Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2GDC0

Protein Details
Accession A0A1Y2GDC0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-120AQGISRQARRLLKKQNKKVAKKSQGNNGRPCFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-110RRLLKKQNKKVAKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002562  3'-5'_exonuclease_dom  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR034922  REX1-like_exo  
IPR047021  REXO1/3/4-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0008408  F:3'-5' exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006139  P:nucleobase-containing compound metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01612  DNA_pol_A_exo1  
CDD cd06145  REX1_like  
Amino Acid Sequences MTEDNGEQLYSPDNTQENEANSSVALKQVDSVCEETTCILSNQANVTENTKVVITTNETVELCNVSKKRKVDDDKSVNKAHADSDDEAAQGISRQARRLLKKQNKKVAKKSQGNNGRPCFMLSRDYNKLSIKDLRDLVIYLLTETKTLPWIMVKNKFNIDKVLLLYVPGLDPQFFNIDLQDPESSKPIIWTQKAKTGAVTEFSHLPKFFDTMNVMKAGGDRYRVHPPVDTLLSVPLSNSEKTKREQELKSKKDLARMLKPENYMMTLQQLREHEFPLPSYLGDKKAVQDGWIETEQRIAESTPKKMIAMDCEMCRTTTGSELTRISLIDEEGTTIYDQLVLPDNPIVDYLTQYSGMTAERLKGITTRLVDVQKKLKEMITYNTILVGHSLENDMRALKFAHPFIIDTTVVYHHTRGPPFRASLKWLAQKWLSRRIQQGGDHGHDSVEDAKACMDLVKLKIKEGPGFGEYNRDEESIFSRMSRHTTSRTSAIIDCEHVSGQGSATAVIKASSDAEVVKAIPKAINEHNFVWARLRVLEINHGVTSASLAQDGENERQDQIDDIKPCDKPASSIDVEVTDEELRKAAKNIDQSIAEIVESLPDNTAVIMTSGQGDLREVRRLQALQSRFRRLYNTHSLSMIPKEDQFSDEDQKALEAAVNRAKNGVCFFMVK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.23
3 0.27
4 0.26
5 0.28
6 0.28
7 0.24
8 0.22
9 0.23
10 0.19
11 0.19
12 0.16
13 0.12
14 0.17
15 0.19
16 0.21
17 0.22
18 0.24
19 0.21
20 0.21
21 0.22
22 0.18
23 0.17
24 0.17
25 0.14
26 0.15
27 0.15
28 0.18
29 0.2
30 0.22
31 0.23
32 0.22
33 0.25
34 0.24
35 0.23
36 0.21
37 0.18
38 0.15
39 0.14
40 0.16
41 0.18
42 0.18
43 0.19
44 0.22
45 0.22
46 0.22
47 0.23
48 0.23
49 0.18
50 0.24
51 0.26
52 0.28
53 0.35
54 0.38
55 0.44
56 0.52
57 0.6
58 0.61
59 0.69
60 0.73
61 0.76
62 0.79
63 0.75
64 0.66
65 0.58
66 0.5
67 0.41
68 0.34
69 0.3
70 0.25
71 0.24
72 0.24
73 0.22
74 0.21
75 0.19
76 0.15
77 0.11
78 0.12
79 0.16
80 0.17
81 0.19
82 0.26
83 0.35
84 0.42
85 0.5
86 0.59
87 0.64
88 0.73
89 0.81
90 0.85
91 0.87
92 0.89
93 0.91
94 0.91
95 0.91
96 0.9
97 0.86
98 0.86
99 0.86
100 0.84
101 0.83
102 0.77
103 0.68
104 0.59
105 0.55
106 0.47
107 0.38
108 0.37
109 0.32
110 0.35
111 0.39
112 0.41
113 0.43
114 0.43
115 0.42
116 0.4
117 0.43
118 0.38
119 0.38
120 0.37
121 0.34
122 0.32
123 0.31
124 0.26
125 0.21
126 0.18
127 0.13
128 0.14
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.18
138 0.25
139 0.33
140 0.36
141 0.38
142 0.44
143 0.47
144 0.45
145 0.43
146 0.38
147 0.32
148 0.3
149 0.28
150 0.21
151 0.18
152 0.17
153 0.14
154 0.12
155 0.1
156 0.09
157 0.07
158 0.07
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.12
165 0.12
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.14
170 0.16
171 0.16
172 0.13
173 0.15
174 0.19
175 0.24
176 0.27
177 0.33
178 0.33
179 0.4
180 0.43
181 0.41
182 0.37
183 0.33
184 0.31
185 0.28
186 0.27
187 0.21
188 0.23
189 0.24
190 0.26
191 0.23
192 0.22
193 0.19
194 0.19
195 0.17
196 0.15
197 0.17
198 0.16
199 0.18
200 0.17
201 0.17
202 0.15
203 0.16
204 0.16
205 0.14
206 0.17
207 0.17
208 0.2
209 0.28
210 0.3
211 0.3
212 0.28
213 0.28
214 0.28
215 0.28
216 0.25
217 0.17
218 0.17
219 0.16
220 0.15
221 0.13
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.16
226 0.19
227 0.21
228 0.24
229 0.32
230 0.34
231 0.4
232 0.46
233 0.54
234 0.6
235 0.61
236 0.66
237 0.67
238 0.63
239 0.62
240 0.61
241 0.57
242 0.55
243 0.57
244 0.55
245 0.51
246 0.5
247 0.44
248 0.39
249 0.34
250 0.25
251 0.2
252 0.2
253 0.17
254 0.17
255 0.19
256 0.19
257 0.21
258 0.22
259 0.23
260 0.2
261 0.18
262 0.18
263 0.17
264 0.16
265 0.12
266 0.13
267 0.14
268 0.14
269 0.16
270 0.16
271 0.14
272 0.18
273 0.18
274 0.16
275 0.16
276 0.14
277 0.17
278 0.18
279 0.17
280 0.13
281 0.16
282 0.15
283 0.13
284 0.13
285 0.09
286 0.14
287 0.16
288 0.19
289 0.19
290 0.19
291 0.19
292 0.2
293 0.21
294 0.18
295 0.21
296 0.21
297 0.19
298 0.21
299 0.21
300 0.19
301 0.19
302 0.16
303 0.11
304 0.11
305 0.13
306 0.12
307 0.14
308 0.14
309 0.15
310 0.14
311 0.14
312 0.11
313 0.09
314 0.09
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.08
349 0.08
350 0.09
351 0.12
352 0.12
353 0.13
354 0.16
355 0.21
356 0.22
357 0.25
358 0.31
359 0.3
360 0.3
361 0.3
362 0.28
363 0.25
364 0.25
365 0.26
366 0.23
367 0.22
368 0.21
369 0.21
370 0.19
371 0.16
372 0.14
373 0.12
374 0.07
375 0.06
376 0.07
377 0.06
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.06
382 0.08
383 0.08
384 0.1
385 0.13
386 0.13
387 0.14
388 0.14
389 0.15
390 0.15
391 0.17
392 0.15
393 0.12
394 0.13
395 0.12
396 0.14
397 0.14
398 0.14
399 0.14
400 0.19
401 0.22
402 0.23
403 0.26
404 0.27
405 0.29
406 0.31
407 0.29
408 0.29
409 0.33
410 0.37
411 0.39
412 0.37
413 0.39
414 0.39
415 0.43
416 0.42
417 0.46
418 0.44
419 0.42
420 0.46
421 0.47
422 0.48
423 0.45
424 0.47
425 0.43
426 0.41
427 0.38
428 0.33
429 0.28
430 0.22
431 0.21
432 0.16
433 0.12
434 0.09
435 0.08
436 0.08
437 0.09
438 0.09
439 0.08
440 0.07
441 0.09
442 0.12
443 0.2
444 0.2
445 0.21
446 0.24
447 0.26
448 0.28
449 0.26
450 0.26
451 0.2
452 0.22
453 0.21
454 0.26
455 0.24
456 0.24
457 0.24
458 0.21
459 0.19
460 0.18
461 0.21
462 0.16
463 0.16
464 0.13
465 0.14
466 0.15
467 0.2
468 0.23
469 0.23
470 0.26
471 0.3
472 0.33
473 0.34
474 0.34
475 0.33
476 0.3
477 0.3
478 0.26
479 0.24
480 0.21
481 0.19
482 0.17
483 0.14
484 0.14
485 0.11
486 0.1
487 0.09
488 0.08
489 0.08
490 0.09
491 0.09
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.07
496 0.08
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.09
502 0.09
503 0.11
504 0.11
505 0.11
506 0.12
507 0.13
508 0.17
509 0.23
510 0.28
511 0.3
512 0.3
513 0.37
514 0.36
515 0.36
516 0.35
517 0.3
518 0.26
519 0.22
520 0.24
521 0.18
522 0.18
523 0.24
524 0.22
525 0.24
526 0.22
527 0.21
528 0.19
529 0.17
530 0.17
531 0.12
532 0.1
533 0.07
534 0.08
535 0.07
536 0.11
537 0.15
538 0.17
539 0.18
540 0.19
541 0.19
542 0.19
543 0.2
544 0.18
545 0.19
546 0.22
547 0.22
548 0.24
549 0.29
550 0.29
551 0.31
552 0.32
553 0.28
554 0.25
555 0.26
556 0.3
557 0.26
558 0.27
559 0.27
560 0.24
561 0.25
562 0.22
563 0.21
564 0.15
565 0.14
566 0.13
567 0.14
568 0.14
569 0.14
570 0.16
571 0.19
572 0.22
573 0.28
574 0.32
575 0.35
576 0.34
577 0.34
578 0.34
579 0.29
580 0.24
581 0.17
582 0.13
583 0.12
584 0.12
585 0.11
586 0.1
587 0.09
588 0.09
589 0.09
590 0.09
591 0.07
592 0.07
593 0.06
594 0.06
595 0.07
596 0.08
597 0.08
598 0.08
599 0.1
600 0.14
601 0.17
602 0.24
603 0.23
604 0.24
605 0.3
606 0.31
607 0.34
608 0.38
609 0.42
610 0.45
611 0.53
612 0.6
613 0.56
614 0.58
615 0.59
616 0.54
617 0.56
618 0.57
619 0.55
620 0.48
621 0.47
622 0.47
623 0.44
624 0.45
625 0.4
626 0.31
627 0.28
628 0.29
629 0.29
630 0.28
631 0.28
632 0.29
633 0.33
634 0.32
635 0.3
636 0.26
637 0.26
638 0.24
639 0.21
640 0.18
641 0.13
642 0.18
643 0.25
644 0.27
645 0.27
646 0.3
647 0.3
648 0.3
649 0.31
650 0.28