FuNGI

A0A1Y2H1R8

Protein Details

Accession

A0A1Y2H1R8

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
212-234	DDDERHEKRKKNRLSKHLSVNKE	Basic
276-309	VLSPKKPRLQKKSGSKAHRKKKRERNPFKDQLMI	Basic
439-466	DTEAIKRKEKQARRTKKRQENAGHPKPS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
219-223	KRKKN
279-301	PKKPRLQKKSGSKAHRKKKRERN
443-458	IKRKEKQARRTKKRQE

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017336 Snurportin-1 IPR024721 Snurportin-1_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0061015 P:snRNA import into nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF11538 Snurportin1
CDD	cd09232 Snurportin-1_C

Amino Acid Sequences

MSNGDKNSNTVSNNRNVNGHVQDVSTPMHGHEPTSPNATSITHMSVPLLLSLPPDFASPITTTSTTASITTSTATTVSNMTSISTSTAATTTPIASSCVVSQKTIEVLGDWLLESVSVQPLLGSQEQRRKQSFKSNSLINKTMKQSQEERRKQALAEQAKKRYQFTNHARKLALFASGQPSDGSSSSEDDDSRDDNDDEDDEDEDQEDDDVDDDERHEKRKKNRLSKHLSVNKENNEQEESRILPQLKATTAHKRRLSFGSESETAAGRKTDNVDVLSPKKPRLQKKSGSKAHRKKKRERNPFKDQLMIPETMSDIPVDLDTNYYIVPLPVGHRCFVISADGKTTARLPSGQLLASPFESCLPAGSNQYRGNRRSDYCILDCVYSPITRTFWTFDIMCWRGHPVYDCETEFRFWWLRGKLAEIEELQGKWIANQIKERDTEAIKRKEKQARRTKKRQENAGHPKPSNVALEEVGEEGGEDAGSEDMDIEAGSRINGSTNLSGSGKFWPIVFTPLPYFNASINLIRLLAESMYQPSPSPPSIGSPCTAASALLSVPHNLSLSSRNTSASAAPFDLTSTSPISTQSHGSNGNQNESHQNGAIVPVSPLGTMALSGEIATAASLFPAHDITQKTRQGNTLAYERAAGLVFFNKKTMYVLGTTPLCGWVAMEQIGDVFFDEEGGVGPVPGTSAVEGREIEMEDALQRIRI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.45
3	0.42
4	0.47
5	0.42
6	0.39
7	0.33
8	0.27
9	0.26
10	0.26
11	0.26
12	0.21
13	0.18
14	0.16
15	0.21
16	0.2
17	0.21
18	0.26
19	0.29
20	0.3
21	0.35
22	0.34
23	0.28
24	0.29
25	0.28
26	0.23
27	0.22
28	0.24
29	0.2
30	0.2
31	0.2
32	0.2
33	0.19
34	0.18
35	0.16
36	0.11
37	0.12
38	0.12
39	0.13
40	0.12
41	0.12
42	0.11
43	0.11
44	0.13
45	0.13
46	0.14
47	0.17
48	0.17
49	0.18
50	0.18
51	0.2
52	0.18
53	0.17
54	0.16
55	0.13
56	0.13
57	0.13
58	0.11
59	0.1
60	0.1
61	0.1
62	0.1
63	0.11
64	0.11
65	0.1
66	0.1
67	0.1
68	0.1
69	0.1
70	0.11
71	0.11
72	0.1
73	0.1
74	0.11
75	0.1
76	0.1
77	0.11
78	0.1
79	0.1
80	0.11
81	0.12
82	0.12
83	0.13
84	0.14
85	0.2
86	0.2
87	0.2
88	0.2
89	0.2
90	0.2
91	0.2
92	0.18
93	0.11
94	0.11
95	0.12
96	0.11
97	0.1
98	0.08
99	0.07
100	0.07
101	0.06
102	0.07
103	0.07
104	0.07
105	0.07
106	0.06
107	0.08
108	0.12
109	0.15
110	0.18
111	0.23
112	0.33
113	0.39
114	0.46
115	0.51
116	0.52
117	0.53
118	0.6
119	0.63
120	0.62
121	0.62
122	0.63
123	0.65
124	0.68
125	0.69
126	0.62
127	0.59
128	0.54
129	0.55
130	0.5
131	0.48
132	0.49
133	0.53
134	0.61
135	0.63
136	0.67
137	0.65
138	0.64
139	0.59
140	0.57
141	0.56
142	0.55
143	0.56
144	0.56
145	0.59
146	0.62
147	0.64
148	0.61
149	0.58
150	0.53
151	0.55
152	0.57
153	0.6
154	0.61
155	0.63
156	0.61
157	0.55
158	0.52
159	0.42
160	0.35
161	0.24
162	0.2
163	0.22
164	0.21
165	0.21
166	0.18
167	0.17
168	0.16
169	0.16
170	0.15
171	0.11
172	0.12
173	0.13
174	0.14
175	0.14
176	0.13
177	0.15
178	0.14
179	0.15
180	0.16
181	0.14
182	0.14
183	0.15
184	0.14
185	0.13
186	0.12
187	0.12
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.08
192	0.08
193	0.07
194	0.06
195	0.05
196	0.05
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.07
201	0.12
202	0.13
203	0.19
204	0.25
205	0.31
206	0.41
207	0.51
208	0.61
209	0.67
210	0.75
211	0.8
212	0.83
213	0.84
214	0.85
215	0.83
216	0.79
217	0.76
218	0.74
219	0.68
220	0.66
221	0.59
222	0.51
223	0.46
224	0.41
225	0.34
226	0.29
227	0.25
228	0.2
229	0.23
230	0.22
231	0.18
232	0.19
233	0.2
234	0.19
235	0.2
236	0.22
237	0.28
238	0.34
239	0.42
240	0.45
241	0.45
242	0.47
243	0.49
244	0.49
245	0.41
246	0.37
247	0.35
248	0.31
249	0.3
250	0.27
251	0.24
252	0.2
253	0.18
254	0.15
255	0.1
256	0.1
257	0.12
258	0.13
259	0.13
260	0.14
261	0.15
262	0.19
263	0.23
264	0.27
265	0.26
266	0.27
267	0.31
268	0.37
269	0.45
270	0.5
271	0.56
272	0.59
273	0.68
274	0.77
275	0.79
276	0.82
277	0.84
278	0.84
279	0.86
280	0.86
281	0.84
282	0.84
283	0.87
284	0.88
285	0.88
286	0.9
287	0.88
288	0.89
289	0.89
290	0.81
291	0.76
292	0.65
293	0.6
294	0.51
295	0.43
296	0.32
297	0.23
298	0.22
299	0.15
300	0.15
301	0.09
302	0.06
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.04
314	0.05
315	0.04
316	0.07
317	0.1
318	0.12
319	0.12
320	0.12
321	0.12
322	0.13
323	0.12
324	0.14
325	0.12
326	0.11
327	0.12
328	0.14
329	0.14
330	0.14
331	0.15
332	0.12
333	0.11
334	0.11
335	0.1
336	0.11
337	0.12
338	0.12
339	0.11
340	0.11
341	0.11
342	0.11
343	0.1
344	0.08
345	0.07
346	0.08
347	0.07
348	0.06
349	0.07
350	0.07
351	0.11
352	0.12
353	0.16
354	0.2
355	0.26
356	0.32
357	0.32
358	0.36
359	0.37
360	0.37
361	0.39
362	0.38
363	0.37
364	0.32
365	0.33
366	0.29
367	0.25
368	0.24
369	0.19
370	0.17
371	0.12
372	0.12
373	0.11
374	0.11
375	0.11
376	0.13
377	0.13
378	0.13
379	0.15
380	0.14
381	0.13
382	0.2
383	0.21
384	0.2
385	0.18
386	0.2
387	0.17
388	0.18
389	0.19
390	0.14
391	0.17
392	0.2
393	0.2
394	0.2
395	0.2
396	0.21
397	0.19
398	0.19
399	0.17
400	0.15
401	0.21
402	0.19
403	0.21
404	0.21
405	0.23
406	0.22
407	0.21
408	0.23
409	0.17
410	0.17
411	0.16
412	0.16
413	0.14
414	0.13
415	0.11
416	0.09
417	0.14
418	0.15
419	0.16
420	0.21
421	0.24
422	0.26
423	0.27
424	0.28
425	0.27
426	0.26
427	0.32
428	0.36
429	0.43
430	0.44
431	0.47
432	0.54
433	0.6
434	0.66
435	0.68
436	0.7
437	0.72
438	0.78
439	0.86
440	0.88
441	0.89
442	0.88
443	0.88
444	0.85
445	0.84
446	0.85
447	0.84
448	0.8
449	0.7
450	0.63
451	0.55
452	0.5
453	0.4
454	0.3
455	0.22
456	0.15
457	0.16
458	0.15
459	0.13
460	0.1
461	0.08
462	0.07
463	0.05
464	0.05
465	0.04
466	0.03
467	0.03
468	0.03
469	0.03
470	0.03
471	0.03
472	0.03
473	0.03
474	0.03
475	0.03
476	0.04
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.05
481	0.06
482	0.07
483	0.08
484	0.09
485	0.1
486	0.12
487	0.12
488	0.13
489	0.13
490	0.15
491	0.15
492	0.14
493	0.14
494	0.13
495	0.14
496	0.18
497	0.17
498	0.16
499	0.18
500	0.2
501	0.22
502	0.21
503	0.22
504	0.17
505	0.2
506	0.2
507	0.18
508	0.16
509	0.15
510	0.14
511	0.13
512	0.12
513	0.1
514	0.08
515	0.08
516	0.08
517	0.1
518	0.11
519	0.11
520	0.11
521	0.12
522	0.16
523	0.16
524	0.17
525	0.14
526	0.19
527	0.23
528	0.24
529	0.23
530	0.21
531	0.21
532	0.21
533	0.2
534	0.14
535	0.11
536	0.1
537	0.09
538	0.11
539	0.11
540	0.1
541	0.11
542	0.12
543	0.12
544	0.11
545	0.12
546	0.14
547	0.18
548	0.2
549	0.2
550	0.2
551	0.21
552	0.22
553	0.23
554	0.21
555	0.2
556	0.17
557	0.17
558	0.16
559	0.15
560	0.15
561	0.13
562	0.13
563	0.12
564	0.12
565	0.12
566	0.14
567	0.16
568	0.16
569	0.19
570	0.18
571	0.21
572	0.23
573	0.25
574	0.31
575	0.31
576	0.35
577	0.32
578	0.32
579	0.34
580	0.33
581	0.33
582	0.25
583	0.24
584	0.18
585	0.19
586	0.18
587	0.13
588	0.12
589	0.11
590	0.11
591	0.1
592	0.1
593	0.08
594	0.07
595	0.07
596	0.07
597	0.06
598	0.06
599	0.06
600	0.06
601	0.05
602	0.05
603	0.05
604	0.04
605	0.04
606	0.04
607	0.04
608	0.04
609	0.05
610	0.07
611	0.08
612	0.13
613	0.17
614	0.23
615	0.32
616	0.39
617	0.41
618	0.42
619	0.45
620	0.44
621	0.44
622	0.42
623	0.4
624	0.35
625	0.32
626	0.31
627	0.27
628	0.25
629	0.21
630	0.17
631	0.11
632	0.16
633	0.2
634	0.19
635	0.21
636	0.2
637	0.2
638	0.22
639	0.23
640	0.18
641	0.17
642	0.18
643	0.23
644	0.23
645	0.24
646	0.22
647	0.21
648	0.19
649	0.16
650	0.15
651	0.1
652	0.12
653	0.12
654	0.11
655	0.1
656	0.1
657	0.1
658	0.1
659	0.09
660	0.07
661	0.06
662	0.06
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.08
667	0.07
668	0.06
669	0.07
670	0.06
671	0.07
672	0.07
673	0.07
674	0.07
675	0.08
676	0.1
677	0.13
678	0.13
679	0.14
680	0.16
681	0.16
682	0.16
683	0.14
684	0.14
685	0.12
686	0.14

A0A1Y2H1R8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer