FuNGI

A0A1Y2GX61

Protein Details

Accession

A0A1Y2GX61

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-28	SAQIKAEKEKRDKSTQREDTRVS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 12, nucl 6, cyto 5, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MADDISAQIKAEKEKRDKSTQREDTRVSLTGGVGYDQDIYDAGDKFAGYSTELPMDEEEEEDELSKRMAQQNSKKLSSYSAPKEAFAHLASVDDDDTDPFAGRKESQRIIDREGDYHKRRLNRVLSPSRQDPFSNKDSDANGSEARSYAEIMKETELEKEQQRVMHLIAEKKKEAQKATGLEAPPPPTPTGRKRRWDVATPVVAPAATKSSWDEPDDHVAVPSNRWEETPKVEGKKRNRWDETPVVNAGASWDATPKVSGAAETPVAKRSRWDETPVAPSGMFSATPMAGGLGMVTPNITVPMTPEAMNAQRWEHEIDMRNRPLSDEELDAMFPTTGYKILEPPANYQPIRTPARKLMATPTPYAGGFMMQDENMKQNYGISPAEIEVPGGSNLPFFKQEDMQHFGKLLDEKDESSMSAEDIKERKIMRLLLKIKNGTPPMRKAALRTITDKARDFGAGPLFNQILPLLMSPTLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPFVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLSKAAGLTTMIATMRPDIDHADEYVRNTTARAFSVVASALGIPTLLPFLKAVCNSKKSWQARHTGIKIVQQIAILLGCAILPHLKNLVDTIAKGLEDEQQKVRTITSLAIAALAEAAHPYGIESFDSVLAPLWSGTRKHRGKGLAAFLKAIGYIIPLMDVEYANYHTKEVMPILIREFQSPDEEMKKIVLKVVKQCAGTDGVTPQYIKEEILPEFFKNFWVRRMALDRRNYKQLVETTVELAQKVGVTEIVSRIVDDLKDESEPYRKMVMETIEKVISQLGAADIDGRLEETLIDGILYAFQEQTVEDIVMLNGFGTVVNALGYRSKAYLPQITSTILWRLNNKSAKVRQQAADLISRIAVVMKTCGEEKLMGHLGLVLFEYLGEEYPEVLGSILGALKAIVNVIGMSSMTPPIKDLLPRLTPILKNRHEKVQENNIDLVGRIADRGAEYVSAREWMRVCFELLDMLKAHKKGIRRAAVNTFGYIAKAIGPQDVLATLLNNLKVQERQNRVCTTVAIAIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLAWVFEYIGEMGKDYIYAVTPLLEDALMDRDLVHRQTACTTVKHMSLGVVGLGCEDALLHLLNYVWPNIFETSPHVINAVMDAIEGLTVALGPGTILQYVVQGLFHPARKVREIYWKIYNNMYILAQDGMIPSYPSIDNDATNKYERTELYYVV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.62
3	0.7
4	0.76
5	0.78
6	0.82
7	0.83
8	0.82
9	0.81
10	0.78
11	0.72
12	0.68
13	0.61
14	0.52
15	0.43
16	0.34
17	0.28
18	0.25
19	0.2
20	0.15
21	0.14
22	0.13
23	0.11
24	0.11
25	0.09
26	0.1
27	0.12
28	0.13
29	0.13
30	0.12
31	0.12
32	0.12
33	0.14
34	0.13
35	0.12
36	0.13
37	0.15
38	0.18
39	0.18
40	0.19
41	0.18
42	0.19
43	0.17
44	0.16
45	0.15
46	0.12
47	0.12
48	0.12
49	0.13
50	0.11
51	0.11
52	0.12
53	0.16
54	0.23
55	0.29
56	0.38
57	0.47
58	0.57
59	0.64
60	0.66
61	0.62
62	0.56
63	0.54
64	0.52
65	0.52
66	0.5
67	0.51
68	0.49
69	0.49
70	0.5
71	0.47
72	0.42
73	0.33
74	0.27
75	0.17
76	0.18
77	0.17
78	0.16
79	0.14
80	0.11
81	0.11
82	0.1
83	0.11
84	0.1
85	0.1
86	0.09
87	0.11
88	0.13
89	0.16
90	0.23
91	0.29
92	0.34
93	0.41
94	0.5
95	0.52
96	0.55
97	0.6
98	0.54
99	0.51
100	0.54
101	0.56
102	0.53
103	0.57
104	0.56
105	0.55
106	0.59
107	0.63
108	0.64
109	0.62
110	0.68
111	0.7
112	0.73
113	0.73
114	0.75
115	0.69
116	0.64
117	0.57
118	0.52
119	0.48
120	0.46
121	0.43
122	0.38
123	0.39
124	0.38
125	0.4
126	0.37
127	0.34
128	0.29
129	0.26
130	0.25
131	0.21
132	0.2
133	0.16
134	0.15
135	0.15
136	0.16
137	0.17
138	0.18
139	0.19
140	0.19
141	0.19
142	0.21
143	0.21
144	0.22
145	0.24
146	0.27
147	0.28
148	0.28
149	0.3
150	0.29
151	0.27
152	0.29
153	0.3
154	0.34
155	0.38
156	0.42
157	0.41
158	0.45
159	0.5
160	0.5
161	0.49
162	0.46
163	0.46
164	0.45
165	0.48
166	0.47
167	0.42
168	0.39
169	0.4
170	0.38
171	0.33
172	0.32
173	0.29
174	0.27
175	0.34
176	0.41
177	0.48
178	0.54
179	0.61
180	0.65
181	0.72
182	0.74
183	0.75
184	0.72
185	0.7
186	0.67
187	0.59
188	0.54
189	0.45
190	0.38
191	0.29
192	0.23
193	0.18
194	0.11
195	0.11
196	0.14
197	0.18
198	0.21
199	0.23
200	0.25
201	0.24
202	0.31
203	0.32
204	0.28
205	0.24
206	0.26
207	0.25
208	0.23
209	0.25
210	0.21
211	0.19
212	0.2
213	0.23
214	0.22
215	0.27
216	0.32
217	0.35
218	0.4
219	0.47
220	0.55
221	0.61
222	0.69
223	0.72
224	0.76
225	0.76
226	0.72
227	0.73
228	0.74
229	0.69
230	0.63
231	0.54
232	0.45
233	0.37
234	0.33
235	0.26
236	0.18
237	0.13
238	0.09
239	0.09
240	0.09
241	0.09
242	0.1
243	0.09
244	0.09
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.11
249	0.13
250	0.16
251	0.17
252	0.21
253	0.23
254	0.22
255	0.24
256	0.26
257	0.31
258	0.31
259	0.36
260	0.35
261	0.38
262	0.44
263	0.42
264	0.39
265	0.32
266	0.28
267	0.24
268	0.2
269	0.15
270	0.1
271	0.1
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.07
276	0.06
277	0.06
278	0.05
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.05
286	0.05
287	0.04
288	0.07
289	0.1
290	0.11
291	0.11
292	0.12
293	0.14
294	0.17
295	0.18
296	0.18
297	0.16
298	0.16
299	0.17
300	0.19
301	0.18
302	0.21
303	0.27
304	0.32
305	0.39
306	0.41
307	0.41
308	0.39
309	0.39
310	0.35
311	0.31
312	0.27
313	0.2
314	0.18
315	0.17
316	0.17
317	0.15
318	0.14
319	0.1
320	0.08
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.08
325	0.08
326	0.1
327	0.13
328	0.16
329	0.17
330	0.22
331	0.26
332	0.32
333	0.31
334	0.3
335	0.32
336	0.36
337	0.41
338	0.38
339	0.37
340	0.36
341	0.43
342	0.42
343	0.4
344	0.38
345	0.4
346	0.41
347	0.38
348	0.33
349	0.28
350	0.27
351	0.27
352	0.2
353	0.13
354	0.1
355	0.1
356	0.09
357	0.08
358	0.09
359	0.09
360	0.12
361	0.11
362	0.12
363	0.1
364	0.11
365	0.11
366	0.14
367	0.13
368	0.11
369	0.11
370	0.11
371	0.12
372	0.11
373	0.1
374	0.07
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.09
382	0.1
383	0.1
384	0.12
385	0.16
386	0.2
387	0.24
388	0.29
389	0.29
390	0.28
391	0.27
392	0.25
393	0.24
394	0.22
395	0.17
396	0.15
397	0.15
398	0.15
399	0.16
400	0.17
401	0.14
402	0.14
403	0.13
404	0.1
405	0.12
406	0.11
407	0.14
408	0.16
409	0.17
410	0.19
411	0.2
412	0.21
413	0.22
414	0.27
415	0.27
416	0.35
417	0.41
418	0.43
419	0.48
420	0.49
421	0.47
422	0.48
423	0.48
424	0.45
425	0.43
426	0.41
427	0.4
428	0.42
429	0.41
430	0.38
431	0.42
432	0.43
433	0.4
434	0.39
435	0.39
436	0.39
437	0.42
438	0.4
439	0.32
440	0.26
441	0.24
442	0.21
443	0.2
444	0.21
445	0.17
446	0.16
447	0.18
448	0.17
449	0.16
450	0.16
451	0.12
452	0.08
453	0.07
454	0.07
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.07
460	0.08
461	0.08
462	0.08
463	0.09
464	0.14
465	0.15
466	0.15
467	0.14
468	0.15
469	0.15
470	0.2
471	0.2
472	0.16
473	0.18
474	0.17
475	0.18
476	0.17
477	0.17
478	0.13
479	0.13
480	0.14
481	0.14
482	0.15
483	0.18
484	0.16
485	0.18
486	0.18
487	0.17
488	0.15
489	0.13
490	0.12
491	0.11
492	0.12
493	0.1
494	0.1
495	0.09
496	0.08
497	0.08
498	0.08
499	0.05
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.05
504	0.05
505	0.06
506	0.05
507	0.05
508	0.06
509	0.08
510	0.09
511	0.11
512	0.11
513	0.13
514	0.14
515	0.14
516	0.14
517	0.12
518	0.1
519	0.08
520	0.07
521	0.06
522	0.05
523	0.05
524	0.05
525	0.05
526	0.05
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.06
531	0.06
532	0.06
533	0.06
534	0.08
535	0.09
536	0.09
537	0.11
538	0.12
539	0.13
540	0.14
541	0.13
542	0.11
543	0.11
544	0.12
545	0.11
546	0.11
547	0.11
548	0.1
549	0.1
550	0.11
551	0.11
552	0.09
553	0.08
554	0.07
555	0.05
556	0.04
557	0.04
558	0.03
559	0.03
560	0.04
561	0.03
562	0.04
563	0.04
564	0.05
565	0.07
566	0.09
567	0.14
568	0.17
569	0.21
570	0.22
571	0.27
572	0.36
573	0.38
574	0.44
575	0.45
576	0.47
577	0.49
578	0.56
579	0.53
580	0.48
581	0.46
582	0.43
583	0.4
584	0.34
585	0.29
586	0.21
587	0.19
588	0.15
589	0.13
590	0.08
591	0.05
592	0.04
593	0.03
594	0.03
595	0.03
596	0.04
597	0.04
598	0.05
599	0.07
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.09
604	0.08
605	0.08
606	0.08
607	0.08
608	0.07
609	0.07
610	0.08
611	0.11
612	0.12
613	0.14
614	0.16
615	0.17
616	0.18
617	0.18
618	0.18
619	0.13
620	0.12
621	0.11
622	0.1
623	0.08
624	0.07
625	0.07
626	0.07
627	0.06
628	0.05
629	0.04
630	0.03
631	0.03
632	0.03
633	0.02
634	0.02
635	0.03
636	0.03
637	0.03
638	0.04
639	0.04
640	0.05
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.05
645	0.05
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.06
650	0.08
651	0.12
652	0.22
653	0.24
654	0.26
655	0.31
656	0.32
657	0.35
658	0.39
659	0.43
660	0.38
661	0.36
662	0.35
663	0.3
664	0.27
665	0.23
666	0.18
667	0.09
668	0.04
669	0.04
670	0.03
671	0.04
672	0.03
673	0.04
674	0.04
675	0.04
676	0.04
677	0.05
678	0.08
679	0.09
680	0.1
681	0.09
682	0.09
683	0.1
684	0.1
685	0.1
686	0.1
687	0.1
688	0.1
689	0.12
690	0.16
691	0.16
692	0.16
693	0.17
694	0.15
695	0.16
696	0.16
697	0.17
698	0.15
699	0.15
700	0.14
701	0.15
702	0.16
703	0.15
704	0.17
705	0.17
706	0.18
707	0.24
708	0.3
709	0.32
710	0.3
711	0.3
712	0.29
713	0.28
714	0.25
715	0.2
716	0.15
717	0.12
718	0.13
719	0.13
720	0.11
721	0.1
722	0.1
723	0.09
724	0.1
725	0.11
726	0.11
727	0.14
728	0.16
729	0.14
730	0.15
731	0.15
732	0.17
733	0.19
734	0.19
735	0.19
736	0.22
737	0.22
738	0.24
739	0.32
740	0.37
741	0.4
742	0.47
743	0.51
744	0.51
745	0.57
746	0.54
747	0.46
748	0.44
749	0.39
750	0.35
751	0.31
752	0.27
753	0.23
754	0.26
755	0.25
756	0.2
757	0.17
758	0.13
759	0.11
760	0.1
761	0.08
762	0.05
763	0.05
764	0.06
765	0.07
766	0.08
767	0.08
768	0.08
769	0.08
770	0.09
771	0.08
772	0.08
773	0.09
774	0.08
775	0.09
776	0.1
777	0.11
778	0.15
779	0.16
780	0.17
781	0.19
782	0.18
783	0.18
784	0.21
785	0.23
786	0.23
787	0.24
788	0.25
789	0.22
790	0.22
791	0.21
792	0.18
793	0.14
794	0.09
795	0.07
796	0.05
797	0.04
798	0.04
799	0.05
800	0.05
801	0.05
802	0.05
803	0.05
804	0.04
805	0.04
806	0.04
807	0.04
808	0.04
809	0.04
810	0.04
811	0.04
812	0.04
813	0.04
814	0.05
815	0.04
816	0.04
817	0.04
818	0.05
819	0.04
820	0.05
821	0.06
822	0.05
823	0.05
824	0.06
825	0.06
826	0.05
827	0.05
828	0.04
829	0.03
830	0.03
831	0.03
832	0.03
833	0.03
834	0.03
835	0.04
836	0.04
837	0.04
838	0.06
839	0.07
840	0.07
841	0.09
842	0.09
843	0.12
844	0.15
845	0.21
846	0.21
847	0.22
848	0.23
849	0.23
850	0.23
851	0.22
852	0.23
853	0.2
854	0.2
855	0.22
856	0.25
857	0.32
858	0.36
859	0.37
860	0.42
861	0.46
862	0.54
863	0.56
864	0.57
865	0.5
866	0.49
867	0.5
868	0.44
869	0.42
870	0.33
871	0.27
872	0.21
873	0.19
874	0.16
875	0.13
876	0.11
877	0.07
878	0.08
879	0.08
880	0.09
881	0.1
882	0.1
883	0.1
884	0.11
885	0.11
886	0.16
887	0.18
888	0.16
889	0.15
890	0.17
891	0.15
892	0.14
893	0.14
894	0.08
895	0.05
896	0.05
897	0.06
898	0.04
899	0.05
900	0.05
901	0.05
902	0.05
903	0.05
904	0.06
905	0.05
906	0.05
907	0.04
908	0.04
909	0.05
910	0.05
911	0.04
912	0.04
913	0.04
914	0.04
915	0.04
916	0.04
917	0.04
918	0.04
919	0.04
920	0.04
921	0.04
922	0.04
923	0.04
924	0.05
925	0.08
926	0.09
927	0.09
928	0.09
929	0.11
930	0.13
931	0.14
932	0.17
933	0.2
934	0.23
935	0.24
936	0.27
937	0.31
938	0.33
939	0.38
940	0.45
941	0.46
942	0.52
943	0.53
944	0.6
945	0.6
946	0.6
947	0.61
948	0.62
949	0.6
950	0.56
951	0.54
952	0.45
953	0.39
954	0.35
955	0.27
956	0.17
957	0.11
958	0.08
959	0.07
960	0.06
961	0.07
962	0.07
963	0.07
964	0.08
965	0.08
966	0.09
967	0.1
968	0.13
969	0.13
970	0.15
971	0.16
972	0.16
973	0.19
974	0.19
975	0.19
976	0.17
977	0.17
978	0.19
979	0.18
980	0.19
981	0.16
982	0.18
983	0.22
984	0.22
985	0.24
986	0.22
987	0.27
988	0.33
989	0.42
990	0.47
991	0.46
992	0.52
993	0.57
994	0.62
995	0.57
996	0.49
997	0.41
998	0.33
999	0.3
1000	0.24
1001	0.17
1002	0.11
1003	0.12
1004	0.12
1005	0.11
1006	0.11
1007	0.1
1008	0.11
1009	0.1
1010	0.1
1011	0.08
1012	0.08
1013	0.09
1014	0.11
1015	0.12
1016	0.12
1017	0.13
1018	0.15
1019	0.19
1020	0.25
1021	0.32
1022	0.38
1023	0.44
1024	0.51
1025	0.53
1026	0.53
1027	0.5
1028	0.44
1029	0.38
1030	0.33
1031	0.27
1032	0.19
1033	0.17
1034	0.14
1035	0.13
1036	0.12
1037	0.09
1038	0.05
1039	0.05
1040	0.05
1041	0.06
1042	0.05
1043	0.06
1044	0.09
1045	0.1
1046	0.1
1047	0.11
1048	0.16
1049	0.16
1050	0.18
1051	0.18
1052	0.17
1053	0.18
1054	0.18
1055	0.19
1056	0.2
1057	0.23
1058	0.25
1059	0.26
1060	0.25
1061	0.28
1062	0.27
1063	0.25
1064	0.2
1065	0.16
1066	0.14
1067	0.14
1068	0.14
1069	0.11
1070	0.11
1071	0.11
1072	0.12
1073	0.14
1074	0.13
1075	0.13
1076	0.12
1077	0.12
1078	0.12
1079	0.11
1080	0.09
1081	0.08
1082	0.09
1083	0.07
1084	0.08
1085	0.08
1086	0.08
1087	0.08
1088	0.08
1089	0.08
1090	0.07
1091	0.06
1092	0.07
1093	0.1
1094	0.09
1095	0.09
1096	0.09
1097	0.11
1098	0.15
1099	0.17
1100	0.19
1101	0.17
1102	0.18
1103	0.21
1104	0.27
1105	0.28
1106	0.26
1107	0.29
1108	0.29
1109	0.3
1110	0.3
1111	0.27
1112	0.22
1113	0.2
1114	0.19
1115	0.15
1116	0.12
1117	0.1
1118	0.09
1119	0.08
1120	0.07
1121	0.06
1122	0.05
1123	0.04
1124	0.05
1125	0.06
1126	0.05
1127	0.06
1128	0.06
1129	0.09
1130	0.1
1131	0.12
1132	0.11
1133	0.11
1134	0.14
1135	0.16
1136	0.16
1137	0.14
1138	0.19
1139	0.24
1140	0.24
1141	0.24
1142	0.22
1143	0.2
1144	0.19
1145	0.2
1146	0.15
1147	0.09
1148	0.07
1149	0.07
1150	0.07
1151	0.06
1152	0.06
1153	0.04
1154	0.03
1155	0.03
1156	0.03
1157	0.03
1158	0.03
1159	0.03
1160	0.04
1161	0.05
1162	0.05
1163	0.06
1164	0.06
1165	0.07
1166	0.09
1167	0.09
1168	0.08
1169	0.08
1170	0.13
1171	0.18
1172	0.21
1173	0.26
1174	0.3
1175	0.34
1176	0.39
1177	0.42
1178	0.42
1179	0.48
1180	0.51
1181	0.52
1182	0.57
1183	0.59
1184	0.56
1185	0.58
1186	0.55
1187	0.45
1188	0.42
1189	0.36
1190	0.26
1191	0.22
1192	0.19
1193	0.15
1194	0.12
1195	0.12
1196	0.11
1197	0.11
1198	0.11
1199	0.09
1200	0.12
1201	0.13
1202	0.13
1203	0.18
1204	0.18
1205	0.2
1206	0.23
1207	0.28
1208	0.28
1209	0.32
1210	0.32
1211	0.28
1212	0.32
1213	0.3
1214	0.34

A0A1Y2GX61

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer