FuNGI

A0A1Y2GHM0

Protein Details

Accession

A0A1Y2GHM0

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MSFLRSRPPIQTNRAQQRRA	Hydrophilic
79-99	FTAPVKLQRKRNETNHYYRGY	Hydrophilic
577-598	DLIVDLKKKLRKEPRNKNILAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
296-304	KERKKKRGK
425-453	KQKGKGKANAKAPLIAKKANAAKAATPNK
583-591	KKKLRKEPR

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSFLRSRPPIQTNRAQQRRALGAGTGVGTGPTIKRKIEKPAPQAIPENHTDYKLVSTSRDVLHHVMRFHGTKEVDPSTFTAPVKLQRKRNETNHYYRGYNYQNKYNNQNNKTGDDKKDGATTGAGGGANGGTPGAPSTGPTTGADTSLIAPYSGAKRTRQIYIANEEERKKKEIEAAPWVIEDYDSKNNWTGQLEGGQHANYVLFVFSDDGFKVVPADKWYKFSPKIPYTTLTAEEAEEQYQKSQKQNNNIRWLMRSKNKTKAEDGEEGVEEDAGHEQLMTVDHEDDVGYDEDEAKERKKKRGKHGDVDEMDFDEVWQDDEEMPAEMPGFEDDAKDDSRRNQGPSMDSDEDEDEEDDRGRLTETGKAVKKALLKLQKNKVYASDDDKDPYASDKDSSDSDLDEVDKEKEMKKEDESNPLSQETAKQKGKGKANAKAPLIAKKANAAKAATPNKPVTAKAVKTKVPMPTPRNVNASANVKTGALSSQSPKLPSNGIASSPAAAGVVEKKRKKMGDANEAADDGPSRKQPRSNELAPSAPSSSANAPADTGAPGDDSMLITEAEVIALLKSRPQVTTRDLIVDLKKKLRKEPRNKNILAAIVKKVATPHDGILVLKEGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.8
2	0.75
3	0.69
4	0.68
5	0.66
6	0.58
7	0.49
8	0.38
9	0.3
10	0.29
11	0.27
12	0.2
13	0.14
14	0.11
15	0.1
16	0.11
17	0.13
18	0.18
19	0.2
20	0.23
21	0.29
22	0.34
23	0.45
24	0.53
25	0.6
26	0.61
27	0.68
28	0.7
29	0.69
30	0.72
31	0.65
32	0.6
33	0.54
34	0.53
35	0.44
36	0.4
37	0.36
38	0.29
39	0.29
40	0.27
41	0.24
42	0.2
43	0.22
44	0.26
45	0.28
46	0.29
47	0.28
48	0.29
49	0.35
50	0.36
51	0.33
52	0.32
53	0.34
54	0.33
55	0.31
56	0.34
57	0.29
58	0.27
59	0.33
60	0.34
61	0.29
62	0.29
63	0.31
64	0.28
65	0.31
66	0.29
67	0.26
68	0.25
69	0.33
70	0.41
71	0.46
72	0.51
73	0.56
74	0.65
75	0.71
76	0.78
77	0.79
78	0.79
79	0.81
80	0.81
81	0.75
82	0.68
83	0.6
84	0.58
85	0.57
86	0.57
87	0.51
88	0.52
89	0.56
90	0.59
91	0.65
92	0.67
93	0.69
94	0.63
95	0.67
96	0.61
97	0.58
98	0.61
99	0.6
100	0.55
101	0.52
102	0.5
103	0.44
104	0.44
105	0.4
106	0.33
107	0.26
108	0.22
109	0.16
110	0.16
111	0.13
112	0.09
113	0.09
114	0.08
115	0.07
116	0.06
117	0.06
118	0.03
119	0.03
120	0.04
121	0.05
122	0.05
123	0.06
124	0.09
125	0.1
126	0.12
127	0.13
128	0.15
129	0.15
130	0.16
131	0.15
132	0.13
133	0.13
134	0.13
135	0.12
136	0.09
137	0.08
138	0.11
139	0.14
140	0.18
141	0.2
142	0.2
143	0.26
144	0.29
145	0.32
146	0.33
147	0.35
148	0.34
149	0.39
150	0.43
151	0.42
152	0.45
153	0.46
154	0.49
155	0.47
156	0.45
157	0.39
158	0.35
159	0.39
160	0.39
161	0.4
162	0.42
163	0.42
164	0.4
165	0.38
166	0.37
167	0.28
168	0.22
169	0.18
170	0.13
171	0.17
172	0.17
173	0.18
174	0.2
175	0.21
176	0.23
177	0.23
178	0.19
179	0.14
180	0.19
181	0.19
182	0.17
183	0.18
184	0.16
185	0.15
186	0.14
187	0.12
188	0.07
189	0.06
190	0.05
191	0.04
192	0.04
193	0.06
194	0.06
195	0.07
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.07
200	0.08
201	0.08
202	0.1
203	0.13
204	0.19
205	0.19
206	0.23
207	0.25
208	0.31
209	0.33
210	0.36
211	0.42
212	0.41
213	0.44
214	0.43
215	0.42
216	0.39
217	0.38
218	0.34
219	0.26
220	0.22
221	0.18
222	0.17
223	0.16
224	0.14
225	0.13
226	0.11
227	0.12
228	0.15
229	0.17
230	0.21
231	0.28
232	0.31
233	0.4
234	0.5
235	0.55
236	0.61
237	0.61
238	0.57
239	0.53
240	0.53
241	0.5
242	0.48
243	0.49
244	0.46
245	0.53
246	0.58
247	0.57
248	0.57
249	0.56
250	0.53
251	0.49
252	0.44
253	0.36
254	0.29
255	0.27
256	0.23
257	0.17
258	0.11
259	0.07
260	0.06
261	0.05
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.07
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.08
281	0.09
282	0.1
283	0.17
284	0.21
285	0.3
286	0.37
287	0.45
288	0.55
289	0.66
290	0.71
291	0.73
292	0.76
293	0.76
294	0.7
295	0.64
296	0.53
297	0.42
298	0.34
299	0.24
300	0.17
301	0.08
302	0.06
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.06
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.05
317	0.04
318	0.05
319	0.05
320	0.07
321	0.08
322	0.09
323	0.1
324	0.13
325	0.2
326	0.23
327	0.24
328	0.26
329	0.27
330	0.28
331	0.3
332	0.34
333	0.28
334	0.26
335	0.24
336	0.22
337	0.2
338	0.18
339	0.15
340	0.09
341	0.08
342	0.08
343	0.07
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.07
348	0.07
349	0.11
350	0.13
351	0.2
352	0.22
353	0.24
354	0.24
355	0.26
356	0.29
357	0.28
358	0.34
359	0.36
360	0.41
361	0.48
362	0.57
363	0.6
364	0.58
365	0.55
366	0.52
367	0.46
368	0.42
369	0.4
370	0.34
371	0.29
372	0.29
373	0.28
374	0.25
375	0.21
376	0.21
377	0.16
378	0.13
379	0.12
380	0.12
381	0.13
382	0.13
383	0.15
384	0.13
385	0.12
386	0.11
387	0.11
388	0.11
389	0.1
390	0.11
391	0.1
392	0.11
393	0.12
394	0.15
395	0.19
396	0.22
397	0.24
398	0.27
399	0.35
400	0.36
401	0.45
402	0.45
403	0.44
404	0.42
405	0.4
406	0.36
407	0.27
408	0.31
409	0.26
410	0.31
411	0.32
412	0.35
413	0.42
414	0.49
415	0.57
416	0.59
417	0.6
418	0.59
419	0.64
420	0.66
421	0.6
422	0.58
423	0.52
424	0.51
425	0.48
426	0.42
427	0.35
428	0.34
429	0.38
430	0.37
431	0.37
432	0.3
433	0.3
434	0.37
435	0.44
436	0.4
437	0.4
438	0.38
439	0.39
440	0.39
441	0.36
442	0.34
443	0.35
444	0.36
445	0.39
446	0.44
447	0.43
448	0.45
449	0.49
450	0.48
451	0.48
452	0.54
453	0.5
454	0.52
455	0.55
456	0.57
457	0.57
458	0.53
459	0.47
460	0.44
461	0.45
462	0.39
463	0.34
464	0.3
465	0.26
466	0.23
467	0.21
468	0.16
469	0.13
470	0.13
471	0.15
472	0.2
473	0.22
474	0.24
475	0.25
476	0.26
477	0.26
478	0.26
479	0.28
480	0.24
481	0.23
482	0.23
483	0.22
484	0.21
485	0.19
486	0.16
487	0.11
488	0.09
489	0.09
490	0.13
491	0.21
492	0.29
493	0.32
494	0.36
495	0.43
496	0.45
497	0.5
498	0.52
499	0.53
500	0.56
501	0.59
502	0.58
503	0.53
504	0.52
505	0.46
506	0.37
507	0.29
508	0.19
509	0.17
510	0.2
511	0.23
512	0.26
513	0.32
514	0.38
515	0.45
516	0.52
517	0.54
518	0.54
519	0.54
520	0.55
521	0.5
522	0.48
523	0.41
524	0.33
525	0.29
526	0.24
527	0.22
528	0.25
529	0.25
530	0.22
531	0.2
532	0.2
533	0.2
534	0.18
535	0.16
536	0.09
537	0.09
538	0.08
539	0.08
540	0.08
541	0.08
542	0.08
543	0.09
544	0.08
545	0.07
546	0.08
547	0.07
548	0.06
549	0.06
550	0.05
551	0.05
552	0.07
553	0.07
554	0.1
555	0.14
556	0.16
557	0.18
558	0.21
559	0.26
560	0.3
561	0.36
562	0.35
563	0.35
564	0.35
565	0.37
566	0.43
567	0.45
568	0.45
569	0.48
570	0.51
571	0.52
572	0.6
573	0.66
574	0.7
575	0.74
576	0.79
577	0.81
578	0.87
579	0.84
580	0.79
581	0.73
582	0.69
583	0.65
584	0.58
585	0.51
586	0.45
587	0.44
588	0.4
589	0.36
590	0.32
591	0.29
592	0.27
593	0.24
594	0.25
595	0.26
596	0.25
597	0.25

A0A1Y2GHM0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer