Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2GUB2

Protein Details
Accession A0A1Y2GUB2    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-72AVMPSLPKPKKQKLHRNLDNIVAHydrophilic
89-115KTGQRMVKGPYKKREKKADNKDGKKGABasic
333-362TGPIRPEHLREAQRRHKKKELQRGQGVRTPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-63PRKRKNAAVMPSLPKPKKQKL
93-117RMVKGPYKKREKKADNKDGKKGAGG
132-139SSKKGKGG
345-352QRRHKKKE
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 9.5, nucl 8.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MTSGSSSTSSAAPSPTAFPGPSAASTPTPSTPTTVAGVTAPAPRKRKNAAVMPSLPKPKKQKLHRNLDNIVARKQLPDVPTGANAGGNKTGQRMVKGPYKKREKKADNKDGKKGAGGDTAPSTPGGGIGASSSKKGKGGKGNMGNTASAAGSIASGMAASTAAAHSLGGIGGVDADGTNGFGQGGYQLGIKNEDDDETESRAGPSQAIDGDGNPITGEAGGDAGGEGKEDEDDEHEEEPEYTDYEWSQEANARGRSKEELKALLDCFSEEQLQRYEVYRRSVLSKSTIKKLVGTILNQQVTQTMAFVVAGFCKVFVGEMVEKAREVMEDWGETGPIRPEHLREAQRRHKKKELQRGQGVRTPYGYKRRMFCR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.21
4 0.2
5 0.19
6 0.21
7 0.21
8 0.21
9 0.21
10 0.21
11 0.2
12 0.23
13 0.25
14 0.25
15 0.25
16 0.24
17 0.25
18 0.23
19 0.23
20 0.23
21 0.2
22 0.18
23 0.16
24 0.16
25 0.15
26 0.2
27 0.25
28 0.3
29 0.36
30 0.41
31 0.48
32 0.52
33 0.58
34 0.6
35 0.62
36 0.63
37 0.65
38 0.67
39 0.66
40 0.67
41 0.69
42 0.63
43 0.62
44 0.63
45 0.65
46 0.67
47 0.73
48 0.76
49 0.77
50 0.86
51 0.88
52 0.87
53 0.8
54 0.79
55 0.76
56 0.68
57 0.6
58 0.53
59 0.44
60 0.36
61 0.36
62 0.31
63 0.25
64 0.23
65 0.23
66 0.21
67 0.21
68 0.22
69 0.2
70 0.18
71 0.17
72 0.16
73 0.15
74 0.14
75 0.14
76 0.14
77 0.18
78 0.17
79 0.19
80 0.2
81 0.23
82 0.31
83 0.4
84 0.47
85 0.52
86 0.63
87 0.7
88 0.76
89 0.82
90 0.84
91 0.85
92 0.88
93 0.89
94 0.89
95 0.86
96 0.86
97 0.8
98 0.7
99 0.61
100 0.52
101 0.43
102 0.36
103 0.3
104 0.23
105 0.2
106 0.2
107 0.18
108 0.16
109 0.14
110 0.09
111 0.08
112 0.07
113 0.05
114 0.04
115 0.04
116 0.07
117 0.07
118 0.09
119 0.1
120 0.11
121 0.14
122 0.17
123 0.22
124 0.28
125 0.34
126 0.41
127 0.48
128 0.5
129 0.5
130 0.49
131 0.43
132 0.34
133 0.29
134 0.2
135 0.11
136 0.09
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.02
142 0.02
143 0.02
144 0.02
145 0.02
146 0.02
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.02
158 0.02
159 0.02
160 0.02
161 0.02
162 0.02
163 0.02
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.1
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.11
187 0.11
188 0.12
189 0.11
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.04
217 0.04
218 0.06
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.12
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.11
236 0.13
237 0.18
238 0.24
239 0.24
240 0.25
241 0.27
242 0.31
243 0.31
244 0.33
245 0.31
246 0.3
247 0.3
248 0.33
249 0.31
250 0.29
251 0.25
252 0.2
253 0.18
254 0.15
255 0.17
256 0.14
257 0.16
258 0.15
259 0.16
260 0.17
261 0.18
262 0.23
263 0.23
264 0.27
265 0.27
266 0.27
267 0.3
268 0.32
269 0.32
270 0.34
271 0.38
272 0.38
273 0.44
274 0.48
275 0.44
276 0.43
277 0.42
278 0.42
279 0.38
280 0.35
281 0.36
282 0.38
283 0.39
284 0.36
285 0.35
286 0.28
287 0.25
288 0.23
289 0.16
290 0.08
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.06
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.11
304 0.12
305 0.16
306 0.19
307 0.19
308 0.19
309 0.2
310 0.2
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.15
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.15
321 0.17
322 0.15
323 0.18
324 0.19
325 0.21
326 0.28
327 0.37
328 0.44
329 0.48
330 0.57
331 0.65
332 0.74
333 0.81
334 0.83
335 0.84
336 0.85
337 0.87
338 0.88
339 0.88
340 0.88
341 0.88
342 0.88
343 0.84
344 0.79
345 0.73
346 0.64
347 0.58
348 0.53
349 0.51
350 0.53
351 0.53
352 0.54