Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2FDI0

Protein Details
Accession A0A1Y2FDI0    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-77EAVEVPVKEKRKKQKRKRDDVLLEDLYHydrophilic
329-350VTRATKMPSKHKSEQKERDQITHydrophilic
388-415GERASKPDGARKKKKSKGSLARSKARAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-68KEKRKKQKRKR
318-366KKLGEKGRKLRVTRATKMPSKHKSEQKERDQITNPNLKPRDKAKLGRVK
388-416GERASKPDGARKKKKSKGSLARSKARAAV
Subcellular Location(s) nucl 17, mito_nucl 12.166, cyto_nucl 11.166, mito 6, cyto_mito 5.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034221  RBM34_RRM2  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12395  RRM2_RBM34  
Amino Acid Sequences MDTAIDKTIADLFAASAGPIKAAPKKDRFLHVEQPTQTVEQAPEPAASEEEAVEVPVKEKRKKQKRKRDDVLLEDLYMSKLAASDEPVAKKATHEPTPVEPASGSVSDSGSVSDSGSVSDSEGEEMPAGDNLVHESQQRQDKELNKAQSTVFCGNLPTTVITSHTTFKQLKALFSQHGRVLSIRFRSIAFSELLPRKVAFVQGKFHPERDTANAYIVYNDPEAARKALSLNGSVFLEKHIRVDSVAHPAAHENKKCVFVGSLPFEAKEEPLWKHFSVAGEIESVRIIRDRKTNVGKGFAYVQFKDASSVQNALLLNEKKLGEKGRKLRVTRATKMPSKHKSEQKERDQITNPNLKPRDKAKLGRVKNLMGSQAAAKLKLLQKELALEGERASKPDGARKKKKSKGSLARSKARAAVYRKVEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.11
7 0.15
8 0.2
9 0.28
10 0.37
11 0.41
12 0.49
13 0.54
14 0.62
15 0.65
16 0.66
17 0.69
18 0.67
19 0.68
20 0.62
21 0.6
22 0.54
23 0.48
24 0.41
25 0.33
26 0.28
27 0.22
28 0.22
29 0.2
30 0.18
31 0.19
32 0.19
33 0.17
34 0.15
35 0.14
36 0.11
37 0.11
38 0.1
39 0.09
40 0.1
41 0.09
42 0.11
43 0.15
44 0.23
45 0.28
46 0.37
47 0.48
48 0.58
49 0.69
50 0.79
51 0.85
52 0.89
53 0.93
54 0.94
55 0.94
56 0.92
57 0.88
58 0.85
59 0.75
60 0.64
61 0.53
62 0.44
63 0.33
64 0.24
65 0.17
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.1
71 0.14
72 0.19
73 0.21
74 0.22
75 0.23
76 0.22
77 0.24
78 0.29
79 0.31
80 0.32
81 0.33
82 0.35
83 0.38
84 0.45
85 0.43
86 0.35
87 0.29
88 0.24
89 0.24
90 0.21
91 0.17
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.11
96 0.1
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.05
117 0.05
118 0.07
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.15
124 0.23
125 0.23
126 0.24
127 0.29
128 0.34
129 0.42
130 0.47
131 0.48
132 0.42
133 0.43
134 0.41
135 0.38
136 0.38
137 0.31
138 0.25
139 0.19
140 0.19
141 0.17
142 0.17
143 0.15
144 0.1
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.1
149 0.12
150 0.13
151 0.14
152 0.19
153 0.19
154 0.2
155 0.25
156 0.25
157 0.25
158 0.27
159 0.29
160 0.27
161 0.28
162 0.3
163 0.24
164 0.24
165 0.23
166 0.2
167 0.19
168 0.2
169 0.2
170 0.18
171 0.17
172 0.16
173 0.17
174 0.17
175 0.17
176 0.13
177 0.11
178 0.17
179 0.2
180 0.2
181 0.2
182 0.19
183 0.18
184 0.18
185 0.22
186 0.19
187 0.18
188 0.21
189 0.23
190 0.3
191 0.3
192 0.31
193 0.27
194 0.25
195 0.24
196 0.24
197 0.25
198 0.19
199 0.2
200 0.19
201 0.17
202 0.17
203 0.16
204 0.13
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.08
214 0.1
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.12
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.12
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.14
230 0.14
231 0.19
232 0.2
233 0.18
234 0.18
235 0.19
236 0.27
237 0.31
238 0.3
239 0.26
240 0.27
241 0.29
242 0.29
243 0.28
244 0.21
245 0.17
246 0.22
247 0.22
248 0.23
249 0.21
250 0.21
251 0.21
252 0.2
253 0.18
254 0.15
255 0.15
256 0.14
257 0.17
258 0.21
259 0.21
260 0.22
261 0.23
262 0.21
263 0.2
264 0.19
265 0.16
266 0.13
267 0.13
268 0.12
269 0.11
270 0.1
271 0.08
272 0.1
273 0.11
274 0.13
275 0.2
276 0.23
277 0.31
278 0.39
279 0.45
280 0.44
281 0.49
282 0.46
283 0.41
284 0.42
285 0.38
286 0.35
287 0.29
288 0.28
289 0.24
290 0.23
291 0.24
292 0.2
293 0.18
294 0.15
295 0.17
296 0.15
297 0.17
298 0.17
299 0.16
300 0.22
301 0.21
302 0.2
303 0.22
304 0.23
305 0.2
306 0.24
307 0.3
308 0.3
309 0.38
310 0.46
311 0.52
312 0.6
313 0.61
314 0.66
315 0.7
316 0.71
317 0.69
318 0.7
319 0.68
320 0.66
321 0.71
322 0.73
323 0.71
324 0.71
325 0.74
326 0.72
327 0.75
328 0.8
329 0.83
330 0.83
331 0.84
332 0.78
333 0.77
334 0.74
335 0.7
336 0.68
337 0.68
338 0.59
339 0.59
340 0.61
341 0.55
342 0.56
343 0.55
344 0.57
345 0.55
346 0.61
347 0.62
348 0.67
349 0.7
350 0.73
351 0.72
352 0.65
353 0.63
354 0.58
355 0.5
356 0.4
357 0.36
358 0.28
359 0.3
360 0.28
361 0.22
362 0.2
363 0.24
364 0.28
365 0.32
366 0.33
367 0.29
368 0.29
369 0.32
370 0.33
371 0.31
372 0.28
373 0.24
374 0.22
375 0.28
376 0.27
377 0.25
378 0.26
379 0.25
380 0.26
381 0.35
382 0.44
383 0.47
384 0.58
385 0.67
386 0.75
387 0.8
388 0.88
389 0.89
390 0.9
391 0.9
392 0.9
393 0.9
394 0.89
395 0.9
396 0.84
397 0.78
398 0.72
399 0.67
400 0.64
401 0.59
402 0.59