Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2GEH5

Protein Details
Accession A0A1Y2GEH5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-70TTDNRGPRKDAPRPNNRPRDNDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-104PKKETKPAAKTGAKPAAGNTSKSATTDNRGPRKDAPRPNNRPRDNDAPRGPRYDRAPRDGEATPRPPRGSRAPRGGRGGRH
220-227KSRKGKKE
246-277PAPRSAFRGGRGGDRAPRGARGGNSSRPRGGA
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13, cyto 11.5, nucl 9.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Amino Acid Sequences MASTNIFDVLNDDAQDQEIRVPAPKKETKPAAKTGAKPAAGNTSKSATTDNRGPRKDAPRPNNRPRDNDAPRGPRYDRAPRDGEATPRPPRGSRAPRGGRGGRHGGYDRHSGTGIVDSENKENNRLGDPTSSYLEAEQDAATVGTDEATTDAPEPAEPETTIKTLDDFLQEKAAKAAKIALPEARAANAGADESKWKDAKVLEIQEAEDFIKMGKESATKSRKGKKEGKVLITDIDFKFTEPAREPAPRSAFRGGRGGDRAPRGARGGNSSRPRGGAGSRGASVNVDDQEVFPSLGSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.14
4 0.12
5 0.13
6 0.13
7 0.19
8 0.22
9 0.24
10 0.33
11 0.4
12 0.44
13 0.51
14 0.6
15 0.64
16 0.67
17 0.72
18 0.72
19 0.71
20 0.71
21 0.71
22 0.69
23 0.61
24 0.54
25 0.48
26 0.49
27 0.45
28 0.42
29 0.35
30 0.3
31 0.29
32 0.29
33 0.31
34 0.24
35 0.27
36 0.33
37 0.4
38 0.46
39 0.48
40 0.51
41 0.56
42 0.62
43 0.67
44 0.69
45 0.69
46 0.71
47 0.8
48 0.86
49 0.88
50 0.84
51 0.81
52 0.78
53 0.79
54 0.74
55 0.73
56 0.71
57 0.69
58 0.66
59 0.66
60 0.6
61 0.55
62 0.55
63 0.56
64 0.53
65 0.51
66 0.51
67 0.45
68 0.48
69 0.45
70 0.44
71 0.4
72 0.42
73 0.42
74 0.43
75 0.44
76 0.41
77 0.43
78 0.48
79 0.5
80 0.51
81 0.55
82 0.58
83 0.61
84 0.67
85 0.67
86 0.59
87 0.55
88 0.54
89 0.44
90 0.41
91 0.38
92 0.33
93 0.32
94 0.35
95 0.3
96 0.25
97 0.24
98 0.21
99 0.18
100 0.19
101 0.16
102 0.12
103 0.13
104 0.13
105 0.15
106 0.2
107 0.19
108 0.18
109 0.18
110 0.18
111 0.18
112 0.18
113 0.17
114 0.15
115 0.16
116 0.16
117 0.17
118 0.16
119 0.14
120 0.13
121 0.12
122 0.1
123 0.09
124 0.07
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.06
145 0.07
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.17
157 0.18
158 0.17
159 0.19
160 0.2
161 0.17
162 0.16
163 0.19
164 0.14
165 0.15
166 0.16
167 0.16
168 0.15
169 0.16
170 0.16
171 0.13
172 0.12
173 0.1
174 0.09
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.09
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.15
185 0.15
186 0.21
187 0.26
188 0.27
189 0.26
190 0.26
191 0.27
192 0.24
193 0.25
194 0.19
195 0.13
196 0.09
197 0.07
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.1
203 0.13
204 0.23
205 0.28
206 0.33
207 0.42
208 0.51
209 0.57
210 0.63
211 0.7
212 0.69
213 0.74
214 0.76
215 0.74
216 0.69
217 0.63
218 0.57
219 0.5
220 0.47
221 0.36
222 0.32
223 0.25
224 0.21
225 0.23
226 0.21
227 0.24
228 0.21
229 0.24
230 0.25
231 0.3
232 0.33
233 0.38
234 0.45
235 0.42
236 0.44
237 0.49
238 0.47
239 0.44
240 0.49
241 0.42
242 0.4
243 0.42
244 0.41
245 0.4
246 0.41
247 0.43
248 0.38
249 0.4
250 0.36
251 0.36
252 0.34
253 0.36
254 0.39
255 0.43
256 0.49
257 0.51
258 0.5
259 0.47
260 0.46
261 0.41
262 0.37
263 0.35
264 0.33
265 0.32
266 0.31
267 0.31
268 0.29
269 0.27
270 0.26
271 0.23
272 0.19
273 0.16
274 0.15
275 0.15
276 0.17
277 0.18
278 0.17