Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y2H6T0

Protein Details
Accession A0A1Y2H6T0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-44VKLVKNKAYYKRFQVKYRRRREGKTDYYARKRLVHydrophilic
260-303HVPTEKKKPAPGEKVKNNKKERLNYKQKKNKIQQKLKAFNAKNGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
265-296KKKPAPGEKVKNNKKERLNYKQKKNKIQQKLK
Subcellular Location(s) cyto 13, cyto_mito 12.333, mito 10.5, cyto_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005485  Rbsml_L5_euk/L18_arc  
IPR025607  Rbsml_L5e_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF14204  Ribosomal_L18_c  
PF17144  Ribosomal_L5e  
CDD cd00432  Ribosomal_L18_L5e  
Amino Acid Sequences MILTMLCVPFVKLVKNKAYYKRFQVKYRRRREGKTDYYARKRLVVQAKNKYNSPKYRLVVRFTNADIVCQVVYAKLQGDFVLASAYSHELPKYGVKGGLTNWAAAYCTGLLVARRVLTKLGLADKYEGVTEPDGTISMTEAIEDAPRPFKCFLDVGLKRTSTGSRVFAAMKGASDGGIFIPHGENRFPGFDAESKELDADVLRSYIYGGHVADYMRYLEEDDDEKYKKQFSKFIAAGVEPDDLEDMYADAHKAIREDPTHVPTEKKKPAPGEKVKNNKKERLNYKQKKNKIQQKLKAFNAKNGISA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.49
3 0.56
4 0.62
5 0.69
6 0.69
7 0.74
8 0.77
9 0.76
10 0.77
11 0.8
12 0.81
13 0.84
14 0.88
15 0.88
16 0.86
17 0.86
18 0.87
19 0.87
20 0.85
21 0.84
22 0.84
23 0.83
24 0.85
25 0.83
26 0.75
27 0.69
28 0.61
29 0.6
30 0.6
31 0.58
32 0.58
33 0.62
34 0.7
35 0.69
36 0.71
37 0.71
38 0.7
39 0.71
40 0.68
41 0.66
42 0.6
43 0.66
44 0.67
45 0.64
46 0.61
47 0.55
48 0.51
49 0.43
50 0.49
51 0.38
52 0.34
53 0.28
54 0.22
55 0.19
56 0.16
57 0.15
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.1
78 0.12
79 0.13
80 0.13
81 0.14
82 0.14
83 0.15
84 0.16
85 0.23
86 0.2
87 0.19
88 0.17
89 0.16
90 0.16
91 0.14
92 0.14
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.09
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.11
107 0.15
108 0.14
109 0.14
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.14
114 0.12
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.1
133 0.1
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.15
138 0.15
139 0.17
140 0.22
141 0.24
142 0.25
143 0.27
144 0.27
145 0.26
146 0.27
147 0.25
148 0.17
149 0.18
150 0.17
151 0.14
152 0.15
153 0.16
154 0.15
155 0.16
156 0.14
157 0.11
158 0.1
159 0.09
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.04
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.12
177 0.13
178 0.17
179 0.19
180 0.18
181 0.17
182 0.16
183 0.16
184 0.14
185 0.11
186 0.09
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.08
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.15
210 0.17
211 0.18
212 0.19
213 0.25
214 0.28
215 0.3
216 0.34
217 0.34
218 0.42
219 0.41
220 0.43
221 0.4
222 0.35
223 0.33
224 0.28
225 0.24
226 0.14
227 0.14
228 0.11
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.15
242 0.16
243 0.21
244 0.26
245 0.29
246 0.33
247 0.34
248 0.38
249 0.41
250 0.49
251 0.54
252 0.54
253 0.56
254 0.6
255 0.69
256 0.74
257 0.77
258 0.78
259 0.79
260 0.85
261 0.89
262 0.9
263 0.88
264 0.86
265 0.84
266 0.84
267 0.84
268 0.84
269 0.86
270 0.86
271 0.89
272 0.91
273 0.91
274 0.92
275 0.92
276 0.92
277 0.92
278 0.92
279 0.9
280 0.91
281 0.91
282 0.89
283 0.89
284 0.81
285 0.77
286 0.75