Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y2H0K6

Protein Details
Accession A0A1Y2H0K6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1051-1076LREKIQAWKASQKSRKQQQQVEQMEIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MQDASNDVPLSQEERERIRMKRLEKLQGSYNSQQSSGSEGNAPSSSIHGSASKPEASSSSSNTTAAAARTSSPITIPNLPKGASIPPTTPSPKPASPSAPKQPALTFEAWQNEALSRILCVSLNENAPAPMLYLSNLARELAEANEPLVISQGSLDRVLVDRMSVDPNDESNAHLLDRGQLRYPLFDYLLDCWKRLETVKIQTSRSKLPANVIEERVQSLNTSKSLLVSYAGIVLQMPDMFPQVQSSTPLGATQLVERLFADQDTASGIPTEFLRDVAARFQGDGLEDLVQQLVAGIGARARAATILTDWRTPFRALLTLIEIPAIASTLPSIAIWNPPNATARQIEIVSALGPFFKISGFCSDEPSVAELFGSGLKRNKADSNGAFTSIRGTVRGIQSSLFQIVNSLIRSGPESKGKMLDYFYSILNKNERRAQMQVDRATVSGDGFIYNISEVLMQFCDPFLDSGHTKIDKISHEFFKGKSKIDITKETRICASKEMTDSYASGTSTSAINFISDIFFLTLGFHHIGLSKMYIDYKRFMKDFYEIRDQYDRLKEQETSGQLSVENGLLIKRYEIQLEKMITFRLSLESQIMDPIILAHSFQFYNLVMAWLLRMVDPTHTYPQSTIQLPLPEKPSEDFANLPEYIIEDIVEFFLFVLRHSHETVGSSTLDELITFTMVFLITPGYIKNPYLKAKFAEILFYMTLPYRGQRNDDTLGMKLNTHPMALQCLIPAIMNFYVEVENTGRSSQFYDKFNIRYNISQILKFVWKNPIHRDMVKAESQKSETFVRFVNLLINDTTYLLDEGLTKLVEIHGIEAEMDDKAGWAAQTPQYRQEKEGVLRTAQRQASSYIALGNETVNMLAYLTEVIKQPFLTAEIVDRLATMLDYNLVILVGEKMSTLKVKNQEEYRFQPRTLLSDIISVYLHLDCPKFIAALARDDRSYKASIFHKASRILEGRNLKSPDEIAQLTRLVQKVEDMRQQGAEDEEELGEIPEEFLDPLLFTLMEDPVLLPTSNISIDRSTIKSHLLSDSTDPFNRMPLKISDVVDNIELREKIQAWKASQKSRKQQQQVEQMEIDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.37
3 0.42
4 0.45
5 0.51
6 0.56
7 0.56
8 0.61
9 0.65
10 0.67
11 0.67
12 0.67
13 0.66
14 0.67
15 0.7
16 0.67
17 0.65
18 0.56
19 0.5
20 0.47
21 0.38
22 0.37
23 0.31
24 0.26
25 0.23
26 0.22
27 0.25
28 0.24
29 0.24
30 0.17
31 0.18
32 0.18
33 0.15
34 0.16
35 0.15
36 0.16
37 0.2
38 0.24
39 0.24
40 0.23
41 0.23
42 0.24
43 0.26
44 0.28
45 0.28
46 0.29
47 0.29
48 0.29
49 0.28
50 0.28
51 0.25
52 0.23
53 0.2
54 0.15
55 0.15
56 0.18
57 0.19
58 0.17
59 0.16
60 0.19
61 0.21
62 0.29
63 0.31
64 0.34
65 0.36
66 0.36
67 0.36
68 0.34
69 0.35
70 0.31
71 0.31
72 0.26
73 0.26
74 0.33
75 0.37
76 0.36
77 0.37
78 0.39
79 0.4
80 0.43
81 0.46
82 0.48
83 0.52
84 0.59
85 0.64
86 0.65
87 0.63
88 0.61
89 0.58
90 0.53
91 0.51
92 0.44
93 0.35
94 0.32
95 0.35
96 0.33
97 0.31
98 0.27
99 0.22
100 0.21
101 0.2
102 0.16
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.13
109 0.17
110 0.18
111 0.19
112 0.19
113 0.18
114 0.18
115 0.17
116 0.15
117 0.11
118 0.1
119 0.09
120 0.12
121 0.12
122 0.14
123 0.14
124 0.14
125 0.13
126 0.13
127 0.13
128 0.11
129 0.13
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.11
136 0.09
137 0.07
138 0.08
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.12
145 0.13
146 0.12
147 0.1
148 0.09
149 0.11
150 0.14
151 0.13
152 0.15
153 0.14
154 0.15
155 0.18
156 0.17
157 0.16
158 0.15
159 0.16
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.16
164 0.2
165 0.21
166 0.22
167 0.25
168 0.25
169 0.27
170 0.28
171 0.25
172 0.22
173 0.21
174 0.2
175 0.2
176 0.29
177 0.27
178 0.26
179 0.24
180 0.24
181 0.25
182 0.25
183 0.28
184 0.26
185 0.35
186 0.43
187 0.47
188 0.5
189 0.53
190 0.56
191 0.55
192 0.54
193 0.49
194 0.42
195 0.43
196 0.46
197 0.46
198 0.47
199 0.44
200 0.42
201 0.38
202 0.39
203 0.33
204 0.26
205 0.21
206 0.19
207 0.19
208 0.16
209 0.18
210 0.15
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.14
215 0.11
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.05
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.13
233 0.14
234 0.14
235 0.14
236 0.14
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.11
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.14
246 0.13
247 0.12
248 0.13
249 0.08
250 0.08
251 0.1
252 0.1
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.11
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.13
265 0.16
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.13
270 0.12
271 0.12
272 0.11
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.08
277 0.07
278 0.06
279 0.05
280 0.04
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.12
294 0.14
295 0.17
296 0.18
297 0.19
298 0.22
299 0.22
300 0.21
301 0.17
302 0.18
303 0.16
304 0.17
305 0.19
306 0.17
307 0.17
308 0.16
309 0.14
310 0.11
311 0.1
312 0.09
313 0.04
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.11
322 0.12
323 0.14
324 0.14
325 0.15
326 0.18
327 0.18
328 0.2
329 0.16
330 0.16
331 0.17
332 0.16
333 0.15
334 0.13
335 0.12
336 0.1
337 0.09
338 0.08
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.06
346 0.11
347 0.15
348 0.16
349 0.21
350 0.21
351 0.21
352 0.22
353 0.22
354 0.17
355 0.13
356 0.12
357 0.07
358 0.07
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.13
363 0.15
364 0.16
365 0.19
366 0.21
367 0.22
368 0.28
369 0.27
370 0.31
371 0.3
372 0.32
373 0.29
374 0.26
375 0.25
376 0.21
377 0.19
378 0.12
379 0.13
380 0.15
381 0.17
382 0.19
383 0.17
384 0.15
385 0.16
386 0.17
387 0.18
388 0.13
389 0.11
390 0.1
391 0.11
392 0.12
393 0.11
394 0.11
395 0.08
396 0.09
397 0.11
398 0.13
399 0.15
400 0.19
401 0.2
402 0.2
403 0.23
404 0.24
405 0.23
406 0.22
407 0.2
408 0.17
409 0.17
410 0.16
411 0.17
412 0.17
413 0.18
414 0.24
415 0.25
416 0.25
417 0.3
418 0.32
419 0.31
420 0.32
421 0.35
422 0.35
423 0.4
424 0.39
425 0.35
426 0.33
427 0.3
428 0.29
429 0.23
430 0.17
431 0.1
432 0.07
433 0.06
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.05
451 0.08
452 0.08
453 0.1
454 0.14
455 0.14
456 0.14
457 0.15
458 0.18
459 0.17
460 0.22
461 0.25
462 0.23
463 0.26
464 0.28
465 0.28
466 0.34
467 0.34
468 0.31
469 0.29
470 0.3
471 0.32
472 0.35
473 0.43
474 0.39
475 0.45
476 0.45
477 0.43
478 0.42
479 0.38
480 0.35
481 0.29
482 0.25
483 0.19
484 0.19
485 0.2
486 0.18
487 0.17
488 0.16
489 0.15
490 0.14
491 0.12
492 0.1
493 0.09
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.07
498 0.06
499 0.06
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.06
511 0.07
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.06
519 0.06
520 0.08
521 0.1
522 0.11
523 0.13
524 0.16
525 0.18
526 0.18
527 0.18
528 0.18
529 0.21
530 0.23
531 0.25
532 0.31
533 0.29
534 0.32
535 0.34
536 0.33
537 0.32
538 0.35
539 0.31
540 0.23
541 0.25
542 0.22
543 0.2
544 0.25
545 0.22
546 0.2
547 0.19
548 0.17
549 0.15
550 0.15
551 0.14
552 0.1
553 0.08
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.05
559 0.06
560 0.06
561 0.09
562 0.1
563 0.12
564 0.15
565 0.17
566 0.17
567 0.16
568 0.16
569 0.14
570 0.14
571 0.12
572 0.1
573 0.09
574 0.09
575 0.09
576 0.09
577 0.09
578 0.09
579 0.09
580 0.06
581 0.05
582 0.05
583 0.05
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.07
591 0.06
592 0.07
593 0.07
594 0.07
595 0.06
596 0.06
597 0.06
598 0.05
599 0.05
600 0.04
601 0.05
602 0.05
603 0.07
604 0.09
605 0.12
606 0.16
607 0.16
608 0.17
609 0.16
610 0.19
611 0.21
612 0.2
613 0.19
614 0.17
615 0.21
616 0.22
617 0.25
618 0.25
619 0.22
620 0.22
621 0.21
622 0.22
623 0.18
624 0.19
625 0.16
626 0.14
627 0.17
628 0.16
629 0.15
630 0.12
631 0.11
632 0.1
633 0.09
634 0.08
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.04
640 0.04
641 0.06
642 0.06
643 0.06
644 0.08
645 0.09
646 0.12
647 0.13
648 0.14
649 0.12
650 0.14
651 0.14
652 0.14
653 0.12
654 0.1
655 0.1
656 0.1
657 0.09
658 0.07
659 0.07
660 0.05
661 0.05
662 0.05
663 0.05
664 0.04
665 0.04
666 0.04
667 0.04
668 0.04
669 0.04
670 0.05
671 0.05
672 0.07
673 0.08
674 0.09
675 0.13
676 0.17
677 0.24
678 0.26
679 0.28
680 0.27
681 0.29
682 0.32
683 0.27
684 0.25
685 0.19
686 0.19
687 0.17
688 0.16
689 0.13
690 0.1
691 0.12
692 0.09
693 0.1
694 0.13
695 0.14
696 0.17
697 0.19
698 0.23
699 0.24
700 0.27
701 0.27
702 0.23
703 0.25
704 0.22
705 0.2
706 0.16
707 0.19
708 0.16
709 0.15
710 0.15
711 0.12
712 0.16
713 0.16
714 0.16
715 0.11
716 0.11
717 0.11
718 0.1
719 0.09
720 0.08
721 0.07
722 0.07
723 0.07
724 0.08
725 0.08
726 0.08
727 0.1
728 0.08
729 0.08
730 0.09
731 0.1
732 0.09
733 0.09
734 0.13
735 0.17
736 0.21
737 0.23
738 0.27
739 0.3
740 0.34
741 0.4
742 0.4
743 0.36
744 0.34
745 0.35
746 0.39
747 0.36
748 0.34
749 0.27
750 0.27
751 0.3
752 0.28
753 0.29
754 0.3
755 0.32
756 0.37
757 0.43
758 0.47
759 0.46
760 0.47
761 0.48
762 0.42
763 0.43
764 0.44
765 0.41
766 0.36
767 0.35
768 0.36
769 0.33
770 0.32
771 0.32
772 0.27
773 0.25
774 0.23
775 0.21
776 0.18
777 0.18
778 0.2
779 0.15
780 0.16
781 0.15
782 0.14
783 0.13
784 0.14
785 0.13
786 0.09
787 0.09
788 0.07
789 0.07
790 0.07
791 0.08
792 0.08
793 0.08
794 0.07
795 0.07
796 0.07
797 0.08
798 0.07
799 0.08
800 0.07
801 0.07
802 0.07
803 0.07
804 0.08
805 0.06
806 0.06
807 0.05
808 0.04
809 0.04
810 0.05
811 0.05
812 0.05
813 0.09
814 0.14
815 0.2
816 0.22
817 0.3
818 0.38
819 0.4
820 0.41
821 0.42
822 0.43
823 0.42
824 0.48
825 0.42
826 0.37
827 0.41
828 0.42
829 0.45
830 0.4
831 0.37
832 0.31
833 0.3
834 0.29
835 0.26
836 0.23
837 0.17
838 0.15
839 0.15
840 0.14
841 0.12
842 0.09
843 0.08
844 0.08
845 0.06
846 0.05
847 0.05
848 0.05
849 0.05
850 0.05
851 0.06
852 0.08
853 0.09
854 0.1
855 0.11
856 0.11
857 0.11
858 0.11
859 0.13
860 0.12
861 0.1
862 0.12
863 0.13
864 0.14
865 0.13
866 0.13
867 0.11
868 0.1
869 0.09
870 0.07
871 0.05
872 0.06
873 0.06
874 0.06
875 0.05
876 0.05
877 0.05
878 0.05
879 0.06
880 0.05
881 0.05
882 0.05
883 0.06
884 0.08
885 0.11
886 0.12
887 0.18
888 0.27
889 0.31
890 0.38
891 0.46
892 0.51
893 0.55
894 0.6
895 0.63
896 0.58
897 0.54
898 0.52
899 0.46
900 0.44
901 0.4
902 0.35
903 0.27
904 0.27
905 0.27
906 0.23
907 0.21
908 0.16
909 0.14
910 0.13
911 0.13
912 0.12
913 0.13
914 0.11
915 0.13
916 0.14
917 0.13
918 0.12
919 0.18
920 0.17
921 0.25
922 0.29
923 0.29
924 0.29
925 0.31
926 0.33
927 0.29
928 0.3
929 0.22
930 0.25
931 0.27
932 0.35
933 0.39
934 0.43
935 0.45
936 0.48
937 0.49
938 0.5
939 0.49
940 0.43
941 0.45
942 0.49
943 0.47
944 0.5
945 0.5
946 0.43
947 0.42
948 0.41
949 0.36
950 0.33
951 0.31
952 0.24
953 0.24
954 0.24
955 0.25
956 0.28
957 0.26
958 0.21
959 0.2
960 0.23
961 0.27
962 0.32
963 0.37
964 0.35
965 0.36
966 0.37
967 0.37
968 0.33
969 0.29
970 0.23
971 0.17
972 0.16
973 0.14
974 0.12
975 0.12
976 0.11
977 0.09
978 0.08
979 0.07
980 0.06
981 0.06
982 0.06
983 0.06
984 0.06
985 0.06
986 0.06
987 0.07
988 0.07
989 0.06
990 0.08
991 0.08
992 0.08
993 0.08
994 0.08
995 0.09
996 0.11
997 0.11
998 0.09
999 0.09
1000 0.11
1001 0.13
1002 0.13
1003 0.14
1004 0.13
1005 0.16
1006 0.21
1007 0.22
1008 0.23
1009 0.24
1010 0.27
1011 0.26
1012 0.28
1013 0.3
1014 0.27
1015 0.28
1016 0.29
1017 0.33
1018 0.35
1019 0.35
1020 0.35
1021 0.3
1022 0.36
1023 0.37
1024 0.34
1025 0.32
1026 0.3
1027 0.35
1028 0.38
1029 0.39
1030 0.37
1031 0.34
1032 0.35
1033 0.34
1034 0.31
1035 0.26
1036 0.26
1037 0.25
1038 0.2
1039 0.23
1040 0.23
1041 0.26
1042 0.33
1043 0.37
1044 0.37
1045 0.47
1046 0.54
1047 0.6
1048 0.67
1049 0.72
1050 0.76
1051 0.8
1052 0.85
1053 0.85
1054 0.87
1055 0.86
1056 0.88
1057 0.84
1058 0.8