Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2H1F4

Protein Details
Accession A0A1Y2H1F4    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-114VIYAENSKRNKSKRKDYDNDNNSTAHydrophilic
135-163HGGKNNRFNKQNNKRQKNNNNPQERERKPHydrophilic
267-291TLSEDQKKKVQKKYQKLEKKLDWFEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, mito_nucl 11.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
IPR034392  TatSF1-like_RRM1  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12281  RRM1_TatSF1_like  
cd12282  RRM2_TatSF1_like  
Amino Acid Sequences MNTDSTADDPANESATAIGVGGGANMSGAPQVAQQNMHFIEETGRWTYTDAEGISYEYDENLKAWFPMFNEQLVQAQQSAYGETVPDSYVIYAENSKRNKSKRKDYDNDNNSTAEQDDNGEEHVAEFLSEIESMHGGKNNRFNKQNNKRQKNNNNPQERERKPKPISSVFVTGLPFDTDVEEVADVFKKGGVFMEDEKGVPKIKLYTDKEGRRTGEGLVSYLRPESVALAIDLLDDTEFRPGVERGRVRVQQAQFKEKEKPEQTKSTLSEDQKKKVQKKYQKLEKKLDWFEDDENLVKAEKWNKVCILKHMFTLQELEADPTLLLDLKEDIREECEKVGEVTNVIIYDHHPEGVVSVRFKDKESAELCVRLMSGRYFAGQKVVAEIYDGHTKYDVKKSKEELEQEEKQRLDRYAKWLESEEEKEKQAKQSAVADAPTP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.11
4 0.09
5 0.07
6 0.05
7 0.05
8 0.05
9 0.05
10 0.04
11 0.04
12 0.04
13 0.04
14 0.04
15 0.04
16 0.05
17 0.08
18 0.12
19 0.14
20 0.16
21 0.17
22 0.23
23 0.24
24 0.25
25 0.22
26 0.19
27 0.21
28 0.2
29 0.24
30 0.2
31 0.2
32 0.18
33 0.19
34 0.21
35 0.19
36 0.2
37 0.17
38 0.16
39 0.15
40 0.16
41 0.16
42 0.14
43 0.13
44 0.1
45 0.11
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.1
52 0.11
53 0.12
54 0.19
55 0.2
56 0.2
57 0.21
58 0.21
59 0.23
60 0.22
61 0.21
62 0.15
63 0.13
64 0.13
65 0.12
66 0.12
67 0.1
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.13
80 0.17
81 0.24
82 0.27
83 0.33
84 0.41
85 0.5
86 0.58
87 0.63
88 0.7
89 0.74
90 0.81
91 0.83
92 0.85
93 0.87
94 0.85
95 0.81
96 0.72
97 0.62
98 0.51
99 0.43
100 0.34
101 0.24
102 0.16
103 0.12
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.07
121 0.08
122 0.11
123 0.13
124 0.16
125 0.25
126 0.3
127 0.35
128 0.41
129 0.46
130 0.54
131 0.63
132 0.7
133 0.72
134 0.77
135 0.8
136 0.85
137 0.89
138 0.89
139 0.89
140 0.89
141 0.87
142 0.82
143 0.81
144 0.81
145 0.75
146 0.73
147 0.68
148 0.69
149 0.63
150 0.63
151 0.62
152 0.59
153 0.57
154 0.52
155 0.51
156 0.41
157 0.4
158 0.35
159 0.28
160 0.21
161 0.18
162 0.14
163 0.09
164 0.09
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.12
191 0.21
192 0.25
193 0.32
194 0.4
195 0.45
196 0.49
197 0.51
198 0.5
199 0.42
200 0.4
201 0.32
202 0.26
203 0.21
204 0.17
205 0.14
206 0.13
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.06
228 0.07
229 0.1
230 0.16
231 0.17
232 0.19
233 0.26
234 0.29
235 0.3
236 0.36
237 0.37
238 0.38
239 0.41
240 0.45
241 0.42
242 0.42
243 0.47
244 0.43
245 0.49
246 0.48
247 0.52
248 0.5
249 0.54
250 0.54
251 0.54
252 0.53
253 0.51
254 0.51
255 0.48
256 0.52
257 0.5
258 0.51
259 0.51
260 0.57
261 0.58
262 0.6
263 0.66
264 0.66
265 0.72
266 0.78
267 0.83
268 0.85
269 0.86
270 0.85
271 0.83
272 0.82
273 0.76
274 0.68
275 0.6
276 0.53
277 0.46
278 0.39
279 0.32
280 0.24
281 0.2
282 0.17
283 0.14
284 0.12
285 0.14
286 0.18
287 0.23
288 0.24
289 0.27
290 0.31
291 0.37
292 0.38
293 0.43
294 0.45
295 0.4
296 0.4
297 0.39
298 0.35
299 0.3
300 0.31
301 0.23
302 0.17
303 0.16
304 0.16
305 0.13
306 0.13
307 0.12
308 0.09
309 0.09
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.11
318 0.14
319 0.16
320 0.17
321 0.16
322 0.16
323 0.16
324 0.16
325 0.19
326 0.15
327 0.13
328 0.13
329 0.12
330 0.12
331 0.11
332 0.1
333 0.08
334 0.13
335 0.13
336 0.12
337 0.11
338 0.11
339 0.12
340 0.17
341 0.19
342 0.16
343 0.18
344 0.23
345 0.24
346 0.26
347 0.31
348 0.26
349 0.31
350 0.32
351 0.35
352 0.33
353 0.34
354 0.33
355 0.28
356 0.28
357 0.2
358 0.2
359 0.16
360 0.15
361 0.13
362 0.15
363 0.16
364 0.16
365 0.19
366 0.19
367 0.18
368 0.19
369 0.19
370 0.17
371 0.16
372 0.17
373 0.16
374 0.23
375 0.23
376 0.2
377 0.22
378 0.24
379 0.28
380 0.38
381 0.42
382 0.39
383 0.47
384 0.52
385 0.58
386 0.63
387 0.65
388 0.63
389 0.63
390 0.67
391 0.64
392 0.66
393 0.59
394 0.54
395 0.53
396 0.49
397 0.47
398 0.44
399 0.47
400 0.5
401 0.51
402 0.51
403 0.49
404 0.48
405 0.48
406 0.49
407 0.47
408 0.41
409 0.43
410 0.44
411 0.45
412 0.49
413 0.49
414 0.45
415 0.43
416 0.46
417 0.48
418 0.47