Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2GKX1

Protein Details
Accession A0A1Y2GKX1    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
195-226VVSAKERKHKSSRDKHKHNKDKDKGRDKDRYRBasic
245-280DSSSYHQKDNRRNRSRTRSPSPKRRMDKHFRPQVENHydrophilic
285-305LAVMRAHKHRRHTKRGDGGGSBasic
320-351GEGPRSRSHSRSRSRSPRRNDGRRTGHDHGREBasic
354-373GRHGGSRNDRQHRDRHDHRCBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
199-273KERKHKSSRDKHKHNKDKDKGRDKDRYRDKERERVKESRRDYKDRKDSSSYHQKDNRRNRSRTRSPSPKRRMDKH
289-359RAHKHRRHTKRGDGGGSEEEDKKKESRKQGYGEGPRSRSHSRSRSRSPRRNDGRRTGHDHGREHEGRHGGS
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR022967  S1_dom  
IPR003029  S1_domain  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00575  S1  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50126  S1  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MDSQQEAFERFKAANSGKRSTREGQQSRSSKLKEVDGPLPDLYSIHRGQVVRVEDYGAFVQIPGFRKQGLVHKRQTSNHFTENVSDVVASGDHVWVKVTSLQDGKIALSMKYVSQGDGTDLDPNLVKLTGEEDRKRTHTTFIDKQPIAIEEGGVFLKTVCKKCGASGHLATDCFSAGEQFELLADEDDEATRQNVVSAKERKHKSSRDKHKHNKDKDKGRDKDRYRDKERERVKESRRDYKDRKDSSSYHQKDNRRNRSRTRSPSPKRRMDKHFRPQVENLEDALAVMRAHKHRRHTKRGDGGGSEEEDKKKESRKQGYGEGPRSRSHSRSRSRSPRRNDGRRTGHDHGREHEGRHGGSRNDRQHRDRHDHRC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.4
3 0.46
4 0.5
5 0.54
6 0.59
7 0.56
8 0.59
9 0.62
10 0.63
11 0.63
12 0.67
13 0.68
14 0.68
15 0.72
16 0.66
17 0.61
18 0.58
19 0.57
20 0.53
21 0.53
22 0.54
23 0.48
24 0.48
25 0.42
26 0.38
27 0.31
28 0.25
29 0.22
30 0.21
31 0.19
32 0.17
33 0.21
34 0.21
35 0.22
36 0.28
37 0.29
38 0.25
39 0.25
40 0.26
41 0.21
42 0.23
43 0.23
44 0.16
45 0.13
46 0.1
47 0.12
48 0.14
49 0.17
50 0.18
51 0.19
52 0.19
53 0.2
54 0.23
55 0.31
56 0.37
57 0.42
58 0.48
59 0.55
60 0.61
61 0.66
62 0.7
63 0.69
64 0.66
65 0.62
66 0.57
67 0.49
68 0.45
69 0.41
70 0.34
71 0.26
72 0.19
73 0.14
74 0.11
75 0.1
76 0.08
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.12
85 0.12
86 0.14
87 0.15
88 0.16
89 0.17
90 0.17
91 0.16
92 0.16
93 0.16
94 0.13
95 0.12
96 0.13
97 0.11
98 0.15
99 0.15
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.13
106 0.12
107 0.11
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.1
112 0.09
113 0.08
114 0.05
115 0.09
116 0.13
117 0.19
118 0.22
119 0.25
120 0.28
121 0.32
122 0.36
123 0.34
124 0.34
125 0.34
126 0.39
127 0.44
128 0.47
129 0.53
130 0.49
131 0.48
132 0.44
133 0.39
134 0.33
135 0.25
136 0.17
137 0.08
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.07
142 0.05
143 0.1
144 0.14
145 0.16
146 0.16
147 0.19
148 0.19
149 0.22
150 0.29
151 0.26
152 0.27
153 0.27
154 0.3
155 0.29
156 0.29
157 0.27
158 0.2
159 0.18
160 0.12
161 0.1
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.08
182 0.1
183 0.18
184 0.24
185 0.29
186 0.38
187 0.41
188 0.45
189 0.5
190 0.57
191 0.6
192 0.65
193 0.71
194 0.74
195 0.82
196 0.87
197 0.91
198 0.92
199 0.92
200 0.92
201 0.9
202 0.89
203 0.89
204 0.89
205 0.85
206 0.83
207 0.82
208 0.76
209 0.77
210 0.77
211 0.77
212 0.73
213 0.76
214 0.74
215 0.74
216 0.77
217 0.76
218 0.72
219 0.72
220 0.72
221 0.71
222 0.71
223 0.72
224 0.71
225 0.72
226 0.72
227 0.73
228 0.76
229 0.72
230 0.71
231 0.67
232 0.63
233 0.62
234 0.67
235 0.6
236 0.58
237 0.61
238 0.63
239 0.67
240 0.75
241 0.77
242 0.75
243 0.79
244 0.8
245 0.84
246 0.86
247 0.86
248 0.85
249 0.85
250 0.85
251 0.89
252 0.89
253 0.89
254 0.87
255 0.86
256 0.86
257 0.86
258 0.87
259 0.86
260 0.86
261 0.81
262 0.78
263 0.73
264 0.72
265 0.64
266 0.55
267 0.45
268 0.36
269 0.31
270 0.25
271 0.21
272 0.12
273 0.08
274 0.08
275 0.12
276 0.17
277 0.26
278 0.3
279 0.4
280 0.5
281 0.61
282 0.71
283 0.75
284 0.79
285 0.81
286 0.84
287 0.79
288 0.7
289 0.64
290 0.56
291 0.5
292 0.43
293 0.37
294 0.31
295 0.28
296 0.28
297 0.29
298 0.34
299 0.39
300 0.46
301 0.52
302 0.58
303 0.63
304 0.69
305 0.75
306 0.76
307 0.78
308 0.75
309 0.68
310 0.63
311 0.64
312 0.6
313 0.56
314 0.56
315 0.57
316 0.59
317 0.66
318 0.74
319 0.79
320 0.85
321 0.89
322 0.88
323 0.89
324 0.9
325 0.91
326 0.89
327 0.89
328 0.88
329 0.86
330 0.86
331 0.82
332 0.8
333 0.77
334 0.72
335 0.65
336 0.65
337 0.6
338 0.53
339 0.53
340 0.49
341 0.43
342 0.44
343 0.47
344 0.42
345 0.48
346 0.56
347 0.59
348 0.65
349 0.72
350 0.71
351 0.75
352 0.79
353 0.8