FuNGI

A0A1Y2GSK3

Protein Details

Accession

A0A1Y2GSK3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
996-1019	QESLTVKGRKKKTSRKAIADQQMT	Hydrophilic
1244-1270	AKAMGKALRKRGGKKTSKKLFHSWESI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1003-1010	GRKKKTSR
1247-1262	MGKALRKRGGKKTSKK

Subcellular Location(s)

mito 24.5, cyto_mito 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MLSVASTLRGNRITLASARTSSLRTQLALPRIARNHLRYRLHSTAAVEESSQSITHTTVPISQARAETNQNLHSYSSASGKLEPIRIIRLPEAKSHEPRESGKFGDNQLSEQMAVMYACINTGDMDRARRIFVTLHKNNPEDMLVLGDIRMHNSFMESYMNASPSPRTKEALKWFESLSKYKVKPDLTSFAILIKGFIKMDSMHTAKVMMMEMQKAGFTLDELRQCPDLQAEDVDRINSVAGMLKPASARLKPLTPVSSVAPTTPKSEFKEAIPVQNSNNETVIGVRFMKDTLETLNLKELTPFERQMKLEERSYQSAIDRMEYERESIPEQLNVRPLRTYLWQWHQALKAGIRAEIKRVDAVLERRSLSDDAALDKDRMLYGPFLKLLSPDKLSIITILELLRLNNSGGIIEGMKSARALIGIGKAVESEYNAEQMAKKSNKALFDQKVSVHQLYGSGKLFNIAVRKAETKRSSTMHPTDWTPVWPETMRAKVGSVLTTLLMDCAKVQIPSFDPETKQKIVEEIPAFYHSYQYNKGQRIGVIKVHNHISEILSSEPIGSLIHPSMLPMLVHPRPWLAYNDGGYLTAQSIIMRIRHCPQQLDYLKKAHEEGLLFRVYNGLDVLGKTRWAVNKKVLKTVLEAWNSGKEFGKIPAAAAQVEDLPKPDDYETNSKAKARWLFENRKMKMEAKNHHSLRCDVNYKIEIARAFADEPMFFPHNLDFRGRAYPIPPLFNHLGNDLCRGLLLFDEAKPLGPKGFTWLKIHLANLAGYDKHSLSARAKFAMDHLDDIFDSADNPMEGRRWWLKAEDPWQCLATCIEVAEAVRSGDPESYMSRIPVHQDGTCNGLQHYAALGGDIAGAQQVNLVPSDAPQDVYSGVAKAVERILEQHAAEGVENAKILLGKVTRKIVKQTVMTNVYGVTFVGARAQIENRLKETEGIPKENVHALSTYLTQQVFASIGEMFTGARAIQDWLAESARRIAKSVPKDVVDPETDEIQESLTVKGRKKKTSRKAIADQQMTSVIWTTPLNLPIVQPYRKLEHKQIRTNLQQLTIKDPSQASPVNVQKQRTAFPPNFIHSLDATHMLMSAAGCVEAGLTFASVHDSYWTHACDVEIMNEVLRKQFILLHSNNIMKNLENEFMERYKDYLYPVTYIIAGPGEPVEEGMIAWDDERVHRKNARIESSISGTEFVPDLEAPADEPMTTSSDRSAKIKENNMYHFDDDEDDEHDLSGVVIEEDAAELEAEAKAMGKALRKRGGKKTSKKLFHSWESISFPPLPDRGEFDVAKVADSDYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.28
3	0.27
4	0.26
5	0.28
6	0.27
7	0.29
8	0.28
9	0.31
10	0.29
11	0.27
12	0.31
13	0.36
14	0.4
15	0.44
16	0.44
17	0.46
18	0.47
19	0.52
20	0.54
21	0.55
22	0.58
23	0.61
24	0.66
25	0.64
26	0.7
27	0.68
28	0.64
29	0.6
30	0.52
31	0.49
32	0.44
33	0.39
34	0.3
35	0.25
36	0.23
37	0.21
38	0.19
39	0.13
40	0.11
41	0.12
42	0.14
43	0.15
44	0.14
45	0.17
46	0.2
47	0.23
48	0.25
49	0.27
50	0.27
51	0.28
52	0.31
53	0.32
54	0.34
55	0.36
56	0.38
57	0.37
58	0.36
59	0.34
60	0.31
61	0.28
62	0.24
63	0.23
64	0.21
65	0.2
66	0.2
67	0.24
68	0.28
69	0.29
70	0.31
71	0.29
72	0.32
73	0.33
74	0.35
75	0.37
76	0.4
77	0.38
78	0.41
79	0.47
80	0.49
81	0.55
82	0.57
83	0.56
84	0.54
85	0.57
86	0.58
87	0.54
88	0.48
89	0.46
90	0.45
91	0.42
92	0.46
93	0.42
94	0.36
95	0.35
96	0.33
97	0.27
98	0.23
99	0.2
100	0.12
101	0.11
102	0.1
103	0.08
104	0.07
105	0.07
106	0.07
107	0.07
108	0.07
109	0.08
110	0.13
111	0.15
112	0.19
113	0.23
114	0.24
115	0.26
116	0.25
117	0.26
118	0.25
119	0.31
120	0.38
121	0.41
122	0.49
123	0.54
124	0.55
125	0.54
126	0.51
127	0.44
128	0.34
129	0.27
130	0.2
131	0.14
132	0.13
133	0.12
134	0.12
135	0.12
136	0.13
137	0.14
138	0.12
139	0.11
140	0.13
141	0.13
142	0.12
143	0.15
144	0.12
145	0.15
146	0.17
147	0.18
148	0.16
149	0.17
150	0.2
151	0.24
152	0.31
153	0.3
154	0.31
155	0.33
156	0.42
157	0.51
158	0.55
159	0.52
160	0.47
161	0.47
162	0.5
163	0.51
164	0.46
165	0.41
166	0.42
167	0.41
168	0.45
169	0.5
170	0.47
171	0.47
172	0.5
173	0.5
174	0.45
175	0.45
176	0.39
177	0.34
178	0.33
179	0.27
180	0.22
181	0.17
182	0.15
183	0.13
184	0.12
185	0.12
186	0.11
187	0.14
188	0.2
189	0.21
190	0.2
191	0.2
192	0.21
193	0.19
194	0.2
195	0.17
196	0.13
197	0.13
198	0.14
199	0.14
200	0.14
201	0.13
202	0.12
203	0.12
204	0.08
205	0.08
206	0.11
207	0.14
208	0.19
209	0.21
210	0.23
211	0.24
212	0.24
213	0.24
214	0.23
215	0.2
216	0.16
217	0.18
218	0.17
219	0.19
220	0.19
221	0.19
222	0.16
223	0.15
224	0.13
225	0.1
226	0.09
227	0.1
228	0.09
229	0.12
230	0.12
231	0.13
232	0.13
233	0.17
234	0.22
235	0.18
236	0.23
237	0.24
238	0.27
239	0.28
240	0.33
241	0.32
242	0.29
243	0.3
244	0.29
245	0.29
246	0.26
247	0.25
248	0.24
249	0.23
250	0.25
251	0.26
252	0.29
253	0.3
254	0.35
255	0.35
256	0.32
257	0.42
258	0.4
259	0.44
260	0.42
261	0.39
262	0.35
263	0.4
264	0.4
265	0.31
266	0.29
267	0.22
268	0.18
269	0.18
270	0.17
271	0.13
272	0.12
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.12
277	0.11
278	0.11
279	0.11
280	0.16
281	0.16
282	0.16
283	0.22
284	0.22
285	0.22
286	0.22
287	0.21
288	0.19
289	0.23
290	0.26
291	0.23
292	0.28
293	0.28
294	0.32
295	0.38
296	0.38
297	0.38
298	0.41
299	0.43
300	0.42
301	0.42
302	0.39
303	0.33
304	0.33
305	0.29
306	0.24
307	0.21
308	0.18
309	0.21
310	0.19
311	0.21
312	0.19
313	0.2
314	0.2
315	0.21
316	0.21
317	0.21
318	0.22
319	0.22
320	0.28
321	0.28
322	0.27
323	0.24
324	0.24
325	0.22
326	0.24
327	0.26
328	0.27
329	0.33
330	0.39
331	0.4
332	0.45
333	0.44
334	0.44
335	0.42
336	0.35
337	0.32
338	0.25
339	0.27
340	0.26
341	0.25
342	0.26
343	0.26
344	0.25
345	0.22
346	0.21
347	0.2
348	0.21
349	0.24
350	0.24
351	0.25
352	0.24
353	0.24
354	0.27
355	0.26
356	0.21
357	0.19
358	0.16
359	0.15
360	0.17
361	0.18
362	0.15
363	0.15
364	0.15
365	0.13
366	0.12
367	0.11
368	0.11
369	0.11
370	0.13
371	0.14
372	0.14
373	0.14
374	0.15
375	0.18
376	0.19
377	0.19
378	0.17
379	0.18
380	0.18
381	0.18
382	0.16
383	0.14
384	0.1
385	0.1
386	0.09
387	0.1
388	0.09
389	0.09
390	0.1
391	0.09
392	0.09
393	0.08
394	0.08
395	0.07
396	0.06
397	0.07
398	0.06
399	0.06
400	0.07
401	0.07
402	0.07
403	0.07
404	0.07
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.08
410	0.08
411	0.08
412	0.08
413	0.08
414	0.08
415	0.08
416	0.07
417	0.08
418	0.08
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.11
423	0.12
424	0.21
425	0.2
426	0.2
427	0.25
428	0.28
429	0.3
430	0.33
431	0.4
432	0.35
433	0.38
434	0.4
435	0.35
436	0.37
437	0.39
438	0.35
439	0.26
440	0.22
441	0.21
442	0.2
443	0.23
444	0.18
445	0.15
446	0.14
447	0.15
448	0.15
449	0.13
450	0.15
451	0.12
452	0.13
453	0.15
454	0.19
455	0.21
456	0.29
457	0.3
458	0.31
459	0.34
460	0.35
461	0.37
462	0.4
463	0.42
464	0.38
465	0.37
466	0.35
467	0.34
468	0.32
469	0.29
470	0.25
471	0.21
472	0.2
473	0.18
474	0.19
475	0.19
476	0.21
477	0.21
478	0.18
479	0.18
480	0.18
481	0.19
482	0.16
483	0.13
484	0.11
485	0.1
486	0.1
487	0.09
488	0.07
489	0.06
490	0.06
491	0.05
492	0.06
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.08
497	0.1
498	0.12
499	0.16
500	0.17
501	0.18
502	0.22
503	0.28
504	0.27
505	0.26
506	0.24
507	0.23
508	0.22
509	0.26
510	0.23
511	0.18
512	0.18
513	0.19
514	0.2
515	0.17
516	0.19
517	0.14
518	0.15
519	0.17
520	0.24
521	0.28
522	0.3
523	0.33
524	0.3
525	0.32
526	0.33
527	0.33
528	0.31
529	0.28
530	0.27
531	0.27
532	0.29
533	0.26
534	0.23
535	0.21
536	0.17
537	0.13
538	0.13
539	0.11
540	0.09
541	0.09
542	0.08
543	0.07
544	0.07
545	0.06
546	0.04
547	0.05
548	0.05
549	0.06
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.07
554	0.06
555	0.06
556	0.11
557	0.11
558	0.12
559	0.13
560	0.13
561	0.13
562	0.15
563	0.16
564	0.13
565	0.15
566	0.15
567	0.16
568	0.15
569	0.15
570	0.13
571	0.12
572	0.09
573	0.07
574	0.06
575	0.05
576	0.06
577	0.07
578	0.09
579	0.1
580	0.12
581	0.14
582	0.19
583	0.21
584	0.22
585	0.22
586	0.29
587	0.34
588	0.38
589	0.38
590	0.36
591	0.36
592	0.35
593	0.34
594	0.25
595	0.22
596	0.16
597	0.15
598	0.15
599	0.15
600	0.15
601	0.14
602	0.13
603	0.11
604	0.1
605	0.09
606	0.06
607	0.05
608	0.05
609	0.08
610	0.07
611	0.07
612	0.07
613	0.09
614	0.13
615	0.16
616	0.19
617	0.25
618	0.32
619	0.34
620	0.39
621	0.38
622	0.35
623	0.34
624	0.37
625	0.36
626	0.3
627	0.29
628	0.24
629	0.27
630	0.26
631	0.25
632	0.19
633	0.13
634	0.13
635	0.13
636	0.15
637	0.11
638	0.11
639	0.14
640	0.14
641	0.13
642	0.12
643	0.11
644	0.1
645	0.1
646	0.1
647	0.07
648	0.08
649	0.08
650	0.09
651	0.09
652	0.09
653	0.12
654	0.19
655	0.21
656	0.24
657	0.25
658	0.25
659	0.25
660	0.29
661	0.31
662	0.27
663	0.32
664	0.38
665	0.45
666	0.53
667	0.62
668	0.58
669	0.56
670	0.56
671	0.52
672	0.51
673	0.5
674	0.48
675	0.45
676	0.53
677	0.52
678	0.53
679	0.51
680	0.45
681	0.41
682	0.4
683	0.36
684	0.27
685	0.29
686	0.26
687	0.25
688	0.23
689	0.21
690	0.16
691	0.14
692	0.15
693	0.12
694	0.11
695	0.11
696	0.11
697	0.09
698	0.09
699	0.12
700	0.12
701	0.11
702	0.11
703	0.13
704	0.14
705	0.15
706	0.15
707	0.13
708	0.14
709	0.17
710	0.17
711	0.15
712	0.14
713	0.2
714	0.2
715	0.22
716	0.2
717	0.23
718	0.24
719	0.24
720	0.24
721	0.19
722	0.19
723	0.17
724	0.19
725	0.14
726	0.12
727	0.1
728	0.1
729	0.08
730	0.06
731	0.07
732	0.06
733	0.06
734	0.08
735	0.09
736	0.09
737	0.1
738	0.1
739	0.09
740	0.08
741	0.08
742	0.12
743	0.17
744	0.19
745	0.21
746	0.23
747	0.26
748	0.27
749	0.27
750	0.23
751	0.2
752	0.17
753	0.15
754	0.14
755	0.1
756	0.1
757	0.11
758	0.09
759	0.1
760	0.1
761	0.12
762	0.14
763	0.19
764	0.2
765	0.2
766	0.2
767	0.19
768	0.2
769	0.23
770	0.2
771	0.16
772	0.15
773	0.14
774	0.14
775	0.14
776	0.13
777	0.07
778	0.07
779	0.05
780	0.06
781	0.05
782	0.05
783	0.05
784	0.06
785	0.06
786	0.11
787	0.14
788	0.15
789	0.16
790	0.18
791	0.21
792	0.26
793	0.34
794	0.37
795	0.35
796	0.35
797	0.35
798	0.33
799	0.3
800	0.25
801	0.18
802	0.11
803	0.09
804	0.07
805	0.07
806	0.07
807	0.06
808	0.07
809	0.06
810	0.06
811	0.06
812	0.07
813	0.06
814	0.07
815	0.08
816	0.09
817	0.1
818	0.11
819	0.11
820	0.12
821	0.12
822	0.15
823	0.16
824	0.18
825	0.17
826	0.18
827	0.18
828	0.22
829	0.22
830	0.2
831	0.17
832	0.16
833	0.14
834	0.12
835	0.12
836	0.08
837	0.06
838	0.06
839	0.06
840	0.04
841	0.04
842	0.04
843	0.03
844	0.03
845	0.03
846	0.03
847	0.04
848	0.04
849	0.05
850	0.05
851	0.05
852	0.05
853	0.06
854	0.09
855	0.09
856	0.09
857	0.09
858	0.1
859	0.09
860	0.11
861	0.11
862	0.08
863	0.07
864	0.08
865	0.08
866	0.08
867	0.09
868	0.08
869	0.08
870	0.1
871	0.12
872	0.14
873	0.14
874	0.13
875	0.13
876	0.13
877	0.13
878	0.12
879	0.1
880	0.08
881	0.08
882	0.07
883	0.06
884	0.06
885	0.06
886	0.08
887	0.1
888	0.13
889	0.16
890	0.23
891	0.27
892	0.28
893	0.34
894	0.36
895	0.39
896	0.4
897	0.4
898	0.42
899	0.42
900	0.4
901	0.34
902	0.29
903	0.24
904	0.21
905	0.16
906	0.09
907	0.06
908	0.05
909	0.07
910	0.07
911	0.07
912	0.09
913	0.1
914	0.17
915	0.22
916	0.24
917	0.24
918	0.26
919	0.26
920	0.26
921	0.27
922	0.29
923	0.28
924	0.3
925	0.28
926	0.27
927	0.29
928	0.31
929	0.29
930	0.21
931	0.17
932	0.15
933	0.15
934	0.15
935	0.15
936	0.14
937	0.14
938	0.13
939	0.13
940	0.13
941	0.11
942	0.1
943	0.09
944	0.06
945	0.06
946	0.06
947	0.06
948	0.05
949	0.05
950	0.05
951	0.04
952	0.04
953	0.05
954	0.06
955	0.07
956	0.07
957	0.08
958	0.1
959	0.11
960	0.11
961	0.11
962	0.17
963	0.2
964	0.2
965	0.2
966	0.23
967	0.29
968	0.35
969	0.41
970	0.39
971	0.36
972	0.37
973	0.39
974	0.38
975	0.32
976	0.28
977	0.24
978	0.21
979	0.2
980	0.19
981	0.17
982	0.13
983	0.13
984	0.12
985	0.12
986	0.16
987	0.2
988	0.25
989	0.34
990	0.4
991	0.49
992	0.58
993	0.67
994	0.72
995	0.79
996	0.83
997	0.84
998	0.86
999	0.86
1000	0.85
1001	0.79
1002	0.69
1003	0.59
1004	0.52
1005	0.42
1006	0.34
1007	0.25
1008	0.15
1009	0.12
1010	0.12
1011	0.13
1012	0.13
1013	0.15
1014	0.16
1015	0.15
1016	0.16
1017	0.22
1018	0.28
1019	0.27
1020	0.27
1021	0.29
1022	0.34
1023	0.4
1024	0.45
1025	0.48
1026	0.52
1027	0.59
1028	0.66
1029	0.7
1030	0.72
1031	0.72
1032	0.73
1033	0.65
1034	0.61
1035	0.56
1036	0.48
1037	0.49
1038	0.44
1039	0.38
1040	0.35
1041	0.34
1042	0.28
1043	0.29
1044	0.3
1045	0.25
1046	0.29
1047	0.35
1048	0.42
1049	0.45
1050	0.45
1051	0.45
1052	0.46
1053	0.47
1054	0.43
1055	0.45
1056	0.38
1057	0.41
1058	0.45
1059	0.44
1060	0.44
1061	0.42
1062	0.39
1063	0.31
1064	0.31
1065	0.25
1066	0.22
1067	0.18
1068	0.14
1069	0.14
1070	0.12
1071	0.12
1072	0.1
1073	0.08
1074	0.06
1075	0.05
1076	0.05
1077	0.05
1078	0.05
1079	0.04
1080	0.05
1081	0.04
1082	0.04
1083	0.04
1084	0.05
1085	0.09
1086	0.08
1087	0.09
1088	0.11
1089	0.11
1090	0.13
1091	0.17
1092	0.18
1093	0.15
1094	0.16
1095	0.16
1096	0.16
1097	0.17
1098	0.16
1099	0.15
1100	0.14
1101	0.15
1102	0.16
1103	0.17
1104	0.16
1105	0.15
1106	0.13
1107	0.11
1108	0.15
1109	0.17
1110	0.24
1111	0.25
1112	0.29
1113	0.33
1114	0.38
1115	0.38
1116	0.37
1117	0.34
1118	0.27
1119	0.29
1120	0.27
1121	0.25
1122	0.2
1123	0.21
1124	0.23
1125	0.24
1126	0.26
1127	0.23
1128	0.21
1129	0.21
1130	0.21
1131	0.23
1132	0.24
1133	0.24
1134	0.23
1135	0.23
1136	0.23
1137	0.21
1138	0.19
1139	0.17
1140	0.12
1141	0.1
1142	0.09
1143	0.08
1144	0.08
1145	0.07
1146	0.07
1147	0.07
1148	0.06
1149	0.06
1150	0.06
1151	0.07
1152	0.07
1153	0.07
1154	0.08
1155	0.09
1156	0.13
1157	0.21
1158	0.23
1159	0.28
1160	0.33
1161	0.39
1162	0.47
1163	0.54
1164	0.57
1165	0.53
1166	0.54
1167	0.52
1168	0.52
1169	0.48
1170	0.39
1171	0.32
1172	0.25
1173	0.23
1174	0.2
1175	0.15
1176	0.12
1177	0.1
1178	0.1
1179	0.09
1180	0.1
1181	0.09
1182	0.1
1183	0.11
1184	0.09
1185	0.1
1186	0.1
1187	0.13
1188	0.14
1189	0.14
1190	0.17
1191	0.21
1192	0.24
1193	0.26
1194	0.3
1195	0.35
1196	0.42
1197	0.5
1198	0.53
1199	0.56
1200	0.6
1201	0.63
1202	0.62
1203	0.56
1204	0.48
1205	0.41
1206	0.36
1207	0.3
1208	0.25
1209	0.22
1210	0.19
1211	0.17
1212	0.16
1213	0.15
1214	0.13
1215	0.1
1216	0.1
1217	0.07
1218	0.06
1219	0.05
1220	0.05
1221	0.05
1222	0.05
1223	0.06
1224	0.05
1225	0.05
1226	0.04
1227	0.06
1228	0.06
1229	0.06
1230	0.06
1231	0.06
1232	0.06
1233	0.08
1234	0.11
1235	0.18
1236	0.25
1237	0.34
1238	0.43
1239	0.5
1240	0.59
1241	0.67
1242	0.75
1243	0.78
1244	0.82
1245	0.84
1246	0.86
1247	0.88
1248	0.87
1249	0.86
1250	0.84
1251	0.81
1252	0.78
1253	0.72
1254	0.68
1255	0.64
1256	0.59
1257	0.53
1258	0.45
1259	0.39
1260	0.36
1261	0.34
1262	0.3
1263	0.26
1264	0.3
1265	0.32
1266	0.36
1267	0.35
1268	0.31
1269	0.36
1270	0.34
1271	0.33
1272	0.27
1273	0.22
1274	0.19

A0A1Y2GSK3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer