Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2GPB8

Protein Details
Accession A0A1Y2GPB8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-263GREFGRDRDRRRSRSRSRDRHDRYRRNSRSRSRDRRDRDRRRSRSRSPRRRDSSRDRRSGRSSRRSRSPAPRDRSPABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
178-295GRGGRDRDRGREFGRDRDRRRSRSRSRDRHDRYRRNSRSRSRDRRDRDRRRSRSRSPRRRDSSRDRRSGRSSRRSRSPAPRDRSPAPRDRSPVRERTPSRDRSGSPAPRRERSRSGSR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12337  RRM1_SRSF4_like  
cd12339  RRM2_SRSF1_4_like  
Amino Acid Sequences MGTRVYLGHLSRDASDRDVESLFKNYGRLREVTLKNGFGFVEFSDPRDAKDAVYDIHGKDFMGERLVVELARGDRRDRRDDRDDRRFRPPERTEHRLIVENLAHGVSWQDIKDLMRRAGEVTFADISKDNDSQGVVEFSSAEDVQNAIKTLNGEDLRGNPVSLREFDPSRDTAPRDMGRGGRDRDRGREFGRDRDRRRSRSRSRDRHDRYRRNSRSRSRDRRDRDRRRSRSRSPRRRDSSRDRRSGRSSRRSRSPAPRDRSPAPRDRSPVRERTPSRDRSGSPAPRRERSRSGSRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.23
4 0.23
5 0.23
6 0.22
7 0.21
8 0.23
9 0.23
10 0.21
11 0.25
12 0.25
13 0.3
14 0.31
15 0.31
16 0.32
17 0.4
18 0.42
19 0.46
20 0.47
21 0.45
22 0.41
23 0.41
24 0.35
25 0.26
26 0.24
27 0.16
28 0.19
29 0.17
30 0.18
31 0.24
32 0.24
33 0.25
34 0.28
35 0.27
36 0.2
37 0.24
38 0.23
39 0.16
40 0.2
41 0.23
42 0.19
43 0.21
44 0.21
45 0.17
46 0.17
47 0.19
48 0.16
49 0.15
50 0.14
51 0.11
52 0.13
53 0.13
54 0.11
55 0.09
56 0.11
57 0.11
58 0.16
59 0.17
60 0.19
61 0.25
62 0.31
63 0.4
64 0.43
65 0.49
66 0.55
67 0.63
68 0.69
69 0.74
70 0.77
71 0.72
72 0.78
73 0.77
74 0.7
75 0.7
76 0.66
77 0.66
78 0.64
79 0.66
80 0.6
81 0.58
82 0.57
83 0.52
84 0.47
85 0.4
86 0.34
87 0.27
88 0.23
89 0.19
90 0.16
91 0.1
92 0.1
93 0.06
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.08
98 0.09
99 0.14
100 0.16
101 0.17
102 0.16
103 0.17
104 0.18
105 0.17
106 0.17
107 0.13
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.12
114 0.13
115 0.13
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.05
126 0.07
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.13
143 0.15
144 0.15
145 0.15
146 0.09
147 0.11
148 0.12
149 0.13
150 0.14
151 0.13
152 0.14
153 0.15
154 0.18
155 0.18
156 0.19
157 0.21
158 0.2
159 0.19
160 0.25
161 0.25
162 0.23
163 0.24
164 0.24
165 0.25
166 0.29
167 0.3
168 0.31
169 0.37
170 0.37
171 0.42
172 0.44
173 0.45
174 0.41
175 0.48
176 0.44
177 0.47
178 0.55
179 0.58
180 0.59
181 0.66
182 0.72
183 0.71
184 0.79
185 0.8
186 0.8
187 0.82
188 0.88
189 0.87
190 0.87
191 0.89
192 0.88
193 0.89
194 0.9
195 0.89
196 0.87
197 0.87
198 0.89
199 0.88
200 0.9
201 0.89
202 0.89
203 0.89
204 0.91
205 0.9
206 0.9
207 0.89
208 0.9
209 0.92
210 0.92
211 0.92
212 0.92
213 0.92
214 0.93
215 0.93
216 0.93
217 0.93
218 0.93
219 0.93
220 0.92
221 0.92
222 0.9
223 0.9
224 0.89
225 0.89
226 0.89
227 0.88
228 0.88
229 0.82
230 0.81
231 0.81
232 0.81
233 0.81
234 0.8
235 0.8
236 0.78
237 0.83
238 0.83
239 0.83
240 0.84
241 0.84
242 0.83
243 0.81
244 0.81
245 0.78
246 0.78
247 0.79
248 0.76
249 0.74
250 0.71
251 0.71
252 0.69
253 0.69
254 0.71
255 0.7
256 0.72
257 0.69
258 0.72
259 0.69
260 0.72
261 0.75
262 0.73
263 0.72
264 0.69
265 0.64
266 0.61
267 0.67
268 0.69
269 0.68
270 0.71
271 0.71
272 0.73
273 0.79
274 0.79
275 0.77
276 0.75