Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y2GFY4

Protein Details
Accession A0A1Y2GFY4    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-118DKLDERRKARREAREKEMEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-122RRKARREAREKEMEEKLNK
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 12.333, cyto 9, cyto_nucl 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MFGATKDFMGKPAPPGYIAGLGRGATGFTTRSDIGPAREGPTEADILKLQEQAKRKGADTGDDDDDRYQDPDNETGLFDTAPYEADDEEADLIYKAIDDKLDERRKARREAREKEMEEKLNKERPKITAQFAELKRGLNAVTEEEWENLPEGGNISGRNRKKAQLREKFAPAPDSLLPRAQEEMATTLDARTNGLTTPVPGTMTNFREIGEANKQVLGMRLDRMADSASGKTTIDPKGYLTGLNSVVIRSEAEIGDLKKARDLLKSVITTNPKHAPGWIAAARLEEHAGKLVDARQIIDKGCAECPKSEDIWLEAARLNNTDNAKKILANAVKQIPHSVKIWLHAAQLETTVKAKKTVIRRALDFVPNSVRLWKTAVELEDDPNNARILLARAVELVPLSVELWIALARLETYENAQKVLNQARAKIPTSHEIWITAFCLQEANNKDVEKLVANAIKKLSVMESALSREQWLEEAEKCEKNGFINTCQAIVRATVGMGIEEADLKSTWMEDAQNAIERQSYGTARAIYAHALRTFPSKKSIWRRAAMLEKAHGTRESLEELLVRAVKFCPQAEFLWLMGAKEKWIGGDVQAARAILDAAFEANPNSEQIWLAAVKLEAENGEHGRAELLLSKAREKADTQKVWMKSAVLKRQLGKIDEALELLDVGLTKYPNADKLWMIRGQILVDRGDIQKARENYLKALKSCPKSIPLWILASRLEEKAGMLTKARSLLDKARLLNPKTPELWLESVRIELRGNNANFGRAQMAKALQECPTSGLLWSESVWLETRAQRKGKIVDALKKSENSAHVLITAARLFWSDRQVEKARSWFLRAEKADSDLGDAWAWHYKFEVEYGDEARKAELVMRCKAAEPRHGEYWQAVAKDLKNAGKPLEEILVLVAASLPPNMVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.29
4 0.32
5 0.3
6 0.26
7 0.23
8 0.21
9 0.21
10 0.19
11 0.16
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.1
16 0.15
17 0.15
18 0.16
19 0.2
20 0.23
21 0.25
22 0.29
23 0.3
24 0.29
25 0.3
26 0.3
27 0.27
28 0.27
29 0.26
30 0.2
31 0.2
32 0.18
33 0.2
34 0.21
35 0.24
36 0.24
37 0.27
38 0.34
39 0.39
40 0.45
41 0.45
42 0.44
43 0.46
44 0.45
45 0.47
46 0.45
47 0.43
48 0.41
49 0.39
50 0.39
51 0.33
52 0.33
53 0.27
54 0.24
55 0.2
56 0.18
57 0.21
58 0.22
59 0.22
60 0.22
61 0.21
62 0.21
63 0.19
64 0.15
65 0.12
66 0.11
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.1
86 0.14
87 0.25
88 0.34
89 0.38
90 0.42
91 0.51
92 0.56
93 0.65
94 0.7
95 0.7
96 0.72
97 0.75
98 0.8
99 0.81
100 0.78
101 0.74
102 0.73
103 0.7
104 0.63
105 0.61
106 0.6
107 0.58
108 0.57
109 0.56
110 0.52
111 0.49
112 0.55
113 0.54
114 0.52
115 0.5
116 0.51
117 0.56
118 0.52
119 0.56
120 0.48
121 0.44
122 0.38
123 0.33
124 0.29
125 0.22
126 0.22
127 0.16
128 0.16
129 0.17
130 0.18
131 0.18
132 0.18
133 0.16
134 0.16
135 0.13
136 0.12
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.11
141 0.12
142 0.15
143 0.24
144 0.27
145 0.34
146 0.36
147 0.42
148 0.5
149 0.58
150 0.65
151 0.67
152 0.72
153 0.72
154 0.76
155 0.75
156 0.68
157 0.61
158 0.5
159 0.44
160 0.39
161 0.36
162 0.3
163 0.29
164 0.27
165 0.25
166 0.26
167 0.22
168 0.19
169 0.16
170 0.16
171 0.14
172 0.14
173 0.13
174 0.11
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.13
185 0.12
186 0.13
187 0.13
188 0.16
189 0.2
190 0.23
191 0.24
192 0.22
193 0.21
194 0.21
195 0.21
196 0.22
197 0.22
198 0.22
199 0.21
200 0.22
201 0.21
202 0.21
203 0.24
204 0.22
205 0.17
206 0.16
207 0.16
208 0.16
209 0.16
210 0.16
211 0.14
212 0.12
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.12
218 0.13
219 0.16
220 0.18
221 0.18
222 0.17
223 0.18
224 0.2
225 0.21
226 0.2
227 0.16
228 0.17
229 0.16
230 0.17
231 0.16
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.11
236 0.08
237 0.09
238 0.07
239 0.09
240 0.12
241 0.12
242 0.18
243 0.2
244 0.2
245 0.19
246 0.23
247 0.23
248 0.23
249 0.26
250 0.23
251 0.28
252 0.29
253 0.29
254 0.32
255 0.35
256 0.33
257 0.36
258 0.38
259 0.33
260 0.31
261 0.3
262 0.27
263 0.23
264 0.28
265 0.24
266 0.2
267 0.19
268 0.19
269 0.19
270 0.17
271 0.17
272 0.11
273 0.1
274 0.11
275 0.11
276 0.1
277 0.1
278 0.12
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.16
284 0.17
285 0.18
286 0.17
287 0.16
288 0.19
289 0.21
290 0.2
291 0.2
292 0.22
293 0.22
294 0.22
295 0.22
296 0.19
297 0.18
298 0.21
299 0.2
300 0.19
301 0.17
302 0.18
303 0.16
304 0.16
305 0.15
306 0.15
307 0.18
308 0.18
309 0.18
310 0.2
311 0.2
312 0.19
313 0.2
314 0.23
315 0.24
316 0.23
317 0.26
318 0.27
319 0.28
320 0.28
321 0.31
322 0.25
323 0.24
324 0.23
325 0.23
326 0.19
327 0.2
328 0.22
329 0.2
330 0.19
331 0.18
332 0.18
333 0.14
334 0.16
335 0.14
336 0.12
337 0.12
338 0.14
339 0.13
340 0.14
341 0.16
342 0.19
343 0.27
344 0.35
345 0.41
346 0.42
347 0.44
348 0.46
349 0.49
350 0.48
351 0.4
352 0.33
353 0.29
354 0.27
355 0.25
356 0.24
357 0.2
358 0.16
359 0.18
360 0.16
361 0.14
362 0.15
363 0.16
364 0.16
365 0.17
366 0.17
367 0.17
368 0.17
369 0.16
370 0.15
371 0.14
372 0.1
373 0.09
374 0.09
375 0.08
376 0.1
377 0.1
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.09
383 0.07
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.04
392 0.04
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.07
400 0.11
401 0.11
402 0.12
403 0.12
404 0.12
405 0.16
406 0.2
407 0.25
408 0.21
409 0.23
410 0.26
411 0.29
412 0.3
413 0.29
414 0.26
415 0.24
416 0.26
417 0.25
418 0.22
419 0.2
420 0.19
421 0.16
422 0.15
423 0.12
424 0.09
425 0.08
426 0.08
427 0.07
428 0.12
429 0.14
430 0.15
431 0.16
432 0.17
433 0.17
434 0.17
435 0.17
436 0.12
437 0.11
438 0.11
439 0.12
440 0.12
441 0.14
442 0.13
443 0.13
444 0.12
445 0.12
446 0.1
447 0.07
448 0.08
449 0.07
450 0.08
451 0.09
452 0.1
453 0.1
454 0.09
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.09
461 0.12
462 0.16
463 0.17
464 0.17
465 0.17
466 0.16
467 0.15
468 0.19
469 0.17
470 0.16
471 0.2
472 0.2
473 0.2
474 0.2
475 0.19
476 0.15
477 0.13
478 0.11
479 0.06
480 0.06
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.05
492 0.05
493 0.04
494 0.04
495 0.05
496 0.06
497 0.05
498 0.07
499 0.08
500 0.11
501 0.11
502 0.11
503 0.11
504 0.11
505 0.11
506 0.12
507 0.12
508 0.1
509 0.12
510 0.13
511 0.12
512 0.13
513 0.13
514 0.12
515 0.13
516 0.14
517 0.12
518 0.12
519 0.13
520 0.18
521 0.2
522 0.2
523 0.24
524 0.23
525 0.31
526 0.41
527 0.5
528 0.5
529 0.5
530 0.51
531 0.52
532 0.57
533 0.53
534 0.44
535 0.36
536 0.33
537 0.31
538 0.3
539 0.25
540 0.18
541 0.16
542 0.15
543 0.15
544 0.12
545 0.12
546 0.11
547 0.11
548 0.12
549 0.12
550 0.1
551 0.09
552 0.09
553 0.12
554 0.14
555 0.14
556 0.15
557 0.16
558 0.16
559 0.18
560 0.19
561 0.16
562 0.17
563 0.16
564 0.14
565 0.14
566 0.13
567 0.11
568 0.11
569 0.1
570 0.07
571 0.08
572 0.08
573 0.07
574 0.14
575 0.14
576 0.14
577 0.15
578 0.15
579 0.14
580 0.14
581 0.13
582 0.06
583 0.06
584 0.05
585 0.05
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.06
590 0.06
591 0.07
592 0.07
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.08
597 0.08
598 0.07
599 0.08
600 0.07
601 0.08
602 0.08
603 0.08
604 0.06
605 0.07
606 0.09
607 0.09
608 0.1
609 0.09
610 0.09
611 0.09
612 0.09
613 0.08
614 0.09
615 0.1
616 0.13
617 0.14
618 0.16
619 0.19
620 0.2
621 0.21
622 0.21
623 0.28
624 0.35
625 0.36
626 0.39
627 0.43
628 0.44
629 0.44
630 0.43
631 0.35
632 0.32
633 0.38
634 0.42
635 0.41
636 0.44
637 0.44
638 0.49
639 0.51
640 0.46
641 0.4
642 0.34
643 0.3
644 0.27
645 0.25
646 0.19
647 0.14
648 0.12
649 0.09
650 0.07
651 0.04
652 0.04
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.08
657 0.1
658 0.13
659 0.14
660 0.16
661 0.16
662 0.2
663 0.25
664 0.25
665 0.25
666 0.24
667 0.23
668 0.22
669 0.23
670 0.21
671 0.16
672 0.15
673 0.16
674 0.15
675 0.18
676 0.18
677 0.18
678 0.23
679 0.24
680 0.28
681 0.3
682 0.31
683 0.33
684 0.4
685 0.43
686 0.38
687 0.45
688 0.48
689 0.47
690 0.5
691 0.48
692 0.44
693 0.41
694 0.44
695 0.41
696 0.37
697 0.37
698 0.34
699 0.33
700 0.29
701 0.3
702 0.28
703 0.23
704 0.2
705 0.15
706 0.14
707 0.16
708 0.18
709 0.15
710 0.15
711 0.16
712 0.17
713 0.21
714 0.21
715 0.19
716 0.2
717 0.26
718 0.32
719 0.37
720 0.37
721 0.42
722 0.49
723 0.51
724 0.53
725 0.5
726 0.47
727 0.44
728 0.42
729 0.36
730 0.33
731 0.34
732 0.3
733 0.28
734 0.23
735 0.25
736 0.24
737 0.24
738 0.19
739 0.17
740 0.19
741 0.25
742 0.25
743 0.28
744 0.28
745 0.28
746 0.28
747 0.27
748 0.27
749 0.19
750 0.2
751 0.18
752 0.2
753 0.21
754 0.23
755 0.23
756 0.22
757 0.22
758 0.22
759 0.21
760 0.2
761 0.17
762 0.16
763 0.15
764 0.14
765 0.13
766 0.13
767 0.13
768 0.11
769 0.12
770 0.13
771 0.13
772 0.16
773 0.21
774 0.27
775 0.32
776 0.36
777 0.39
778 0.44
779 0.47
780 0.49
781 0.52
782 0.54
783 0.55
784 0.58
785 0.61
786 0.58
787 0.55
788 0.51
789 0.48
790 0.42
791 0.39
792 0.33
793 0.28
794 0.24
795 0.24
796 0.22
797 0.2
798 0.17
799 0.12
800 0.11
801 0.11
802 0.13
803 0.15
804 0.21
805 0.22
806 0.24
807 0.32
808 0.38
809 0.41
810 0.44
811 0.48
812 0.49
813 0.47
814 0.49
815 0.47
816 0.45
817 0.51
818 0.48
819 0.47
820 0.41
821 0.42
822 0.41
823 0.35
824 0.34
825 0.26
826 0.25
827 0.2
828 0.18
829 0.16
830 0.22
831 0.21
832 0.17
833 0.17
834 0.17
835 0.17
836 0.19
837 0.21
838 0.16
839 0.19
840 0.23
841 0.26
842 0.26
843 0.26
844 0.25
845 0.22
846 0.19
847 0.22
848 0.24
849 0.26
850 0.3
851 0.33
852 0.33
853 0.36
854 0.42
855 0.42
856 0.44
857 0.46
858 0.48
859 0.51
860 0.51
861 0.49
862 0.44
863 0.45
864 0.41
865 0.35
866 0.31
867 0.28
868 0.29
869 0.34
870 0.38
871 0.37
872 0.37
873 0.39
874 0.39
875 0.38
876 0.37
877 0.33
878 0.31
879 0.25
880 0.2
881 0.18
882 0.17
883 0.13
884 0.12
885 0.1
886 0.07
887 0.07
888 0.07