Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2FGZ4

Protein Details
Accession A0A1Y2FGZ4    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-74PAERTVKKRKVHVKEAPDANNKNHydrophilic
645-664ENVGVVKRRQEKEKMHKEKABasic
704-725AQAKMGKIISKKRQMKRGKRQAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
652-667RRQEKEKMHKEKALSA
685-725ERRRKRAGNKPSALDAEAAAQAKMGKIISKKRQMKRGKRQA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12676  RRM3_Nop4p  
Amino Acid Sequences MVSAKKQAFLDRKKTLKEAGGQDGDEAVKPEIIVRPSKKRTQTEVAETAHEPAERTVKKRKVHVKEAPDANNKNATLFVRNLSFKTTQEQLEAFFSAVSPVKHTVIITNPETSVSLGYGFVSFATAEDAALAKSELSMAPLDDRLVKIDFAEKRARKDEAEAEKKQATKQARLDATKESHQAELILRNLSFKVRDPVQLRRVFEKFGGIKDVRIPRGPGAKMRGFGFVVFKKREHAAKAIEALNGIDLEGRPIAVDWSVKKEESEEATAEDEDEDEAQSDENEDEDEDEDDEEAYDEVEEGEKNAGEGSKDSEEDSEENSDEESDTPDQRSSTLFVRNLLFETTETEIYTFFKQFGPLRYARIVMDHFTGRSRGTAFVAFVHVADAQACLALYRTLPKNVTHDATSLLLSEERKEGTLGRFVLGGRLLDINEALSRDDAAQQVDKHDAAKRAEKGKGVDKRNLFLLNEGRIGGSHPLLPLLSEQDQSMRSASFTQRKSLVARNPGLHLSLTRLSVRNLPRHIGDKELKYLARQSIVGFGQDVKAGLRESLTKEELARDSSKSSATGVVKQAKVVLEKDGSRSRGYGFISFASHRFALMGLRWLNARQIGSKLDLVKMKNAQPMDPGRDVSQDDRKRRLIVEFAIENVGVVKRRQEKEKMHKEKALSAKDLKAQQERQRAEEVEDERRRKRAGNKPSALDAEAAAQAKMGKIISKKRQMKRGKRQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.67
3 0.63
4 0.62
5 0.59
6 0.59
7 0.55
8 0.5
9 0.46
10 0.42
11 0.37
12 0.29
13 0.25
14 0.17
15 0.13
16 0.13
17 0.15
18 0.18
19 0.21
20 0.29
21 0.33
22 0.43
23 0.5
24 0.59
25 0.66
26 0.68
27 0.73
28 0.74
29 0.75
30 0.73
31 0.74
32 0.67
33 0.62
34 0.55
35 0.49
36 0.42
37 0.34
38 0.27
39 0.21
40 0.29
41 0.29
42 0.33
43 0.41
44 0.47
45 0.52
46 0.61
47 0.69
48 0.69
49 0.76
50 0.8
51 0.78
52 0.8
53 0.83
54 0.82
55 0.81
56 0.75
57 0.68
58 0.65
59 0.56
60 0.47
61 0.42
62 0.35
63 0.3
64 0.29
65 0.28
66 0.27
67 0.29
68 0.29
69 0.31
70 0.31
71 0.28
72 0.31
73 0.32
74 0.28
75 0.29
76 0.29
77 0.25
78 0.26
79 0.25
80 0.21
81 0.16
82 0.14
83 0.14
84 0.16
85 0.14
86 0.14
87 0.17
88 0.18
89 0.19
90 0.19
91 0.2
92 0.23
93 0.28
94 0.27
95 0.27
96 0.26
97 0.25
98 0.26
99 0.23
100 0.18
101 0.12
102 0.1
103 0.08
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.09
127 0.1
128 0.11
129 0.12
130 0.12
131 0.13
132 0.14
133 0.14
134 0.13
135 0.19
136 0.21
137 0.24
138 0.34
139 0.35
140 0.4
141 0.44
142 0.46
143 0.4
144 0.43
145 0.47
146 0.48
147 0.53
148 0.5
149 0.5
150 0.51
151 0.52
152 0.48
153 0.46
154 0.4
155 0.4
156 0.43
157 0.47
158 0.5
159 0.51
160 0.51
161 0.51
162 0.5
163 0.47
164 0.44
165 0.37
166 0.31
167 0.28
168 0.28
169 0.23
170 0.23
171 0.21
172 0.19
173 0.18
174 0.18
175 0.19
176 0.19
177 0.18
178 0.16
179 0.2
180 0.2
181 0.28
182 0.3
183 0.39
184 0.46
185 0.5
186 0.5
187 0.51
188 0.5
189 0.45
190 0.41
191 0.4
192 0.33
193 0.29
194 0.34
195 0.28
196 0.27
197 0.33
198 0.38
199 0.33
200 0.33
201 0.34
202 0.3
203 0.38
204 0.38
205 0.36
206 0.36
207 0.37
208 0.37
209 0.36
210 0.35
211 0.28
212 0.27
213 0.28
214 0.26
215 0.3
216 0.3
217 0.29
218 0.29
219 0.32
220 0.35
221 0.32
222 0.33
223 0.29
224 0.3
225 0.34
226 0.33
227 0.29
228 0.25
229 0.22
230 0.18
231 0.14
232 0.11
233 0.07
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.08
243 0.08
244 0.14
245 0.16
246 0.16
247 0.16
248 0.17
249 0.19
250 0.2
251 0.22
252 0.16
253 0.15
254 0.17
255 0.16
256 0.15
257 0.12
258 0.09
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.08
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.13
303 0.11
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.1
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.12
318 0.11
319 0.13
320 0.17
321 0.17
322 0.18
323 0.19
324 0.19
325 0.19
326 0.17
327 0.15
328 0.09
329 0.11
330 0.11
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.12
337 0.1
338 0.09
339 0.09
340 0.12
341 0.14
342 0.16
343 0.2
344 0.2
345 0.22
346 0.22
347 0.23
348 0.2
349 0.2
350 0.18
351 0.14
352 0.15
353 0.12
354 0.12
355 0.12
356 0.13
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.1
361 0.1
362 0.11
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.1
367 0.09
368 0.09
369 0.07
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.03
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.08
381 0.1
382 0.13
383 0.14
384 0.16
385 0.19
386 0.22
387 0.23
388 0.2
389 0.19
390 0.18
391 0.17
392 0.16
393 0.12
394 0.1
395 0.1
396 0.09
397 0.1
398 0.1
399 0.09
400 0.09
401 0.09
402 0.11
403 0.11
404 0.15
405 0.15
406 0.14
407 0.15
408 0.14
409 0.15
410 0.14
411 0.12
412 0.08
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.06
418 0.06
419 0.07
420 0.06
421 0.05
422 0.06
423 0.06
424 0.08
425 0.09
426 0.09
427 0.11
428 0.11
429 0.13
430 0.14
431 0.14
432 0.14
433 0.17
434 0.21
435 0.21
436 0.27
437 0.31
438 0.34
439 0.37
440 0.38
441 0.37
442 0.41
443 0.47
444 0.45
445 0.47
446 0.44
447 0.42
448 0.43
449 0.42
450 0.33
451 0.29
452 0.29
453 0.24
454 0.23
455 0.22
456 0.18
457 0.16
458 0.17
459 0.14
460 0.1
461 0.09
462 0.08
463 0.09
464 0.09
465 0.09
466 0.08
467 0.1
468 0.11
469 0.11
470 0.11
471 0.13
472 0.14
473 0.14
474 0.15
475 0.11
476 0.1
477 0.13
478 0.19
479 0.25
480 0.26
481 0.29
482 0.3
483 0.32
484 0.35
485 0.39
486 0.39
487 0.39
488 0.42
489 0.41
490 0.4
491 0.39
492 0.36
493 0.29
494 0.23
495 0.2
496 0.18
497 0.18
498 0.18
499 0.18
500 0.19
501 0.26
502 0.31
503 0.34
504 0.34
505 0.34
506 0.34
507 0.39
508 0.38
509 0.39
510 0.39
511 0.35
512 0.37
513 0.38
514 0.36
515 0.32
516 0.36
517 0.3
518 0.27
519 0.24
520 0.21
521 0.22
522 0.22
523 0.21
524 0.17
525 0.15
526 0.14
527 0.14
528 0.14
529 0.08
530 0.09
531 0.09
532 0.09
533 0.09
534 0.12
535 0.15
536 0.19
537 0.2
538 0.2
539 0.2
540 0.24
541 0.25
542 0.26
543 0.24
544 0.21
545 0.21
546 0.22
547 0.22
548 0.19
549 0.18
550 0.21
551 0.21
552 0.25
553 0.3
554 0.35
555 0.35
556 0.34
557 0.36
558 0.32
559 0.32
560 0.28
561 0.26
562 0.22
563 0.23
564 0.29
565 0.33
566 0.33
567 0.31
568 0.31
569 0.29
570 0.3
571 0.31
572 0.27
573 0.22
574 0.22
575 0.24
576 0.24
577 0.24
578 0.23
579 0.2
580 0.18
581 0.16
582 0.15
583 0.14
584 0.14
585 0.2
586 0.17
587 0.18
588 0.19
589 0.19
590 0.21
591 0.22
592 0.22
593 0.18
594 0.2
595 0.21
596 0.23
597 0.27
598 0.26
599 0.27
600 0.31
601 0.3
602 0.33
603 0.37
604 0.38
605 0.4
606 0.39
607 0.35
608 0.38
609 0.43
610 0.43
611 0.4
612 0.37
613 0.33
614 0.35
615 0.37
616 0.36
617 0.4
618 0.42
619 0.46
620 0.52
621 0.54
622 0.54
623 0.54
624 0.52
625 0.48
626 0.43
627 0.43
628 0.37
629 0.35
630 0.33
631 0.3
632 0.26
633 0.21
634 0.2
635 0.14
636 0.14
637 0.21
638 0.28
639 0.34
640 0.41
641 0.49
642 0.58
643 0.67
644 0.78
645 0.8
646 0.79
647 0.79
648 0.75
649 0.75
650 0.73
651 0.69
652 0.64
653 0.59
654 0.56
655 0.57
656 0.6
657 0.58
658 0.57
659 0.59
660 0.61
661 0.66
662 0.64
663 0.62
664 0.62
665 0.57
666 0.51
667 0.51
668 0.47
669 0.47
670 0.53
671 0.56
672 0.54
673 0.58
674 0.57
675 0.56
676 0.62
677 0.62
678 0.64
679 0.68
680 0.71
681 0.71
682 0.74
683 0.7
684 0.61
685 0.52
686 0.41
687 0.33
688 0.29
689 0.25
690 0.18
691 0.15
692 0.15
693 0.14
694 0.16
695 0.14
696 0.15
697 0.22
698 0.32
699 0.42
700 0.52
701 0.62
702 0.68
703 0.78
704 0.84
705 0.88