Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2H1R4

Protein Details
Accession A0A1Y2H1R4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
230-252EPESMKKKKPSSKSQKNAKPDPEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
235-249KKKKPSSKSQKNAKP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006642  Rad18_UBZ4  
IPR044245  Spartan  
IPR006640  SprT-like_domain  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004222  F:metalloendopeptidase activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006508  P:proteolysis  
Pfam View protein in Pfam  
PF10263  SprT-like  
Amino Acid Sequences MVQSDEELARLLQEQEYGAVGSSSLLKKGDIDSPFIIPEDDDYDNGVTPPDLDTEAPFKDLHGLFLAFNDQYFESKLSACEVRWSPRMTRCAGLCYYQSKAQYCSIRLSEPLLKFRPESDYIDTLLHEMIHAYLFVTKAIQDHDGHGADFQYHMNRINKAAGTSITIYHTFHDEVRHYQTHIWKCNGPCQHRPPYYGIVKRSMNRPPQPADRWFAEHQMTCGGTYTKISEPESMKKKKPSSKSQKNAKPDPESKGRTLIDDFFSPSKTASETNSSKSSSLSLTSLNNKDGSNKDNSILIHDADHIDNAKNFIPGSSELTDDVQQNDSSTTENIFGKDKEVGINPLSPREAAAAAALRRFERHLNQTSINMKSLSPLSSSSKRKTVAAADLNDKDALRSKRMKEEGIVYMKRNTTDSGQGKESVVLIKRSTSSSTRIEDPYEGSDTGVQRGALDNKEVRVNTGIKSSPSGPSSMKAEVVDALLVSCPICTQKVEEATINDHVDLCIWHASGAN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.13
4 0.12
5 0.11
6 0.09
7 0.08
8 0.08
9 0.13
10 0.13
11 0.15
12 0.15
13 0.15
14 0.17
15 0.2
16 0.26
17 0.22
18 0.26
19 0.26
20 0.27
21 0.28
22 0.27
23 0.24
24 0.17
25 0.17
26 0.17
27 0.16
28 0.14
29 0.16
30 0.16
31 0.16
32 0.16
33 0.15
34 0.1
35 0.1
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.13
41 0.16
42 0.17
43 0.18
44 0.17
45 0.16
46 0.22
47 0.21
48 0.21
49 0.2
50 0.2
51 0.18
52 0.19
53 0.22
54 0.14
55 0.14
56 0.14
57 0.12
58 0.13
59 0.14
60 0.15
61 0.13
62 0.14
63 0.15
64 0.17
65 0.18
66 0.17
67 0.23
68 0.25
69 0.3
70 0.35
71 0.38
72 0.41
73 0.46
74 0.51
75 0.46
76 0.47
77 0.43
78 0.43
79 0.41
80 0.38
81 0.34
82 0.32
83 0.33
84 0.32
85 0.35
86 0.31
87 0.32
88 0.36
89 0.38
90 0.37
91 0.39
92 0.37
93 0.34
94 0.33
95 0.35
96 0.36
97 0.34
98 0.39
99 0.36
100 0.36
101 0.35
102 0.36
103 0.37
104 0.33
105 0.34
106 0.32
107 0.31
108 0.3
109 0.3
110 0.29
111 0.23
112 0.2
113 0.15
114 0.1
115 0.08
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.05
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.1
127 0.13
128 0.12
129 0.14
130 0.18
131 0.18
132 0.18
133 0.17
134 0.16
135 0.13
136 0.13
137 0.12
138 0.1
139 0.11
140 0.17
141 0.19
142 0.21
143 0.22
144 0.25
145 0.24
146 0.22
147 0.23
148 0.17
149 0.17
150 0.16
151 0.16
152 0.14
153 0.14
154 0.14
155 0.13
156 0.15
157 0.14
158 0.14
159 0.16
160 0.16
161 0.19
162 0.24
163 0.25
164 0.24
165 0.27
166 0.34
167 0.38
168 0.42
169 0.41
170 0.4
171 0.4
172 0.47
173 0.5
174 0.49
175 0.49
176 0.52
177 0.59
178 0.57
179 0.59
180 0.56
181 0.55
182 0.57
183 0.54
184 0.49
185 0.45
186 0.46
187 0.45
188 0.47
189 0.47
190 0.48
191 0.48
192 0.5
193 0.49
194 0.53
195 0.56
196 0.54
197 0.5
198 0.43
199 0.43
200 0.39
201 0.37
202 0.32
203 0.27
204 0.24
205 0.22
206 0.2
207 0.15
208 0.15
209 0.12
210 0.09
211 0.09
212 0.12
213 0.11
214 0.14
215 0.15
216 0.18
217 0.21
218 0.29
219 0.37
220 0.4
221 0.43
222 0.48
223 0.55
224 0.58
225 0.64
226 0.67
227 0.69
228 0.74
229 0.8
230 0.83
231 0.83
232 0.83
233 0.82
234 0.77
235 0.74
236 0.67
237 0.63
238 0.61
239 0.57
240 0.5
241 0.48
242 0.42
243 0.35
244 0.32
245 0.29
246 0.22
247 0.19
248 0.19
249 0.14
250 0.15
251 0.13
252 0.12
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.17
258 0.18
259 0.21
260 0.24
261 0.24
262 0.23
263 0.23
264 0.22
265 0.15
266 0.15
267 0.12
268 0.11
269 0.13
270 0.18
271 0.2
272 0.2
273 0.2
274 0.19
275 0.22
276 0.22
277 0.23
278 0.22
279 0.21
280 0.21
281 0.22
282 0.22
283 0.22
284 0.21
285 0.18
286 0.14
287 0.13
288 0.14
289 0.11
290 0.12
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.1
300 0.11
301 0.15
302 0.14
303 0.14
304 0.14
305 0.15
306 0.17
307 0.16
308 0.16
309 0.13
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.11
314 0.1
315 0.1
316 0.09
317 0.11
318 0.12
319 0.12
320 0.14
321 0.14
322 0.14
323 0.15
324 0.15
325 0.14
326 0.15
327 0.17
328 0.16
329 0.2
330 0.19
331 0.2
332 0.2
333 0.17
334 0.16
335 0.15
336 0.14
337 0.1
338 0.1
339 0.12
340 0.12
341 0.13
342 0.14
343 0.13
344 0.14
345 0.16
346 0.19
347 0.21
348 0.28
349 0.33
350 0.37
351 0.38
352 0.43
353 0.46
354 0.44
355 0.4
356 0.33
357 0.26
358 0.24
359 0.24
360 0.19
361 0.16
362 0.17
363 0.21
364 0.29
365 0.36
366 0.38
367 0.42
368 0.42
369 0.42
370 0.42
371 0.41
372 0.41
373 0.41
374 0.41
375 0.41
376 0.4
377 0.41
378 0.38
379 0.33
380 0.25
381 0.27
382 0.26
383 0.27
384 0.33
385 0.36
386 0.44
387 0.48
388 0.49
389 0.44
390 0.47
391 0.48
392 0.5
393 0.49
394 0.42
395 0.43
396 0.43
397 0.41
398 0.37
399 0.31
400 0.25
401 0.32
402 0.34
403 0.33
404 0.34
405 0.35
406 0.34
407 0.32
408 0.3
409 0.26
410 0.24
411 0.23
412 0.21
413 0.22
414 0.23
415 0.24
416 0.27
417 0.25
418 0.27
419 0.3
420 0.33
421 0.36
422 0.36
423 0.37
424 0.34
425 0.34
426 0.32
427 0.3
428 0.26
429 0.22
430 0.24
431 0.22
432 0.23
433 0.22
434 0.18
435 0.15
436 0.19
437 0.23
438 0.2
439 0.24
440 0.25
441 0.25
442 0.31
443 0.31
444 0.29
445 0.3
446 0.3
447 0.27
448 0.31
449 0.31
450 0.27
451 0.3
452 0.3
453 0.3
454 0.29
455 0.31
456 0.26
457 0.28
458 0.3
459 0.29
460 0.29
461 0.23
462 0.23
463 0.21
464 0.2
465 0.17
466 0.12
467 0.11
468 0.09
469 0.09
470 0.08
471 0.06
472 0.07
473 0.09
474 0.1
475 0.11
476 0.15
477 0.22
478 0.27
479 0.31
480 0.33
481 0.34
482 0.37
483 0.41
484 0.39
485 0.32
486 0.27
487 0.23
488 0.21
489 0.18
490 0.17
491 0.14
492 0.13