 0.27
677 0.23
678 0.19
679 0.13
680 0.12
681 0.09
682 0.08
683 0.08
684 0.07
685 0.07
686 0.06
687 0.06
688 0.05
689 0.06
690 0.06
691 0.06
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.07
696 0.08
697 0.1
698 0.14
699 0.14
700 0.15
701 0.16
702 0.16
703 0.17
704 0.17
705 0.16
706 0.13
707 0.13
708 0.13
709 0.12
710 0.11
711 0.09
712 0.08
713 0.07
714 0.06
715 0.06
716 0.06
717 0.08
718 0.09
719 0.08
720 0.09
721 0.08
722 0.09
723 0.13
724 0.16
725 0.17
726 0.19
727 0.21
728 0.22
729 0.23
730 0.22
731 0.18
732 0.15
733 0.14
734 0.15
735 0.15
736 0.15
737 0.17
738 0.19
739 0.19
740 0.18
741 0.16
742 0.14
743 0.12
744 0.12
745 0.09
746 0.06
747 0.07
748 0.07
749 0.07
750 0.06
751 0.05
752 0.05
753 0.05
754 0.06
755 0.08
756 0.16
757 0.16
758 0.18
759 0.26
760 0.3
761 0.35
762 0.43
763 0.46
764 0.41
765 0.49
766 0.56
767 0.59
768 0.63
769 0.66
770 0.62
771 0.59
772 0.61
773 0.53
774 0.44
775 0.36
776 0.31
777 0.25
778 0.25
779 0.25
780 0.2
781 0.22
782 0.23
783 0.23
784 0.22
785 0.22
786 0.22
787 0.21
788 0.27
789 0.28
790 0.34
791 0.33
792 0.32
793 0.3
794 0.29
795 0.29
796 0.31
797 0.34
798 0.33
799 0.33
800 0.34
801 0.38
802 0.36
803 0.33
804 0.26
805 0.2
806 0.14
807 0.16
808 0.14
809 0.1
810 0.09
811 0.1
812 0.1
813 0.1
814 0.11
815 0.08
816 0.08
817 0.09
818 0.1
819 0.1
820 0.1
821 0.15
822 0.18
823 0.22
824 0.28
825 0.31
826 0.34
827 0.38
828 0.38
829 0.33
830 0.33
831 0.35
832 0.32
833 0.29
834 0.29
835 0.25
836 0.26
837 0.24
838 0.21
839 0.16
840 0.14
841 0.12
842 0.1
843 0.13
844 0.15
845 0.16
846 0.23
847 0.27
848 0.28
849 0.35
850 0.44
851 0.47
852 0.51
853 0.55
854 0.54
855 0.57
856 0.59
857 0.55
858 0.5
859 0.47
860 0.43
861 0.4
862 0.34
863 0.26
864 0.23
865 0.19
866 0.19
867 0.17
868 0.15
869 0.16
870 0.17
871 0.23
872 0.3
873 0.38
874 0.43
875 0.51
876 0.6
877 0.69
878 0.78
879 0.82
880 0.86
881 0.87
882 0.89
883 0.9
884 0.9
885 0.9
886 0.89
887 0.89
888 0.88
889 0.84
890 0.83
891 0.79
892 0.75
893 0.71
894 0.7
895 0.64
896 0.55
897 0.51
898 0.42
899 0.37
900 0.31
901 0.25
902 0.16
903 0.13
904 0.14
905 0.16
906 0.17
907 0.18
908 0.17
909 0.2
910 0.2
911 0.19
912 0.18
913 0.15
914 0.15
915 0.13
916 0.14
917 0.14
918 0.14
919 0.14
920 0.13
921 0.13
922 0.12
923 0.11
924 0.1
925 0.08
926 0.08
927 0.09
928 0.09
929 0.09
930 0.1
931 0.12
932 0.11
933 0.12
934 0.12
935 0.12
936 0.18
937 0.17