FuNGI

A0A1Y2F8V6

Protein Details

Accession

A0A1Y2F8V6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
156-180	DDAGDKTPPRTRKRRWDVAEPTVEE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 14, cyto 5, nucl 3, E.R. 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSKSSEQQGSQRGTEHKGIAFNAAADELYENPSDKYDGYARELDVSGASPEPEDESSRRLVANYTAPKELLDEFAGEDDDGLQLVTDKNVSRQIAARESDYQRRRFDRALSPQDGKTIAEVMQQRELEREEARVQREIEKRQQEGTTDGGKTPPRDDAGDKTPPRTRKRRWDVAEPTVEETPVASSGTPTKKSRWDQPAEVEAPRKSRWDQTPAPVADAAVEKVDVPRGGLGMDLQGRPLPYTDEELDIILPKAGYKILEPPAGYEPLRAAAKKLTSAPEVSTGFTMQEPDSMQAKMMSEQLPTDIPGVGDLQFFKQEDMKYFGALMDTTDENLLTVAELKERKIMRLILKVKNGAPPTRKSALRQLTDNARAFGADALFKQILPILMERTLEDQERHLLVKIIDRILYKLDDLVRPWVHRILVVIEPLLIDEDFYARVEGREIISNLSKAAGLAHMIATMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPAILPFLKAVCKSKKSWQARHTGVKIIQQIAILMGCAVLPHLKQLVDCIGLGLTDEQQKVRTMTALAIAALAEAATPYGIESFDSVLKPLWVGIRKHRGKGLAAFLKATGYIIPLMDPEWADHFTKEVMTVLTREFTSPDEEMKKIVLKVVSQCAATDGVTAGFLQSQVMPDFFRNFWIRRMALDRRNYRQVVETTVELAQKVGVVEIVDRVVDTLKDESEPYRRMGVETIDKVIAAGGAAELTDRVEERLVDGILFAFQEQTVEDPIMLNGFGTVVNALGLRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSANVRQQSADLISRVAVVMKTCGEEQLMGKLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGALKSIVNVVGMSSMTPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENSIDLVGRIADRGSEFVSAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAAVNTFGYIAKAIGPSDVLATLLNNLRVQERQNRVCTTVAIAIVAETCAPFTVVPALMAEYRVPELTVRTGVLKSLAFMFEYIGDMARDYVYAVGPLLEDALTDRDHVHRQTAATAIKHLSLGVVGLGCEDLMVHLLNLVWPNIFETSPHVINAMTDAVSGIRTALGPGLVSNYLLAGLFHPARKVRNIYTKLYNDMYVQQAAAMTPYYPQIEADKRNDWYRHTAQVWI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.45
3	0.4
4	0.39
5	0.38
6	0.35
7	0.32
8	0.27
9	0.22
10	0.19
11	0.15
12	0.12
13	0.12
14	0.1
15	0.12
16	0.13
17	0.13
18	0.13
19	0.15
20	0.16
21	0.15
22	0.18
23	0.21
24	0.23
25	0.27
26	0.3
27	0.3
28	0.32
29	0.32
30	0.28
31	0.23
32	0.21
33	0.17
34	0.15
35	0.14
36	0.11
37	0.11
38	0.13
39	0.14
40	0.18
41	0.18
42	0.2
43	0.23
44	0.24
45	0.25
46	0.22
47	0.23
48	0.23
49	0.31
50	0.36
51	0.37
52	0.37
53	0.37
54	0.36
55	0.36
56	0.33
57	0.26
58	0.19
59	0.16
60	0.14
61	0.15
62	0.16
63	0.13
64	0.12
65	0.09
66	0.08
67	0.07
68	0.06
69	0.05
70	0.06
71	0.07
72	0.07
73	0.1
74	0.11
75	0.14
76	0.21
77	0.22
78	0.23
79	0.27
80	0.33
81	0.37
82	0.38
83	0.38
84	0.4
85	0.45
86	0.53
87	0.56
88	0.56
89	0.58
90	0.61
91	0.63
92	0.59
93	0.61
94	0.61
95	0.64
96	0.67
97	0.65
98	0.64
99	0.6
100	0.59
101	0.52
102	0.42
103	0.33
104	0.25
105	0.19
106	0.21
107	0.24
108	0.24
109	0.29
110	0.3
111	0.29
112	0.3
113	0.31
114	0.29
115	0.26
116	0.27
117	0.28
118	0.33
119	0.35
120	0.37
121	0.37
122	0.42
123	0.48
124	0.52
125	0.54
126	0.56
127	0.55
128	0.56
129	0.56
130	0.49
131	0.44
132	0.42
133	0.38
134	0.32
135	0.3
136	0.3
137	0.32
138	0.32
139	0.31
140	0.31
141	0.28
142	0.29
143	0.32
144	0.33
145	0.36
146	0.44
147	0.44
148	0.46
149	0.5
150	0.56
151	0.62
152	0.66
153	0.69
154	0.71
155	0.79
156	0.83
157	0.83
158	0.85
159	0.84
160	0.83
161	0.81
162	0.71
163	0.65
164	0.55
165	0.48
166	0.37
167	0.29
168	0.2
169	0.13
170	0.12
171	0.08
172	0.08
173	0.16
174	0.23
175	0.28
176	0.3
177	0.34
178	0.43
179	0.48
180	0.57
181	0.59
182	0.6
183	0.59
184	0.63
185	0.67
186	0.61
187	0.59
188	0.55
189	0.48
190	0.45
191	0.41
192	0.39
193	0.33
194	0.39
195	0.42
196	0.45
197	0.48
198	0.5
199	0.58
200	0.55
201	0.54
202	0.46
203	0.39
204	0.32
205	0.28
206	0.21
207	0.12
208	0.11
209	0.09
210	0.1
211	0.12
212	0.1
213	0.1
214	0.1
215	0.09
216	0.09
217	0.09
218	0.08
219	0.1
220	0.13
221	0.12
222	0.13
223	0.14
224	0.14
225	0.15
226	0.15
227	0.14
228	0.12
229	0.17
230	0.18
231	0.18
232	0.18
233	0.18
234	0.18
235	0.16
236	0.15
237	0.11
238	0.09
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.15
245	0.18
246	0.22
247	0.21
248	0.24
249	0.26
250	0.29
251	0.28
252	0.22
253	0.19
254	0.2
255	0.23
256	0.2
257	0.18
258	0.19
259	0.21
260	0.23
261	0.25
262	0.24
263	0.24
264	0.25
265	0.25
266	0.27
267	0.26
268	0.24
269	0.22
270	0.18
271	0.17
272	0.16
273	0.16
274	0.1
275	0.11
276	0.12
277	0.13
278	0.15
279	0.14
280	0.14
281	0.14
282	0.14
283	0.14
284	0.16
285	0.15
286	0.13
287	0.13
288	0.14
289	0.14
290	0.14
291	0.13
292	0.1
293	0.09
294	0.09
295	0.1
296	0.09
297	0.1
298	0.09
299	0.1
300	0.12
301	0.12
302	0.12
303	0.16
304	0.16
305	0.18
306	0.24
307	0.23
308	0.21
309	0.21
310	0.2
311	0.16
312	0.15
313	0.12
314	0.09
315	0.09
316	0.09
317	0.09
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.07
322	0.04
323	0.06
324	0.06
325	0.1
326	0.11
327	0.12
328	0.18
329	0.19
330	0.2
331	0.22
332	0.27
333	0.28
334	0.36
335	0.43
336	0.44
337	0.48
338	0.5
339	0.48
340	0.49
341	0.48
342	0.44
343	0.42
344	0.39
345	0.42
346	0.44
347	0.44
348	0.41
349	0.48
350	0.5
351	0.48
352	0.47
353	0.44
354	0.46
355	0.52
356	0.5
357	0.4
358	0.32
359	0.28
360	0.26
361	0.23
362	0.16
363	0.09
364	0.08
365	0.11
366	0.11
367	0.11
368	0.11
369	0.11
370	0.11
371	0.11
372	0.12
373	0.1
374	0.11
375	0.12
376	0.12
377	0.14
378	0.14
379	0.15
380	0.14
381	0.14
382	0.15
383	0.16
384	0.16
385	0.14
386	0.15
387	0.14
388	0.18
389	0.2
390	0.18
391	0.19
392	0.19
393	0.19
394	0.19
395	0.19
396	0.14
397	0.14
398	0.15
399	0.14
400	0.15
401	0.21
402	0.21
403	0.21
404	0.23
405	0.22
406	0.2
407	0.19
408	0.19
409	0.15
410	0.15
411	0.14
412	0.12
413	0.1
414	0.1
415	0.1
416	0.09
417	0.06
418	0.04
419	0.04
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.06
424	0.05
425	0.06
426	0.07
427	0.08
428	0.08
429	0.11
430	0.11
431	0.12
432	0.14
433	0.14
434	0.13
435	0.12
436	0.11
437	0.08
438	0.08
439	0.06
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.05
450	0.06
451	0.06
452	0.08
453	0.09
454	0.09
455	0.12
456	0.12
457	0.14
458	0.15
459	0.14
460	0.12
461	0.12
462	0.12
463	0.12
464	0.11
465	0.1
466	0.09
467	0.09
468	0.09
469	0.09
470	0.08
471	0.06
472	0.06
473	0.05
474	0.04
475	0.04
476	0.03
477	0.03
478	0.03
479	0.03
480	0.03
481	0.03
482	0.04
483	0.06
484	0.08
485	0.14
486	0.19
487	0.23
488	0.26
489	0.34
490	0.44
491	0.51
492	0.59
493	0.6
494	0.63
495	0.66
496	0.71
497	0.65
498	0.6
499	0.53
500	0.48
501	0.44
502	0.36
503	0.31
504	0.23
505	0.21
506	0.16
507	0.13
508	0.08
509	0.05
510	0.04
511	0.03
512	0.03
513	0.03
514	0.04
515	0.04
516	0.05
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.08
521	0.09
522	0.09
523	0.09
524	0.08
525	0.07
526	0.06
527	0.07
528	0.06
529	0.06
530	0.08
531	0.09
532	0.09
533	0.1
534	0.11
535	0.12
536	0.12
537	0.11
538	0.08
539	0.08
540	0.1
541	0.09
542	0.08
543	0.07
544	0.06
545	0.06
546	0.05
547	0.04
548	0.02
549	0.02
550	0.02
551	0.02
552	0.02
553	0.02
554	0.02
555	0.03
556	0.03
557	0.03
558	0.05
559	0.06
560	0.07
561	0.07
562	0.07
563	0.07
564	0.07
565	0.07
566	0.1
567	0.13
568	0.15
569	0.21
570	0.32
571	0.34
572	0.36
573	0.38
574	0.36
575	0.33
576	0.36
577	0.37
578	0.31
579	0.29
580	0.27
581	0.25
582	0.23
583	0.21
584	0.17
585	0.09
586	0.05
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.06
593	0.06
594	0.05
595	0.07
596	0.09
597	0.09
598	0.09
599	0.09
600	0.09
601	0.09
602	0.09
603	0.08
604	0.06
605	0.06
606	0.07
607	0.07
608	0.08
609	0.08
610	0.08
611	0.08
612	0.08
613	0.11
614	0.11
615	0.14
616	0.15
617	0.15
618	0.16
619	0.16
620	0.17
621	0.14
622	0.16
623	0.13
624	0.12
625	0.15
626	0.18
627	0.18
628	0.16
629	0.16
630	0.15
631	0.15
632	0.13
633	0.11
634	0.07
635	0.06
636	0.06
637	0.06
638	0.05
639	0.04
640	0.04
641	0.04
642	0.04
643	0.05
644	0.06
645	0.06
646	0.07
647	0.08
648	0.1
649	0.1
650	0.14
651	0.17
652	0.17
653	0.2
654	0.24
655	0.24
656	0.23
657	0.3
658	0.33
659	0.36
660	0.44
661	0.47
662	0.48
663	0.55
664	0.53
665	0.48
666	0.45
667	0.39
668	0.35
669	0.3
670	0.25
671	0.2
672	0.21
673	0.2
674	0.15
675	0.14
676	0.1
677	0.08
678	0.08
679	0.06
680	0.05
681	0.04
682	0.05
683	0.05
684	0.05
685	0.04
686	0.04
687	0.05
688	0.05
689	0.05
690	0.06
691	0.06
692	0.07
693	0.07
694	0.08
695	0.1
696	0.16
697	0.18
698	0.18
699	0.2
700	0.2
701	0.2
702	0.21
703	0.22
704	0.22
705	0.21
706	0.22
707	0.18
708	0.18
709	0.17
710	0.16
711	0.12
712	0.06
713	0.05
714	0.03
715	0.02
716	0.03
717	0.03
718	0.03
719	0.03
720	0.03
721	0.04
722	0.04
723	0.05
724	0.05
725	0.06
726	0.08
727	0.08
728	0.07
729	0.07
730	0.07
731	0.07
732	0.07
733	0.06
734	0.04
735	0.04
736	0.04
737	0.04
738	0.05
739	0.06
740	0.06
741	0.06
742	0.06
743	0.06
744	0.06
745	0.06
746	0.05
747	0.04
748	0.04
749	0.04
750	0.04
751	0.04
752	0.03
753	0.04
754	0.04
755	0.04
756	0.07
757	0.07
758	0.1
759	0.1
760	0.11
761	0.12
762	0.18
763	0.26
764	0.26
765	0.28
766	0.28
767	0.3
768	0.3
769	0.3
770	0.27
771	0.21
772	0.21
773	0.2
774	0.21
775	0.25
776	0.28
777	0.29
778	0.35
779	0.38
780	0.45
781	0.48
782	0.46
783	0.41
784	0.38
785	0.38
786	0.32
787	0.28
788	0.19
789	0.16
790	0.13
791	0.13
792	0.12
793	0.11
794	0.09
795	0.07
796	0.08
797	0.08
798	0.09
799	0.09
800	0.1
801	0.09
802	0.1
803	0.1
804	0.13
805	0.14
806	0.13
807	0.12
808	0.12
809	0.12
810	0.11
811	0.1
812	0.07
813	0.05
814	0.05
815	0.06
816	0.06
817	0.06
818	0.06
819	0.06
820	0.06
821	0.06
822	0.05
823	0.05
824	0.04
825	0.04
826	0.04
827	0.04
828	0.05
829	0.04
830	0.04
831	0.05
832	0.05
833	0.05
834	0.05
835	0.05
836	0.04
837	0.04
838	0.04
839	0.05
840	0.05
841	0.06
842	0.06
843	0.09
844	0.09
845	0.09
846	0.1
847	0.11
848	0.13
849	0.14
850	0.16
851	0.2
852	0.22
853	0.23
854	0.26
855	0.29
856	0.32
857	0.38
858	0.45
859	0.45
860	0.5
861	0.52
862	0.58
863	0.61
864	0.63
865	0.61
866	0.6
867	0.57
868	0.52
869	0.5
870	0.41
871	0.35
872	0.27
873	0.23
874	0.14
875	0.11
876	0.08
877	0.07
878	0.07
879	0.07
880	0.08
881	0.09
882	0.11
883	0.11
884	0.12
885	0.13
886	0.14
887	0.15
888	0.18
889	0.18
890	0.15
891	0.19
892	0.2
893	0.19
894	0.17
895	0.17
896	0.17
897	0.17
898	0.19
899	0.15
900	0.18
901	0.21
902	0.21
903	0.24
904	0.21
905	0.26
906	0.33
907	0.42
908	0.47
909	0.46
910	0.51
911	0.56
912	0.61
913	0.56
914	0.49
915	0.41
916	0.33
917	0.29
918	0.24
919	0.17
920	0.11
921	0.11
922	0.1
923	0.08
924	0.09
925	0.08
926	0.09
927	0.09
928	0.07
929	0.07
930	0.07
931	0.1
932	0.12
933	0.13
934	0.13
935	0.14
936	0.16
937	0.18
938	0.22
939	0.28
940	0.35
941	0.4
942	0.46
943	0.48
944	0.49
945	0.48
946	0.44
947	0.38
948	0.32
949	0.25
950	0.19
951	0.16
952	0.14
953	0.13
954	0.12
955	0.09
956	0.05
957	0.05
958	0.05
959	0.06
960	0.05
961	0.06
962	0.09
963	0.09
964	0.09
965	0.1
966	0.11
967	0.11
968	0.12
969	0.12
970	0.1
971	0.11
972	0.11
973	0.11
974	0.1
975	0.12
976	0.14
977	0.15
978	0.15
979	0.16
980	0.16
981	0.16
982	0.18
983	0.16
984	0.14
985	0.15
986	0.14
987	0.12
988	0.12
989	0.12
990	0.1
991	0.12
992	0.11
993	0.1
994	0.09
995	0.09
996	0.09
997	0.09
998	0.08
999	0.07
1000	0.08
1001	0.07
1002	0.08
1003	0.07
1004	0.07
1005	0.07
1006	0.07
1007	0.07
1008	0.06
1009	0.05
1010	0.07
1011	0.09
1012	0.09
1013	0.1
1014	0.11
1015	0.15
1016	0.2
1017	0.22
1018	0.23
1019	0.24
1020	0.25
1021	0.26
1022	0.31
1023	0.32
1024	0.28
1025	0.3
1026	0.28
1027	0.26
1028	0.25
1029	0.23
1030	0.17
1031	0.12
1032	0.11
1033	0.09
1034	0.07
1035	0.06
1036	0.06
1037	0.06
1038	0.06
1039	0.05
1040	0.05
1041	0.04
1042	0.05
1043	0.05
1044	0.05
1045	0.06
1046	0.06
1047	0.08
1048	0.1
1049	0.1
1050	0.09
1051	0.09
1052	0.11
1053	0.12
1054	0.12
1055	0.11
1056	0.16
1057	0.21
1058	0.22
1059	0.22
1060	0.21
1061	0.19
1062	0.19
1063	0.21
1064	0.16
1065	0.1
1066	0.09
1067	0.09
1068	0.09
1069	0.09
1070	0.09
1071	0.07
1072	0.06
1073	0.06
1074	0.07
1075	0.08
1076	0.08
1077	0.07
1078	0.08
1079	0.11
1080	0.1
1081	0.11
1082	0.1
1083	0.09
1084	0.09
1085	0.09
1086	0.09
1087	0.06
1088	0.12
1089	0.15
1090	0.16
1091	0.21
1092	0.24
1093	0.28
1094	0.35
1095	0.41
1096	0.43
1097	0.51
1098	0.55
1099	0.57
1100	0.63
1101	0.64
1102	0.63
1103	0.59
1104	0.52
1105	0.44
1106	0.42
1107	0.4
1108	0.31
1109	0.27
1110	0.21
1111	0.19
1112	0.17
1113	0.16
1114	0.13
1115	0.09
1116	0.09
1117	0.12
1118	0.13
1119	0.13
1120	0.14
1121	0.2
1122	0.28
1123	0.35
1124	0.4
1125	0.43
1126	0.46
1127	0.54
1128	0.56
1129	0.54
1130	0.56
1131	0.54
1132	0.56

A0A1Y2F8V6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer