Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2GXT4

Protein Details
Accession A0A1Y2GXT4    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-108HNDLERKIRRGKERKDKEVDEBasic
271-323YRDSRSYRDQPYRREDRRDRDRDGRDGRDRRDRSRDRGSRRDYDRDRDYRRRYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-102KIRRGKERK
285-311EDRRDRDRDGRDGRDRRDRSRDRGSRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MTHNYARSLVSELFAPFEPSKHKFWDKEVCKHFLVKFCPNSLFTNTKSDLGNCDLIHDEKLREEYQNAPDKDSYRYEDDFFEYLTYLHNDLERKIRRGKERKDKEVDENLLNPRKDEKEERIVMLEQKIKDTLAKVEEAGEEGHVDEAQALSEQVEKMQADLEHLKSNDDVNPIFRQENKMEVCHVCGAFLVMNDTSNRLDAHLQGKQHTGYQKIHETYEEMKKQRGDRYHHSSSSSSSSRGRHRDNDYGGPGPHRDHPYNDSRDRDRGGYRDSRSYRDQPYRREDRRDRDRDGRDGRDRRDRSRDRGSRRDYDRDRDYRRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.23
3 0.18
4 0.2
5 0.27
6 0.28
7 0.32
8 0.37
9 0.45
10 0.43
11 0.5
12 0.58
13 0.6
14 0.66
15 0.68
16 0.66
17 0.6
18 0.63
19 0.59
20 0.56
21 0.55
22 0.54
23 0.52
24 0.51
25 0.53
26 0.49
27 0.49
28 0.47
29 0.45
30 0.38
31 0.41
32 0.39
33 0.37
34 0.36
35 0.33
36 0.31
37 0.3
38 0.32
39 0.24
40 0.24
41 0.24
42 0.24
43 0.25
44 0.24
45 0.2
46 0.18
47 0.23
48 0.22
49 0.21
50 0.22
51 0.25
52 0.31
53 0.4
54 0.38
55 0.37
56 0.39
57 0.39
58 0.41
59 0.39
60 0.35
61 0.31
62 0.32
63 0.3
64 0.29
65 0.31
66 0.28
67 0.24
68 0.2
69 0.15
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.11
74 0.11
75 0.13
76 0.14
77 0.15
78 0.25
79 0.28
80 0.31
81 0.37
82 0.43
83 0.51
84 0.61
85 0.69
86 0.71
87 0.76
88 0.81
89 0.82
90 0.8
91 0.77
92 0.75
93 0.68
94 0.59
95 0.54
96 0.51
97 0.5
98 0.45
99 0.38
100 0.33
101 0.32
102 0.34
103 0.34
104 0.33
105 0.36
106 0.38
107 0.38
108 0.37
109 0.36
110 0.34
111 0.33
112 0.31
113 0.23
114 0.22
115 0.21
116 0.19
117 0.18
118 0.17
119 0.16
120 0.13
121 0.13
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.08
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.11
149 0.13
150 0.14
151 0.14
152 0.15
153 0.14
154 0.15
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.12
159 0.14
160 0.15
161 0.15
162 0.15
163 0.17
164 0.16
165 0.23
166 0.22
167 0.21
168 0.22
169 0.22
170 0.23
171 0.21
172 0.2
173 0.14
174 0.12
175 0.12
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.12
189 0.16
190 0.17
191 0.18
192 0.19
193 0.21
194 0.2
195 0.23
196 0.23
197 0.24
198 0.24
199 0.27
200 0.33
201 0.32
202 0.32
203 0.29
204 0.29
205 0.3
206 0.36
207 0.38
208 0.33
209 0.35
210 0.39
211 0.43
212 0.47
213 0.49
214 0.48
215 0.5
216 0.57
217 0.61
218 0.58
219 0.57
220 0.51
221 0.46
222 0.46
223 0.39
224 0.33
225 0.31
226 0.34
227 0.39
228 0.46
229 0.49
230 0.5
231 0.55
232 0.6
233 0.6
234 0.61
235 0.57
236 0.53
237 0.48
238 0.43
239 0.38
240 0.32
241 0.34
242 0.34
243 0.32
244 0.33
245 0.38
246 0.44
247 0.51
248 0.55
249 0.55
250 0.53
251 0.56
252 0.55
253 0.53
254 0.48
255 0.44
256 0.45
257 0.47
258 0.46
259 0.51
260 0.51
261 0.52
262 0.55
263 0.58
264 0.6
265 0.63
266 0.66
267 0.64
268 0.71
269 0.77
270 0.77
271 0.8
272 0.8
273 0.8
274 0.84
275 0.84
276 0.82
277 0.81
278 0.8
279 0.8
280 0.79
281 0.77
282 0.77
283 0.77
284 0.77
285 0.78
286 0.77
287 0.75
288 0.78
289 0.77
290 0.75
291 0.77
292 0.79
293 0.78
294 0.83
295 0.83
296 0.81
297 0.81
298 0.83
299 0.79
300 0.79
301 0.79
302 0.79
303 0.81