Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2EYC4

Protein Details
Accession A0A1Y2EYC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
211-233SESTLREKKKKKAGKLRAKLNDWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-84KKRRKEAIEEDGVSGKKAKRK
216-229REKKKKKAGKLRAK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
IPR034392  TatSF1-like_RRM1  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12281  RRM1_TatSF1_like  
cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MSTRDDPEFNQVSGRFEYEDEDGQTFEQDPTTKAWHPVLSPEQIEAQQKAYAIEGVSEEAVPAKKRRKEAIEEDGVSGKKAKRKGDDTADSGAPQRKPKETAVYVQGLPLGVTATELAETFSKCGLLGEDPLTSQPRIKIYTNPDGSQKGDALITYFREESVSLAITMLDDIDLRGDGKSRIRVAKATFEPRPEQSAEGKAKPPAGEHVVSESTLREKKKKKAGKLRAKLNDWSSSEDEREAFLPGRKDATADAGRHAKVVVLKHMFTLAELDEDPGLLLEVKADVREECETMGEVTNVVIYDADPAGVLMVRFKEPAAAIQCVRKMHGRFFAGRQVEATLHDGKTKYKRSAKHAGDEDDEEEAQRLAKFGSWLEGDNEDTTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.25
3 0.22
4 0.25
5 0.22
6 0.24
7 0.23
8 0.22
9 0.2
10 0.19
11 0.2
12 0.18
13 0.16
14 0.15
15 0.14
16 0.15
17 0.18
18 0.24
19 0.25
20 0.28
21 0.31
22 0.31
23 0.3
24 0.36
25 0.38
26 0.38
27 0.36
28 0.33
29 0.32
30 0.33
31 0.36
32 0.3
33 0.27
34 0.23
35 0.23
36 0.22
37 0.19
38 0.17
39 0.13
40 0.13
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.1
47 0.13
48 0.15
49 0.22
50 0.3
51 0.35
52 0.41
53 0.49
54 0.53
55 0.6
56 0.65
57 0.67
58 0.67
59 0.63
60 0.59
61 0.56
62 0.49
63 0.4
64 0.37
65 0.31
66 0.28
67 0.32
68 0.36
69 0.4
70 0.45
71 0.53
72 0.57
73 0.6
74 0.59
75 0.58
76 0.52
77 0.44
78 0.44
79 0.41
80 0.35
81 0.35
82 0.35
83 0.35
84 0.38
85 0.41
86 0.46
87 0.43
88 0.44
89 0.44
90 0.44
91 0.4
92 0.36
93 0.33
94 0.23
95 0.2
96 0.15
97 0.09
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.04
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.12
119 0.14
120 0.13
121 0.14
122 0.14
123 0.16
124 0.2
125 0.21
126 0.26
127 0.3
128 0.4
129 0.41
130 0.4
131 0.4
132 0.38
133 0.38
134 0.33
135 0.27
136 0.18
137 0.15
138 0.13
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.04
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.07
165 0.09
166 0.13
167 0.16
168 0.18
169 0.19
170 0.22
171 0.23
172 0.29
173 0.31
174 0.34
175 0.32
176 0.33
177 0.34
178 0.32
179 0.33
180 0.26
181 0.24
182 0.2
183 0.26
184 0.27
185 0.27
186 0.27
187 0.26
188 0.26
189 0.25
190 0.23
191 0.19
192 0.19
193 0.17
194 0.15
195 0.17
196 0.16
197 0.16
198 0.16
199 0.13
200 0.14
201 0.17
202 0.19
203 0.24
204 0.31
205 0.39
206 0.49
207 0.56
208 0.62
209 0.69
210 0.78
211 0.81
212 0.83
213 0.85
214 0.83
215 0.79
216 0.74
217 0.67
218 0.62
219 0.52
220 0.48
221 0.42
222 0.35
223 0.32
224 0.28
225 0.25
226 0.19
227 0.18
228 0.15
229 0.13
230 0.14
231 0.15
232 0.15
233 0.17
234 0.16
235 0.16
236 0.14
237 0.2
238 0.22
239 0.2
240 0.23
241 0.26
242 0.26
243 0.26
244 0.25
245 0.2
246 0.18
247 0.19
248 0.23
249 0.21
250 0.22
251 0.22
252 0.23
253 0.21
254 0.18
255 0.18
256 0.11
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.06
273 0.09
274 0.11
275 0.11
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.06
288 0.05
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.11
302 0.13
303 0.12
304 0.19
305 0.21
306 0.23
307 0.23
308 0.28
309 0.32
310 0.3
311 0.33
312 0.34
313 0.33
314 0.35
315 0.41
316 0.41
317 0.42
318 0.45
319 0.51
320 0.46
321 0.44
322 0.39
323 0.33
324 0.29
325 0.27
326 0.27
327 0.23
328 0.21
329 0.24
330 0.25
331 0.29
332 0.38
333 0.43
334 0.49
335 0.53
336 0.59
337 0.63
338 0.73
339 0.73
340 0.73
341 0.73
342 0.69
343 0.65
344 0.61
345 0.54
346 0.47
347 0.4
348 0.31
349 0.24
350 0.19
351 0.17
352 0.14
353 0.13
354 0.1
355 0.12
356 0.13
357 0.13
358 0.18
359 0.18
360 0.19
361 0.21
362 0.23
363 0.23