Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2H3R5

Protein Details
Accession A0A1Y2H3R5    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
278-303IGTRAESRSMRRKKKKRVVQGMAVMFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
285-294RSMRRKKKKR
478-491EKVAKERAHKKKKL
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
Amino Acid Sequences MTCLSRKDNNLLRKQEWQLLLGANNDIVNAATATIPPVVPAIFKQDTFLVKTLFSEAEKYYLILITNLKQCWFEKMQIEDIRRRSMKIKSFAYEEDTQLEALLLSLSAIFNKVEQQQQQNNQQQVPELEQQRRIEKHCEKLSLFVGFNFGLASVQWEFKLTPLLMEATPASFSPAIGTNDDNNNNNNNNLDDDEELLSIFPKSTSRTGAGTVTSSKQLEKRTKRFLEDSDLEDATNNDMMDDEDEGEEEDDEEEGDEDDAEGDYDYLDRYDREGRDSIGTRAESRSMRRKKKKRVVQGMAVMFDQLVLPLVSVSNAYRRQIKALEMVIKSKENEVVEALEMLEQNGINYHNRRKATERYDKQKTETKLKEDLEKLIRPDLFTPRELFSGKNIPELCSIVSVNAGKRDSHPSSLDSRVTLLSQDPTLLTQAIRGAQKNSGTTGRARVGAAATSGTDEKALKEAQELERRRALQEQLDKEKVAKERAHKKKKLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.67
3 0.6
4 0.52
5 0.46
6 0.41
7 0.39
8 0.32
9 0.28
10 0.21
11 0.19
12 0.17
13 0.14
14 0.11
15 0.09
16 0.07
17 0.07
18 0.06
19 0.07
20 0.08
21 0.09
22 0.09
23 0.08
24 0.09
25 0.09
26 0.1
27 0.11
28 0.17
29 0.18
30 0.19
31 0.2
32 0.24
33 0.26
34 0.3
35 0.32
36 0.25
37 0.23
38 0.24
39 0.25
40 0.22
41 0.2
42 0.19
43 0.17
44 0.19
45 0.19
46 0.18
47 0.16
48 0.16
49 0.16
50 0.14
51 0.16
52 0.19
53 0.24
54 0.25
55 0.25
56 0.26
57 0.27
58 0.32
59 0.33
60 0.32
61 0.32
62 0.35
63 0.43
64 0.47
65 0.51
66 0.52
67 0.52
68 0.56
69 0.52
70 0.5
71 0.47
72 0.49
73 0.53
74 0.54
75 0.55
76 0.49
77 0.52
78 0.51
79 0.52
80 0.47
81 0.39
82 0.33
83 0.28
84 0.25
85 0.2
86 0.19
87 0.12
88 0.09
89 0.07
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.06
96 0.05
97 0.06
98 0.1
99 0.13
100 0.18
101 0.22
102 0.3
103 0.37
104 0.45
105 0.54
106 0.58
107 0.59
108 0.55
109 0.51
110 0.45
111 0.39
112 0.37
113 0.34
114 0.33
115 0.33
116 0.37
117 0.4
118 0.45
119 0.47
120 0.45
121 0.48
122 0.49
123 0.54
124 0.54
125 0.57
126 0.5
127 0.5
128 0.49
129 0.43
130 0.37
131 0.28
132 0.25
133 0.19
134 0.18
135 0.14
136 0.11
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.14
147 0.11
148 0.1
149 0.11
150 0.13
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.12
162 0.13
163 0.14
164 0.15
165 0.16
166 0.21
167 0.24
168 0.24
169 0.21
170 0.24
171 0.23
172 0.23
173 0.21
174 0.16
175 0.15
176 0.14
177 0.14
178 0.1
179 0.11
180 0.11
181 0.1
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.05
188 0.06
189 0.08
190 0.1
191 0.13
192 0.14
193 0.15
194 0.16
195 0.17
196 0.17
197 0.15
198 0.15
199 0.14
200 0.15
201 0.14
202 0.14
203 0.17
204 0.24
205 0.32
206 0.4
207 0.46
208 0.54
209 0.56
210 0.59
211 0.58
212 0.53
213 0.51
214 0.45
215 0.4
216 0.33
217 0.3
218 0.26
219 0.23
220 0.21
221 0.14
222 0.12
223 0.09
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.04
242 0.04
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.04
256 0.07
257 0.12
258 0.13
259 0.16
260 0.17
261 0.18
262 0.21
263 0.23
264 0.22
265 0.2
266 0.2
267 0.19
268 0.19
269 0.21
270 0.2
271 0.23
272 0.33
273 0.39
274 0.49
275 0.59
276 0.68
277 0.76
278 0.84
279 0.88
280 0.89
281 0.9
282 0.86
283 0.83
284 0.8
285 0.71
286 0.62
287 0.52
288 0.41
289 0.29
290 0.22
291 0.14
292 0.07
293 0.05
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.11
302 0.13
303 0.15
304 0.21
305 0.21
306 0.24
307 0.26
308 0.27
309 0.25
310 0.27
311 0.32
312 0.28
313 0.3
314 0.29
315 0.29
316 0.28
317 0.25
318 0.24
319 0.18
320 0.18
321 0.16
322 0.15
323 0.13
324 0.12
325 0.11
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.08
334 0.11
335 0.16
336 0.23
337 0.29
338 0.31
339 0.34
340 0.39
341 0.47
342 0.53
343 0.59
344 0.61
345 0.64
346 0.73
347 0.72
348 0.71
349 0.7
350 0.65
351 0.65
352 0.62
353 0.58
354 0.57
355 0.56
356 0.59
357 0.53
358 0.55
359 0.51
360 0.48
361 0.44
362 0.42
363 0.41
364 0.34
365 0.36
366 0.37
367 0.33
368 0.32
369 0.33
370 0.29
371 0.31
372 0.3
373 0.27
374 0.24
375 0.3
376 0.28
377 0.32
378 0.31
379 0.3
380 0.31
381 0.32
382 0.27
383 0.21
384 0.2
385 0.14
386 0.17
387 0.17
388 0.17
389 0.21
390 0.22
391 0.21
392 0.24
393 0.32
394 0.32
395 0.34
396 0.34
397 0.32
398 0.36
399 0.41
400 0.39
401 0.31
402 0.29
403 0.26
404 0.24
405 0.22
406 0.19
407 0.16
408 0.14
409 0.15
410 0.13
411 0.13
412 0.14
413 0.14
414 0.12
415 0.11
416 0.13
417 0.17
418 0.21
419 0.22
420 0.23
421 0.26
422 0.3
423 0.3
424 0.31
425 0.3
426 0.29
427 0.3
428 0.34
429 0.32
430 0.31
431 0.3
432 0.28
433 0.25
434 0.24
435 0.22
436 0.16
437 0.13
438 0.13
439 0.14
440 0.12
441 0.13
442 0.12
443 0.13
444 0.16
445 0.17
446 0.14
447 0.17
448 0.24
449 0.3
450 0.4
451 0.42
452 0.45
453 0.51
454 0.52
455 0.51
456 0.5
457 0.47
458 0.46
459 0.52
460 0.55
461 0.57
462 0.59
463 0.57
464 0.54
465 0.55
466 0.52
467 0.5
468 0.47
469 0.49
470 0.56
471 0.66
472 0.76