Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2F3S4

Protein Details
Accession A0A1Y2F3S4    Localization Confidence Low Confidence Score 6.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
241-264DESLKENRETRKRNSPKVVHAGQRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 18.5, cyto_mito 10.5, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045055  DNA2/NAM7-like  
IPR041679  DNA2/NAM7-like_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR047187  SF1_C_Upf1  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0051539  F:4 iron, 4 sulfur cluster binding  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0017116  F:single-stranded DNA helicase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0033567  P:DNA replication, Okazaki fragment processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF13087  AAA_12  
CDD cd18808  SF1_C_Upf1  
Amino Acid Sequences MNADIMSIANELIYGGMLKCGTPQIAAQQLQVDSTKALESVHAHGSCHTPCLFESILSPKRSVAFLNTDDIAEAKETKRGDQTQNAVESMLIAQIVSSLVAGGVAQHAIGVISPYRSQLKLLHADLEAFPHVMVDTADKFQGRDKECILVSFVRSNSTGQVGDLLKDWRRINVALTRAKRKLICIGSQETLAHDALLNKFVHLAHRRGWSIDLPSDVLQQHVAKQPASGVAVSLSTVARMDESLKENRETRKRNSPKVVHAGQRVLFKNGARPILRDLKNEM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.07
4 0.08
5 0.08
6 0.09
7 0.11
8 0.12
9 0.12
10 0.13
11 0.17
12 0.24
13 0.25
14 0.25
15 0.27
16 0.26
17 0.27
18 0.27
19 0.22
20 0.14
21 0.14
22 0.14
23 0.1
24 0.1
25 0.11
26 0.12
27 0.15
28 0.22
29 0.22
30 0.22
31 0.23
32 0.27
33 0.25
34 0.26
35 0.23
36 0.17
37 0.16
38 0.21
39 0.2
40 0.15
41 0.18
42 0.24
43 0.3
44 0.31
45 0.31
46 0.27
47 0.29
48 0.29
49 0.27
50 0.22
51 0.22
52 0.22
53 0.24
54 0.24
55 0.22
56 0.21
57 0.2
58 0.16
59 0.11
60 0.12
61 0.09
62 0.13
63 0.13
64 0.15
65 0.21
66 0.26
67 0.3
68 0.34
69 0.38
70 0.39
71 0.4
72 0.39
73 0.32
74 0.27
75 0.22
76 0.16
77 0.12
78 0.06
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.03
96 0.03
97 0.03
98 0.04
99 0.05
100 0.05
101 0.07
102 0.1
103 0.1
104 0.12
105 0.14
106 0.18
107 0.22
108 0.23
109 0.23
110 0.21
111 0.22
112 0.21
113 0.19
114 0.15
115 0.09
116 0.09
117 0.06
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.11
128 0.18
129 0.19
130 0.2
131 0.2
132 0.22
133 0.22
134 0.23
135 0.22
136 0.16
137 0.15
138 0.16
139 0.15
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.14
145 0.13
146 0.09
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.13
151 0.14
152 0.14
153 0.19
154 0.2
155 0.17
156 0.19
157 0.19
158 0.21
159 0.23
160 0.28
161 0.31
162 0.35
163 0.41
164 0.41
165 0.44
166 0.42
167 0.39
168 0.4
169 0.37
170 0.37
171 0.34
172 0.37
173 0.34
174 0.34
175 0.32
176 0.25
177 0.23
178 0.18
179 0.14
180 0.1
181 0.12
182 0.11
183 0.15
184 0.14
185 0.12
186 0.13
187 0.14
188 0.2
189 0.23
190 0.25
191 0.26
192 0.31
193 0.32
194 0.32
195 0.34
196 0.29
197 0.29
198 0.28
199 0.24
200 0.21
201 0.21
202 0.23
203 0.21
204 0.18
205 0.17
206 0.16
207 0.19
208 0.22
209 0.23
210 0.2
211 0.2
212 0.21
213 0.2
214 0.21
215 0.17
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.07
227 0.09
228 0.12
229 0.17
230 0.23
231 0.26
232 0.3
233 0.34
234 0.43
235 0.51
236 0.54
237 0.57
238 0.62
239 0.69
240 0.75
241 0.81
242 0.79
243 0.79
244 0.82
245 0.82
246 0.78
247 0.75
248 0.71
249 0.64
250 0.65
251 0.57
252 0.52
253 0.47
254 0.41
255 0.42
256 0.42
257 0.46
258 0.39
259 0.39
260 0.43
261 0.5
262 0.53