Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2F2J6

Protein Details
Accession A0A1Y2F2J6    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-68QSSPSSHKTTPRAKKKAKAEQGWQPPKHHydrophilic
205-225AKGTPTKGKARTKPKVKESYWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-59KRKRQSSPSSHKTTPRAKKKAKA
172-220KTKRRESASQKTPAVKPSPATTAKSSPSKAASSAKGTPTKGKARTKPKV
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 10.833, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR008251  Chromo_shadow_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PF01393  Chromo_shadow  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences MAAAASPASHKKAAEGSAFTAVNNSPAKADVSDDALKRKRQSSPSSHKTTPRAKKKAKAEQGWQPPKHLDSWEGLAEITAVTNNEWGRLQFALLWNGGQTSMHPATLVNVKMPQTVISYYESNLVLEGSQEAEQAELSGQDDDQDSIPEVMQSDDEEEEEAPSKRAHTSSSKTKRRESASQKTPAVKPSPATTAKSSPSKAASSAKGTPTKGKARTKPKVKESYWEIEDIVDDRIRNGKKQYRVRWVGYSARHDTWVPEEHSLEDCPEAVQEYLERKAEEAAAAKENAEAAGREEFSEVGDEEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.31
3 0.3
4 0.33
5 0.34
6 0.3
7 0.28
8 0.23
9 0.25
10 0.23
11 0.21
12 0.16
13 0.17
14 0.19
15 0.17
16 0.19
17 0.14
18 0.19
19 0.24
20 0.25
21 0.33
22 0.37
23 0.42
24 0.44
25 0.49
26 0.51
27 0.54
28 0.61
29 0.64
30 0.69
31 0.73
32 0.77
33 0.77
34 0.76
35 0.76
36 0.78
37 0.78
38 0.78
39 0.79
40 0.78
41 0.82
42 0.85
43 0.87
44 0.87
45 0.84
46 0.8
47 0.79
48 0.82
49 0.84
50 0.74
51 0.67
52 0.6
53 0.53
54 0.49
55 0.4
56 0.31
57 0.24
58 0.26
59 0.23
60 0.2
61 0.18
62 0.15
63 0.14
64 0.11
65 0.09
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.1
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.1
78 0.13
79 0.14
80 0.13
81 0.13
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.09
86 0.07
87 0.11
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.11
92 0.13
93 0.18
94 0.18
95 0.12
96 0.14
97 0.15
98 0.15
99 0.16
100 0.15
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.14
106 0.13
107 0.16
108 0.15
109 0.13
110 0.12
111 0.11
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.05
145 0.06
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.13
154 0.17
155 0.22
156 0.33
157 0.43
158 0.51
159 0.54
160 0.59
161 0.63
162 0.62
163 0.66
164 0.65
165 0.65
166 0.65
167 0.68
168 0.66
169 0.64
170 0.61
171 0.56
172 0.5
173 0.4
174 0.33
175 0.28
176 0.32
177 0.3
178 0.31
179 0.3
180 0.3
181 0.33
182 0.37
183 0.35
184 0.31
185 0.31
186 0.29
187 0.28
188 0.29
189 0.27
190 0.28
191 0.31
192 0.34
193 0.36
194 0.36
195 0.38
196 0.41
197 0.46
198 0.49
199 0.54
200 0.58
201 0.64
202 0.72
203 0.77
204 0.8
205 0.81
206 0.83
207 0.75
208 0.74
209 0.7
210 0.68
211 0.6
212 0.52
213 0.42
214 0.32
215 0.31
216 0.24
217 0.2
218 0.13
219 0.12
220 0.11
221 0.19
222 0.2
223 0.23
224 0.31
225 0.36
226 0.44
227 0.54
228 0.62
229 0.66
230 0.72
231 0.73
232 0.69
233 0.67
234 0.65
235 0.61
236 0.6
237 0.54
238 0.49
239 0.46
240 0.41
241 0.37
242 0.35
243 0.35
244 0.3
245 0.27
246 0.27
247 0.27
248 0.29
249 0.28
250 0.24
251 0.18
252 0.16
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.1
257 0.1
258 0.12
259 0.15
260 0.19
261 0.21
262 0.21
263 0.2
264 0.22
265 0.22
266 0.21
267 0.21
268 0.2
269 0.21
270 0.22
271 0.21
272 0.2
273 0.19
274 0.17
275 0.15
276 0.12
277 0.11
278 0.15
279 0.15
280 0.15
281 0.16
282 0.15
283 0.15
284 0.17