Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2FF93

Protein Details
Accession A0A1Y2FF93    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-263AYFTGTQKQKQQDKKERKQKEFVAIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-135ARGGRGGSRGGRGGRGRE
273-311SRPEGGRGGGRGGARGGRGRGEGRGRGEGRGRGGARGGA
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Amino Acid Sequences MSSATRNPFALLNEDGDNEQPQQQAKPAAQQTAGVSVKQTPKEITAKQTTSKKRDPTRSSAGEQRREGQQQASTGARGGRNNGPGGRGPRNDNEAFAKDKSVGHDANAAKPIDGDAPARGGRGGSRGGRGGRGREFDRRNATGKTDTPKATEQAWGNEAEAQQAAEGEEAAALGPKDPNAEEPAAAPVEEEDNTMSYEEYLKSKTSNVPAAPQPRAANEGTEDKWSNTTAFEKDNNEAYFTGTQKQKQQDKKERKQKEFVAIEQRFSAPPVASRPEGGRGGGRGGARGGRGRGEGRGRGEGRGRGGARGGASSRPQSSAAPVMDESAFPELGKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.22
4 0.22
5 0.19
6 0.2
7 0.2
8 0.2
9 0.21
10 0.24
11 0.28
12 0.27
13 0.35
14 0.36
15 0.37
16 0.35
17 0.36
18 0.33
19 0.36
20 0.36
21 0.27
22 0.24
23 0.27
24 0.33
25 0.33
26 0.34
27 0.27
28 0.32
29 0.39
30 0.41
31 0.43
32 0.45
33 0.46
34 0.52
35 0.6
36 0.63
37 0.65
38 0.7
39 0.71
40 0.72
41 0.79
42 0.79
43 0.77
44 0.77
45 0.75
46 0.71
47 0.71
48 0.71
49 0.68
50 0.63
51 0.58
52 0.55
53 0.53
54 0.5
55 0.44
56 0.38
57 0.32
58 0.33
59 0.31
60 0.24
61 0.23
62 0.24
63 0.24
64 0.21
65 0.24
66 0.26
67 0.27
68 0.3
69 0.29
70 0.28
71 0.29
72 0.34
73 0.37
74 0.35
75 0.36
76 0.37
77 0.43
78 0.41
79 0.39
80 0.37
81 0.33
82 0.33
83 0.29
84 0.27
85 0.22
86 0.22
87 0.23
88 0.24
89 0.21
90 0.18
91 0.25
92 0.25
93 0.27
94 0.3
95 0.27
96 0.21
97 0.21
98 0.21
99 0.15
100 0.15
101 0.12
102 0.08
103 0.11
104 0.12
105 0.12
106 0.11
107 0.1
108 0.09
109 0.11
110 0.14
111 0.13
112 0.14
113 0.17
114 0.18
115 0.23
116 0.24
117 0.26
118 0.26
119 0.28
120 0.29
121 0.35
122 0.38
123 0.38
124 0.43
125 0.42
126 0.42
127 0.39
128 0.39
129 0.34
130 0.35
131 0.33
132 0.32
133 0.3
134 0.3
135 0.3
136 0.28
137 0.25
138 0.26
139 0.23
140 0.2
141 0.2
142 0.18
143 0.16
144 0.17
145 0.16
146 0.12
147 0.11
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.04
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.07
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.08
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.05
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.13
191 0.16
192 0.19
193 0.23
194 0.22
195 0.25
196 0.3
197 0.35
198 0.34
199 0.34
200 0.31
201 0.27
202 0.3
203 0.26
204 0.21
205 0.18
206 0.21
207 0.19
208 0.22
209 0.22
210 0.19
211 0.2
212 0.2
213 0.18
214 0.15
215 0.17
216 0.15
217 0.17
218 0.2
219 0.22
220 0.23
221 0.28
222 0.27
223 0.26
224 0.24
225 0.24
226 0.24
227 0.22
228 0.26
229 0.25
230 0.28
231 0.33
232 0.41
233 0.47
234 0.53
235 0.63
236 0.68
237 0.75
238 0.83
239 0.87
240 0.89
241 0.87
242 0.87
243 0.82
244 0.82
245 0.75
246 0.71
247 0.71
248 0.62
249 0.56
250 0.49
251 0.44
252 0.34
253 0.3
254 0.26
255 0.15
256 0.17
257 0.2
258 0.23
259 0.22
260 0.24
261 0.25
262 0.28
263 0.28
264 0.27
265 0.24
266 0.21
267 0.22
268 0.24
269 0.22
270 0.18
271 0.18
272 0.19
273 0.19
274 0.22
275 0.22
276 0.21
277 0.24
278 0.24
279 0.29
280 0.34
281 0.36
282 0.37
283 0.44
284 0.43
285 0.44
286 0.48
287 0.45
288 0.43
289 0.45
290 0.42
291 0.35
292 0.35
293 0.33
294 0.29
295 0.28
296 0.26
297 0.23
298 0.26
299 0.29
300 0.3
301 0.3
302 0.3
303 0.28
304 0.3
305 0.33
306 0.29
307 0.28
308 0.26
309 0.26
310 0.25
311 0.24
312 0.21
313 0.17
314 0.17