FuNGI

A0A1Y2F8I6

Protein Details

Accession

A0A1Y2F8I6

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-25	MSSLSIRAPKKKKPVPLAQRPVSSA	Hydrophilic
144-165	YAGAGSRRGNRKKTRQVYQADE	Hydrophilic
572-596	SLLNLFKHKLARNKQNKKNMSSLLK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-13	PKKKK

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 12

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSLSIRAPKKKKPVPLAQRPVSSAAPTQAVKREPIDVPVDTRTWTEYKLRAGPTGPVVLSDRRQTGEAVQGSATRPGHKYNIMRFHGAKPIDPSTDLAQPVRLSRRDPYEEPVAAAVVADDGSETTPATAAAPSVAPDNVAPYAGAGSRRGNRKKTRQVYQADEQVYKLRTEERYPWILEDFEGKASYQGTLEGGQAHTYVFMTLSADGFDVTPVSKFYRFQPRARYSTLSIDEAEEKMGKARSLPRWFMREGGPSLPGSPAPAVAAPQHRMRTTTDNRKQNVKHEELEEELDFNEDFADDEEQHALVEDEEDNKELEERIKKEMLSANALGDADPNADDEEDSKQKAKLDKEGRRVQRFLERLEKNNMYESDSSNPYASSSTSEDEAEAKTSAAASVKGEEEKKSLDQLRDQNIRDQVNRLQNTSVTTYNTPQVSDGSSLSSRRPSASNLNNAKAAARARRHRPGLVTLRLPSAALVSFAHIPSSAAQAGSSLHKRRAGSDGYDSDRSQKKIRFQTGDVTSPGPASRQTSPLASPRHGSPVLVAGNESDLITAAELKEAIVSHGSVDMRSLLNLFKHKLARNKQNKKNMSSLLKEVGATLQNGVLVVK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.84
3	0.87
4	0.89
5	0.85
6	0.82
7	0.75
8	0.69
9	0.6
10	0.52
11	0.43
12	0.35
13	0.33
14	0.29
15	0.31
16	0.33
17	0.33
18	0.34
19	0.33
20	0.35
21	0.31
22	0.35
23	0.35
24	0.3
25	0.31
26	0.32
27	0.31
28	0.27
29	0.27
30	0.26
31	0.23
32	0.25
33	0.27
34	0.28
35	0.34
36	0.4
37	0.41
38	0.4
39	0.4
40	0.4
41	0.38
42	0.38
43	0.31
44	0.26
45	0.27
46	0.29
47	0.31
48	0.32
49	0.31
50	0.28
51	0.29
52	0.28
53	0.27
54	0.31
55	0.29
56	0.26
57	0.24
58	0.25
59	0.25
60	0.3
61	0.29
62	0.24
63	0.24
64	0.27
65	0.31
66	0.35
67	0.42
68	0.44
69	0.53
70	0.53
71	0.57
72	0.56
73	0.55
74	0.55
75	0.49
76	0.43
77	0.38
78	0.39
79	0.35
80	0.33
81	0.32
82	0.27
83	0.31
84	0.3
85	0.25
86	0.24
87	0.23
88	0.28
89	0.32
90	0.31
91	0.29
92	0.33
93	0.41
94	0.45
95	0.46
96	0.45
97	0.46
98	0.45
99	0.43
100	0.38
101	0.29
102	0.22
103	0.2
104	0.14
105	0.06
106	0.05
107	0.04
108	0.04
109	0.04
110	0.04
111	0.05
112	0.05
113	0.05
114	0.05
115	0.05
116	0.06
117	0.06
118	0.05
119	0.06
120	0.06
121	0.07
122	0.08
123	0.08
124	0.08
125	0.08
126	0.1
127	0.09
128	0.09
129	0.08
130	0.07
131	0.08
132	0.1
133	0.11
134	0.11
135	0.16
136	0.21
137	0.32
138	0.39
139	0.47
140	0.55
141	0.65
142	0.74
143	0.77
144	0.81
145	0.8
146	0.8
147	0.78
148	0.75
149	0.72
150	0.64
151	0.56
152	0.47
153	0.43
154	0.37
155	0.3
156	0.24
157	0.22
158	0.21
159	0.24
160	0.3
161	0.31
162	0.34
163	0.34
164	0.35
165	0.31
166	0.29
167	0.25
168	0.22
169	0.17
170	0.14
171	0.14
172	0.13
173	0.12
174	0.12
175	0.12
176	0.09
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.09
181	0.09
182	0.09
183	0.09
184	0.09
185	0.09
186	0.08
187	0.07
188	0.06
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.06
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.06
203	0.09
204	0.1
205	0.11
206	0.17
207	0.28
208	0.32
209	0.37
210	0.46
211	0.51
212	0.54
213	0.57
214	0.55
215	0.46
216	0.49
217	0.46
218	0.37
219	0.3
220	0.27
221	0.24
222	0.21
223	0.19
224	0.13
225	0.1
226	0.11
227	0.12
228	0.1
229	0.12
230	0.19
231	0.26
232	0.32
233	0.36
234	0.38
235	0.41
236	0.42
237	0.41
238	0.37
239	0.33
240	0.29
241	0.26
242	0.23
243	0.19
244	0.19
245	0.18
246	0.14
247	0.11
248	0.09
249	0.08
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.09
254	0.12
255	0.14
256	0.17
257	0.2
258	0.19
259	0.21
260	0.23
261	0.29
262	0.35
263	0.44
264	0.48
265	0.54
266	0.56
267	0.62
268	0.61
269	0.61
270	0.6
271	0.53
272	0.47
273	0.4
274	0.4
275	0.33
276	0.33
277	0.25
278	0.17
279	0.13
280	0.11
281	0.09
282	0.08
283	0.06
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.06
288	0.05
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.05
295	0.04
296	0.05
297	0.05
298	0.06
299	0.06
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.11
306	0.14
307	0.16
308	0.19
309	0.2
310	0.2
311	0.23
312	0.26
313	0.24
314	0.22
315	0.21
316	0.17
317	0.17
318	0.17
319	0.14
320	0.1
321	0.09
322	0.06
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.09
330	0.11
331	0.12
332	0.13
333	0.14
334	0.17
335	0.23
336	0.24
337	0.29
338	0.38
339	0.45
340	0.52
341	0.6
342	0.66
343	0.66
344	0.65
345	0.58
346	0.56
347	0.51
348	0.46
349	0.47
350	0.41
351	0.4
352	0.46
353	0.46
354	0.38
355	0.4
356	0.37
357	0.3
358	0.28
359	0.26
360	0.23
361	0.23
362	0.23
363	0.19
364	0.18
365	0.15
366	0.14
367	0.13
368	0.11
369	0.12
370	0.12
371	0.12
372	0.13
373	0.12
374	0.13
375	0.13
376	0.12
377	0.1
378	0.09
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.07
383	0.08
384	0.07
385	0.08
386	0.09
387	0.12
388	0.14
389	0.14
390	0.15
391	0.17
392	0.17
393	0.21
394	0.25
395	0.24
396	0.3
397	0.35
398	0.42
399	0.47
400	0.47
401	0.47
402	0.48
403	0.49
404	0.44
405	0.41
406	0.4
407	0.42
408	0.42
409	0.38
410	0.33
411	0.31
412	0.32
413	0.32
414	0.27
415	0.2
416	0.21
417	0.21
418	0.25
419	0.24
420	0.21
421	0.19
422	0.18
423	0.16
424	0.16
425	0.15
426	0.14
427	0.15
428	0.16
429	0.18
430	0.21
431	0.2
432	0.2
433	0.22
434	0.22
435	0.3
436	0.36
437	0.44
438	0.46
439	0.47
440	0.47
441	0.45
442	0.42
443	0.36
444	0.33
445	0.31
446	0.33
447	0.39
448	0.45
449	0.54
450	0.58
451	0.58
452	0.57
453	0.59
454	0.59
455	0.57
456	0.54
457	0.46
458	0.44
459	0.41
460	0.37
461	0.27
462	0.2
463	0.14
464	0.11
465	0.1
466	0.1
467	0.12
468	0.12
469	0.12
470	0.1
471	0.11
472	0.11
473	0.14
474	0.13
475	0.1
476	0.1
477	0.1
478	0.12
479	0.17
480	0.24
481	0.24
482	0.28
483	0.32
484	0.33
485	0.35
486	0.4
487	0.38
488	0.35
489	0.38
490	0.4
491	0.41
492	0.44
493	0.42
494	0.44
495	0.46
496	0.45
497	0.45
498	0.45
499	0.49
500	0.55
501	0.64
502	0.62
503	0.58
504	0.64
505	0.62
506	0.61
507	0.54
508	0.45
509	0.36
510	0.31
511	0.29
512	0.21
513	0.18
514	0.18
515	0.19
516	0.21
517	0.22
518	0.24
519	0.27
520	0.34
521	0.37
522	0.34
523	0.34
524	0.34
525	0.39
526	0.37
527	0.33
528	0.27
529	0.29
530	0.28
531	0.26
532	0.23
533	0.16
534	0.17
535	0.17
536	0.16
537	0.09
538	0.07
539	0.07
540	0.07
541	0.08
542	0.07
543	0.08
544	0.08
545	0.08
546	0.09
547	0.09
548	0.1
549	0.1
550	0.1
551	0.09
552	0.14
553	0.14
554	0.12
555	0.13
556	0.14
557	0.13
558	0.14
559	0.15
560	0.13
561	0.18
562	0.24
563	0.26
564	0.3
565	0.37
566	0.43
567	0.52
568	0.6
569	0.66
570	0.71
571	0.8
572	0.83
573	0.87
574	0.89
575	0.85
576	0.83
577	0.81
578	0.79
579	0.73
580	0.69
581	0.64
582	0.57
583	0.5
584	0.42
585	0.37
586	0.31
587	0.26
588	0.21
589	0.17
590	0.15

A0A1Y2F8I6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer