Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2H237

Protein Details
Accession A0A1Y2H237    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-122IEKTKARRKSPSSSRQKEKRHRSASSHBasic
136-188SSSDSEDDRRHRRKRRHKSSRHRKTDHSRSRSRSRSRRISRHRRQSSRDRSSDBasic
233-298SNTYNKSPKRAARPRFRSHSRSRSRSRSRSHSPQNLKEYRANSKSRSPSISRGRPRTRSRSPSLSSHydrophilic
310-335DDSRSMSRSRSPRRSSNLRSRSRTRHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-117TKARRKSPSSSRQKEKRHR
144-292RRHRRKRRHKSSRHRKTDHSRSRSRSRSRRISRHRRQSSRDRSSDRHERDSRDDRRSSRASHRQSHSRRSRSRSISNSPIRDRSRSRERSNTYNKSPKRAARPRFRSHSRSRSRSRSRSHSPQNLKEYRANSKSRSPSISRGRPRTRSR
319-332RSPRRSSNLRSRSR
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13917  zf-CCHC_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSDFQRGLQAYERLLKSDEGVRAGTCRKCGGSGHLTYECRNFIKLDPPAAKPKANSRFGFLKKQLGVASSASPSPSASASGGMPQIVSSTTVGGDIEKTKARRKSPSSSRQKEKRHRSASSHSDSNSDSEYTSSDSSSDSEDDRRHRRKRRHKSSRHRKTDHSRSRSRSRSRRISRHRRQSSRDRSSDRHERDSRDDRRSSRASHRQSHSRRSRSRSISNSPIRDRSRSRERSNTYNKSPKRAARPRFRSHSRSRSRSRSRSHSPQNLKEYRANSKSRSPSISRGRPRTRSRSPSLSSSHTHSFQVTRRDDSRSMSRSRSPRRSSNLRSRSRTRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.31
3 0.27
4 0.31
5 0.31
6 0.25
7 0.25
8 0.24
9 0.27
10 0.33
11 0.33
12 0.3
13 0.3
14 0.28
15 0.3
16 0.31
17 0.34
18 0.35
19 0.36
20 0.4
21 0.44
22 0.44
23 0.44
24 0.46
25 0.42
26 0.36
27 0.33
28 0.29
29 0.24
30 0.31
31 0.33
32 0.38
33 0.38
34 0.41
35 0.49
36 0.51
37 0.52
38 0.45
39 0.52
40 0.53
41 0.57
42 0.53
43 0.5
44 0.56
45 0.58
46 0.65
47 0.58
48 0.56
49 0.49
50 0.51
51 0.46
52 0.38
53 0.35
54 0.27
55 0.26
56 0.19
57 0.18
58 0.15
59 0.14
60 0.13
61 0.12
62 0.11
63 0.1
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.12
68 0.12
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.09
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.11
84 0.15
85 0.18
86 0.25
87 0.32
88 0.36
89 0.44
90 0.49
91 0.57
92 0.63
93 0.72
94 0.76
95 0.78
96 0.84
97 0.84
98 0.89
99 0.89
100 0.89
101 0.89
102 0.86
103 0.82
104 0.79
105 0.78
106 0.76
107 0.72
108 0.65
109 0.55
110 0.49
111 0.44
112 0.38
113 0.3
114 0.22
115 0.15
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.12
128 0.16
129 0.22
130 0.31
131 0.4
132 0.48
133 0.56
134 0.66
135 0.74
136 0.82
137 0.87
138 0.89
139 0.91
140 0.93
141 0.96
142 0.96
143 0.95
144 0.89
145 0.86
146 0.85
147 0.85
148 0.84
149 0.81
150 0.78
151 0.74
152 0.79
153 0.79
154 0.79
155 0.77
156 0.76
157 0.78
158 0.79
159 0.83
160 0.84
161 0.87
162 0.87
163 0.89
164 0.9
165 0.87
166 0.84
167 0.85
168 0.85
169 0.83
170 0.8
171 0.74
172 0.68
173 0.68
174 0.71
175 0.65
176 0.63
177 0.58
178 0.55
179 0.57
180 0.63
181 0.63
182 0.6
183 0.61
184 0.53
185 0.57
186 0.56
187 0.53
188 0.53
189 0.55
190 0.55
191 0.59
192 0.62
193 0.65
194 0.68
195 0.74
196 0.74
197 0.74
198 0.74
199 0.73
200 0.77
201 0.74
202 0.76
203 0.73
204 0.7
205 0.7
206 0.7
207 0.7
208 0.65
209 0.66
210 0.6
211 0.59
212 0.56
213 0.54
214 0.58
215 0.6
216 0.62
217 0.63
218 0.65
219 0.69
220 0.76
221 0.75
222 0.73
223 0.75
224 0.71
225 0.69
226 0.71
227 0.67
228 0.68
229 0.7
230 0.71
231 0.72
232 0.79
233 0.8
234 0.83
235 0.84
236 0.82
237 0.83
238 0.84
239 0.83
240 0.83
241 0.82
242 0.84
243 0.86
244 0.86
245 0.84
246 0.83
247 0.82
248 0.83
249 0.85
250 0.84
251 0.83
252 0.82
253 0.84
254 0.8
255 0.75
256 0.7
257 0.65
258 0.64
259 0.62
260 0.58
261 0.52
262 0.56
263 0.6
264 0.59
265 0.61
266 0.56
267 0.58
268 0.64
269 0.7
270 0.7
271 0.73
272 0.77
273 0.8
274 0.85
275 0.85
276 0.85
277 0.84
278 0.82
279 0.81
280 0.76
281 0.73
282 0.69
283 0.65
284 0.57
285 0.55
286 0.53
287 0.45
288 0.42
289 0.37
290 0.38
291 0.38
292 0.45
293 0.42
294 0.43
295 0.44
296 0.49
297 0.49
298 0.5
299 0.54
300 0.51
301 0.52
302 0.51
303 0.57
304 0.61
305 0.69
306 0.74
307 0.71
308 0.75
309 0.78
310 0.83
311 0.85
312 0.86
313 0.85
314 0.85
315 0.86