FuNGI

A0A1Y2GGD8

Protein Details

Accession

A0A1Y2GGD8

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-34	GGKATNFKRASRPKGPNRGQQKTKIVVRRL	Hydrophilic
278-304	TENTSGSKPKRERRRNRASKKANADAS	Hydrophilic
391-413	GGSGRSSRSRRTRGDRAKQEAKA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-22	RASRPKGPNR
285-298	KPKRERRRNRASKK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 13, mito 3, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSTAGGKATNFKRASRPKGPNRGQQKTKIVVRRLPANLPEHVFMESIKPFVQETSLERPTTWVAGKVSKNPVKGNTFARAYIYFKNEKLALEFQNVYHGHMFIDKQKNESRAFVEFAPFQKVPREPRKVDSKQGTIEQDPDYIAFLESLNAEPTEAEKEMKLSGTELLLKESVVNPKATPLLEALRAQKAAAQAKAQAAKIAARQARQAGKAGLSNATKGQITILINRNAKETSNNRGQSSNASAAANKNQQPQQNQPQTPQGRKSAQSAQNVQNADTENTSGSKPKRERRRNRASKKANADASSSTTGEAATPQITLLKPKSTTNNNTPAPSAQNPPSQSEPKQQNINSGSHGNQEPGNPSGRRGQQQQGSNNVSTNAKKDSLQTANSEGGSGRSSRSRRTRGDRAKQEAKAATSNATVANNNSGNTTNVPPASGNKGQGGQSTGGSGGSGRQGRSRRGRGGGQDNSQTSTVQG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.66
3	0.73
4	0.74
5	0.83
6	0.88
7	0.87
8	0.88
9	0.89
10	0.86
11	0.85
12	0.83
13	0.81
14	0.81
15	0.8
16	0.77
17	0.73
18	0.7
19	0.7
20	0.65
21	0.63
22	0.6
23	0.55
24	0.52
25	0.5
26	0.46
27	0.38
28	0.35
29	0.29
30	0.22
31	0.24
32	0.2
33	0.18
34	0.17
35	0.17
36	0.16
37	0.16
38	0.18
39	0.15
40	0.19
41	0.26
42	0.31
43	0.3
44	0.3
45	0.32
46	0.31
47	0.33
48	0.29
49	0.24
50	0.22
51	0.3
52	0.33
53	0.38
54	0.47
55	0.47
56	0.5
57	0.5
58	0.54
59	0.51
60	0.53
61	0.51
62	0.48
63	0.45
64	0.41
65	0.4
66	0.36
67	0.35
68	0.36
69	0.37
70	0.34
71	0.32
72	0.36
73	0.34
74	0.32
75	0.32
76	0.32
77	0.29
78	0.29
79	0.3
80	0.26
81	0.32
82	0.31
83	0.29
84	0.25
85	0.23
86	0.18
87	0.2
88	0.21
89	0.22
90	0.32
91	0.3
92	0.34
93	0.39
94	0.44
95	0.43
96	0.45
97	0.39
98	0.32
99	0.34
100	0.3
101	0.28
102	0.25
103	0.25
104	0.28
105	0.25
106	0.23
107	0.27
108	0.31
109	0.37
110	0.44
111	0.51
112	0.48
113	0.55
114	0.65
115	0.64
116	0.68
117	0.66
118	0.61
119	0.56
120	0.58
121	0.55
122	0.46
123	0.44
124	0.36
125	0.29
126	0.24
127	0.21
128	0.16
129	0.13
130	0.11
131	0.08
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.08
136	0.08
137	0.07
138	0.07
139	0.07
140	0.08
141	0.1
142	0.1
143	0.1
144	0.09
145	0.11
146	0.11
147	0.12
148	0.11
149	0.09
150	0.09
151	0.09
152	0.12
153	0.12
154	0.13
155	0.12
156	0.12
157	0.12
158	0.14
159	0.18
160	0.16
161	0.17
162	0.15
163	0.16
164	0.18
165	0.17
166	0.16
167	0.12
168	0.13
169	0.14
170	0.17
171	0.18
172	0.18
173	0.18
174	0.17
175	0.17
176	0.2
177	0.21
178	0.2
179	0.18
180	0.18
181	0.22
182	0.25
183	0.23
184	0.19
185	0.16
186	0.17
187	0.17
188	0.22
189	0.21
190	0.19
191	0.2
192	0.24
193	0.27
194	0.27
195	0.27
196	0.21
197	0.2
198	0.21
199	0.2
200	0.19
201	0.16
202	0.16
203	0.14
204	0.14
205	0.13
206	0.12
207	0.11
208	0.1
209	0.11
210	0.16
211	0.2
212	0.25
213	0.27
214	0.27
215	0.28
216	0.25
217	0.25
218	0.25
219	0.23
220	0.23
221	0.3
222	0.32
223	0.32
224	0.32
225	0.32
226	0.29
227	0.3
228	0.25
229	0.18
230	0.16
231	0.16
232	0.16
233	0.2
234	0.22
235	0.21
236	0.24
237	0.26
238	0.3
239	0.33
240	0.39
241	0.45
242	0.49
243	0.48
244	0.46
245	0.51
246	0.53
247	0.54
248	0.5
249	0.46
250	0.4
251	0.41
252	0.43
253	0.44
254	0.45
255	0.46
256	0.48
257	0.47
258	0.48
259	0.47
260	0.42
261	0.35
262	0.3
263	0.25
264	0.2
265	0.15
266	0.11
267	0.12
268	0.12
269	0.15
270	0.15
271	0.23
272	0.3
273	0.38
274	0.49
275	0.59
276	0.69
277	0.75
278	0.85
279	0.87
280	0.9
281	0.93
282	0.91
283	0.89
284	0.86
285	0.83
286	0.76
287	0.66
288	0.58
289	0.49
290	0.44
291	0.37
292	0.29
293	0.22
294	0.16
295	0.15
296	0.13
297	0.12
298	0.08
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.08
303	0.09
304	0.13
305	0.14
306	0.17
307	0.18
308	0.21
309	0.29
310	0.34
311	0.41
312	0.44
313	0.52
314	0.5
315	0.5
316	0.48
317	0.43
318	0.41
319	0.36
320	0.34
321	0.29
322	0.32
323	0.32
324	0.35
325	0.39
326	0.38
327	0.39
328	0.43
329	0.45
330	0.45
331	0.51
332	0.48
333	0.51
334	0.49
335	0.48
336	0.42
337	0.38
338	0.34
339	0.31
340	0.31
341	0.24
342	0.22
343	0.21
344	0.21
345	0.2
346	0.25
347	0.21
348	0.22
349	0.29
350	0.33
351	0.36
352	0.39
353	0.44
354	0.45
355	0.52
356	0.56
357	0.57
358	0.56
359	0.52
360	0.48
361	0.42
362	0.39
363	0.33
364	0.31
365	0.26
366	0.23
367	0.23
368	0.25
369	0.31
370	0.33
371	0.33
372	0.33
373	0.33
374	0.34
375	0.33
376	0.3
377	0.22
378	0.18
379	0.17
380	0.15
381	0.14
382	0.19
383	0.22
384	0.3
385	0.4
386	0.47
387	0.55
388	0.64
389	0.73
390	0.76
391	0.84
392	0.85
393	0.85
394	0.86
395	0.79
396	0.78
397	0.71
398	0.63
399	0.56
400	0.47
401	0.4
402	0.32
403	0.3
404	0.25
405	0.23
406	0.2
407	0.18
408	0.23
409	0.22
410	0.21
411	0.22
412	0.21
413	0.21
414	0.23
415	0.25
416	0.23
417	0.21
418	0.22
419	0.21
420	0.24
421	0.29
422	0.3
423	0.3
424	0.28
425	0.32
426	0.32
427	0.33
428	0.33
429	0.27
430	0.23
431	0.22
432	0.19
433	0.16
434	0.14
435	0.12
436	0.1
437	0.16
438	0.19
439	0.19
440	0.26
441	0.32
442	0.41
443	0.52
444	0.58
445	0.59
446	0.62
447	0.68
448	0.7
449	0.74
450	0.73
451	0.69
452	0.68
453	0.62
454	0.59
455	0.53

A0A1Y2GGD8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer