Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2FR09

Protein Details
Accession A0A1Y2FR09    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-98VIPGSASKKKEKKEKKVRDPDMPKRPVTBasic
206-235QDVPSTPKSSKKRGRPAKKDGQPSAKKVKTHydrophilic
238-263QEAPAETPKAEKKKKERKKKSAEQSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-90SKKKEKKEKKVRDP
213-258KSSKKRGRPAKKDGQPSAKKVKTPAQEAPAETPKAEKKKKERKKKS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 11, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR031061  HMGB_plant  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MLEQTNKLQEKYDSVLGCTRLLTEAHAALIRSVKDLNEYVQETHPELDTEASVSTLVAPSNAAPATHEAPVIPGSASKKKEKKEKKVRDPDMPKRPVTAFFHFQNAIRQEMKNSLPDSASAADVQQALAAKWKEMDTEARKPYVAANEEALRAYTREMDTYNKSHGIAPKQAPAKKTTPAAEPSSPNTSPSAEDEEDDVAAASVLQDVPSTPKSSKKRGRPAKKDGQPSAKKVKTPAQEAPAETPKAEKKKKERKKKSAEQSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.35
3 0.34
4 0.32
5 0.28
6 0.23
7 0.19
8 0.18
9 0.18
10 0.16
11 0.15
12 0.16
13 0.17
14 0.16
15 0.16
16 0.19
17 0.17
18 0.16
19 0.16
20 0.15
21 0.17
22 0.18
23 0.18
24 0.2
25 0.22
26 0.23
27 0.25
28 0.27
29 0.25
30 0.25
31 0.23
32 0.18
33 0.17
34 0.15
35 0.12
36 0.11
37 0.09
38 0.08
39 0.08
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.09
51 0.12
52 0.14
53 0.15
54 0.15
55 0.11
56 0.13
57 0.13
58 0.13
59 0.09
60 0.1
61 0.14
62 0.2
63 0.24
64 0.32
65 0.38
66 0.45
67 0.55
68 0.64
69 0.7
70 0.75
71 0.83
72 0.85
73 0.9
74 0.89
75 0.89
76 0.89
77 0.87
78 0.87
79 0.8
80 0.7
81 0.62
82 0.57
83 0.52
84 0.48
85 0.43
86 0.37
87 0.33
88 0.36
89 0.34
90 0.33
91 0.33
92 0.29
93 0.27
94 0.24
95 0.23
96 0.2
97 0.24
98 0.24
99 0.22
100 0.21
101 0.19
102 0.17
103 0.17
104 0.17
105 0.14
106 0.13
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.17
123 0.18
124 0.26
125 0.28
126 0.27
127 0.27
128 0.27
129 0.28
130 0.26
131 0.23
132 0.16
133 0.17
134 0.17
135 0.18
136 0.17
137 0.16
138 0.11
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.09
143 0.1
144 0.11
145 0.14
146 0.18
147 0.2
148 0.22
149 0.2
150 0.21
151 0.22
152 0.26
153 0.27
154 0.3
155 0.29
156 0.33
157 0.39
158 0.4
159 0.39
160 0.4
161 0.38
162 0.35
163 0.38
164 0.34
165 0.32
166 0.34
167 0.38
168 0.37
169 0.36
170 0.36
171 0.38
172 0.36
173 0.32
174 0.29
175 0.25
176 0.22
177 0.23
178 0.25
179 0.19
180 0.19
181 0.19
182 0.19
183 0.17
184 0.16
185 0.13
186 0.07
187 0.06
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.09
196 0.11
197 0.15
198 0.15
199 0.25
200 0.31
201 0.42
202 0.51
203 0.58
204 0.67
205 0.75
206 0.85
207 0.86
208 0.9
209 0.9
210 0.89
211 0.89
212 0.86
213 0.86
214 0.83
215 0.8
216 0.81
217 0.74
218 0.69
219 0.64
220 0.64
221 0.6
222 0.6
223 0.59
224 0.55
225 0.55
226 0.55
227 0.57
228 0.55
229 0.49
230 0.42
231 0.41
232 0.43
233 0.49
234 0.54
235 0.56
236 0.61
237 0.71
238 0.82
239 0.87
240 0.9
241 0.91
242 0.94
243 0.95