Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2F5H4

Protein Details
Accession A0A1Y2F5H4    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
762-794GGPPQQQQQQQQPQPQQQKQQQQQQQQQQRGGQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 13.166, cyto 4.5, cyto_nucl 4.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MVAGKPSGQAAPNKTGQRAWSKVAAGSPKSASPSRAPVHDKLAAVIAKLTNKRAEVTLKSGLRYAGIVSQVDVANGLSVTLRDVQAVNVANGSKSGAASTLNELVIKPGELVQVHGPNEQPQQQQPAHPSSNTPSSIAWKTDVDISGRSYIKERTLQAWQPDSQDEGFSLESDSTPARGPQSAGAGVGGKWDQFAANEQLFGVKSQWDEDVYTHKLDTSRPDFAKRQAEAAKIAREIEGAASNNPHVLEERNLTVDDSGMTEEDKYSGVARTANRWIPPAQRAAAQAQNSGQPVDPAIISAQLARPSAGGLTPSRATPSSGKDDPIEAKLMRTFQDFVGKEETRIQQKKAQSLKKEKDGRLQDLLKFSQSFKLKTPVPEDLIPILTKDKSKQDAIVQKSASNSSAASSPVAARPVVHLGGKQEAKPETLRAKIDKMRASPGGQLMPSPIRERSPANPAAPSAATPASSTKLKPTAFAFKPSAASFTPSFAPRGSVGVASSPALSNNSTTQPRHPPNYVDPSLFLHDKQPRPFAERENILDHYNPFKSFKEKNPEAPIDIEAPHRTDPAWPNEEDARGLLDPPTYTFGKPHSSGSNVTGSYDEFKGVMPMPMPMQPGMSPYGAPFMQPMMVQGPGMPPQFMGQPMYIGSPQAMAAAAAAAAAGGMPFAGMPQGYYGQQLGVPPMMPQHAGGQQAGSPQQPAGFYGAMPSGASFGGPAGGQGQQQAGGKHGGQGSFAGQSFSGPAGYGGYTQHGPAGGMGGYQGGPPQQQQQQQQPQPQQQKQQQQQQQQQQRGGQSGMTSKTHTAQRSQATGALS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.45
3 0.48
4 0.5
5 0.49
6 0.47
7 0.46
8 0.44
9 0.44
10 0.47
11 0.48
12 0.41
13 0.41
14 0.39
15 0.35
16 0.39
17 0.39
18 0.37
19 0.34
20 0.41
21 0.4
22 0.46
23 0.49
24 0.48
25 0.52
26 0.53
27 0.48
28 0.4
29 0.43
30 0.35
31 0.3
32 0.29
33 0.25
34 0.27
35 0.3
36 0.33
37 0.31
38 0.32
39 0.33
40 0.34
41 0.38
42 0.35
43 0.38
44 0.43
45 0.41
46 0.41
47 0.41
48 0.37
49 0.32
50 0.28
51 0.23
52 0.18
53 0.18
54 0.17
55 0.16
56 0.19
57 0.18
58 0.17
59 0.16
60 0.12
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.06
65 0.06
66 0.08
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.12
71 0.12
72 0.17
73 0.18
74 0.17
75 0.16
76 0.17
77 0.15
78 0.15
79 0.16
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.08
84 0.09
85 0.11
86 0.14
87 0.16
88 0.16
89 0.16
90 0.16
91 0.17
92 0.17
93 0.15
94 0.12
95 0.11
96 0.14
97 0.13
98 0.16
99 0.2
100 0.24
101 0.25
102 0.27
103 0.26
104 0.27
105 0.32
106 0.36
107 0.34
108 0.32
109 0.38
110 0.39
111 0.42
112 0.44
113 0.47
114 0.44
115 0.41
116 0.4
117 0.37
118 0.42
119 0.39
120 0.34
121 0.28
122 0.31
123 0.33
124 0.32
125 0.29
126 0.23
127 0.23
128 0.25
129 0.26
130 0.22
131 0.21
132 0.21
133 0.25
134 0.25
135 0.25
136 0.24
137 0.25
138 0.28
139 0.31
140 0.31
141 0.29
142 0.36
143 0.4
144 0.44
145 0.45
146 0.43
147 0.4
148 0.39
149 0.38
150 0.3
151 0.26
152 0.2
153 0.17
154 0.15
155 0.13
156 0.13
157 0.1
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.09
162 0.1
163 0.11
164 0.12
165 0.13
166 0.14
167 0.15
168 0.18
169 0.17
170 0.16
171 0.15
172 0.14
173 0.13
174 0.14
175 0.12
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.11
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.15
186 0.16
187 0.16
188 0.16
189 0.13
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.12
194 0.11
195 0.12
196 0.13
197 0.18
198 0.19
199 0.19
200 0.18
201 0.19
202 0.19
203 0.2
204 0.26
205 0.26
206 0.31
207 0.32
208 0.38
209 0.4
210 0.45
211 0.52
212 0.45
213 0.46
214 0.42
215 0.42
216 0.42
217 0.43
218 0.39
219 0.31
220 0.31
221 0.25
222 0.21
223 0.19
224 0.15
225 0.14
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.13
231 0.13
232 0.12
233 0.09
234 0.1
235 0.12
236 0.13
237 0.15
238 0.15
239 0.15
240 0.15
241 0.14
242 0.12
243 0.1
244 0.08
245 0.08
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.07
254 0.08
255 0.09
256 0.12
257 0.13
258 0.17
259 0.22
260 0.25
261 0.25
262 0.26
263 0.28
264 0.29
265 0.32
266 0.31
267 0.27
268 0.26
269 0.27
270 0.29
271 0.3
272 0.26
273 0.24
274 0.21
275 0.23
276 0.21
277 0.2
278 0.16
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.09
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.09
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.07
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.12
302 0.12
303 0.14
304 0.15
305 0.19
306 0.23
307 0.24
308 0.25
309 0.24
310 0.26
311 0.25
312 0.24
313 0.23
314 0.16
315 0.16
316 0.17
317 0.18
318 0.16
319 0.16
320 0.16
321 0.13
322 0.22
323 0.21
324 0.22
325 0.28
326 0.27
327 0.26
328 0.3
329 0.33
330 0.34
331 0.36
332 0.36
333 0.35
334 0.38
335 0.46
336 0.49
337 0.52
338 0.52
339 0.59
340 0.62
341 0.66
342 0.72
343 0.66
344 0.65
345 0.64
346 0.59
347 0.56
348 0.53
349 0.46
350 0.41
351 0.4
352 0.33
353 0.28
354 0.25
355 0.24
356 0.24
357 0.23
358 0.21
359 0.26
360 0.27
361 0.29
362 0.32
363 0.29
364 0.3
365 0.29
366 0.28
367 0.23
368 0.22
369 0.19
370 0.15
371 0.14
372 0.12
373 0.12
374 0.13
375 0.16
376 0.19
377 0.19
378 0.21
379 0.26
380 0.32
381 0.35
382 0.38
383 0.34
384 0.32
385 0.32
386 0.31
387 0.24
388 0.17
389 0.13
390 0.09
391 0.1
392 0.09
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.08
399 0.07
400 0.08
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.09
405 0.1
406 0.15
407 0.16
408 0.15
409 0.17
410 0.17
411 0.18
412 0.18
413 0.21
414 0.19
415 0.22
416 0.24
417 0.22
418 0.27
419 0.29
420 0.34
421 0.34
422 0.32
423 0.33
424 0.33
425 0.32
426 0.29
427 0.27
428 0.23
429 0.19
430 0.17
431 0.15
432 0.15
433 0.15
434 0.14
435 0.13
436 0.13
437 0.15
438 0.18
439 0.18
440 0.24
441 0.27
442 0.26
443 0.26
444 0.25
445 0.25
446 0.22
447 0.2
448 0.15
449 0.11
450 0.1
451 0.1
452 0.11
453 0.11
454 0.13
455 0.13
456 0.14
457 0.2
458 0.2
459 0.21
460 0.23
461 0.3
462 0.3
463 0.35
464 0.33
465 0.28
466 0.31
467 0.29
468 0.29
469 0.19
470 0.21
471 0.17
472 0.16
473 0.17
474 0.16
475 0.17
476 0.14
477 0.15
478 0.12
479 0.13
480 0.12
481 0.1
482 0.1
483 0.09
484 0.1
485 0.09
486 0.09
487 0.07
488 0.07
489 0.08
490 0.08
491 0.08
492 0.1
493 0.14
494 0.17
495 0.19
496 0.23
497 0.32
498 0.36
499 0.39
500 0.39
501 0.39
502 0.43
503 0.5
504 0.47
505 0.38
506 0.35
507 0.33
508 0.34
509 0.31
510 0.24
511 0.23
512 0.28
513 0.33
514 0.35
515 0.38
516 0.37
517 0.41
518 0.44
519 0.42
520 0.41
521 0.39
522 0.39
523 0.38
524 0.38
525 0.34
526 0.32
527 0.29
528 0.26
529 0.24
530 0.22
531 0.2
532 0.2
533 0.26
534 0.29
535 0.36
536 0.42
537 0.44
538 0.5
539 0.56
540 0.56
541 0.51
542 0.48
543 0.41
544 0.33
545 0.3
546 0.26
547 0.19
548 0.19
549 0.18
550 0.17
551 0.15
552 0.19
553 0.23
554 0.27
555 0.3
556 0.27
557 0.3
558 0.32
559 0.32
560 0.27
561 0.22
562 0.18
563 0.14
564 0.14
565 0.12
566 0.11
567 0.1
568 0.11
569 0.14
570 0.13
571 0.13
572 0.14
573 0.17
574 0.21
575 0.23
576 0.25
577 0.24
578 0.26
579 0.27
580 0.29
581 0.31
582 0.25
583 0.24
584 0.22
585 0.19
586 0.19
587 0.18
588 0.15
589 0.1
590 0.1
591 0.12
592 0.12
593 0.12
594 0.09
595 0.1
596 0.11
597 0.14
598 0.15
599 0.13
600 0.14
601 0.13
602 0.14
603 0.16
604 0.15
605 0.12
606 0.11
607 0.15
608 0.13
609 0.13
610 0.12
611 0.1
612 0.11
613 0.11
614 0.12
615 0.09
616 0.1
617 0.1
618 0.1
619 0.11
620 0.15
621 0.15
622 0.14
623 0.12
624 0.13
625 0.15
626 0.16
627 0.16
628 0.11
629 0.11
630 0.12
631 0.14
632 0.13
633 0.12
634 0.11
635 0.09
636 0.09
637 0.09
638 0.08
639 0.05
640 0.05
641 0.05
642 0.04
643 0.04
644 0.03
645 0.02
646 0.02
647 0.02
648 0.02
649 0.02
650 0.02
651 0.02
652 0.02
653 0.02
654 0.03
655 0.03
656 0.03
657 0.05
658 0.08
659 0.08
660 0.1
661 0.1
662 0.1
663 0.11
664 0.12
665 0.12
666 0.11
667 0.11
668 0.1
669 0.12
670 0.13
671 0.12
672 0.12
673 0.14
674 0.17
675 0.19
676 0.19
677 0.17
678 0.17
679 0.2
680 0.21
681 0.18
682 0.15
683 0.14
684 0.15
685 0.15
686 0.15
687 0.15
688 0.13
689 0.12
690 0.13
691 0.14
692 0.12
693 0.12
694 0.11
695 0.08
696 0.08
697 0.08
698 0.06
699 0.05
700 0.06
701 0.06
702 0.06
703 0.07
704 0.08
705 0.09
706 0.1
707 0.1
708 0.13
709 0.15
710 0.16
711 0.16
712 0.18
713 0.17
714 0.21
715 0.23
716 0.2
717 0.18
718 0.19
719 0.18
720 0.19
721 0.19
722 0.16
723 0.13
724 0.13
725 0.13
726 0.13
727 0.11
728 0.08
729 0.08
730 0.09
731 0.09
732 0.1
733 0.1
734 0.12
735 0.13
736 0.13
737 0.14
738 0.13
739 0.12
740 0.11
741 0.12
742 0.09
743 0.08
744 0.08
745 0.08
746 0.08
747 0.08
748 0.09
749 0.09
750 0.1
751 0.12
752 0.2
753 0.25
754 0.32
755 0.39
756 0.49
757 0.58
758 0.64
759 0.72
760 0.74
761 0.77
762 0.81
763 0.81
764 0.81
765 0.79
766 0.82
767 0.82
768 0.84
769 0.83
770 0.82
771 0.85
772 0.86
773 0.86
774 0.83
775 0.81
776 0.76
777 0.71
778 0.65
779 0.56
780 0.46
781 0.4
782 0.38
783 0.36
784 0.33
785 0.31
786 0.29
787 0.34
788 0.4
789 0.39
790 0.38
791 0.42
792 0.46
793 0.48
794 0.47