Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2FNN5

Protein Details
Accession A0A1Y2FNN5    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MSERKPSKPRNKRGGERKGPDARVBasic
59-81AQHASARRRDTRPQQRLRIVVRHHydrophilic
109-133YLQGKMPKQKTKQPRASRAYIKFRRHydrophilic
360-388TNGGPKSGKAVRKQRAPKKQTSVNSSNKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-20RKPSKPRNKRGGERKGP
230-241AKQKIKKAEKAK
275-282KSRKGKRR
350-353KGKP
361-378NGGPKSGKAVRKQRAPKK
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 8, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSERKPSKPRNKRGGERKGPDARVLAAPSSTGTANVPRTVSQRGSAQSGRGAHSCASRAQHASARRRDTRPQQRLRIVVRHLPPTLPEDVFTSTFERYSELKKVESITYLQGKMPKQKTKQPRASRAYIKFRRQEDLAAFMKAFKGHVFVNGEGHEFMAQVELAPLPKAHNTGASGSQDALMGTLADDPDYLAFLNPPEQPAVEESSEPADPRVTPLIEFLRAQKVKNDAKQKIKKAEKAKLQEEKRQAAQDLADAATEKVKAQMAAQNNADGSKSRKGKRRDAKDAESTPSQSNQNKPVVKNGKKGSASSLSVCQGHEKKAAIADVTKTGNARKSNDTCPSTKDSKAPKGKPNGSEHLTNGGPKSGKAVRKQRAPKKQTSVNSSNKLVDLSGPTPAEMAAAHAKTKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.94
2 0.93
3 0.88
4 0.88
5 0.87
6 0.79
7 0.72
8 0.64
9 0.55
10 0.49
11 0.45
12 0.36
13 0.26
14 0.24
15 0.2
16 0.2
17 0.17
18 0.13
19 0.12
20 0.17
21 0.2
22 0.22
23 0.23
24 0.23
25 0.27
26 0.32
27 0.32
28 0.29
29 0.32
30 0.32
31 0.37
32 0.36
33 0.35
34 0.34
35 0.36
36 0.36
37 0.31
38 0.31
39 0.27
40 0.28
41 0.28
42 0.27
43 0.27
44 0.28
45 0.29
46 0.31
47 0.34
48 0.4
49 0.48
50 0.52
51 0.57
52 0.61
53 0.64
54 0.69
55 0.75
56 0.77
57 0.78
58 0.8
59 0.81
60 0.8
61 0.83
62 0.8
63 0.77
64 0.71
65 0.69
66 0.64
67 0.6
68 0.54
69 0.46
70 0.41
71 0.37
72 0.36
73 0.28
74 0.23
75 0.2
76 0.22
77 0.22
78 0.22
79 0.21
80 0.17
81 0.17
82 0.17
83 0.17
84 0.16
85 0.2
86 0.25
87 0.24
88 0.25
89 0.26
90 0.29
91 0.27
92 0.27
93 0.24
94 0.23
95 0.26
96 0.27
97 0.27
98 0.29
99 0.31
100 0.39
101 0.45
102 0.48
103 0.48
104 0.56
105 0.66
106 0.71
107 0.78
108 0.79
109 0.82
110 0.8
111 0.83
112 0.83
113 0.81
114 0.81
115 0.79
116 0.77
117 0.74
118 0.7
119 0.65
120 0.57
121 0.53
122 0.43
123 0.41
124 0.34
125 0.28
126 0.25
127 0.22
128 0.22
129 0.17
130 0.16
131 0.09
132 0.1
133 0.09
134 0.13
135 0.16
136 0.15
137 0.18
138 0.18
139 0.19
140 0.16
141 0.16
142 0.12
143 0.09
144 0.08
145 0.06
146 0.05
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.11
159 0.13
160 0.16
161 0.16
162 0.15
163 0.14
164 0.14
165 0.12
166 0.11
167 0.09
168 0.06
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.1
189 0.12
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.08
198 0.07
199 0.09
200 0.11
201 0.09
202 0.09
203 0.12
204 0.13
205 0.14
206 0.14
207 0.14
208 0.21
209 0.22
210 0.23
211 0.23
212 0.3
213 0.34
214 0.4
215 0.47
216 0.45
217 0.55
218 0.63
219 0.66
220 0.69
221 0.7
222 0.71
223 0.7
224 0.72
225 0.69
226 0.69
227 0.7
228 0.69
229 0.67
230 0.67
231 0.65
232 0.61
233 0.55
234 0.5
235 0.42
236 0.34
237 0.3
238 0.23
239 0.18
240 0.14
241 0.11
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.15
252 0.17
253 0.21
254 0.22
255 0.21
256 0.2
257 0.2
258 0.19
259 0.16
260 0.16
261 0.2
262 0.27
263 0.33
264 0.41
265 0.48
266 0.58
267 0.67
268 0.73
269 0.76
270 0.77
271 0.77
272 0.79
273 0.75
274 0.69
275 0.62
276 0.55
277 0.46
278 0.41
279 0.4
280 0.36
281 0.37
282 0.39
283 0.44
284 0.46
285 0.45
286 0.52
287 0.57
288 0.58
289 0.62
290 0.59
291 0.6
292 0.56
293 0.57
294 0.52
295 0.47
296 0.44
297 0.37
298 0.37
299 0.31
300 0.3
301 0.29
302 0.31
303 0.28
304 0.29
305 0.31
306 0.28
307 0.27
308 0.28
309 0.29
310 0.23
311 0.22
312 0.21
313 0.21
314 0.22
315 0.21
316 0.2
317 0.22
318 0.27
319 0.29
320 0.32
321 0.36
322 0.4
323 0.47
324 0.54
325 0.55
326 0.51
327 0.52
328 0.55
329 0.51
330 0.48
331 0.49
332 0.49
333 0.55
334 0.64
335 0.66
336 0.68
337 0.74
338 0.78
339 0.78
340 0.77
341 0.75
342 0.68
343 0.64
344 0.57
345 0.52
346 0.46
347 0.4
348 0.34
349 0.31
350 0.27
351 0.23
352 0.28
353 0.3
354 0.35
355 0.42
356 0.52
357 0.55
358 0.65
359 0.76
360 0.8
361 0.84
362 0.86
363 0.86
364 0.86
365 0.86
366 0.84
367 0.83
368 0.82
369 0.81
370 0.79
371 0.73
372 0.66
373 0.58
374 0.5
375 0.41
376 0.34
377 0.3
378 0.24
379 0.26
380 0.23
381 0.22
382 0.22
383 0.21
384 0.18
385 0.12
386 0.15
387 0.17
388 0.18