Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y2FSN5

Protein Details
Accession A0A1Y2FSN5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
202-222RDPPLPRSKRRRGVTHDSERDBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences METRGVTAATKVPEPKPAAANNASGTTPRIKIKQPSYRATLLRLSNSISHSSAEILQRYSKNEPSLILHFHQQHWRFEQQDGIFLYNSQGRQILECIRNEQIPVDCLEVFRDVKIKYYEGCLILRLVDHRSTPPTILHTALRPSPESIWTEMLLYSEQTQGNFTDAKALLVESDILVATNPPLNLKPAVHPAQVAQYLTDLRDPPLPRSKRRRGVTHDSERDKLMFLYDEGHGKDFAPDFKRLAFVEAHRRKRALAAQRTGATAATGAAGGPAGNVLTPGHAPIRSGTTTVPAIPANATPEEALAAQQQQVQQALAANRSSASPAIKASQQTPMSLQQQQQMAQLSQQQQQAAMAAATAMSNGNASQQQQQQQQQQGLMSQQQQLQQQQISMQGMSANGAFAARQAQVQAAAKRTGQSPQMPRQGMTPQQMAQQLAMHQAQLQQQQQQHQNGKLQQAGQGNNQMFDDLARQQQIMLQQRAMAIRNMQAQNAARQHAVAAAAAAAQTGQSPSPGSMHARLPQGGNSGGRSQTSSPAMHAANLQNGGHVGGSPALQQQMLQQQMQMQAMQAAAAANGGGGGGRGAPTQLQLQQMRQAHLVQQQQMAFNNANAQAQQQAHLQAKAQAAAAALAQQHGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.42
3 0.43
4 0.44
5 0.47
6 0.45
7 0.47
8 0.41
9 0.39
10 0.34
11 0.29
12 0.29
13 0.26
14 0.28
15 0.29
16 0.32
17 0.36
18 0.45
19 0.55
20 0.62
21 0.65
22 0.68
23 0.69
24 0.72
25 0.67
26 0.63
27 0.6
28 0.54
29 0.5
30 0.44
31 0.41
32 0.37
33 0.38
34 0.37
35 0.3
36 0.26
37 0.23
38 0.23
39 0.25
40 0.25
41 0.25
42 0.23
43 0.29
44 0.31
45 0.35
46 0.39
47 0.4
48 0.39
49 0.38
50 0.38
51 0.36
52 0.38
53 0.38
54 0.34
55 0.36
56 0.36
57 0.39
58 0.46
59 0.46
60 0.47
61 0.48
62 0.53
63 0.48
64 0.45
65 0.49
66 0.4
67 0.41
68 0.37
69 0.34
70 0.27
71 0.25
72 0.27
73 0.23
74 0.23
75 0.18
76 0.18
77 0.16
78 0.18
79 0.21
80 0.27
81 0.28
82 0.29
83 0.32
84 0.32
85 0.32
86 0.31
87 0.31
88 0.24
89 0.21
90 0.21
91 0.2
92 0.17
93 0.16
94 0.18
95 0.19
96 0.17
97 0.17
98 0.21
99 0.18
100 0.23
101 0.26
102 0.26
103 0.23
104 0.26
105 0.3
106 0.27
107 0.28
108 0.23
109 0.21
110 0.2
111 0.2
112 0.17
113 0.17
114 0.16
115 0.18
116 0.19
117 0.23
118 0.24
119 0.24
120 0.24
121 0.24
122 0.24
123 0.25
124 0.24
125 0.23
126 0.26
127 0.27
128 0.27
129 0.24
130 0.24
131 0.24
132 0.25
133 0.25
134 0.23
135 0.23
136 0.21
137 0.2
138 0.18
139 0.17
140 0.14
141 0.12
142 0.11
143 0.13
144 0.14
145 0.13
146 0.14
147 0.13
148 0.15
149 0.15
150 0.13
151 0.16
152 0.16
153 0.16
154 0.15
155 0.14
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.05
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.12
171 0.14
172 0.15
173 0.17
174 0.23
175 0.27
176 0.26
177 0.25
178 0.24
179 0.27
180 0.28
181 0.25
182 0.17
183 0.15
184 0.15
185 0.15
186 0.17
187 0.13
188 0.12
189 0.18
190 0.19
191 0.23
192 0.33
193 0.38
194 0.45
195 0.54
196 0.63
197 0.67
198 0.72
199 0.76
200 0.75
201 0.79
202 0.8
203 0.81
204 0.79
205 0.74
206 0.69
207 0.61
208 0.53
209 0.43
210 0.33
211 0.23
212 0.15
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.13
217 0.13
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.14
222 0.13
223 0.17
224 0.18
225 0.19
226 0.19
227 0.19
228 0.21
229 0.19
230 0.2
231 0.18
232 0.18
233 0.28
234 0.36
235 0.42
236 0.43
237 0.43
238 0.41
239 0.43
240 0.47
241 0.46
242 0.46
243 0.43
244 0.45
245 0.45
246 0.45
247 0.41
248 0.33
249 0.23
250 0.14
251 0.1
252 0.06
253 0.05
254 0.04
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.02
261 0.02
262 0.03
263 0.03
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.12
272 0.11
273 0.12
274 0.11
275 0.12
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.07
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.08
295 0.09
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.09
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.1
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.08
312 0.09
313 0.11
314 0.12
315 0.12
316 0.18
317 0.18
318 0.18
319 0.19
320 0.22
321 0.24
322 0.26
323 0.27
324 0.24
325 0.25
326 0.25
327 0.25
328 0.23
329 0.19
330 0.17
331 0.2
332 0.2
333 0.23
334 0.24
335 0.21
336 0.2
337 0.2
338 0.19
339 0.14
340 0.11
341 0.06
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.05
351 0.06
352 0.08
353 0.12
354 0.16
355 0.22
356 0.27
357 0.33
358 0.37
359 0.4
360 0.4
361 0.36
362 0.33
363 0.29
364 0.25
365 0.23
366 0.19
367 0.18
368 0.2
369 0.22
370 0.25
371 0.25
372 0.27
373 0.23
374 0.21
375 0.19
376 0.2
377 0.17
378 0.14
379 0.12
380 0.1
381 0.09
382 0.1
383 0.09
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.04
388 0.04
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.1
395 0.14
396 0.16
397 0.17
398 0.18
399 0.19
400 0.2
401 0.2
402 0.21
403 0.21
404 0.26
405 0.3
406 0.37
407 0.45
408 0.44
409 0.44
410 0.43
411 0.44
412 0.42
413 0.39
414 0.34
415 0.27
416 0.3
417 0.32
418 0.3
419 0.25
420 0.21
421 0.18
422 0.19
423 0.18
424 0.14
425 0.12
426 0.16
427 0.19
428 0.23
429 0.24
430 0.25
431 0.28
432 0.34
433 0.41
434 0.45
435 0.46
436 0.45
437 0.49
438 0.48
439 0.49
440 0.45
441 0.39
442 0.36
443 0.37
444 0.35
445 0.32
446 0.35
447 0.32
448 0.3
449 0.29
450 0.23
451 0.18
452 0.16
453 0.16
454 0.11
455 0.13
456 0.13
457 0.13
458 0.13
459 0.15
460 0.22
461 0.27
462 0.27
463 0.25
464 0.25
465 0.27
466 0.3
467 0.29
468 0.23
469 0.17
470 0.18
471 0.26
472 0.26
473 0.24
474 0.26
475 0.26
476 0.32
477 0.34
478 0.32
479 0.24
480 0.23
481 0.23
482 0.2
483 0.19
484 0.12
485 0.08
486 0.06
487 0.07
488 0.06
489 0.06
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.05
494 0.05
495 0.06
496 0.07
497 0.08
498 0.09
499 0.12
500 0.15
501 0.18
502 0.21
503 0.26
504 0.28
505 0.29
506 0.29
507 0.29
508 0.28
509 0.27
510 0.25
511 0.23
512 0.23
513 0.22
514 0.22
515 0.23
516 0.21
517 0.24
518 0.26
519 0.24
520 0.22
521 0.26
522 0.25
523 0.24
524 0.27
525 0.23
526 0.23
527 0.25
528 0.24
529 0.19
530 0.19
531 0.19
532 0.14
533 0.12
534 0.09
535 0.07
536 0.08
537 0.08
538 0.1
539 0.1
540 0.1
541 0.1
542 0.14
543 0.21
544 0.24
545 0.23
546 0.22
547 0.25
548 0.29
549 0.3
550 0.25
551 0.18
552 0.16
553 0.16
554 0.15
555 0.12
556 0.08
557 0.06
558 0.06
559 0.05
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.03
564 0.03
565 0.03
566 0.03
567 0.04
568 0.05
569 0.06
570 0.06
571 0.08
572 0.13
573 0.16
574 0.23
575 0.26
576 0.28
577 0.36
578 0.39
579 0.4
580 0.39
581 0.37
582 0.35
583 0.39
584 0.43
585 0.38
586 0.4
587 0.39
588 0.4
589 0.4
590 0.39
591 0.33
592 0.27
593 0.29
594 0.25
595 0.24
596 0.22
597 0.21
598 0.23
599 0.23
600 0.24
601 0.22
602 0.27
603 0.29
604 0.3
605 0.3
606 0.3
607 0.31
608 0.3
609 0.28
610 0.22
611 0.19
612 0.18
613 0.17
614 0.14
615 0.12
616 0.11