FuNGI

A0A1Y2FSH6

Protein Details

Accession

A0A1Y2FSH6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
83-112	APPLAKMKEQIRRRRSRAPSKEKRKLDSSQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
89-107	MKEQIRRRRSRAPSKEKRK
304-314	GRKAKGPKGKS

Subcellular Location(s)

mito 8, cyto 7.5, cyto_nucl 7, nucl 5.5, plas 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR004859 Xrn1_N
Gene Ontology	GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03159 XRN_N

Amino Acid Sequences

MGIKEKGFADWVIGQFPDSAHTLSSTDAAPFSHVLIDMNPLIHTNLRTAKDEKQCIKRLFAELDRLLRLTQPQVLVYLAVDGAPPLAKMKEQIRRRRSRAPSKEKRKLDSSQITPGCAFMMRMTAYLQYYAARYLASYKNRSGKLRFIIDGAETEGEGEAKIMAFLATQANMIAGDVAVYSGDSDVVIQSLLSPIAGLFVVRYSPDQIVALSMRVLRTLIAMPLPAAESFTTYRHLVDFVFLVLFSGNDYLQKLRGAKISKTWPIYKAFRAEAAWQGRHLISESFADFDHEVLVELLQRVRLNGRKAKGPKGKSRLFTPNLRVAVAEVEDDTSDAAEEDDEQDLDDAFTEFDRAAAGMNPEFVQSLAPFKRESEAVLRSDTYTTHLPDYFHSLFWCLRVCQHGRCPDYLFLPQRSILTIEQVLTFIARDLPRSPFSLKLDAHPPLPSVAIACALLGKHKAALLPATWQSLFEQDTLRELLFLMLFHPLTSNAQRRRLAHLVRSQIPATSGRRHAGLFDTARQLSCWPQTMPHPTSFQDPLATARHAAASSGLSQIWHGGAADAFTALPPTVGRLVYMDGWQTSDLVDVAAVSQVWRKMPRIQQERGDAFRMFRRQTGVLQPRGIQSGVKVMKRER

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.19
3	0.19
4	0.17
5	0.14
6	0.14
7	0.12
8	0.14
9	0.14
10	0.14
11	0.15
12	0.13
13	0.12
14	0.12
15	0.12
16	0.13
17	0.13
18	0.13
19	0.13
20	0.12
21	0.12
22	0.12
23	0.16
24	0.14
25	0.15
26	0.14
27	0.13
28	0.15
29	0.17
30	0.17
31	0.19
32	0.25
33	0.27
34	0.32
35	0.35
36	0.42
37	0.49
38	0.57
39	0.6
40	0.63
41	0.69
42	0.68
43	0.7
44	0.67
45	0.63
46	0.6
47	0.56
48	0.55
49	0.49
50	0.51
51	0.46
52	0.42
53	0.37
54	0.32
55	0.31
56	0.25
57	0.25
58	0.22
59	0.21
60	0.21
61	0.21
62	0.19
63	0.16
64	0.14
65	0.09
66	0.08
67	0.07
68	0.06
69	0.06
70	0.06
71	0.06
72	0.07
73	0.08
74	0.09
75	0.14
76	0.22
77	0.31
78	0.4
79	0.51
80	0.6
81	0.7
82	0.76
83	0.82
84	0.84
85	0.86
86	0.88
87	0.89
88	0.89
89	0.9
90	0.93
91	0.9
92	0.86
93	0.82
94	0.76
95	0.75
96	0.73
97	0.67
98	0.67
99	0.6
100	0.56
101	0.49
102	0.43
103	0.34
104	0.25
105	0.2
106	0.1
107	0.13
108	0.11
109	0.12
110	0.13
111	0.14
112	0.14
113	0.15
114	0.15
115	0.12
116	0.12
117	0.12
118	0.12
119	0.09
120	0.09
121	0.14
122	0.21
123	0.27
124	0.3
125	0.35
126	0.43
127	0.48
128	0.54
129	0.52
130	0.52
131	0.52
132	0.53
133	0.47
134	0.4
135	0.37
136	0.32
137	0.29
138	0.23
139	0.16
140	0.11
141	0.1
142	0.1
143	0.08
144	0.07
145	0.06
146	0.05
147	0.04
148	0.04
149	0.04
150	0.04
151	0.04
152	0.05
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.05
161	0.04
162	0.03
163	0.03
164	0.03
165	0.03
166	0.03
167	0.03
168	0.03
169	0.03
170	0.03
171	0.03
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.03
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.05
188	0.05
189	0.06
190	0.08
191	0.08
192	0.09
193	0.09
194	0.09
195	0.11
196	0.11
197	0.1
198	0.09
199	0.1
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.07
204	0.08
205	0.08
206	0.08
207	0.08
208	0.08
209	0.07
210	0.08
211	0.08
212	0.07
213	0.07
214	0.06
215	0.08
216	0.09
217	0.1
218	0.13
219	0.12
220	0.13
221	0.12
222	0.13
223	0.11
224	0.1
225	0.1
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.06
230	0.05
231	0.05
232	0.04
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.06
237	0.07
238	0.08
239	0.11
240	0.12
241	0.13
242	0.18
243	0.2
244	0.21
245	0.26
246	0.32
247	0.35
248	0.38
249	0.39
250	0.37
251	0.4
252	0.42
253	0.39
254	0.37
255	0.32
256	0.3
257	0.28
258	0.27
259	0.28
260	0.29
261	0.26
262	0.22
263	0.23
264	0.21
265	0.2
266	0.19
267	0.13
268	0.09
269	0.1
270	0.1
271	0.09
272	0.08
273	0.1
274	0.09
275	0.08
276	0.08
277	0.06
278	0.06
279	0.05
280	0.06
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.1
288	0.15
289	0.2
290	0.24
291	0.26
292	0.32
293	0.36
294	0.45
295	0.5
296	0.52
297	0.56
298	0.59
299	0.63
300	0.58
301	0.6
302	0.59
303	0.56
304	0.54
305	0.5
306	0.48
307	0.43
308	0.4
309	0.34
310	0.26
311	0.22
312	0.17
313	0.13
314	0.06
315	0.06
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.04
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.06
344	0.06
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.07
350	0.06
351	0.05
352	0.11
353	0.12
354	0.13
355	0.13
356	0.13
357	0.15
358	0.14
359	0.16
360	0.16
361	0.18
362	0.19
363	0.2
364	0.2
365	0.19
366	0.19
367	0.18
368	0.16
369	0.14
370	0.14
371	0.15
372	0.16
373	0.16
374	0.16
375	0.24
376	0.22
377	0.2
378	0.19
379	0.19
380	0.18
381	0.19
382	0.2
383	0.12
384	0.13
385	0.18
386	0.21
387	0.24
388	0.3
389	0.37
390	0.37
391	0.39
392	0.41
393	0.36
394	0.36
395	0.38
396	0.36
397	0.3
398	0.29
399	0.28
400	0.25
401	0.24
402	0.24
403	0.18
404	0.16
405	0.15
406	0.14
407	0.13
408	0.13
409	0.12
410	0.09
411	0.09
412	0.06
413	0.1
414	0.09
415	0.11
416	0.13
417	0.17
418	0.19
419	0.22
420	0.23
421	0.24
422	0.28
423	0.33
424	0.32
425	0.31
426	0.35
427	0.34
428	0.34
429	0.29
430	0.26
431	0.19
432	0.19
433	0.16
434	0.1
435	0.09
436	0.09
437	0.08
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.08
442	0.09
443	0.09
444	0.09
445	0.1
446	0.1
447	0.1
448	0.12
449	0.11
450	0.14
451	0.16
452	0.18
453	0.17
454	0.17
455	0.16
456	0.18
457	0.18
458	0.15
459	0.15
460	0.13
461	0.15
462	0.16
463	0.15
464	0.12
465	0.12
466	0.11
467	0.09
468	0.09
469	0.07
470	0.09
471	0.09
472	0.09
473	0.09
474	0.09
475	0.13
476	0.2
477	0.28
478	0.32
479	0.4
480	0.45
481	0.46
482	0.53
483	0.58
484	0.56
485	0.55
486	0.56
487	0.56
488	0.56
489	0.57
490	0.49
491	0.42
492	0.39
493	0.37
494	0.34
495	0.33
496	0.33
497	0.31
498	0.32
499	0.31
500	0.31
501	0.28
502	0.31
503	0.26
504	0.27
505	0.31
506	0.3
507	0.3
508	0.29
509	0.27
510	0.25
511	0.26
512	0.26
513	0.21
514	0.23
515	0.3
516	0.38
517	0.4
518	0.4
519	0.39
520	0.37
521	0.41
522	0.41
523	0.36
524	0.28
525	0.25
526	0.25
527	0.26
528	0.25
529	0.21
530	0.19
531	0.2
532	0.18
533	0.17
534	0.15
535	0.12
536	0.13
537	0.13
538	0.13
539	0.11
540	0.11
541	0.12
542	0.11
543	0.09
544	0.08
545	0.07
546	0.07
547	0.07
548	0.07
549	0.07
550	0.06
551	0.06
552	0.07
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.09
557	0.11
558	0.11
559	0.12
560	0.12
561	0.15
562	0.16
563	0.18
564	0.17
565	0.14
566	0.16
567	0.16
568	0.14
569	0.12
570	0.11
571	0.1
572	0.08
573	0.07
574	0.06
575	0.06
576	0.07
577	0.06
578	0.06
579	0.1
580	0.12
581	0.17
582	0.21
583	0.24
584	0.32
585	0.4
586	0.5
587	0.55
588	0.6
589	0.63
590	0.69
591	0.73
592	0.69
593	0.65
594	0.56
595	0.51
596	0.52
597	0.52
598	0.45
599	0.41
600	0.42
601	0.4
602	0.44
603	0.52
604	0.53
605	0.51
606	0.52
607	0.52
608	0.5
609	0.5
610	0.45
611	0.35
612	0.27
613	0.31
614	0.34
615	0.35

A0A1Y2FSH6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer