Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2GWJ4

Protein Details
Accession A0A1Y2GWJ4    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MGEKLTKKQKKTNEFRGKKRKLDESVAHydrophilic
41-66DSSSNKEDTKNKKKDKSSKDESKGPSHydrophilic
72-95DDSTEGMKKKRRRGKGSSKEDPAPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-21KKQKKTNEFRGKKRK
52-56KKKDK
78-89MKKKRRRGKGSS
200-234KSANRKKKIAEKNEALNEERRKVHEKHIAPAKEAK
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MGEKLTKKQKKTNEFRGKKRKLDESVADLPEEDVVQGDNADSSSNKEDTKNKKKDKSSKDESKGPSPSSTGDDSTEGMKKKRRRGKGSSKEDPAPEAGTQEGDAVTTSVKAAPKNAKFIVFVGNLPYNITKEQLEKHFESCGKGFAVRIQTDKVTKKGKGFAFLEFPDSESMQKALFFNKTLIKERPINVELTAGGGGNKSANRKKKIAEKNEALNEERRKVHEKHIAPAKEAKSSYAAANPAPAQKAAAPKPLKKPTDMSDANSISVEGLAARLRRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.9
3 0.93
4 0.92
5 0.89
6 0.87
7 0.85
8 0.81
9 0.8
10 0.74
11 0.71
12 0.7
13 0.62
14 0.54
15 0.45
16 0.38
17 0.3
18 0.24
19 0.15
20 0.07
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.05
26 0.05
27 0.07
28 0.07
29 0.1
30 0.14
31 0.16
32 0.17
33 0.22
34 0.3
35 0.4
36 0.51
37 0.58
38 0.64
39 0.71
40 0.8
41 0.86
42 0.88
43 0.87
44 0.87
45 0.87
46 0.84
47 0.84
48 0.79
49 0.76
50 0.71
51 0.63
52 0.54
53 0.45
54 0.4
55 0.35
56 0.32
57 0.25
58 0.21
59 0.2
60 0.19
61 0.2
62 0.23
63 0.21
64 0.23
65 0.3
66 0.35
67 0.44
68 0.53
69 0.6
70 0.65
71 0.73
72 0.8
73 0.83
74 0.86
75 0.85
76 0.81
77 0.76
78 0.68
79 0.59
80 0.49
81 0.4
82 0.3
83 0.22
84 0.16
85 0.12
86 0.11
87 0.1
88 0.08
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.04
94 0.05
95 0.07
96 0.08
97 0.09
98 0.13
99 0.21
100 0.23
101 0.28
102 0.29
103 0.28
104 0.27
105 0.28
106 0.29
107 0.21
108 0.2
109 0.17
110 0.17
111 0.16
112 0.16
113 0.16
114 0.12
115 0.11
116 0.12
117 0.1
118 0.1
119 0.14
120 0.17
121 0.22
122 0.22
123 0.22
124 0.25
125 0.24
126 0.25
127 0.22
128 0.19
129 0.15
130 0.14
131 0.13
132 0.13
133 0.17
134 0.16
135 0.17
136 0.16
137 0.18
138 0.23
139 0.25
140 0.27
141 0.28
142 0.29
143 0.31
144 0.37
145 0.36
146 0.37
147 0.36
148 0.33
149 0.32
150 0.3
151 0.3
152 0.23
153 0.23
154 0.18
155 0.17
156 0.15
157 0.11
158 0.12
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.14
166 0.19
167 0.22
168 0.26
169 0.29
170 0.31
171 0.34
172 0.35
173 0.4
174 0.36
175 0.33
176 0.28
177 0.27
178 0.22
179 0.18
180 0.17
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.1
187 0.15
188 0.23
189 0.31
190 0.37
191 0.4
192 0.46
193 0.54
194 0.63
195 0.66
196 0.68
197 0.65
198 0.69
199 0.72
200 0.7
201 0.62
202 0.59
203 0.54
204 0.5
205 0.47
206 0.42
207 0.42
208 0.42
209 0.48
210 0.5
211 0.48
212 0.52
213 0.59
214 0.56
215 0.53
216 0.58
217 0.51
218 0.48
219 0.45
220 0.38
221 0.32
222 0.31
223 0.3
224 0.26
225 0.26
226 0.2
227 0.23
228 0.24
229 0.24
230 0.24
231 0.22
232 0.2
233 0.21
234 0.29
235 0.3
236 0.37
237 0.4
238 0.45
239 0.55
240 0.63
241 0.63
242 0.58
243 0.61
244 0.56
245 0.6
246 0.57
247 0.51
248 0.51
249 0.49
250 0.46
251 0.4
252 0.35
253 0.24
254 0.21
255 0.17
256 0.07
257 0.08
258 0.1