Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2GBM4

Protein Details
Accession A0A1Y2GBM4    Localization Confidence Low Confidence Score 7.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-80LDSSSFSKWPQQQRKQMQRHIAQYSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 9.833, nucl 8.5, cyto_nucl 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR033443  PPR_long  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
PF13041  PPR_2  
PF13812  PPR_3  
PF17177  PPR_long  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MHNSLQHFGRSSLTLPLTTTATTIRRIPHLGSTCRFLHLENRAPIQSHFKGAEGRLDSSSFSKWPQQQRKQMQRHIAQYSSVSTVIRYPVKTLSLDDLDINTLPPPPSRSDKNKERSCSSTTYDTTESSESAFERKEPALLDPSLTYPQSIVDFRELYKQVHDSNDPADMERVLTAYRKLADDPELLELLQPIDFMVTMNSCRELLHCIPRMNQILYGDISKTKYRHRVEFYNIVLKTFVKLSDFKSASNLVDTMRANKEIEFNNTATYHVLLNMCRHERSLKNARGILGQMRRNKVEMNDWTYLTMLSICSKCKNPRLAQEYFDEMPLVGIQWNINHYNALINAYAQAQDLQGAKRIFSQMEESGIEADHYTFVALITAHKHAGKLAEITEWIKNYGGAGTKPNAKVLLELGHEPFDIVKQCDKNGVELTLKDWNTLIIHSIKSNHFANIGRLLHQMSKRGSRPNVYTFTAMIDANIKMGKYQDAREVFKAMEHANIQPDVIAYSAMISGALTHGTVQESLETLKAMVDDGILPNLHTFNSLLSASVGEIGIEGFKIIRQTMQELKIRPDNRSFNALLSAYALRGDMEEMEQALEDMRKSRVIPDALTYSILISGYLQNGDLRFAMQWYYKMIEGGYRPATFVFNNLMAALHGSGQGEQVMMLWHEMERLRIKKNSQTFEIALEACEKFGMDSERIEEELKTYLATRGQFSINNRRDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.24
4 0.23
5 0.22
6 0.21
7 0.19
8 0.2
9 0.22
10 0.25
11 0.27
12 0.3
13 0.32
14 0.34
15 0.38
16 0.44
17 0.48
18 0.47
19 0.49
20 0.45
21 0.46
22 0.44
23 0.36
24 0.36
25 0.38
26 0.44
27 0.43
28 0.47
29 0.45
30 0.47
31 0.47
32 0.48
33 0.42
34 0.38
35 0.34
36 0.31
37 0.34
38 0.33
39 0.39
40 0.33
41 0.34
42 0.3
43 0.3
44 0.3
45 0.27
46 0.28
47 0.22
48 0.22
49 0.28
50 0.34
51 0.44
52 0.54
53 0.61
54 0.69
55 0.79
56 0.87
57 0.89
58 0.9
59 0.89
60 0.85
61 0.84
62 0.79
63 0.7
64 0.61
65 0.52
66 0.46
67 0.39
68 0.32
69 0.23
70 0.18
71 0.19
72 0.23
73 0.25
74 0.23
75 0.23
76 0.25
77 0.28
78 0.28
79 0.28
80 0.28
81 0.26
82 0.26
83 0.24
84 0.22
85 0.21
86 0.2
87 0.18
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.15
92 0.17
93 0.2
94 0.26
95 0.34
96 0.43
97 0.5
98 0.6
99 0.69
100 0.74
101 0.75
102 0.75
103 0.72
104 0.67
105 0.63
106 0.57
107 0.54
108 0.47
109 0.46
110 0.42
111 0.38
112 0.35
113 0.31
114 0.27
115 0.2
116 0.2
117 0.15
118 0.16
119 0.16
120 0.14
121 0.16
122 0.16
123 0.18
124 0.17
125 0.2
126 0.22
127 0.21
128 0.22
129 0.19
130 0.21
131 0.22
132 0.21
133 0.18
134 0.13
135 0.14
136 0.16
137 0.16
138 0.15
139 0.16
140 0.17
141 0.18
142 0.26
143 0.27
144 0.25
145 0.27
146 0.29
147 0.27
148 0.3
149 0.31
150 0.25
151 0.25
152 0.28
153 0.25
154 0.22
155 0.21
156 0.17
157 0.15
158 0.14
159 0.13
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.12
164 0.13
165 0.14
166 0.15
167 0.16
168 0.19
169 0.19
170 0.19
171 0.19
172 0.17
173 0.16
174 0.16
175 0.14
176 0.11
177 0.09
178 0.08
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.07
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.15
192 0.18
193 0.26
194 0.3
195 0.31
196 0.33
197 0.39
198 0.42
199 0.37
200 0.35
201 0.27
202 0.24
203 0.23
204 0.22
205 0.17
206 0.15
207 0.17
208 0.19
209 0.21
210 0.25
211 0.34
212 0.38
213 0.45
214 0.48
215 0.52
216 0.55
217 0.61
218 0.57
219 0.56
220 0.51
221 0.44
222 0.38
223 0.32
224 0.26
225 0.19
226 0.17
227 0.11
228 0.13
229 0.16
230 0.24
231 0.25
232 0.24
233 0.26
234 0.27
235 0.25
236 0.24
237 0.22
238 0.13
239 0.17
240 0.17
241 0.18
242 0.18
243 0.19
244 0.18
245 0.19
246 0.23
247 0.2
248 0.25
249 0.24
250 0.22
251 0.23
252 0.23
253 0.22
254 0.18
255 0.17
256 0.12
257 0.11
258 0.12
259 0.11
260 0.13
261 0.17
262 0.19
263 0.18
264 0.19
265 0.22
266 0.23
267 0.3
268 0.38
269 0.38
270 0.42
271 0.43
272 0.43
273 0.39
274 0.39
275 0.37
276 0.34
277 0.34
278 0.35
279 0.36
280 0.36
281 0.36
282 0.36
283 0.31
284 0.31
285 0.3
286 0.3
287 0.29
288 0.29
289 0.28
290 0.27
291 0.25
292 0.17
293 0.13
294 0.07
295 0.08
296 0.09
297 0.1
298 0.13
299 0.18
300 0.22
301 0.29
302 0.36
303 0.37
304 0.45
305 0.5
306 0.5
307 0.48
308 0.45
309 0.44
310 0.36
311 0.32
312 0.23
313 0.16
314 0.14
315 0.11
316 0.09
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.08
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.05
337 0.07
338 0.09
339 0.08
340 0.13
341 0.13
342 0.13
343 0.14
344 0.15
345 0.13
346 0.13
347 0.16
348 0.11
349 0.13
350 0.12
351 0.11
352 0.1
353 0.1
354 0.09
355 0.06
356 0.06
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.03
361 0.03
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.06
366 0.07
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.11
378 0.12
379 0.11
380 0.11
381 0.1
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.11
388 0.12
389 0.18
390 0.18
391 0.19
392 0.18
393 0.17
394 0.16
395 0.15
396 0.16
397 0.12
398 0.13
399 0.13
400 0.13
401 0.12
402 0.12
403 0.11
404 0.09
405 0.1
406 0.1
407 0.14
408 0.14
409 0.15
410 0.2
411 0.21
412 0.21
413 0.21
414 0.22
415 0.19
416 0.18
417 0.2
418 0.21
419 0.21
420 0.19
421 0.17
422 0.16
423 0.15
424 0.15
425 0.15
426 0.1
427 0.11
428 0.12
429 0.15
430 0.15
431 0.19
432 0.2
433 0.18
434 0.18
435 0.19
436 0.2
437 0.23
438 0.23
439 0.21
440 0.21
441 0.22
442 0.24
443 0.25
444 0.28
445 0.24
446 0.3
447 0.32
448 0.38
449 0.4
450 0.4
451 0.43
452 0.45
453 0.46
454 0.41
455 0.39
456 0.32
457 0.3
458 0.27
459 0.22
460 0.16
461 0.13
462 0.11
463 0.11
464 0.11
465 0.09
466 0.08
467 0.09
468 0.13
469 0.13
470 0.15
471 0.22
472 0.26
473 0.29
474 0.3
475 0.31
476 0.27
477 0.25
478 0.26
479 0.19
480 0.18
481 0.16
482 0.16
483 0.17
484 0.17
485 0.16
486 0.13
487 0.13
488 0.1
489 0.09
490 0.07
491 0.04
492 0.05
493 0.05
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.05
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.07
508 0.08
509 0.08
510 0.07
511 0.06
512 0.07
513 0.07
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.07
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.09
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.07
528 0.1
529 0.1
530 0.09
531 0.09
532 0.09
533 0.08
534 0.09
535 0.08
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.04
541 0.04
542 0.03
543 0.05
544 0.06
545 0.06
546 0.08
547 0.09
548 0.14
549 0.21
550 0.27
551 0.32
552 0.33
553 0.38
554 0.45
555 0.46
556 0.45
557 0.47
558 0.47
559 0.45
560 0.49
561 0.44
562 0.37
563 0.39
564 0.35
565 0.27
566 0.23
567 0.2
568 0.14
569 0.14
570 0.13
571 0.09
572 0.09
573 0.09
574 0.07
575 0.07
576 0.08
577 0.08
578 0.08
579 0.07
580 0.07
581 0.08
582 0.08
583 0.08
584 0.1
585 0.11
586 0.13
587 0.14
588 0.17
589 0.23
590 0.24
591 0.25
592 0.27
593 0.29
594 0.28
595 0.28
596 0.25
597 0.18
598 0.17
599 0.15
600 0.11
601 0.09
602 0.1
603 0.1
604 0.1
605 0.11
606 0.12
607 0.12
608 0.13
609 0.12
610 0.11
611 0.1
612 0.11
613 0.13
614 0.13
615 0.14
616 0.16
617 0.18
618 0.17
619 0.18
620 0.17
621 0.19
622 0.19
623 0.24
624 0.26
625 0.24
626 0.24
627 0.24
628 0.27
629 0.22
630 0.23
631 0.21
632 0.17
633 0.17
634 0.16
635 0.16
636 0.13
637 0.15
638 0.13
639 0.09
640 0.09
641 0.09
642 0.09
643 0.1
644 0.1
645 0.09
646 0.08
647 0.08
648 0.08
649 0.08
650 0.08
651 0.08
652 0.08
653 0.11
654 0.12
655 0.17
656 0.24
657 0.28
658 0.34
659 0.4
660 0.45
661 0.51
662 0.6
663 0.61
664 0.57
665 0.59
666 0.53
667 0.5
668 0.5
669 0.41
670 0.32
671 0.3
672 0.25
673 0.19
674 0.18
675 0.15
676 0.11
677 0.14
678 0.18
679 0.15
680 0.17
681 0.2
682 0.22
683 0.23
684 0.24
685 0.21
686 0.18
687 0.19
688 0.18
689 0.15
690 0.15
691 0.17
692 0.2
693 0.22
694 0.23
695 0.23
696 0.26
697 0.3
698 0.36
699 0.44