Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y2GHI9

Protein Details
Accession A0A1Y2GHI9    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
159-178EDGRRSPSPRPAPRPAPRPABasic
531-550KEYQEMKQKQQKQRAERRGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
167-172PRPAPR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 15, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00478  LIM_DOMAIN_1  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
CDD cd08368  LIM  
Amino Acid Sequences MEDLMQEIKVRPTVSRKPVLPPRPQVSETSQTEYIRVITPQPPVTVADEDQNTDALPMTQPSNDDRVLCVADDRNLTATKLTPNQVQPSKVERRSASTQTSVFLTPEQLQQLQLQLLQQQQQQQQQMKTAVRQSLDADSSPTLTLTSQPKTLAVPRSAEDGRRSPSPRPAPRPAPRPAHTLTTGSTSRQTQTLTKPEPTHKTAIHQTDAVERSTSPIPSRSTIKATRSHSGTSIQTKAELTKSSVTSTTPLPLQPRPIRAAATDTAADKSPKVGSVTPPPLNQDPPSGRWPGYHAHWFGNKFPIAFASGFTSDDKSASIEASTAAVARRSDSALTNPTSPPVLKQRPTRRADMENIPGNDENNRDNSNSSHEIVQCRVGRRLAEYDDEVKNNRLRTSAPSSSSSPSPSPSPAPPSYRSYRRTENETASGDSQPQSPAASRPAYRSHDSIQTSPLPLLDTSKNSRQSEDGRNPSPPAPEQPNMARRSTDRWHLRLFRRSNNKEKEQKENDFSKVQEEGDEDQTQELEKGNEKEYQEMKQKQQKQRAERRGFISGRIKSSERSNGTERDDSVDDYHSRDEGVSEDSPSNERFRRSNNASDSNNSSNNGSNNRINRNSSNDNINSRGRESSSGNNNRNNKNSTNDNSSHSNRASNHDNNNHSGRNSNKSCNSGVEEDNYDHNFDQSYEQVTIRDCNRSSSSNRLSDSSRALSTHSRSTNGRNGPTLERCADCDEDILPSEMADSIKMAFSSYHGECLKCAQCRMPIESSLDCHEYEGRIFCERDFAKLLQQEVLRPQRLRICAGCEGPIQQTERTVFALDKPWHEHHLCCYHCLKPLRVSHVEKNGRVYCPKDYGELFLPKCNACGLRIESQAVSAQDGKLRANGMLIASDVRRARDHSQIRILCL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.54
3 0.54
4 0.6
5 0.7
6 0.75
7 0.75
8 0.75
9 0.73
10 0.72
11 0.71
12 0.66
13 0.63
14 0.63
15 0.58
16 0.55
17 0.53
18 0.46
19 0.45
20 0.41
21 0.36
22 0.28
23 0.26
24 0.24
25 0.23
26 0.29
27 0.31
28 0.31
29 0.3
30 0.3
31 0.32
32 0.31
33 0.28
34 0.28
35 0.26
36 0.27
37 0.26
38 0.24
39 0.2
40 0.17
41 0.16
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.13
47 0.15
48 0.18
49 0.22
50 0.23
51 0.23
52 0.22
53 0.24
54 0.24
55 0.22
56 0.23
57 0.2
58 0.22
59 0.23
60 0.23
61 0.23
62 0.23
63 0.23
64 0.21
65 0.21
66 0.24
67 0.28
68 0.3
69 0.33
70 0.38
71 0.46
72 0.5
73 0.5
74 0.48
75 0.51
76 0.58
77 0.56
78 0.58
79 0.51
80 0.53
81 0.58
82 0.6
83 0.56
84 0.51
85 0.47
86 0.42
87 0.42
88 0.36
89 0.3
90 0.24
91 0.22
92 0.19
93 0.21
94 0.23
95 0.21
96 0.21
97 0.22
98 0.23
99 0.21
100 0.2
101 0.17
102 0.18
103 0.21
104 0.24
105 0.26
106 0.31
107 0.35
108 0.41
109 0.47
110 0.5
111 0.49
112 0.5
113 0.54
114 0.5
115 0.49
116 0.49
117 0.46
118 0.4
119 0.39
120 0.35
121 0.34
122 0.32
123 0.28
124 0.24
125 0.2
126 0.21
127 0.2
128 0.17
129 0.12
130 0.11
131 0.16
132 0.19
133 0.21
134 0.22
135 0.22
136 0.23
137 0.26
138 0.31
139 0.33
140 0.3
141 0.3
142 0.29
143 0.35
144 0.36
145 0.37
146 0.36
147 0.34
148 0.35
149 0.4
150 0.42
151 0.4
152 0.48
153 0.55
154 0.6
155 0.63
156 0.68
157 0.71
158 0.77
159 0.8
160 0.78
161 0.77
162 0.7
163 0.68
164 0.62
165 0.57
166 0.51
167 0.45
168 0.38
169 0.35
170 0.33
171 0.28
172 0.29
173 0.25
174 0.24
175 0.24
176 0.26
177 0.25
178 0.31
179 0.39
180 0.4
181 0.44
182 0.48
183 0.53
184 0.58
185 0.57
186 0.55
187 0.47
188 0.49
189 0.51
190 0.5
191 0.45
192 0.39
193 0.36
194 0.38
195 0.38
196 0.33
197 0.25
198 0.2
199 0.21
200 0.22
201 0.23
202 0.17
203 0.21
204 0.22
205 0.25
206 0.3
207 0.29
208 0.34
209 0.38
210 0.41
211 0.44
212 0.46
213 0.49
214 0.48
215 0.46
216 0.41
217 0.39
218 0.39
219 0.37
220 0.35
221 0.29
222 0.28
223 0.27
224 0.27
225 0.26
226 0.23
227 0.2
228 0.22
229 0.22
230 0.23
231 0.23
232 0.21
233 0.2
234 0.2
235 0.19
236 0.16
237 0.17
238 0.2
239 0.21
240 0.29
241 0.32
242 0.36
243 0.37
244 0.37
245 0.36
246 0.32
247 0.35
248 0.26
249 0.24
250 0.21
251 0.18
252 0.18
253 0.18
254 0.18
255 0.13
256 0.14
257 0.13
258 0.13
259 0.15
260 0.16
261 0.18
262 0.27
263 0.34
264 0.35
265 0.36
266 0.38
267 0.38
268 0.38
269 0.36
270 0.34
271 0.3
272 0.31
273 0.33
274 0.32
275 0.3
276 0.28
277 0.29
278 0.26
279 0.27
280 0.29
281 0.27
282 0.29
283 0.33
284 0.34
285 0.34
286 0.36
287 0.33
288 0.26
289 0.24
290 0.21
291 0.19
292 0.17
293 0.16
294 0.13
295 0.13
296 0.14
297 0.14
298 0.15
299 0.13
300 0.13
301 0.13
302 0.1
303 0.1
304 0.09
305 0.08
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.08
313 0.08
314 0.09
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.14
320 0.17
321 0.18
322 0.2
323 0.19
324 0.19
325 0.19
326 0.18
327 0.18
328 0.23
329 0.29
330 0.32
331 0.42
332 0.52
333 0.6
334 0.64
335 0.66
336 0.61
337 0.59
338 0.59
339 0.55
340 0.51
341 0.47
342 0.44
343 0.41
344 0.36
345 0.32
346 0.28
347 0.24
348 0.18
349 0.15
350 0.16
351 0.15
352 0.15
353 0.16
354 0.2
355 0.21
356 0.21
357 0.22
358 0.22
359 0.23
360 0.23
361 0.29
362 0.26
363 0.25
364 0.26
365 0.25
366 0.23
367 0.24
368 0.26
369 0.21
370 0.2
371 0.2
372 0.22
373 0.23
374 0.24
375 0.22
376 0.22
377 0.23
378 0.23
379 0.21
380 0.18
381 0.17
382 0.22
383 0.28
384 0.29
385 0.29
386 0.31
387 0.32
388 0.33
389 0.33
390 0.3
391 0.23
392 0.2
393 0.19
394 0.18
395 0.18
396 0.18
397 0.23
398 0.24
399 0.28
400 0.3
401 0.34
402 0.38
403 0.43
404 0.46
405 0.45
406 0.49
407 0.48
408 0.52
409 0.51
410 0.48
411 0.44
412 0.42
413 0.38
414 0.31
415 0.29
416 0.23
417 0.19
418 0.16
419 0.12
420 0.11
421 0.1
422 0.09
423 0.1
424 0.12
425 0.14
426 0.14
427 0.17
428 0.23
429 0.27
430 0.28
431 0.29
432 0.28
433 0.32
434 0.33
435 0.3
436 0.27
437 0.24
438 0.23
439 0.2
440 0.18
441 0.13
442 0.11
443 0.13
444 0.11
445 0.13
446 0.17
447 0.23
448 0.3
449 0.29
450 0.3
451 0.3
452 0.34
453 0.4
454 0.45
455 0.45
456 0.39
457 0.4
458 0.41
459 0.4
460 0.36
461 0.28
462 0.24
463 0.24
464 0.23
465 0.24
466 0.28
467 0.34
468 0.34
469 0.34
470 0.31
471 0.26
472 0.32
473 0.32
474 0.35
475 0.34
476 0.35
477 0.4
478 0.47
479 0.52
480 0.55
481 0.57
482 0.56
483 0.61
484 0.65
485 0.69
486 0.69
487 0.71
488 0.71
489 0.7
490 0.71
491 0.68
492 0.67
493 0.63
494 0.59
495 0.54
496 0.47
497 0.44
498 0.36
499 0.3
500 0.25
501 0.19
502 0.17
503 0.16
504 0.18
505 0.18
506 0.16
507 0.14
508 0.14
509 0.13
510 0.11
511 0.1
512 0.07
513 0.1
514 0.12
515 0.14
516 0.18
517 0.18
518 0.23
519 0.24
520 0.28
521 0.34
522 0.37
523 0.43
524 0.48
525 0.57
526 0.6
527 0.68
528 0.7
529 0.71
530 0.77
531 0.81
532 0.79
533 0.74
534 0.7
535 0.69
536 0.62
537 0.57
538 0.55
539 0.47
540 0.43
541 0.41
542 0.38
543 0.31
544 0.36
545 0.37
546 0.32
547 0.34
548 0.35
549 0.36
550 0.39
551 0.4
552 0.36
553 0.32
554 0.29
555 0.26
556 0.23
557 0.22
558 0.18
559 0.18
560 0.18
561 0.14
562 0.13
563 0.12
564 0.11
565 0.09
566 0.12
567 0.11
568 0.12
569 0.12
570 0.13
571 0.15
572 0.16
573 0.19
574 0.18
575 0.2
576 0.21
577 0.25
578 0.34
579 0.37
580 0.44
581 0.46
582 0.51
583 0.5
584 0.51
585 0.53
586 0.47
587 0.44
588 0.37
589 0.31
590 0.26
591 0.28
592 0.28
593 0.26
594 0.27
595 0.31
596 0.37
597 0.39
598 0.4
599 0.4
600 0.44
601 0.45
602 0.42
603 0.44
604 0.41
605 0.4
606 0.41
607 0.41
608 0.35
609 0.32
610 0.31
611 0.25
612 0.25
613 0.25
614 0.28
615 0.35
616 0.43
617 0.47
618 0.53
619 0.59
620 0.61
621 0.64
622 0.61
623 0.53
624 0.49
625 0.51
626 0.49
627 0.49
628 0.46
629 0.44
630 0.46
631 0.46
632 0.47
633 0.4
634 0.4
635 0.34
636 0.37
637 0.41
638 0.4
639 0.45
640 0.47
641 0.5
642 0.49
643 0.52
644 0.49
645 0.42
646 0.41
647 0.37
648 0.39
649 0.41
650 0.43
651 0.43
652 0.44
653 0.45
654 0.43
655 0.43
656 0.37
657 0.34
658 0.3
659 0.28
660 0.26
661 0.29
662 0.26
663 0.24
664 0.2
665 0.19
666 0.16
667 0.14
668 0.15
669 0.13
670 0.15
671 0.15
672 0.15
673 0.16
674 0.17
675 0.2
676 0.21
677 0.26
678 0.23
679 0.26
680 0.29
681 0.32
682 0.35
683 0.4
684 0.45
685 0.44
686 0.45
687 0.43
688 0.43
689 0.42
690 0.43
691 0.36
692 0.3
693 0.25
694 0.26
695 0.3
696 0.31
697 0.35
698 0.32
699 0.33
700 0.34
701 0.4
702 0.45
703 0.46
704 0.45
705 0.4
706 0.42
707 0.45
708 0.47
709 0.45
710 0.39
711 0.34
712 0.33
713 0.34
714 0.32
715 0.26
716 0.23
717 0.19
718 0.17
719 0.17
720 0.17
721 0.13
722 0.1
723 0.1
724 0.11
725 0.1
726 0.09
727 0.08
728 0.07
729 0.08
730 0.09
731 0.09
732 0.07
733 0.09
734 0.15
735 0.15
736 0.21
737 0.22
738 0.22
739 0.22
740 0.29
741 0.34
742 0.31
743 0.33
744 0.3
745 0.35
746 0.39
747 0.44
748 0.41
749 0.38
750 0.39
751 0.39
752 0.37
753 0.35
754 0.32
755 0.27
756 0.25
757 0.23
758 0.2
759 0.2
760 0.21
761 0.19
762 0.22
763 0.23
764 0.21
765 0.29
766 0.28
767 0.29
768 0.31
769 0.29
770 0.32
771 0.34
772 0.36
773 0.32
774 0.33
775 0.32
776 0.37
777 0.44
778 0.43
779 0.41
780 0.44
781 0.46
782 0.48
783 0.5
784 0.44
785 0.41
786 0.41
787 0.42
788 0.4
789 0.34
790 0.33
791 0.31
792 0.32
793 0.29
794 0.24
795 0.26
796 0.25
797 0.25
798 0.24
799 0.23
800 0.2
801 0.2
802 0.29
803 0.27
804 0.31
805 0.35
806 0.38
807 0.43
808 0.44
809 0.43
810 0.42
811 0.49
812 0.45
813 0.44
814 0.44
815 0.41
816 0.47
817 0.51
818 0.47
819 0.46
820 0.52
821 0.56
822 0.61
823 0.65
824 0.65
825 0.7
826 0.73
827 0.67
828 0.68
829 0.65
830 0.62
831 0.6
832 0.55
833 0.5
834 0.49
835 0.48
836 0.44
837 0.39
838 0.39
839 0.41
840 0.47
841 0.42
842 0.41
843 0.43
844 0.38
845 0.38
846 0.37
847 0.32
848 0.24
849 0.3
850 0.29
851 0.33
852 0.35
853 0.37
854 0.33
855 0.33
856 0.35
857 0.29
858 0.27
859 0.22
860 0.21
861 0.22
862 0.24
863 0.23
864 0.22
865 0.23
866 0.2
867 0.18
868 0.19
869 0.16
870 0.15
871 0.14
872 0.15
873 0.14
874 0.2
875 0.2
876 0.21
877 0.23
878 0.28
879 0.31
880 0.38
881 0.45
882 0.47
883 0.56