FuNGI

A0A1Y2GIS4

Protein Details

Accession

A0A1Y2GIS4

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
80-100	TTSATPKTTRARQSRAKKAAD	Hydrophilic
183-208	ESEPVRLQRPKREAKKKKDENFSYEN	Hydrophilic
211-239	QSGSESERRRSRPRSRSRSSTRKARVERA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
191-200	RPKREAKKKK
218-235	RRRSRPRSRSRSSTRKAR

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 10, plas 4, cyto 3.5, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR044780 Heh2/Src1 IPR011015 LEM/LEM-like_dom_sf IPR041885 MAN1_winged_helix_dom IPR018996 MSC
Gene Ontology	GO:0005637 C:nuclear inner membrane GO:0003682 F:chromatin binding
Pfam	View protein in Pfam PF09402 MSC
CDD	cd12935 LEM_like

Amino Acid Sequences

MASTESTHYLHPDFDVTKITMNQIREILSEHHVKLPTGMVKKQQLIDLFNQHIRPQVPEINESDTSDSDRETKATSKATTTSATPKTTRARQSRAKKAADDDADDEDNETPPSMASASTRKKRIASKAKVDNDEPAQAEVKPRLKRSTSRARATTEKNNVESKMEEPSRGRNIQRTVTQSEDESEPVRLQRPKREAKKKKDENFSYENPFQSGSESERRRSRPRSRSRSSTRKARVERADAMENVFKVPAQPQFSRFMRTPEPDKSESSHSRTKPAATSATTTTTTTTTTSAAEDKKTAKAHSTPKKVSTDGLPTPKHRDMASTLDFIDQDFVKTLRQNVGPISLVLAIVLLAYGIWLRQKRIEIGFCTEAELEPTVRPWYYPTCIPCPDRATCLRSDEKPICPPEYILKPQLLSFGNLFPITPVCVLNKAKGYRAFQVADAAEKLLHLHAGNIECSLLRDKAAPDSMEYKARRGLSVDELRFHVEQLKDSNVSDEEFSEYWNIAVKELRRRSNKVVFEEGLASEERIRSLKPQKSLGCRLRQVLVRWIIKFRLFFLAVLLTVAGGFGVRAYILRRRKEVRIVNGLVQNVLSKLSDQAHYYYVDPVIYPEPYLPQTQLRDALLSDVHSASRRQEIWSQVQAVVERNSNVRTSTQEVRGEMHRVWEWVGASGMLGQHGGGPSAVASGVERGRGRNQRGATVPEVEMQEPIGRGIRARGVPKVPPRTGPHGSFFGMRRQDSEYLNPENSLYPSLSQDYPSE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.24
3	0.21
4	0.25
5	0.25
6	0.3
7	0.29
8	0.3
9	0.32
10	0.3
11	0.3
12	0.27
13	0.29
14	0.27
15	0.27
16	0.32
17	0.3
18	0.34
19	0.34
20	0.33
21	0.31
22	0.34
23	0.37
24	0.36
25	0.38
26	0.4
27	0.46
28	0.51
29	0.51
30	0.5
31	0.46
32	0.45
33	0.47
34	0.47
35	0.45
36	0.45
37	0.44
38	0.41
39	0.42
40	0.39
41	0.36
42	0.34
43	0.35
44	0.33
45	0.35
46	0.37
47	0.37
48	0.37
49	0.35
50	0.32
51	0.27
52	0.27
53	0.24
54	0.23
55	0.2
56	0.2
57	0.2
58	0.2
59	0.23
60	0.25
61	0.29
62	0.3
63	0.3
64	0.32
65	0.33
66	0.32
67	0.32
68	0.36
69	0.36
70	0.39
71	0.37
72	0.42
73	0.47
74	0.54
75	0.6
76	0.6
77	0.64
78	0.69
79	0.78
80	0.82
81	0.83
82	0.8
83	0.74
84	0.7
85	0.7
86	0.63
87	0.57
88	0.48
89	0.44
90	0.39
91	0.35
92	0.31
93	0.23
94	0.2
95	0.17
96	0.14
97	0.1
98	0.08
99	0.09
100	0.08
101	0.08
102	0.1
103	0.19
104	0.29
105	0.36
106	0.41
107	0.44
108	0.49
109	0.57
110	0.65
111	0.66
112	0.67
113	0.69
114	0.75
115	0.79
116	0.78
117	0.71
118	0.66
119	0.58
120	0.53
121	0.44
122	0.35
123	0.29
124	0.25
125	0.27
126	0.28
127	0.33
128	0.34
129	0.37
130	0.42
131	0.46
132	0.53
133	0.58
134	0.62
135	0.65
136	0.68
137	0.68
138	0.66
139	0.69
140	0.69
141	0.7
142	0.68
143	0.64
144	0.59
145	0.58
146	0.54
147	0.48
148	0.43
149	0.34
150	0.33
151	0.29
152	0.29
153	0.27
154	0.33
155	0.39
156	0.42
157	0.44
158	0.42
159	0.46
160	0.48
161	0.51
162	0.49
163	0.46
164	0.44
165	0.43
166	0.36
167	0.34
168	0.3
169	0.26
170	0.21
171	0.18
172	0.16
173	0.17
174	0.23
175	0.26
176	0.29
177	0.37
178	0.45
179	0.54
180	0.64
181	0.73
182	0.78
183	0.83
184	0.89
185	0.91
186	0.9
187	0.91
188	0.86
189	0.82
190	0.79
191	0.73
192	0.7
193	0.62
194	0.54
195	0.44
196	0.38
197	0.31
198	0.25
199	0.22
200	0.19
201	0.25
202	0.27
203	0.32
204	0.39
205	0.45
206	0.52
207	0.6
208	0.66
209	0.67
210	0.76
211	0.8
212	0.81
213	0.85
214	0.87
215	0.88
216	0.85
217	0.85
218	0.83
219	0.82
220	0.8
221	0.79
222	0.75
223	0.7
224	0.68
225	0.62
226	0.57
227	0.47
228	0.44
229	0.37
230	0.3
231	0.25
232	0.19
233	0.14
234	0.11
235	0.13
236	0.16
237	0.19
238	0.21
239	0.23
240	0.3
241	0.32
242	0.35
243	0.33
244	0.33
245	0.33
246	0.36
247	0.39
248	0.38
249	0.43
250	0.42
251	0.42
252	0.4
253	0.43
254	0.44
255	0.44
256	0.46
257	0.4
258	0.43
259	0.43
260	0.42
261	0.36
262	0.34
263	0.32
264	0.26
265	0.27
266	0.24
267	0.26
268	0.25
269	0.22
270	0.2
271	0.17
272	0.16
273	0.14
274	0.13
275	0.1
276	0.1
277	0.11
278	0.14
279	0.15
280	0.15
281	0.16
282	0.18
283	0.22
284	0.23
285	0.23
286	0.23
287	0.28
288	0.37
289	0.44
290	0.51
291	0.49
292	0.53
293	0.56
294	0.53
295	0.47
296	0.41
297	0.38
298	0.35
299	0.39
300	0.36
301	0.35
302	0.42
303	0.42
304	0.4
305	0.33
306	0.3
307	0.26
308	0.3
309	0.3
310	0.24
311	0.22
312	0.21
313	0.21
314	0.19
315	0.17
316	0.1
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.1
322	0.11
323	0.14
324	0.14
325	0.15
326	0.15
327	0.17
328	0.15
329	0.14
330	0.14
331	0.1
332	0.09
333	0.08
334	0.07
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.02
339	0.02
340	0.02
341	0.02
342	0.02
343	0.05
344	0.06
345	0.08
346	0.1
347	0.11
348	0.14
349	0.18
350	0.21
351	0.19
352	0.23
353	0.24
354	0.22
355	0.22
356	0.2
357	0.16
358	0.14
359	0.13
360	0.09
361	0.07
362	0.08
363	0.08
364	0.07
365	0.08
366	0.09
367	0.11
368	0.12
369	0.16
370	0.18
371	0.21
372	0.26
373	0.27
374	0.29
375	0.3
376	0.29
377	0.3
378	0.31
379	0.29
380	0.27
381	0.3
382	0.3
383	0.27
384	0.33
385	0.32
386	0.32
387	0.35
388	0.35
389	0.32
390	0.29
391	0.29
392	0.27
393	0.29
394	0.29
395	0.25
396	0.24
397	0.22
398	0.22
399	0.26
400	0.21
401	0.17
402	0.15
403	0.14
404	0.14
405	0.13
406	0.13
407	0.09
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.08
412	0.07
413	0.13
414	0.13
415	0.16
416	0.21
417	0.21
418	0.25
419	0.29
420	0.31
421	0.29
422	0.32
423	0.31
424	0.25
425	0.28
426	0.24
427	0.2
428	0.17
429	0.14
430	0.1
431	0.09
432	0.09
433	0.06
434	0.07
435	0.05
436	0.06
437	0.08
438	0.09
439	0.09
440	0.09
441	0.09
442	0.08
443	0.09
444	0.11
445	0.09
446	0.08
447	0.1
448	0.1
449	0.13
450	0.16
451	0.15
452	0.14
453	0.17
454	0.19
455	0.25
456	0.25
457	0.23
458	0.25
459	0.26
460	0.25
461	0.23
462	0.24
463	0.24
464	0.32
465	0.31
466	0.29
467	0.29
468	0.31
469	0.3
470	0.28
471	0.24
472	0.17
473	0.18
474	0.19
475	0.2
476	0.19
477	0.19
478	0.2
479	0.16
480	0.16
481	0.14
482	0.12
483	0.12
484	0.11
485	0.12
486	0.11
487	0.1
488	0.09
489	0.13
490	0.12
491	0.1
492	0.13
493	0.16
494	0.25
495	0.32
496	0.4
497	0.43
498	0.48
499	0.56
500	0.62
501	0.64
502	0.59
503	0.59
504	0.51
505	0.46
506	0.42
507	0.34
508	0.27
509	0.21
510	0.16
511	0.11
512	0.11
513	0.11
514	0.1
515	0.11
516	0.17
517	0.26
518	0.31
519	0.34
520	0.42
521	0.47
522	0.54
523	0.64
524	0.64
525	0.63
526	0.61
527	0.59
528	0.57
529	0.55
530	0.5
531	0.48
532	0.48
533	0.44
534	0.42
535	0.43
536	0.41
537	0.39
538	0.37
539	0.3
540	0.28
541	0.24
542	0.23
543	0.21
544	0.19
545	0.16
546	0.16
547	0.13
548	0.07
549	0.06
550	0.06
551	0.04
552	0.03
553	0.02
554	0.02
555	0.02
556	0.02
557	0.04
558	0.06
559	0.15
560	0.23
561	0.27
562	0.34
563	0.38
564	0.44
565	0.53
566	0.58
567	0.58
568	0.6
569	0.59
570	0.58
571	0.57
572	0.52
573	0.43
574	0.35
575	0.27
576	0.18
577	0.16
578	0.11
579	0.07
580	0.1
581	0.12
582	0.14
583	0.15
584	0.17
585	0.18
586	0.19
587	0.19
588	0.18
589	0.17
590	0.15
591	0.13
592	0.14
593	0.14
594	0.13
595	0.13
596	0.11
597	0.14
598	0.15
599	0.17
600	0.17
601	0.2
602	0.23
603	0.25
604	0.28
605	0.25
606	0.24
607	0.23
608	0.23
609	0.18
610	0.16
611	0.16
612	0.13
613	0.14
614	0.14
615	0.16
616	0.16
617	0.22
618	0.21
619	0.23
620	0.27
621	0.32
622	0.38
623	0.42
624	0.42
625	0.37
626	0.38
627	0.36
628	0.34
629	0.31
630	0.26
631	0.22
632	0.22
633	0.22
634	0.22
635	0.22
636	0.2
637	0.21
638	0.25
639	0.3
640	0.34
641	0.37
642	0.37
643	0.38
644	0.4
645	0.4
646	0.35
647	0.33
648	0.28
649	0.25
650	0.25
651	0.24
652	0.21
653	0.19
654	0.19
655	0.13
656	0.12
657	0.12
658	0.11
659	0.09
660	0.08
661	0.07
662	0.08
663	0.09
664	0.09
665	0.07
666	0.07
667	0.07
668	0.07
669	0.07
670	0.05
671	0.06
672	0.09
673	0.11
674	0.16
675	0.17
676	0.2
677	0.29
678	0.38
679	0.43
680	0.46
681	0.48
682	0.49
683	0.53
684	0.55
685	0.5
686	0.45
687	0.41
688	0.37
689	0.37
690	0.31
691	0.26
692	0.22
693	0.21
694	0.17
695	0.18
696	0.17
697	0.15
698	0.15
699	0.18
700	0.24
701	0.27
702	0.3
703	0.35
704	0.37
705	0.45
706	0.54
707	0.6
708	0.57
709	0.59
710	0.63
711	0.65
712	0.67
713	0.63
714	0.59
715	0.54
716	0.52
717	0.5
718	0.45
719	0.46
720	0.46
721	0.42
722	0.39
723	0.4
724	0.43
725	0.41
726	0.46
727	0.44
728	0.43
729	0.43
730	0.41
731	0.37
732	0.35
733	0.33
734	0.28
735	0.23
736	0.18
737	0.21
738	0.24
739	0.24

A0A1Y2GIS4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer