Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y2FBD6

Protein Details
Accession A0A1Y2FBD6    Localization Confidence Low Confidence Score 6.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-45QSLSQARRRHEHKHHNDEHVSNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 4.5, cyto_nucl 4.5, cyto 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013784  Carb-bd-like_fold  
IPR008979  Galactose-bd-like_sf  
IPR029413  RG-lyase_II  
IPR029411  RG-lyase_III  
IPR016590  Rhamnogalacturonase_B  
Gene Ontology GO:0030246  F:carbohydrate binding  
GO:0016837  F:carbon-oxygen lyase activity, acting on polysaccharides  
GO:0000272  P:polysaccharide catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF14683  CBM-like  
PF14686  fn3_3  
Amino Acid Sequences MQNLPKGCMRSRDWHSLLARADVQSLSQARRRHEHKHHNDEHVSNNRHSYGVQEYTVVLNNEHAQYWSHVDKGGKFRINGMLAGTYHVRLFQDQREVQATNLVLARGGSAQVSIEAPAEQATMWSIGCHDGRPQGFLNADKFERMHPSDRRMSSWLPRTVSVGDVRQFPMAQIGGLNPTTIRFTLTAKEASSPRTLLIVTTAHVNRGRPFVKVNGTPQRVPPAPSHLQVYGKGVYESRVFTRGAHLLSPATYTFGALQLKAGLNEIVIDVAGRLKPGLSPFLQPTFVYDYVALV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.58
3 0.57
4 0.53
5 0.48
6 0.44
7 0.34
8 0.33
9 0.25
10 0.23
11 0.23
12 0.25
13 0.25
14 0.28
15 0.32
16 0.34
17 0.43
18 0.49
19 0.53
20 0.61
21 0.68
22 0.73
23 0.8
24 0.82
25 0.82
26 0.82
27 0.75
28 0.73
29 0.72
30 0.66
31 0.56
32 0.52
33 0.45
34 0.39
35 0.36
36 0.3
37 0.27
38 0.25
39 0.23
40 0.2
41 0.2
42 0.21
43 0.25
44 0.22
45 0.16
46 0.14
47 0.16
48 0.16
49 0.16
50 0.15
51 0.13
52 0.14
53 0.19
54 0.18
55 0.16
56 0.19
57 0.2
58 0.25
59 0.31
60 0.37
61 0.36
62 0.35
63 0.37
64 0.39
65 0.39
66 0.34
67 0.28
68 0.22
69 0.18
70 0.2
71 0.18
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.11
76 0.11
77 0.14
78 0.15
79 0.23
80 0.23
81 0.26
82 0.28
83 0.28
84 0.26
85 0.27
86 0.24
87 0.16
88 0.16
89 0.14
90 0.11
91 0.1
92 0.1
93 0.07
94 0.07
95 0.05
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.04
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.04
112 0.05
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.13
118 0.13
119 0.16
120 0.16
121 0.15
122 0.16
123 0.18
124 0.19
125 0.17
126 0.17
127 0.15
128 0.15
129 0.14
130 0.17
131 0.18
132 0.23
133 0.23
134 0.28
135 0.35
136 0.35
137 0.37
138 0.35
139 0.35
140 0.35
141 0.39
142 0.39
143 0.33
144 0.32
145 0.32
146 0.29
147 0.29
148 0.24
149 0.19
150 0.17
151 0.17
152 0.18
153 0.17
154 0.16
155 0.14
156 0.14
157 0.11
158 0.09
159 0.08
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.08
170 0.09
171 0.11
172 0.14
173 0.15
174 0.14
175 0.18
176 0.18
177 0.2
178 0.2
179 0.19
180 0.16
181 0.16
182 0.15
183 0.12
184 0.13
185 0.11
186 0.09
187 0.15
188 0.15
189 0.17
190 0.19
191 0.21
192 0.2
193 0.27
194 0.27
195 0.23
196 0.25
197 0.26
198 0.31
199 0.33
200 0.4
201 0.43
202 0.47
203 0.47
204 0.47
205 0.49
206 0.45
207 0.43
208 0.37
209 0.36
210 0.35
211 0.35
212 0.36
213 0.31
214 0.32
215 0.31
216 0.32
217 0.26
218 0.23
219 0.22
220 0.19
221 0.19
222 0.19
223 0.2
224 0.18
225 0.18
226 0.18
227 0.18
228 0.22
229 0.24
230 0.23
231 0.21
232 0.2
233 0.18
234 0.18
235 0.2
236 0.15
237 0.14
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.15
242 0.16
243 0.14
244 0.15
245 0.16
246 0.17
247 0.16
248 0.17
249 0.13
250 0.11
251 0.12
252 0.11
253 0.08
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.11
263 0.14
264 0.19
265 0.18
266 0.22
267 0.27
268 0.31
269 0.33
270 0.3
271 0.32
272 0.34
273 0.33
274 0.29