Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2GJ06

Protein Details
Accession A0A1Y2GJ06    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-30SNAKALNSMKQKVKKNNRLYEKEIQEYHydrophilic
43-67EEEVVETKRKAKKPKKDLSESEDEDAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-58KRKAKKPKK
647-647K
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027516  EIF3C  
IPR008905  EIF3C_N_dom  
IPR000717  PCI_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0031369  F:translation initiation factor binding  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF05470  eIF-3c_N  
PF01399  PCI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MNASNAKALNSMKQKVKKNNRLYEKEIQEYEKDPDNYDVEQDEEEVVETKRKAKKPKKDLSESEDEDEQKGEEEVDDGFTPVGAGGKSIELNQENLFKKLREVIDARGKKNTNREEQVRILERLLVVANNPYQKIHVLLNLISAQFDFAVGLSGYMSIPFWKNAEKYLNNLLTILESNRGYVVKEAVPEDDDIDKDRIPENGQTVFIRGSIVAFVDRLDEEFTKSLQNIDPHTTDYVDRLKDEVGLYAVIVRSNEYFKSLELTDAICRTTMRRLEHLYFKPDTVIVAVENATASLLPSNIIKPVKDSEDLIHDLCVHLYKNANSLQRTRAMLCHIYHHALHNRYFVARDMLLMSHLQETIHQADITTQILHNRTMVQLGLCAFREGMIKEAHTCLQDISGTGRVKELLAQGLQAQRYGSVSPEQEKLERQRQLPFHMHINLELLECVYLTCSMLLEIPNMAANGNSTEGRKKVISKPFRRMLDYNSRQVFSGPPENTRDHIMGAAKALASAEWQKSIDLINSIKIWELMPSSDKIKEMLGRKIQEEGLRTYLFANASYYSSVGLEQLAKMFDLPLTTVVSIVSKMVWNEELSASIDQVTNVVVLHRVEPTKLQSLALAFAEKAAAFVEGNEKLLETKTPQQNERPKKGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.7
3 0.8
4 0.82
5 0.84
6 0.87
7 0.89
8 0.88
9 0.87
10 0.86
11 0.82
12 0.78
13 0.71
14 0.64
15 0.57
16 0.53
17 0.49
18 0.47
19 0.41
20 0.36
21 0.36
22 0.36
23 0.33
24 0.32
25 0.29
26 0.22
27 0.21
28 0.19
29 0.16
30 0.13
31 0.13
32 0.12
33 0.12
34 0.16
35 0.17
36 0.24
37 0.33
38 0.4
39 0.5
40 0.59
41 0.69
42 0.75
43 0.84
44 0.86
45 0.88
46 0.89
47 0.86
48 0.86
49 0.79
50 0.71
51 0.66
52 0.57
53 0.47
54 0.39
55 0.31
56 0.22
57 0.18
58 0.14
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.09
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.06
71 0.07
72 0.07
73 0.09
74 0.1
75 0.1
76 0.15
77 0.15
78 0.17
79 0.19
80 0.26
81 0.26
82 0.29
83 0.31
84 0.26
85 0.27
86 0.32
87 0.32
88 0.3
89 0.31
90 0.36
91 0.44
92 0.51
93 0.51
94 0.53
95 0.54
96 0.53
97 0.6
98 0.61
99 0.59
100 0.61
101 0.63
102 0.62
103 0.63
104 0.66
105 0.61
106 0.54
107 0.45
108 0.39
109 0.34
110 0.28
111 0.24
112 0.16
113 0.12
114 0.14
115 0.17
116 0.18
117 0.19
118 0.18
119 0.18
120 0.19
121 0.2
122 0.18
123 0.17
124 0.17
125 0.16
126 0.19
127 0.2
128 0.19
129 0.16
130 0.15
131 0.12
132 0.09
133 0.09
134 0.06
135 0.04
136 0.06
137 0.05
138 0.06
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.08
146 0.09
147 0.11
148 0.14
149 0.15
150 0.2
151 0.28
152 0.27
153 0.3
154 0.38
155 0.39
156 0.35
157 0.34
158 0.29
159 0.23
160 0.23
161 0.19
162 0.14
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.12
169 0.14
170 0.12
171 0.13
172 0.14
173 0.14
174 0.15
175 0.14
176 0.15
177 0.14
178 0.13
179 0.14
180 0.15
181 0.14
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.16
186 0.18
187 0.18
188 0.18
189 0.2
190 0.18
191 0.19
192 0.18
193 0.16
194 0.13
195 0.1
196 0.09
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.09
206 0.09
207 0.11
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.14
213 0.15
214 0.17
215 0.17
216 0.2
217 0.21
218 0.21
219 0.22
220 0.21
221 0.18
222 0.18
223 0.2
224 0.17
225 0.17
226 0.16
227 0.15
228 0.16
229 0.16
230 0.14
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.09
235 0.09
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.1
245 0.13
246 0.12
247 0.12
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.15
257 0.19
258 0.2
259 0.23
260 0.28
261 0.31
262 0.4
263 0.41
264 0.4
265 0.36
266 0.34
267 0.3
268 0.26
269 0.22
270 0.14
271 0.12
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.03
282 0.03
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.09
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.14
291 0.16
292 0.16
293 0.17
294 0.14
295 0.17
296 0.19
297 0.17
298 0.15
299 0.13
300 0.12
301 0.11
302 0.11
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.08
307 0.12
308 0.16
309 0.2
310 0.21
311 0.23
312 0.24
313 0.26
314 0.27
315 0.24
316 0.22
317 0.21
318 0.23
319 0.21
320 0.22
321 0.2
322 0.21
323 0.2
324 0.22
325 0.25
326 0.24
327 0.25
328 0.23
329 0.22
330 0.21
331 0.21
332 0.18
333 0.15
334 0.12
335 0.11
336 0.1
337 0.09
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.07
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.09
346 0.1
347 0.11
348 0.1
349 0.09
350 0.1
351 0.11
352 0.12
353 0.09
354 0.08
355 0.1
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.11
360 0.11
361 0.11
362 0.11
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.1
367 0.09
368 0.09
369 0.08
370 0.09
371 0.11
372 0.1
373 0.11
374 0.1
375 0.11
376 0.12
377 0.13
378 0.14
379 0.13
380 0.13
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.09
385 0.1
386 0.15
387 0.15
388 0.15
389 0.15
390 0.15
391 0.14
392 0.16
393 0.15
394 0.11
395 0.1
396 0.11
397 0.13
398 0.16
399 0.16
400 0.14
401 0.13
402 0.11
403 0.12
404 0.12
405 0.11
406 0.11
407 0.13
408 0.15
409 0.18
410 0.19
411 0.2
412 0.24
413 0.3
414 0.35
415 0.38
416 0.37
417 0.42
418 0.43
419 0.48
420 0.49
421 0.44
422 0.42
423 0.4
424 0.39
425 0.32
426 0.31
427 0.25
428 0.19
429 0.17
430 0.12
431 0.08
432 0.07
433 0.07
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.06
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.08
446 0.08
447 0.07
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.08
452 0.09
453 0.1
454 0.13
455 0.14
456 0.17
457 0.18
458 0.23
459 0.3
460 0.39
461 0.48
462 0.53
463 0.62
464 0.68
465 0.7
466 0.7
467 0.64
468 0.62
469 0.62
470 0.6
471 0.59
472 0.54
473 0.51
474 0.45
475 0.44
476 0.38
477 0.32
478 0.35
479 0.27
480 0.28
481 0.32
482 0.34
483 0.34
484 0.35
485 0.31
486 0.22
487 0.24
488 0.22
489 0.18
490 0.17
491 0.17
492 0.13
493 0.12
494 0.11
495 0.08
496 0.09
497 0.13
498 0.13
499 0.14
500 0.14
501 0.14
502 0.15
503 0.17
504 0.16
505 0.15
506 0.15
507 0.15
508 0.16
509 0.16
510 0.16
511 0.15
512 0.14
513 0.12
514 0.12
515 0.11
516 0.13
517 0.15
518 0.18
519 0.19
520 0.19
521 0.19
522 0.2
523 0.25
524 0.27
525 0.34
526 0.38
527 0.39
528 0.4
529 0.42
530 0.43
531 0.4
532 0.39
533 0.34
534 0.31
535 0.29
536 0.28
537 0.25
538 0.25
539 0.22
540 0.19
541 0.17
542 0.13
543 0.14
544 0.14
545 0.14
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.09
550 0.1
551 0.09
552 0.09
553 0.11
554 0.11
555 0.11
556 0.11
557 0.11
558 0.1
559 0.09
560 0.1
561 0.1
562 0.11
563 0.11
564 0.11
565 0.11
566 0.11
567 0.11
568 0.1
569 0.1
570 0.1
571 0.1
572 0.12
573 0.14
574 0.14
575 0.16
576 0.16
577 0.16
578 0.17
579 0.17
580 0.15
581 0.15
582 0.14
583 0.12
584 0.12
585 0.11
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.09
590 0.09
591 0.11
592 0.16
593 0.16
594 0.17
595 0.21
596 0.26
597 0.3
598 0.3
599 0.29
600 0.26
601 0.27
602 0.28
603 0.26
604 0.22
605 0.15
606 0.15
607 0.16
608 0.13
609 0.12
610 0.09
611 0.09
612 0.08
613 0.09
614 0.14
615 0.14
616 0.16
617 0.15
618 0.15
619 0.16
620 0.17
621 0.19
622 0.18
623 0.27
624 0.35
625 0.42
626 0.47
627 0.56
628 0.66
629 0.73