Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2GAT5

Protein Details
Accession A0A1Y2GAT5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
540-559KENEKKEKEKEKEKEKEKEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
543-561EKKEKEKEKEKEKEKEKLG
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 10.333, nucl 7.5, cyto_nucl 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MTTFNGRPASKGGKPAVVQRGGKTKLSTQSPPISTQFGNPQITSLNSNSSATNKDTVINEIDSKHMHDRMLFLLSNMIGQPVEITMKNGSKYEGLFHTALTEGELGIVLRLAKAVSGKDKKDPPLLKGQLIIFAKECMAIRVVGVDFASLEKSGPERNEREGFKTDTDISRSGEIRERDLKKWAPEEHVAFTGIEDELGDSHHHSRSGWDQFAANEKLFGVKTDFDEEIYTTKLDRSGADYKAREQHAIQIANEIQQSVSNNVHMREERGLAVDDSGLDEEDLYGAVVRDPLPVTNKYMPPMRRQQLSQQKRSSTPSQQPPSRASTTSMQPITSTSAPIQTDKPVQTSSQPAQPTEPIKDLQQSKQPPNEQAASLASGPNKPAYAQTKPSEGATVSRSNSAKSGSQFNLNDLRKPNPVAPLMNAATIQGSKGQQIPEHAFDSKQIEDNLVKFAMTARTFVMNDKELVDQTKMGLTQRLKELQQKEKNEISAELKQWAMEHTINTPVPDDLKEILGKKGNSSTSTDKTKDTSASKTKDTDKENEKKEKEKEKEKEKEKEKLGRETIETKQEIIKPLPGSEALSNAEKPTNEKSGTTSSFKLNVKASVFKPNVNATPFTPSFAGDKKAGTSSNIVDKNLFFGKLIKKGALPLSETMASPFKKGIASPSPGTIAPTWPYGQRSFRHLFQVTNRYEEDMMYSQGMAQHPGNGAGGYYTIAHYNYGPSGQFGVPPPMSVAGPGHIMPYISATGPLPFSQPPPPGMPHTAAGPGFPQMAPTSSPHYPPQGFPPNRTGMIPPAGMHVPVYPYAPNPHGGHVMMRYPPLPEMMPPIGPNGMLMHQQPLNMDPQTAHYRGGREGGVNEEMLPESGTHN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.53
3 0.56
4 0.56
5 0.55
6 0.52
7 0.58
8 0.55
9 0.57
10 0.52
11 0.49
12 0.5
13 0.54
14 0.53
15 0.51
16 0.56
17 0.55
18 0.57
19 0.53
20 0.49
21 0.43
22 0.43
23 0.44
24 0.42
25 0.43
26 0.38
27 0.36
28 0.33
29 0.35
30 0.35
31 0.28
32 0.25
33 0.23
34 0.24
35 0.25
36 0.26
37 0.27
38 0.26
39 0.27
40 0.23
41 0.25
42 0.25
43 0.27
44 0.28
45 0.27
46 0.26
47 0.24
48 0.26
49 0.24
50 0.27
51 0.29
52 0.28
53 0.27
54 0.26
55 0.27
56 0.27
57 0.31
58 0.26
59 0.21
60 0.21
61 0.2
62 0.2
63 0.17
64 0.15
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.08
69 0.11
70 0.1
71 0.12
72 0.16
73 0.2
74 0.22
75 0.22
76 0.23
77 0.22
78 0.23
79 0.25
80 0.23
81 0.25
82 0.23
83 0.22
84 0.22
85 0.2
86 0.19
87 0.16
88 0.13
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.07
95 0.06
96 0.05
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.09
101 0.12
102 0.21
103 0.29
104 0.32
105 0.39
106 0.46
107 0.5
108 0.58
109 0.59
110 0.53
111 0.57
112 0.58
113 0.52
114 0.49
115 0.45
116 0.43
117 0.4
118 0.37
119 0.26
120 0.23
121 0.22
122 0.2
123 0.19
124 0.13
125 0.13
126 0.11
127 0.1
128 0.13
129 0.13
130 0.11
131 0.11
132 0.09
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.13
141 0.17
142 0.24
143 0.26
144 0.32
145 0.39
146 0.41
147 0.44
148 0.45
149 0.45
150 0.39
151 0.4
152 0.37
153 0.33
154 0.35
155 0.32
156 0.29
157 0.3
158 0.29
159 0.28
160 0.31
161 0.28
162 0.3
163 0.37
164 0.4
165 0.38
166 0.45
167 0.47
168 0.46
169 0.52
170 0.5
171 0.46
172 0.48
173 0.49
174 0.44
175 0.41
176 0.36
177 0.29
178 0.25
179 0.21
180 0.14
181 0.11
182 0.08
183 0.06
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.08
188 0.11
189 0.13
190 0.14
191 0.13
192 0.16
193 0.23
194 0.29
195 0.28
196 0.26
197 0.26
198 0.26
199 0.34
200 0.34
201 0.26
202 0.2
203 0.18
204 0.2
205 0.19
206 0.19
207 0.14
208 0.13
209 0.14
210 0.18
211 0.18
212 0.16
213 0.17
214 0.16
215 0.15
216 0.15
217 0.14
218 0.1
219 0.11
220 0.12
221 0.12
222 0.12
223 0.16
224 0.21
225 0.25
226 0.31
227 0.32
228 0.34
229 0.41
230 0.41
231 0.37
232 0.32
233 0.35
234 0.36
235 0.37
236 0.33
237 0.3
238 0.29
239 0.29
240 0.29
241 0.21
242 0.14
243 0.13
244 0.15
245 0.13
246 0.13
247 0.14
248 0.16
249 0.17
250 0.2
251 0.19
252 0.2
253 0.2
254 0.2
255 0.18
256 0.17
257 0.18
258 0.14
259 0.14
260 0.11
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.07
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.03
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.07
277 0.07
278 0.09
279 0.13
280 0.14
281 0.19
282 0.24
283 0.25
284 0.26
285 0.33
286 0.34
287 0.37
288 0.45
289 0.45
290 0.43
291 0.43
292 0.51
293 0.55
294 0.62
295 0.64
296 0.61
297 0.6
298 0.6
299 0.64
300 0.6
301 0.57
302 0.57
303 0.58
304 0.6
305 0.6
306 0.6
307 0.58
308 0.58
309 0.52
310 0.44
311 0.38
312 0.33
313 0.32
314 0.35
315 0.32
316 0.26
317 0.23
318 0.23
319 0.24
320 0.2
321 0.18
322 0.12
323 0.15
324 0.16
325 0.17
326 0.18
327 0.16
328 0.21
329 0.2
330 0.22
331 0.19
332 0.19
333 0.2
334 0.24
335 0.24
336 0.24
337 0.25
338 0.23
339 0.24
340 0.27
341 0.27
342 0.24
343 0.24
344 0.19
345 0.19
346 0.25
347 0.26
348 0.26
349 0.31
350 0.34
351 0.37
352 0.43
353 0.45
354 0.41
355 0.42
356 0.41
357 0.33
358 0.28
359 0.24
360 0.18
361 0.16
362 0.16
363 0.13
364 0.11
365 0.12
366 0.11
367 0.1
368 0.09
369 0.13
370 0.16
371 0.19
372 0.24
373 0.25
374 0.27
375 0.28
376 0.28
377 0.24
378 0.2
379 0.18
380 0.16
381 0.19
382 0.16
383 0.2
384 0.2
385 0.2
386 0.2
387 0.2
388 0.19
389 0.17
390 0.22
391 0.19
392 0.25
393 0.24
394 0.26
395 0.33
396 0.31
397 0.33
398 0.3
399 0.31
400 0.27
401 0.28
402 0.28
403 0.23
404 0.24
405 0.21
406 0.2
407 0.22
408 0.21
409 0.2
410 0.17
411 0.13
412 0.12
413 0.11
414 0.1
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.1
419 0.11
420 0.11
421 0.14
422 0.16
423 0.17
424 0.18
425 0.17
426 0.15
427 0.16
428 0.18
429 0.16
430 0.16
431 0.13
432 0.13
433 0.14
434 0.14
435 0.15
436 0.12
437 0.11
438 0.08
439 0.1
440 0.12
441 0.11
442 0.12
443 0.11
444 0.13
445 0.13
446 0.14
447 0.16
448 0.13
449 0.13
450 0.13
451 0.13
452 0.12
453 0.13
454 0.12
455 0.1
456 0.09
457 0.1
458 0.09
459 0.09
460 0.13
461 0.13
462 0.15
463 0.18
464 0.21
465 0.22
466 0.28
467 0.34
468 0.39
469 0.46
470 0.46
471 0.48
472 0.48
473 0.47
474 0.41
475 0.37
476 0.31
477 0.28
478 0.26
479 0.22
480 0.2
481 0.18
482 0.18
483 0.16
484 0.15
485 0.12
486 0.11
487 0.11
488 0.15
489 0.15
490 0.15
491 0.15
492 0.12
493 0.12
494 0.12
495 0.13
496 0.09
497 0.11
498 0.13
499 0.13
500 0.16
501 0.19
502 0.19
503 0.18
504 0.22
505 0.22
506 0.22
507 0.25
508 0.28
509 0.29
510 0.34
511 0.35
512 0.32
513 0.32
514 0.32
515 0.32
516 0.29
517 0.32
518 0.34
519 0.36
520 0.37
521 0.4
522 0.44
523 0.46
524 0.47
525 0.47
526 0.48
527 0.54
528 0.59
529 0.64
530 0.61
531 0.62
532 0.66
533 0.69
534 0.67
535 0.69
536 0.7
537 0.71
538 0.78
539 0.79
540 0.8
541 0.77
542 0.78
543 0.75
544 0.75
545 0.69
546 0.68
547 0.63
548 0.55
549 0.52
550 0.48
551 0.44
552 0.43
553 0.38
554 0.31
555 0.32
556 0.32
557 0.32
558 0.28
559 0.29
560 0.23
561 0.23
562 0.23
563 0.19
564 0.19
565 0.16
566 0.17
567 0.14
568 0.15
569 0.15
570 0.15
571 0.16
572 0.14
573 0.17
574 0.19
575 0.22
576 0.21
577 0.21
578 0.23
579 0.28
580 0.32
581 0.32
582 0.3
583 0.27
584 0.34
585 0.34
586 0.34
587 0.3
588 0.3
589 0.29
590 0.32
591 0.32
592 0.35
593 0.35
594 0.33
595 0.35
596 0.35
597 0.37
598 0.33
599 0.33
600 0.24
601 0.31
602 0.29
603 0.27
604 0.24
605 0.2
606 0.21
607 0.22
608 0.24
609 0.17
610 0.18
611 0.18
612 0.2
613 0.2
614 0.18
615 0.19
616 0.18
617 0.26
618 0.27
619 0.26
620 0.25
621 0.24
622 0.26
623 0.25
624 0.23
625 0.14
626 0.18
627 0.23
628 0.28
629 0.29
630 0.27
631 0.25
632 0.29
633 0.33
634 0.29
635 0.26
636 0.21
637 0.23
638 0.23
639 0.22
640 0.21
641 0.22
642 0.21
643 0.19
644 0.19
645 0.17
646 0.16
647 0.17
648 0.22
649 0.23
650 0.27
651 0.27
652 0.29
653 0.29
654 0.29
655 0.31
656 0.25
657 0.21
658 0.17
659 0.19
660 0.18
661 0.19
662 0.22
663 0.25
664 0.3
665 0.29
666 0.35
667 0.37
668 0.39
669 0.45
670 0.43
671 0.43
672 0.45
673 0.52
674 0.46
675 0.46
676 0.43
677 0.38
678 0.36
679 0.32
680 0.28
681 0.2
682 0.2
683 0.16
684 0.16
685 0.14
686 0.17
687 0.18
688 0.16
689 0.14
690 0.15
691 0.15
692 0.17
693 0.16
694 0.12
695 0.12
696 0.09
697 0.09
698 0.07
699 0.07
700 0.07
701 0.08
702 0.08
703 0.09
704 0.09
705 0.11
706 0.11
707 0.12
708 0.12
709 0.12
710 0.15
711 0.14
712 0.17
713 0.17
714 0.23
715 0.21
716 0.21
717 0.21
718 0.19
719 0.19
720 0.17
721 0.16
722 0.11
723 0.12
724 0.12
725 0.12
726 0.11
727 0.11
728 0.1
729 0.11
730 0.11
731 0.09
732 0.1
733 0.1
734 0.11
735 0.13
736 0.13
737 0.14
738 0.14
739 0.17
740 0.22
741 0.25
742 0.26
743 0.29
744 0.32
745 0.34
746 0.37
747 0.36
748 0.31
749 0.3
750 0.31
751 0.27
752 0.24
753 0.2
754 0.18
755 0.17
756 0.16
757 0.15
758 0.12
759 0.14
760 0.15
761 0.17
762 0.21
763 0.22
764 0.26
765 0.27
766 0.34
767 0.35
768 0.35
769 0.42
770 0.47
771 0.47
772 0.48
773 0.53
774 0.5
775 0.49
776 0.49
777 0.42
778 0.36
779 0.38
780 0.35
781 0.27
782 0.26
783 0.25
784 0.24
785 0.22
786 0.18
787 0.16
788 0.16
789 0.17
790 0.14
791 0.16
792 0.21
793 0.22
794 0.27
795 0.26
796 0.28
797 0.3
798 0.29
799 0.3
800 0.28
801 0.31
802 0.27
803 0.28
804 0.25
805 0.23
806 0.23
807 0.23
808 0.21
809 0.18
810 0.22
811 0.23
812 0.25
813 0.24
814 0.25
815 0.23
816 0.22
817 0.22
818 0.17
819 0.16
820 0.17
821 0.17
822 0.2
823 0.2
824 0.21
825 0.21
826 0.21
827 0.24
828 0.22
829 0.22
830 0.17
831 0.23
832 0.29
833 0.29
834 0.3
835 0.28
836 0.3
837 0.32
838 0.35
839 0.3
840 0.26
841 0.26
842 0.28
843 0.27
844 0.24
845 0.22
846 0.2
847 0.19
848 0.17
849 0.16