Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2G9Y0

Protein Details
Accession A0A1Y2G9Y0    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-325RSPSRSRSRSVSRSRSRSRSQSRSRSRSRSADRSRRSKSRGTSRSRSKSRSPSRSRSPHRDQHSYSAELSRRNRTDRTRDRSRSTSRSRSPDRKRRAYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
205-288AARREDGGKRSRSSSRSRSRSISRSPSRSRSRSVSRSRSRSRSQSRSRSRSRSADRSRRSKSRGTSRSRSKSRSPSRSRSPHRD
297-324SRRNRTDRTRDRSRSTSRSRSPDRKRRA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 15, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MAMDNKTVRDAIQIHGTDPQFLIEKILRTRIYESTYWKEHCFGLTESSIIEKAYELKYIGGQYGVQKPTEFICLVLKLLQIQPREEIVIKYITGLTESDNNKYLRALGAFYLRLVGKPVDIYNYLEPLLDDSRKLRKRGAGGYSIIHMDEFIDDLLREERVCDIVLPRLVKRHVLEDAGELDPRISTLEKLEMELEEERKAEEAAARREDGGKRSRSSSRSRSRSISRSPSRSRSRSVSRSRSRSRSQSRSRSRSRSADRSRRSKSRGTSRSRSKSRSPSRSRSPHRDQHSYSAELSRRNRTDRTRDRSRSTSRSRSPDRKRRAY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.33
3 0.33
4 0.29
5 0.27
6 0.26
7 0.19
8 0.19
9 0.23
10 0.19
11 0.24
12 0.25
13 0.32
14 0.32
15 0.32
16 0.36
17 0.36
18 0.38
19 0.37
20 0.41
21 0.41
22 0.46
23 0.47
24 0.45
25 0.43
26 0.38
27 0.36
28 0.33
29 0.27
30 0.25
31 0.22
32 0.21
33 0.19
34 0.2
35 0.19
36 0.15
37 0.13
38 0.09
39 0.12
40 0.13
41 0.15
42 0.13
43 0.14
44 0.16
45 0.17
46 0.17
47 0.13
48 0.14
49 0.16
50 0.24
51 0.25
52 0.23
53 0.22
54 0.23
55 0.23
56 0.26
57 0.21
58 0.14
59 0.16
60 0.16
61 0.17
62 0.17
63 0.16
64 0.14
65 0.18
66 0.22
67 0.2
68 0.2
69 0.21
70 0.21
71 0.23
72 0.22
73 0.18
74 0.16
75 0.16
76 0.14
77 0.14
78 0.13
79 0.11
80 0.11
81 0.1
82 0.09
83 0.15
84 0.16
85 0.18
86 0.22
87 0.23
88 0.22
89 0.22
90 0.21
91 0.16
92 0.15
93 0.14
94 0.1
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.15
99 0.13
100 0.12
101 0.14
102 0.12
103 0.09
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.12
108 0.15
109 0.14
110 0.15
111 0.14
112 0.13
113 0.13
114 0.12
115 0.14
116 0.11
117 0.11
118 0.13
119 0.23
120 0.27
121 0.29
122 0.3
123 0.32
124 0.36
125 0.42
126 0.43
127 0.38
128 0.34
129 0.33
130 0.31
131 0.27
132 0.22
133 0.15
134 0.11
135 0.07
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.09
152 0.11
153 0.12
154 0.12
155 0.15
156 0.16
157 0.19
158 0.18
159 0.19
160 0.18
161 0.17
162 0.17
163 0.15
164 0.17
165 0.15
166 0.14
167 0.11
168 0.1
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.12
179 0.11
180 0.12
181 0.14
182 0.14
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.09
189 0.1
190 0.15
191 0.18
192 0.2
193 0.21
194 0.21
195 0.25
196 0.27
197 0.29
198 0.31
199 0.31
200 0.31
201 0.35
202 0.41
203 0.42
204 0.48
205 0.54
206 0.57
207 0.59
208 0.62
209 0.64
210 0.65
211 0.68
212 0.68
213 0.68
214 0.66
215 0.68
216 0.7
217 0.73
218 0.76
219 0.72
220 0.69
221 0.66
222 0.67
223 0.68
224 0.71
225 0.72
226 0.73
227 0.78
228 0.82
229 0.82
230 0.8
231 0.81
232 0.81
233 0.8
234 0.81
235 0.82
236 0.85
237 0.86
238 0.88
239 0.86
240 0.84
241 0.83
242 0.81
243 0.81
244 0.82
245 0.82
246 0.82
247 0.84
248 0.85
249 0.84
250 0.81
251 0.78
252 0.76
253 0.77
254 0.77
255 0.77
256 0.79
257 0.8
258 0.85
259 0.86
260 0.83
261 0.81
262 0.83
263 0.84
264 0.85
265 0.84
266 0.83
267 0.85
268 0.89
269 0.89
270 0.88
271 0.87
272 0.85
273 0.84
274 0.84
275 0.77
276 0.76
277 0.72
278 0.65
279 0.58
280 0.56
281 0.52
282 0.5
283 0.51
284 0.52
285 0.52
286 0.54
287 0.6
288 0.61
289 0.69
290 0.71
291 0.75
292 0.76
293 0.79
294 0.81
295 0.83
296 0.83
297 0.82
298 0.82
299 0.83
300 0.81
301 0.83
302 0.86
303 0.87
304 0.89
305 0.89