Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2GFD8

Protein Details
Accession A0A1Y2GFD8    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
309-443KSTKATKTATSKKENPRRRKRLKRMKKLKRPKRLQRKRRRRLLQRLIRPKRPTRLIKPRRLRLLRLRRRRRHQRRRRRKLTRLRRPKSQRRLRRLLKTPRLPRPPLVLMPRRRPKLLRRRRLKRQNRQQLLLMHPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
172-216EAKEKRAQKQAAKKAKLAAKAKKAAELKAKKSEAKKALLAKKKDA
297-449NAEKRAKALEAIKSTKATKTATSKKENPRRRKRLKRMKKLKRPKRLQRKRRRRLLQRLIRPKRPTRLIKPRRLRLLRLRRRRRHQRRRRRKLTRLRRPKSQRRLRRLLKTPRLPRPPLVLMPRRRPKLLRRRRLKRQNRQQLLLMHPRRRRRR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044198  DEK  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR036361  SAP_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006325  P:chromatin organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09011  HMG_box_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MSDSAESSDSEVYIPRDPVVPLPVTGPRERKQVERFAVPVVEKPEKKLEIPHGKGVKLGDIPVVSANLDKLKVSDETVKGLHRLLFGRVTATKSPKNDIKAFYGFADLSEKEEEAYEEKLGKWTVGGLRELIELFNLETGGDKDALLERIMVFLKKPADSGLVPRAQKLALEAKEKRAQKQAAKKAKLAAKAKKAAELKAKKSEAKKALLAKKKDAQKTKTTVTTKAANENAKVVIPKIRSAFDMYVKEHQKEIKEKVEPDASRADIYKKLVDKWEAVPAATRKEYEAKAEAENAKNAEKRAKALEAIKSTKATKTATSKKENPRRRKRLKRMKKLKRPKRLQRKRRRRLLQRLIRPKRPTRLIKPRRLRLLRLRRRRRHQRRRRRKLTRLRRPKSQRRLRRLLKTPRLPRPPLVLMPRRRPKLLRRRRLKRQNRQQLLLMHPRRRRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.2
4 0.21
5 0.23
6 0.25
7 0.24
8 0.2
9 0.23
10 0.28
11 0.31
12 0.36
13 0.41
14 0.4
15 0.48
16 0.5
17 0.55
18 0.57
19 0.62
20 0.61
21 0.59
22 0.57
23 0.51
24 0.53
25 0.46
26 0.42
27 0.4
28 0.43
29 0.38
30 0.41
31 0.45
32 0.43
33 0.44
34 0.46
35 0.5
36 0.52
37 0.56
38 0.61
39 0.57
40 0.54
41 0.56
42 0.49
43 0.43
44 0.34
45 0.3
46 0.24
47 0.19
48 0.19
49 0.18
50 0.18
51 0.13
52 0.12
53 0.13
54 0.12
55 0.13
56 0.12
57 0.11
58 0.13
59 0.14
60 0.17
61 0.22
62 0.21
63 0.24
64 0.26
65 0.28
66 0.26
67 0.27
68 0.26
69 0.22
70 0.23
71 0.22
72 0.22
73 0.21
74 0.24
75 0.24
76 0.26
77 0.29
78 0.34
79 0.36
80 0.36
81 0.43
82 0.44
83 0.49
84 0.5
85 0.47
86 0.47
87 0.45
88 0.44
89 0.37
90 0.35
91 0.28
92 0.23
93 0.23
94 0.17
95 0.17
96 0.16
97 0.16
98 0.13
99 0.14
100 0.14
101 0.12
102 0.13
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.15
107 0.15
108 0.14
109 0.12
110 0.14
111 0.16
112 0.17
113 0.17
114 0.15
115 0.15
116 0.16
117 0.17
118 0.13
119 0.1
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.08
131 0.1
132 0.11
133 0.1
134 0.1
135 0.08
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.09
140 0.12
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.13
145 0.15
146 0.15
147 0.19
148 0.22
149 0.26
150 0.26
151 0.26
152 0.26
153 0.23
154 0.22
155 0.21
156 0.22
157 0.2
158 0.27
159 0.28
160 0.33
161 0.4
162 0.42
163 0.42
164 0.43
165 0.45
166 0.46
167 0.54
168 0.59
169 0.62
170 0.64
171 0.62
172 0.61
173 0.6
174 0.6
175 0.58
176 0.55
177 0.53
178 0.57
179 0.55
180 0.55
181 0.52
182 0.49
183 0.51
184 0.5
185 0.48
186 0.49
187 0.51
188 0.49
189 0.51
190 0.55
191 0.5
192 0.47
193 0.46
194 0.46
195 0.52
196 0.55
197 0.54
198 0.51
199 0.51
200 0.55
201 0.58
202 0.57
203 0.53
204 0.53
205 0.55
206 0.54
207 0.56
208 0.51
209 0.47
210 0.42
211 0.44
212 0.38
213 0.38
214 0.39
215 0.32
216 0.3
217 0.28
218 0.25
219 0.19
220 0.18
221 0.14
222 0.14
223 0.13
224 0.16
225 0.16
226 0.16
227 0.16
228 0.19
229 0.21
230 0.21
231 0.24
232 0.23
233 0.29
234 0.3
235 0.3
236 0.29
237 0.3
238 0.29
239 0.32
240 0.35
241 0.34
242 0.35
243 0.36
244 0.37
245 0.42
246 0.38
247 0.34
248 0.33
249 0.27
250 0.24
251 0.24
252 0.23
253 0.18
254 0.2
255 0.22
256 0.2
257 0.22
258 0.24
259 0.25
260 0.26
261 0.24
262 0.29
263 0.25
264 0.23
265 0.26
266 0.24
267 0.26
268 0.24
269 0.23
270 0.18
271 0.23
272 0.23
273 0.22
274 0.24
275 0.22
276 0.22
277 0.27
278 0.29
279 0.26
280 0.27
281 0.25
282 0.26
283 0.26
284 0.26
285 0.27
286 0.24
287 0.24
288 0.26
289 0.26
290 0.26
291 0.29
292 0.34
293 0.35
294 0.37
295 0.37
296 0.36
297 0.35
298 0.34
299 0.32
300 0.28
301 0.27
302 0.33
303 0.41
304 0.46
305 0.53
306 0.61
307 0.68
308 0.77
309 0.82
310 0.83
311 0.85
312 0.88
313 0.91
314 0.93
315 0.94
316 0.95
317 0.96
318 0.96
319 0.96
320 0.96
321 0.96
322 0.96
323 0.96
324 0.95
325 0.95
326 0.95
327 0.95
328 0.95
329 0.95
330 0.95
331 0.96
332 0.96
333 0.96
334 0.95
335 0.95
336 0.95
337 0.95
338 0.94
339 0.93
340 0.94
341 0.92
342 0.91
343 0.88
344 0.85
345 0.84
346 0.83
347 0.82
348 0.81
349 0.83
350 0.85
351 0.87
352 0.89
353 0.88
354 0.9
355 0.86
356 0.83
357 0.83
358 0.84
359 0.84
360 0.85
361 0.87
362 0.86
363 0.92
364 0.95
365 0.95
366 0.95
367 0.96
368 0.96
369 0.96
370 0.97
371 0.98
372 0.97
373 0.97
374 0.97
375 0.97
376 0.96
377 0.96
378 0.92
379 0.92
380 0.92
381 0.92
382 0.92
383 0.91
384 0.91
385 0.9
386 0.94
387 0.92
388 0.92
389 0.91
390 0.91
391 0.91
392 0.91
393 0.9
394 0.9
395 0.9
396 0.84
397 0.78
398 0.75
399 0.71
400 0.69
401 0.69
402 0.68
403 0.67
404 0.73
405 0.79
406 0.76
407 0.75
408 0.75
409 0.76
410 0.78
411 0.8
412 0.8
413 0.81
414 0.86
415 0.91
416 0.95
417 0.95
418 0.95
419 0.96
420 0.96
421 0.94
422 0.89
423 0.84
424 0.81
425 0.79
426 0.78
427 0.76
428 0.74
429 0.73